MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 1070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	AATC	2	8	407	414	50 %	25 %	0 %	25 %	313117185
2	NC_014735	ATAA	2	8	879	886	75 %	25 %	0 %	0 %	313117185
3	NC_014735	AGTA	2	8	1215	1222	50 %	25 %	25 %	0 %	313117186
4	NC_014735	CAAG	2	8	1479	1486	50 %	0 %	25 %	25 %	313117186
5	NC_014735	TCCT	2	8	1642	1649	0 %	50 %	0 %	50 %	313117186
6	NC_014735	CAAT	2	8	1827	1834	50 %	25 %	0 %	25 %	313117186
7	NC_014735	TTTC	2	8	2019	2026	0 %	75 %	0 %	25 %	313117186
8	NC_014735	CCAG	2	8	2400	2407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014735	GTTC	2	8	2627	2634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014735	AATA	2	8	2701	2708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014735	CAGA	2	8	3044	3051	50 %	0 %	25 %	25 %	313117187
12	NC_014735	AGTT	2	8	3665	3672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014735	GCTG	2	8	3990	3997	0 %	25 %	50 %	25 %	313117188
14	NC_014735	ATTC	2	8	4355	4362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014735	CAGA	2	8	4625	4632	50 %	0 %	25 %	25 %	313117189
16	NC_014735	AAGA	2	8	5424	5431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014735	GGCG	2	8	5533	5540	0 %	0 %	75 %	25 %	313117191
18	NC_014735	CGGT	2	8	5816	5823	0 %	25 %	50 %	25 %	313117191
19	NC_014735	ACCA	2	8	5898	5905	50 %	0 %	0 %	50 %	313117191
20	NC_014735	GTCA	2	8	6339	6346	25 %	25 %	25 %	25 %	313117192
21	NC_014735	ACGA	2	8	6358	6365	50 %	0 %	25 %	25 %	313117192
22	NC_014735	ATGG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	50 %	0 %	313117192
23	NC_014735	CGAC	2	8	6491	6498	25 %	0 %	25 %	50 %	313117192
24	NC_014735	TGAC	2	8	7096	7103	25 %	25 %	25 %	25 %	313117193
25	NC_014735	CCAA	2	8	7434	7441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014735	ACGT	2	8	7467	7474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014735	GCTA	2	8	7519	7526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014735	CGGC	2	8	7949	7956	0 %	0 %	50 %	50 %	313117195
29	NC_014735	ACCG	2	8	7984	7991	25 %	0 %	25 %	50 %	313117195
30	NC_014735	GGAA	2	8	8284	8291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014735	TGCG	2	8	9149	9156	0 %	25 %	50 %	25 %	313117196
32	NC_014735	CGTA	2	8	9310	9317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014735	AATA	2	8	10243	10250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014735	AACA	2	8	10341	10348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014735	CGCT	2	8	10395	10402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014735	ACTC	2	8	10429	10436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014735	GCAC	2	8	11478	11485	25 %	0 %	25 %	50 %	313117199
38	NC_014735	TTCC	2	8	12296	12303	0 %	50 %	0 %	50 %	313117201
39	NC_014735	AGTC	2	8	12386	12393	25 %	25 %	25 %	25 %	313117201
40	NC_014735	CGAC	2	8	12921	12928	25 %	0 %	25 %	50 %	313117202
41	NC_014735	ATGG	2	8	13108	13115	25 %	25 %	50 %	0 %	313117202
42	NC_014735	GACT	2	8	13237	13244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014735	ACCC	2	8	13707	13714	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_014735	ATCC	2	8	14343	14350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014735	CGGT	2	8	14695	14702	0 %	25 %	50 %	25 %	313117203
46	NC_014735	CGTT	2	8	15341	15348	0 %	50 %	25 %	25 %	313117204
47	NC_014735	GATC	2	8	15381	15388	25 %	25 %	25 %	25 %	313117204
