MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	AT	3	6	2563	2568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014736	TC	3	6	8259	8264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014736	CA	3	6	9635	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014736	GT	3	6	14495	14500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014736	TC	3	6	15372	15377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014736	CA	3	6	20104	20109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014736	AC	3	6	20187	20192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014736	GA	3	6	21455	21460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014736	CT	3	6	26796	26801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014736	AT	3	6	29455	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014736	TA	3	6	29483	29488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014736	CA	3	6	29988	29993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014736	AC	3	6	38396	38401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014736	GA	3	6	44003	44008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014736	TA	3	6	44391	44396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014736	AC	3	6	44653	44658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014736	AC	3	6	47960	47965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014736	TC	3	6	48877	48882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014736	AT	3	6	49075	49080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014736	GA	3	6	50894	50899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014736	CT	3	6	50971	50976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014736	GA	3	6	51511	51516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014736	GT	3	6	58759	58764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014736	CT	3	6	58815	58820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014736	CA	4	8	63663	63670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014736	TA	3	6	63999	64004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014736	GA	3	6	64057	64062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014736	AG	3	6	64101	64106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014736	TG	3	6	64268	64273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014736	GA	4	8	64334	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014736	GA	3	6	89530	89535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014736	CG	3	6	90551	90556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014736	GA	4	8	90603	90610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014736	TG	3	6	91738	91743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014736	CA	3	6	95110	95115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014736	AT	3	6	99973	99978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014736	TA	3	6	100008	100013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014736	GA	3	6	105943	105948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014736	TG	3	6	105960	105965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014736	AT	3	6	110430	110435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014736	GA	3	6	112780	112785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014736	CT	3	6	113067	113072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014736	CA	3	6	113211	113216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014736	AT	3	6	113308	113313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014736	GT	3	6	117495	117500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014736	AC	3	6	118183	118188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014736	TG	3	6	121197	121202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014736	AG	3	6	123014	123019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014736	GT	3	6	123038	123043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014736	GA	3	6	126767	126772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014736	AT	3	6	132542	132547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014736	GA	3	6	132809	132814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014736	CA	3	6	132949	132954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014736	AT	4	8	132958	132965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014736	TG	3	6	133989	133994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014736	AC	3	6	134041	134046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014736	AG	3	6	135455	135460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014736	TC	3	6	141925	141930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014736	AT	3	6	142529	142534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014736	AG	4	8	143627	143634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014736	GT	3	6	145103	145108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014736	CA	4	8	145367	145374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014736	GT	3	6	145471	145476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014736	TG	3	6	145522	145527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014736	GA	3	6	145561	145566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014736	GA	3	6	151312	151317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014736	CG	3	6	151493	151498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014736	GA	3	6	155665	155670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014736	AC	3	6	158193	158198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014736	GT	3	6	158244	158249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014736	CA	3	6	170749	170754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014736	CG	3	6	175619	175624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014736	CT	3	6	175666	175671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014736	TC	3	6	177165	177170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014736	TG	3	6	180708	180713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014736	TA	3	6	184419	184424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014736	TA	3	6	187296	187301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014736	CG	3	6	188310	188315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014736	TG	3	6	188534	188539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014736	AT	3	6	190720	190725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014736	TA	3	6	197542	197547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014736	AC	3	6	198892	198897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014736	GT	3	6	203247	203252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014736	TA	3	6	204398	204403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014736	AT	3	6	204421	204426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014736	AT	3	6	204595	204600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.