MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	GA	3	6	4107	4112	50 %	0 %	50 %	0 %	313122553
2	NC_014736	GA	3	6	4306	4311	50 %	0 %	50 %	0 %	313122553
3	NC_014736	CG	3	6	4749	4754	0 %	0 %	50 %	50 %	313122553
4	NC_014736	CG	3	6	5345	5350	0 %	0 %	50 %	50 %	313122554
5	NC_014736	GA	3	6	5677	5682	50 %	0 %	50 %	0 %	313122554
6	NC_014736	TC	3	6	6482	6487	0 %	50 %	0 %	50 %	313122555
7	NC_014736	AG	3	6	6992	6997	50 %	0 %	50 %	0 %	313122556
8	NC_014736	GT	3	6	7302	7307	0 %	50 %	50 %	0 %	313122556
9	NC_014736	CG	3	6	8559	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
10	NC_014736	GA	3	6	8748	8753	50 %	0 %	50 %	0 %	313122557
11	NC_014736	CG	4	8	8860	8867	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
12	NC_014736	GC	3	6	9000	9005	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
13	NC_014736	GC	3	6	9449	9454	0 %	0 %	50 %	50 %	313122557
14	NC_014736	GA	3	6	9714	9719	50 %	0 %	50 %	0 %	313122558
15	NC_014736	AG	3	6	11451	11456	50 %	0 %	50 %	0 %	313122559
16	NC_014736	TC	3	6	12344	12349	0 %	50 %	0 %	50 %	313122559
17	NC_014736	GC	3	6	13777	13782	0 %	0 %	50 %	50 %	313122560
18	NC_014736	CA	3	6	14825	14830	50 %	0 %	0 %	50 %	313122561
19	NC_014736	TG	3	6	15500	15505	0 %	50 %	50 %	0 %	313122562
20	NC_014736	AG	3	6	16415	16420	50 %	0 %	50 %	0 %	313122562
21	NC_014736	TC	3	6	17349	17354	0 %	50 %	0 %	50 %	313122562
22	NC_014736	GA	3	6	18283	18288	50 %	0 %	50 %	0 %	313122564
23	NC_014736	AC	3	6	18388	18393	50 %	0 %	0 %	50 %	313122564
24	NC_014736	CT	3	6	19428	19433	0 %	50 %	0 %	50 %	313122564
25	NC_014736	GC	3	6	19528	19533	0 %	0 %	50 %	50 %	313122564
26	NC_014736	TC	3	6	19842	19847	0 %	50 %	0 %	50 %	313122564
27	NC_014736	CT	3	6	21164	21169	0 %	50 %	0 %	50 %	313122568
28	NC_014736	GC	3	6	21650	21655	0 %	0 %	50 %	50 %	313122569
29	NC_014736	CG	3	6	21674	21679	0 %	0 %	50 %	50 %	313122569
30	NC_014736	GA	3	6	22007	22012	50 %	0 %	50 %	0 %	313122570
31	NC_014736	GA	3	6	22512	22517	50 %	0 %	50 %	0 %	313122570
32	NC_014736	AC	3	6	23090	23095	50 %	0 %	0 %	50 %	313122570
33	NC_014736	GC	3	6	23853	23858	0 %	0 %	50 %	50 %	313122571
34	NC_014736	AC	3	6	24341	24346	50 %	0 %	0 %	50 %	313122571
35	NC_014736	AC	3	6	25268	25273	50 %	0 %	0 %	50 %	313122572
36	NC_014736	GA	3	6	26097	26102	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
37	NC_014736	AG	3	6	26350	26355	50 %	0 %	50 %	0 %	313122573
38	NC_014736	TG	3	6	26368	26373	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
39	NC_014736	TG	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	313122573
40	NC_014736	AT	3	6	26691	26696	50 %	50 %	0 %	0 %	313122573
41	NC_014736	GC	3	6	27281	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	313122574
42	NC_014736	GA	3	6	27793	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	313122574
43	NC_014736	TC	3	6	28244	28249	0 %	50 %	0 %	50 %	313122574
44	NC_014736	TG	3	6	29248	29253	0 %	50 %	50 %	0 %	313122575
45	NC_014736	TC	3	6	30409	30414	0 %	50 %	0 %	50 %	313122577
46	NC_014736	GA	3	6	30727	30732	50 %	0 %	50 %	0 %	313122577
47	NC_014736	GC	3	6	30803	30808	0 %	0 %	50 %	50 %	313122577
48	NC_014736	CG	3	6	33115	33120	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
49	NC_014736	TG	3	6	33454	33459	0 %	50 %	50 %	0 %	313122578
50	NC_014736	GC	3	6	33478	33483	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
51	NC_014736	TC	3	6	34388	34393	0 %	50 %	0 %	50 %	313122579
52	NC_014736	AC	3	6	35153	35158	50 %	0 %	0 %	50 %	313122580
53	NC_014736	CT	3	6	35581	35586	0 %	50 %	0 %	50 %	313122580
54	NC_014736	GA	3	6	36145	36150	50 %	0 %	50 %	0 %	313122580
55	NC_014736	TC	3	6	37695	37700	0 %	50 %	0 %	50 %	313122581
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67	NC_014736	GA	3	6	45921	45926	50 %	0 %	50 %	0 %	313122586
68	NC_014736	GA	3	6	45988	45993	50 %	0 %	50 %	0 %	313122586
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111	NC_014736	CG	3	6	78328	78333	0 %	0 %	50 %	50 %	313122612
112	NC_014736	AC	3	6	78455	78460	50 %	0 %	0 %	50 %	313122612
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119	NC_014736	GA	3	6	81445	81450	50 %	0 %	50 %	0 %	313122614
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.