48	NC_014735	AACA	2	8	16019	16026	75 %	0 %	0 %	25 %	313117204
49	NC_014735	CAGC	2	8	16370	16377	25 %	0 %	25 %	50 %	313117204
50	NC_014735	TCTG	2	8	16808	16815	0 %	50 %	25 %	25 %	313117204
51	NC_014735	ACAG	2	8	17007	17014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014735	AATT	2	8	17095	17102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014735	GCCG	2	8	17356	17363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014735	AAAG	2	8	18347	18354	75 %	0 %	25 %	0 %	313117206
55	NC_014735	CCCA	2	8	18406	18413	25 %	0 %	0 %	75 %	313117206
56	NC_014735	CAGA	2	8	18567	18574	50 %	0 %	25 %	25 %	313117206
57	NC_014735	ATTG	2	8	19033	19040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014735	GTTG	2	8	19087	19094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014735	AAAG	2	8	20188	20195	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014735	CGAA	2	8	20500	20507	50 %	0 %	25 %	25 %	313117207
61	NC_014735	CAGC	2	8	20545	20552	25 %	0 %	25 %	50 %	313117207
62	NC_014735	ACCG	2	8	20571	20578	25 %	0 %	25 %	50 %	313117207
63	NC_014735	ACCA	2	8	20658	20665	50 %	0 %	0 %	50 %	313117207
64	NC_014735	CAGT	2	8	21064	21071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014735	AACG	3	12	21098	21109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014735	GTTT	2	8	21142	21149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014735	GAAC	2	8	21477	21484	50 %	0 %	25 %	25 %	313117208
68	NC_014735	TCAG	2	8	21757	21764	25 %	25 %	25 %	25 %	313117209
69	NC_014735	CAGT	2	8	21821	21828	25 %	25 %	25 %	25 %	313117209
70	NC_014735	CGGT	2	8	21851	21858	0 %	25 %	50 %	25 %	313117209
71	NC_014735	AAGC	2	8	21884	21891	50 %	0 %	25 %	25 %	313117209
72	NC_014735	TGGA	2	8	22416	22423	25 %	25 %	50 %	0 %	313117210
73	NC_014735	CCGA	2	8	22650	22657	25 %	0 %	25 %	50 %	313117210
74	NC_014735	GAAT	2	8	22758	22765	50 %	25 %	25 %	0 %	313117210
75	NC_014735	GACA	2	8	22881	22888	50 %	0 %	25 %	25 %	313117211
76	NC_014735	TCGT	2	8	23160	23167	0 %	50 %	25 %	25 %	313117211
77	NC_014735	GTAC	2	8	23821	23828	25 %	25 %	25 %	25 %	313117211
78	NC_014735	AACG	2	8	24074	24081	50 %	0 %	25 %	25 %	313117211
79	NC_014735	GTTC	2	8	24406	24413	0 %	50 %	25 %	25 %	313117212
80	NC_014735	CGAC	2	8	24530	24537	25 %	0 %	25 %	50 %	313117212
81	NC_014735	TCAA	2	8	24707	24714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014735	CGTG	2	8	25775	25782	0 %	25 %	50 %	25 %	313117214
83	NC_014735	ATCC	2	8	26005	26012	25 %	25 %	0 %	50 %	313117215
84	NC_014735	ATCA	2	8	26294	26301	50 %	25 %	0 %	25 %	313117215
85	NC_014735	CCAC	2	8	26486	26493	25 %	0 %	0 %	75 %	313117216
86	NC_014735	TCGT	2	8	26540	26547	0 %	50 %	25 %	25 %	313117216
87	NC_014735	ATTG	2	8	26629	26636	25 %	50 %	25 %	0 %	313117216
88	NC_014735	GGTG	2	8	26652	26659	0 %	25 %	75 %	0 %	313117216
89	NC_014735	CCGG	2	8	26782	26789	0 %	0 %	50 %	50 %	313117216
90	NC_014735	CGAC	2	8	26925	26932	25 %	0 %	25 %	50 %	313117216
91	NC_014735	CAAC	2	8	27837	27844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014735	ATGG	2	8	27951	27958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014735	CCGC	2	8	28894	28901	0 %	0 %	25 %	75 %	313117218
94	NC_014735	CCGA	2	8	29042	29049	25 %	0 %	25 %	50 %	313117218
95	NC_014735	GACG	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	313117218
96	NC_014735	CCAA	2	8	29761	29768	50 %	0 %	0 %	50 %	313117218
