MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	AT	3	6	2563	2568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014736	GA	3	6	4107	4112	50 %	0 %	50 %	0 %	313122553
3	NC_014736	GA	3	6	4306	4311	50 %	0 %	50 %	0 %	313122553
4	NC_014736	CG	3	6	4749	4754	0 %	0 %	50 %	50 %	313122553
5	NC_014736	CG	3	6	5345	5350	0 %	0 %	50 %	50 %	313122554
6	NC_014736	GA	3	6	5677	5682	50 %	0 %	50 %	0 %	313122554
7	NC_014736	TC	3	6	6482	6487	0 %	50 %	0 %	50 %	313122555
8	NC_014736	AG	3	6	6992	6997	50 %	0 %	50 %	0 %	313122556
9	NC_014736	GT	3	6	7302	7307	0 %	50 %	50 %	0 %	313122556
10	NC_014736	TC	3	6	8259	8264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014736	CG	3	6	8559	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
12	NC_014736	GA	3	6	8748	8753	50 %	0 %	50 %	0 %	313122557
13	NC_014736	CG	4	8	8860	8867	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
14	NC_014736	GC	3	6	9000	9005	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
15	NC_014736	GC	3	6	9449	9454	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
16	NC_014736	CA	3	6	9635	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014736	GA	3	6	9714	9719	50 %	0 %	50 %	0 %	313122558
18	NC_014736	AG	3	6	11451	11456	50 %	0 %	50 %	0 %	313122559
19	NC_014736	TC	3	6	12344	12349	0 %	50 %	0 %	50 %	313122559
20	NC_014736	GC	3	6	13777	13782	0 %	0 %	50 %	50 %	313122560
21	NC_014736	GT	3	6	14495	14500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014736	CA	3	6	14825	14830	50 %	0 %	0 %	50 %	313122561
23	NC_014736	TC	3	6	15372	15377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014736	TG	3	6	15500	15505	0 %	50 %	50 %	0 %	313122562
25	NC_014736	AG	3	6	16415	16420	50 %	0 %	50 %	0 %	313122562
26	NC_014736	TC	3	6	17349	17354	0 %	50 %	0 %	50 %	313122562
27	NC_014736	GA	3	6	18283	18288	50 %	0 %	50 %	0 %	313122564
28	NC_014736	AC	3	6	18388	18393	50 %	0 %	0 %	50 %	313122564
29	NC_014736	CT	3	6	19428	19433	0 %	50 %	0 %	50 %	313122564
30	NC_014736	GC	3	6	19528	19533	0 %	0 %	50 %	50 %	313122564
31	NC_014736	TC	3	6	19842	19847	0 %	50 %	0 %	50 %	313122564
32	NC_014736	CA	3	6	20104	20109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014736	AC	3	6	20187	20192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014736	CT	3	6	21164	21169	0 %	50 %	0 %	50 %	313122568
35	NC_014736	GA	3	6	21455	21460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014736	GC	3	6	21650	21655	0 %	0 %	50 %	50 %	313122569
37	NC_014736	CG	3	6	21674	21679	0 %	0 %	50 %	50 %	313122569
38	NC_014736	GA	3	6	22007	22012	50 %	0 %	50 %	0 %	313122570
39	NC_014736	GA	3	6	22512	22517	50 %	0 %	50 %	0 %	313122570
40	NC_014736	AC	3	6	23090	23095	50 %	0 %	0 %	50 %	313122570
41	NC_014736	GC	3	6	23853	23858	0 %	0 %	50 %	50 %	313122571
42	NC_014736	AC	3	6	24341	24346	50 %	0 %	0 %	50 %	313122571
43	NC_014736	AC	3	6	25268	25273	50 %	0 %	0 %	50 %	313122572
44	NC_014736	GA	3	6	26097	26102	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
45	NC_014736	AG	3	6	26350	26355	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
46	NC_014736	TG	3	6	26368	26373	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
47	NC_014736	TG	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
48	NC_014736	AT	3	6	26691	26696	50 %	50 %	0 %	0 %	313122573
49	NC_014736	CT	3	6	26796	26801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014736	GC	3	6	27281	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	313122574
