MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	GCGTC	2	10	2201	2210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014735	CGCGA	2	10	3764	3773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014735	ACGAC	2	10	8068	8077	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014735	TAATA	2	10	17677	17686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014735	GACCG	2	10	24137	24146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014735	CAAAA	2	10	25522	25531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014735	TCGAT	2	10	27647	27656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014735	GGGAT	2	10	31468	31477	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014735	TGCCG	2	10	32000	32009	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014735	GAAAA	2	10	32760	32769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014735	TGACA	2	10	39558	39567	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014735	AGCGT	2	10	46719	46728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014735	ACCGA	2	10	59338	59347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014735	AACAT	2	10	59992	60001	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014735	AGTGT	2	10	61257	61266	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014735	CGCTG	2	10	70382	70391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014735	AAAAT	2	10	107250	107259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014735	CTGTT	2	10	107303	107312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014735	TTTGT	2	10	118546	118555	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014735	CACGG	2	10	121224	121233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014735	TCATC	2	10	137175	137184	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014735	ATCAC	2	10	140207	140216	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014735	GAAGG	13	65	145356	145420	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014735	AGTGG	2	10	162939	162948	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014735	CTTTC	2	10	189092	189101	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014735	AACCG	2	10	199424	199433	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014735	GCGGA	2	10	249120	249129	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014735	GATTA	2	10	254433	254442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014735	TTATT	2	10	261953	261962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014735	CATTA	2	10	263179	263188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014735	AGGTT	2	10	275953	275962	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014735	GAACC	2	10	276645	276654	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014735	CGGTC	2	10	281186	281195	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014735	CGTAT	7	35	281283	281317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014735	TCCCT	16	80	283117	283196	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014735	TGGGA	2	10	291018	291027	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014735	AATAA	2	10	292745	292754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014735	CGATT	2	10	293804	293813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014735	CCATC	2	10	310850	310859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014735	TTTTG	2	10	320927	320936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014735	TTATA	2	10	322079	322088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014735	CGGAG	2	10	349483	349492	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014735	TCGCG	2	10	356039	356048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014735	AATGA	2	10	356851	356860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.