MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 5718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	CGT	2	6	276	281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
2	NC_014735	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
3	NC_014735	TCG	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
4	NC_014735	GTA	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
5	NC_014735	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117185
6	NC_014735	TTG	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117185
7	NC_014735	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
8	NC_014735	CGG	2	6	605	610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117185
9	NC_014735	GTC	3	9	714	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
10	NC_014735	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117185
11	NC_014735	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117186
12	NC_014735	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
13	NC_014735	TAC	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
14	NC_014735	TCA	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
15	NC_014735	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117186
16	NC_014735	AAG	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
17	NC_014735	GTC	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117186
18	NC_014735	AAT	2	6	1970	1975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117186
19	NC_014735	CTC	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117186
20	NC_014735	CCG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117186
21	NC_014735	CAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117186
22	NC_014735	ACA	2	6	2176	2181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014735	ATT	2	6	2454	2459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014735	AAG	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014735	GAA	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014735	TCT	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014735	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117187
28	NC_014735	TCG	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117187
29	NC_014735	TGA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117187
30	NC_014735	ACT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117187
31	NC_014735	ATT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014735	GAG	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014735	GAC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014735	ATA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014735	AGA	2	6	3721	3726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014735	TTC	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014735	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117188
38	NC_014735	GTT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
39	NC_014735	TTG	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
40	NC_014735	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014735	TTA	2	6	4527	4532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014735	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014735	AGT	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014735	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014735	CGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117189
46	NC_014735	TGC	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117189
47	NC_014735	TGG	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117189
48	NC_014735	AGT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117189
49	NC_014735	GCA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117189
50	NC_014735	GGC	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117189
51	NC_014735	AAT	2	6	5037	5042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117189
52	NC_014735	TCA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
53	NC_014735	TCA	3	9	5253	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
54	NC_014735	TTC	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117191
55	NC_014735	AAC	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117191
56	NC_014735	ACG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
57	NC_014735	CGA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
58	NC_014735	GAT	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117191
59	NC_014735	CCG	2	6	5876	5881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117191
60	NC_014735	GAG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
61	NC_014735	GAG	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
62	NC_014735	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117192
63	NC_014735	ACC	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
64	NC_014735	TCA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
65	NC_014735	TCA	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
66	NC_014735	CCA	2	6	6270	6275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
67	NC_014735	ATG	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117192
68	NC_014735	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
69	NC_014735	TCT	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117192
70	NC_014735	CGT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117192
71	NC_014735	CGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
72	NC_014735	CGA	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
73	NC_014735	CTC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117192
74	NC_014735	GGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117192
75	NC_014735	AAC	2	6	6637	6642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117192
76	NC_014735	CAT	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
77	NC_014735	TCA	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
78	NC_014735	TGG	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117193
79	NC_014735	GAA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117193
80	NC_014735	CGA	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
81	NC_014735	ATC	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
82	NC_014735	CGA	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
83	NC_014735	GCA	2	6	6945	6950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
84	NC_014735	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
85	NC_014735	CGA	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
86	NC_014735	GTC	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
87	NC_014735	CGA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
88	NC_014735	TCC	2	6	7078	7083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117193
89	NC_014735	ACA	2	6	7114	7119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117193
90	NC_014735	CGA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
91	NC_014735	CAG	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
92	NC_014735	CTT	2	6	7422	7427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014735	TCG	3	9	7718	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117195
94	NC_014735	CAG	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117195
95	NC_014735	CGA	2	6	7791	7796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117195
96	NC_014735	GAG	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117195
97	NC_014735	TTC	2	6	7865	7870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117195
98	NC_014735	GAG	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117195
99	NC_014735	TCC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014735	GTC	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014735	CTC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014735	TCC	2	6	8168	8173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014735	GAA	2	6	8205	8210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014735	TGA	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014735	ACA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117196
106	NC_014735	CAA	2	6	8423	8428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117196
107	NC_014735	GCA	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
108	NC_014735	TCA	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117196
109	NC_014735	CCT	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117196
110	NC_014735	CGC	2	6	8757	8762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117196
111	NC_014735	ATC	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117196
112	NC_014735	CGA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
113	NC_014735	CAG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
114	NC_014735	TCG	2	6	8891	8896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
115	NC_014735	TCC	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117196
116	NC_014735	TCG	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
117	NC_014735	TCG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
118	NC_014735	GCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
119	NC_014735	CGT	2	6	8952	8957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
120	NC_014735	ACC	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117196
121	NC_014735	CGG	2	6	9039	9044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
122	NC_014735	CCA	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117196
123	NC_014735	GCG	2	6	9175	9180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
124	NC_014735	TTA	2	6	9293	9298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014735	GTG	2	6	9335	9340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014735	CAG	2	6	9366	9371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014735	ACA	2	6	9438	9443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014735	GAA	2	6	9506	9511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014735	CAA	2	6	9625	9630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117197
130	NC_014735	CCG	2	6	9642	9647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117197
131	NC_014735	GAA	2	6	9671	9676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117197
132	NC_014735	AGC	2	6	9678	9683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117197
133	NC_014735	GCC	2	6	9807	9812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014735	AGC	2	6	9925	9930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
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137	NC_014735	GGT	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117198
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244	NC_014735	CCA	2	6	17503	17508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
245	NC_014735	TCC	2	6	17546	17551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
246	NC_014735	TGA	2	6	17579	17584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_014735	TCC	2	6	17586	17591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_014735	GTA	2	6	17715	17720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117206
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257	NC_014735	TCG	2	6	18441	18446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117206
258	NC_014735	GCA	2	6	18456	18461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117206
259	NC_014735	GTC	2	6	18516	18521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117206
260	NC_014735	TAC	2	6	18528	18533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117206
261	NC_014735	CGA	2	6	18665	18670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117206
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269	NC_014735	CGG	2	6	19125	19130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_014735	GCC	2	6	19194	19199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_014735	AAC	2	6	19203	19208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_014735	CAG	2	6	19799	19804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_014735	CAG	2	6	19951	19956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014735	AAG	2	6	20110	20115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_014735	AGT	3	9	21069	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_014735	GGA	2	6	27892	27897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
381	NC_014735	TTA	2	6	27923	27928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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