51	NC_014736	GA	3	6	27793	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	313122574
52	NC_014736	TC	3	6	28244	28249	0 %	50 %	0 %	50 %	313122574
53	NC_014736	TG	3	6	29248	29253	0 %	50 %	50 %	0 %	313122575
54	NC_014736	AT	3	6	29455	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014736	TA	3	6	29483	29488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014736	CA	3	6	29988	29993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014736	TC	3	6	30409	30414	0 %	50 %	0 %	50 %	313122577
58	NC_014736	GA	3	6	30727	30732	50 %	0 %	50 %	0 %	313122577
59	NC_014736	GC	3	6	30803	30808	0 %	0 %	50 %	50 %	313122577
60	NC_014736	CG	3	6	33115	33120	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
61	NC_014736	TG	3	6	33454	33459	0 %	50 %	50 %	0 %	313122578
62	NC_014736	GC	3	6	33478	33483	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
63	NC_014736	TC	3	6	34388	34393	0 %	50 %	0 %	50 %	313122579
64	NC_014736	AC	3	6	35153	35158	50 %	0 %	0 %	50 %	313122580
65	NC_014736	CT	3	6	35581	35586	0 %	50 %	0 %	50 %	313122580
66	NC_014736	GA	3	6	36145	36150	50 %	0 %	50 %	0 %	313122580
67	NC_014736	TC	3	6	37695	37700	0 %	50 %	0 %	50 %	313122581
68	NC_014736	GC	3	6	37803	37808	0 %	0 %	50 %	50 %	313122581
69	NC_014736	TC	3	6	38080	38085	0 %	50 %	0 %	50 %	313122581
70	NC_014736	AC	3	6	38396	38401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014736	GA	3	6	39196	39201	50 %	0 %	50 %	0 %	313122582
72	NC_014736	GC	3	6	40173	40178	0 %	0 %	50 %	50 %	313122583
73	NC_014736	TC	3	6	41592	41597	0 %	50 %	0 %	50 %	313122584
74	NC_014736	CG	3	6	41718	41723	0 %	0 %	50 %	50 %	313122584
75	NC_014736	AG	3	6	42574	42579	50 %	0 %	50 %	0 %	313122584
76	NC_014736	CG	4	8	42663	42670	0 %	0 %	50 %	50 %	313122584
77	NC_014736	TG	3	6	42979	42984	0 %	50 %	50 %	0 %	313122584
78	NC_014736	TC	3	6	43974	43979	0 %	50 %	0 %	50 %	313122585
79	NC_014736	GA	3	6	44003	44008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014736	TA	3	6	44391	44396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014736	AC	3	6	44653	44658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014736	CT	3	6	45672	45677	0 %	50 %	0 %	50 %	313122586
83	NC_014736	GA	3	6	45921	45926	50 %	0 %	50 %	0 %	313122586
84	NC_014736	GA	3	6	45988	45993	50 %	0 %	50 %	0 %	313122586
85	NC_014736	GA	3	6	46333	46338	50 %	0 %	50 %	0 %	313122587
86	NC_014736	AC	3	6	47960	47965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014736	TC	3	6	48877	48882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014736	AT	3	6	49075	49080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014736	GA	3	6	50894	50899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014736	CT	3	6	50971	50976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014736	GA	3	6	51511	51516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014736	GC	3	6	53095	53100	0 %	0 %	50 %	50 %	313122595
93	NC_014736	CT	3	6	53167	53172	0 %	50 %	0 %	50 %	313122595
94	NC_014736	GC	3	6	54220	54225	0 %	0 %	50 %	50 %	313122595
95	NC_014736	GT	3	6	55328	55333	0 %	50 %	50 %	0 %	313122596
96	NC_014736	GC	3	6	55728	55733	0 %	0 %	50 %	50 %	313122596
97	NC_014736	GT	3	6	56814	56819	0 %	50 %	50 %	0 %	313122598
98	NC_014736	CG	3	6	57616	57621	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
99	NC_014736	CG	4	8	57923	57930	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