97	NC_014735	TACT	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	313117218
98	NC_014735	GATC	2	8	30233	30240	25 %	25 %	25 %	25 %	313117218
99	NC_014735	AGCG	2	8	30795	30802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014735	GGAA	2	8	30870	30877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014735	AGTG	2	8	31013	31020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014735	AGAT	2	8	31839	31846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014735	ATTT	2	8	32569	32576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014735	GCGA	2	8	32872	32879	25 %	0 %	50 %	25 %	313117220
105	NC_014735	CTGC	2	8	33515	33522	0 %	25 %	25 %	50 %	313117220
106	NC_014735	CGAC	2	8	34009	34016	25 %	0 %	25 %	50 %	313117220
107	NC_014735	TCGG	2	8	34556	34563	0 %	25 %	50 %	25 %	313117221
108	NC_014735	GTGA	2	8	34589	34596	25 %	25 %	50 %	0 %	313117221
109	NC_014735	TCTG	2	8	34894	34901	0 %	50 %	25 %	25 %	313117221
110	NC_014735	CTCG	2	8	35078	35085	0 %	25 %	25 %	50 %	313117221
111	NC_014735	TTCC	2	8	35625	35632	0 %	50 %	0 %	50 %	313117222
112	NC_014735	TCCA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	0 %	50 %	313117222
113	NC_014735	CAAG	2	8	36452	36459	50 %	0 %	25 %	25 %	313117223
114	NC_014735	TTGG	2	8	37397	37404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014735	ACCG	2	8	37607	37614	25 %	0 %	25 %	50 %	313117224
116	NC_014735	CCTT	2	8	38370	38377	0 %	50 %	0 %	50 %	313117224
117	NC_014735	GAAT	2	8	39052	39059	50 %	25 %	25 %	0 %	313117224
118	NC_014735	GCCG	2	8	39331	39338	0 %	0 %	50 %	50 %	313117224
119	NC_014735	AGGT	2	8	39948	39955	25 %	25 %	50 %	0 %	313117225
120	NC_014735	GCGA	2	8	40073	40080	25 %	0 %	50 %	25 %	313117225
121	NC_014735	GCCC	2	8	40099	40106	0 %	0 %	25 %	75 %	313117225
122	NC_014735	GAGC	2	8	40304	40311	25 %	0 %	50 %	25 %	313117225
123	NC_014735	GGCC	2	8	41833	41840	0 %	0 %	50 %	50 %	313117227
124	NC_014735	AGGA	2	8	41889	41896	50 %	0 %	50 %	0 %	313117227
125	NC_014735	CGGT	2	8	41920	41927	0 %	25 %	50 %	25 %	313117227
126	NC_014735	AGCG	2	8	42073	42080	25 %	0 %	50 %	25 %	313117227
127	NC_014735	GCCA	2	8	42088	42095	25 %	0 %	25 %	50 %	313117227
128	NC_014735	CTGC	2	8	42588	42595	0 %	25 %	25 %	50 %	313117227
129	NC_014735	GCGT	2	8	42912	42919	0 %	25 %	50 %	25 %	313117228
130	NC_014735	ACCA	2	8	43068	43075	50 %	0 %	0 %	50 %	313117228
131	NC_014735	GGAT	2	8	43357	43364	25 %	25 %	50 %	0 %	313117228
132	NC_014735	TGAC	2	8	44203	44210	25 %	25 %	25 %	25 %	313117229
133	NC_014735	GACG	2	8	44351	44358	25 %	0 %	50 %	25 %	313117229
134	NC_014735	GCGA	2	8	45232	45239	25 %	0 %	50 %	25 %	313117229
135	NC_014735	GAAA	2	8	45418	45425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014735	ATAG	2	8	45430	45437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014735	TCAC	2	8	45601	45608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014735	GTTT	2	8	45658	45665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014735	GGGT	2	8	45778	45785	0 %	25 %	75 %	0 %	313117230
140	NC_014735	CAGT	2	8	46304	46311	25 %	25 %	25 %	25 %	313117230
141	NC_014735	TAGA	2	8	46543	46550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014735	CGTC	2	8	47143	47150	0 %	25 %	25 %	50 %	313117231
143	NC_014735	GTCG	2	8	47152	47159	0 %	25 %	50 %	25 %	313117231
144	NC_014735	AACC	2	8	47211	47218	50 %	0 %	0 %	50 %	313117231
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