100	NC_014736	GC	3	6	58155	58160	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
101	NC_014736	CG	3	6	58234	58239	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
102	NC_014736	GT	3	6	58759	58764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014736	CT	3	6	58815	58820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014736	GT	3	6	59556	59561	0 %	50 %	50 %	0 %	313122601
105	NC_014736	GA	3	6	60804	60809	50 %	0 %	50 %	0 %	313122602
106	NC_014736	AC	3	6	61648	61653	50 %	0 %	0 %	50 %	313122603
107	NC_014736	AC	3	6	61702	61707	50 %	0 %	0 %	50 %	313122603
108	NC_014736	AG	3	6	62369	62374	50 %	0 %	50 %	0 %	313122604
109	NC_014736	AG	3	6	63148	63153	50 %	0 %	50 %	0 %	313122604
110	NC_014736	CA	4	8	63663	63670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014736	TA	3	6	63999	64004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014736	GA	3	6	64057	64062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014736	AG	3	6	64101	64106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014736	TG	3	6	64268	64273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014736	GA	4	8	64334	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014736	AT	3	6	64515	64520	50 %	50 %	0 %	0 %	313122605
117	NC_014736	AG	3	6	64673	64678	50 %	0 %	50 %	0 %	313122605
118	NC_014736	AG	3	6	64936	64941	50 %	0 %	50 %	0 %	313122605
119	NC_014736	TC	3	6	65806	65811	0 %	50 %	0 %	50 %	313122606
120	NC_014736	TC	3	6	66013	66018	0 %	50 %	0 %	50 %	313122606
121	NC_014736	AC	3	6	66166	66171	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
122	NC_014736	AG	3	6	67035	67040	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
123	NC_014736	AC	3	6	67376	67381	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
124	NC_014736	AG	3	6	67410	67415	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
125	NC_014736	CG	3	6	67463	67468	0 %	0 %	50 %	50 %	313122606
126	NC_014736	CG	4	8	68347	68354	0 %	0 %	50 %	50 %	313122606
127	NC_014736	AC	3	6	68640	68645	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
128	NC_014736	CA	3	6	68737	68742	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
129	NC_014736	CA	3	6	68950	68955	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
130	NC_014736	CA	3	6	69148	69153	50 %	0 %	0 %	50 %	313122606
131	NC_014736	GA	3	6	69338	69343	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
132	NC_014736	GA	3	6	69417	69422	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
133	NC_014736	CT	3	6	69630	69635	0 %	50 %	0 %	50 %	313122606
134	NC_014736	GA	3	6	71017	71022	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
135	NC_014736	AG	3	6	71497	71502	50 %	0 %	50 %	0 %	313122606
136	NC_014736	AG	3	6	72544	72549	50 %	0 %	50 %	0 %	313122607
137	NC_014736	TC	3	6	72770	72775	0 %	50 %	0 %	50 %	313122607
138	NC_014736	CG	3	6	74313	74318	0 %	0 %	50 %	50 %	313122609
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140	NC_014736	AG	3	6	78094	78099	50 %	0 %	50 %	0 %	313122612
141	NC_014736	CG	3	6	78328	78333	0 %	0 %	50 %	50 %	313122612
142	NC_014736	AC	3	6	78455	78460	50 %	0 %	0 %	50 %	313122612
143	NC_014736	TC	4	8	79029	79036	0 %	50 %	0 %	50 %	313122613
144	NC_014736	GA	3	6	79562	79567	50 %	0 %	50 %	0 %	313122613
145	NC_014736	GA	3	6	79959	79964	50 %	0 %	50 %	0 %	313122613
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.