MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 5056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	CGT	2	6	276	281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
2	NC_014735	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
3	NC_014735	TCG	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
4	NC_014735	GTA	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
5	NC_014735	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117185
6	NC_014735	TTG	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117185
7	NC_014735	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117185
8	NC_014735	CGG	2	6	605	610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117185
9	NC_014735	GTC	3	9	714	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117185
10	NC_014735	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117185
11	NC_014735	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117186
12	NC_014735	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
13	NC_014735	TAC	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
14	NC_014735	TCA	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117186
15	NC_014735	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117186
16	NC_014735	AAG	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117186
17	NC_014735	GTC	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117186
18	NC_014735	AAT	2	6	1970	1975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117186
19	NC_014735	CTC	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117186
20	NC_014735	CCG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117186
21	NC_014735	CAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117186
22	NC_014735	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117187
23	NC_014735	TCG	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117187
24	NC_014735	TGA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117187
25	NC_014735	ACT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117187
26	NC_014735	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117188
27	NC_014735	GTT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
28	NC_014735	TTG	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117188
29	NC_014735	CGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117189
30	NC_014735	TGC	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117189
31	NC_014735	TGG	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117189
32	NC_014735	AGT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117189
33	NC_014735	GCA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117189
34	NC_014735	GGC	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117189
35	NC_014735	AAT	2	6	5037	5042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117189
36	NC_014735	TCA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
37	NC_014735	TCA	3	9	5253	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117190
38	NC_014735	TTC	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117191
39	NC_014735	AAC	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117191
40	NC_014735	ACG	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
41	NC_014735	CGA	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117191
42	NC_014735	GAT	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117191
43	NC_014735	CCG	2	6	5876	5881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117191
44	NC_014735	GAG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
45	NC_014735	GAG	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117191
46	NC_014735	AGA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117192
47	NC_014735	ACC	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
48	NC_014735	TCA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
49	NC_014735	TCA	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
50	NC_014735	CCA	2	6	6270	6275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117192
51	NC_014735	ATG	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117192
52	NC_014735	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
53	NC_014735	TCT	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117192
54	NC_014735	CGT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117192
55	NC_014735	CGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
56	NC_014735	CGA	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117192
57	NC_014735	CTC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117192
58	NC_014735	GGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117192
59	NC_014735	AAC	2	6	6637	6642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117192
60	NC_014735	CAT	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117192
61	NC_014735	TCA	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
62	NC_014735	TGG	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117193
63	NC_014735	GAA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117193
64	NC_014735	CGA	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
65	NC_014735	ATC	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117193
66	NC_014735	CGA	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
67	NC_014735	GCA	2	6	6945	6950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
68	NC_014735	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
69	NC_014735	CGA	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
70	NC_014735	GTC	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117193
71	NC_014735	CGA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117193
72	NC_014735	TCC	2	6	7078	7083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117193
73	NC_014735	ACA	2	6	7114	7119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117193
74	NC_014735	CGA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
75	NC_014735	CAG	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117194
76	NC_014735	TCG	3	9	7718	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117195
77	NC_014735	CAG	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117195
78	NC_014735	CGA	2	6	7791	7796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117195
79	NC_014735	GAG	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117195
80	NC_014735	TTC	2	6	7865	7870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117195
81	NC_014735	GAG	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117195
82	NC_014735	ACA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117196
83	NC_014735	CAA	2	6	8423	8428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117196
84	NC_014735	GCA	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
85	NC_014735	TCA	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117196
86	NC_014735	CCT	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117196
87	NC_014735	CGC	2	6	8757	8762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117196
88	NC_014735	ATC	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117196
89	NC_014735	CGA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
90	NC_014735	CAG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117196
91	NC_014735	TCG	2	6	8891	8896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
92	NC_014735	TCC	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117196
93	NC_014735	TCG	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
94	NC_014735	TCG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
95	NC_014735	GCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
96	NC_014735	CGT	2	6	8952	8957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117196
97	NC_014735	ACC	2	6	9023	9028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117196
98	NC_014735	CGG	2	6	9039	9044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
99	NC_014735	CCA	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117196
100	NC_014735	GCG	2	6	9175	9180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117196
101	NC_014735	CAA	2	6	9625	9630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117197
102	NC_014735	CCG	2	6	9642	9647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117197
103	NC_014735	GAA	2	6	9671	9676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117197
104	NC_014735	AGC	2	6	9678	9683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117197
105	NC_014735	AGC	2	6	9925	9930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
106	NC_014735	TGC	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117198
107	NC_014735	CGA	2	6	9969	9974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
108	NC_014735	GGT	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117198
109	NC_014735	CGA	2	6	10032	10037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
110	NC_014735	ACC	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117198
111	NC_014735	TCA	2	6	10062	10067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117198
112	NC_014735	GCA	2	6	10092	10097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
113	NC_014735	ACG	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117198
114	NC_014735	CCG	2	6	10930	10935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117199
115	NC_014735	TCT	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117199
116	NC_014735	ACA	2	6	11287	11292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117199
117	NC_014735	GAC	2	6	11327	11332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117199
118	NC_014735	TTC	2	6	11366	11371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117199
119	NC_014735	ATC	2	6	11402	11407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117199
120	NC_014735	ACT	2	6	11530	11535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117199
121	NC_014735	CGT	2	6	11780	11785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117200
122	NC_014735	CTT	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117200
123	NC_014735	CGT	2	6	11812	11817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117200
124	NC_014735	GTA	2	6	11825	11830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117200
125	NC_014735	TCG	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117200
126	NC_014735	CGT	2	6	11900	11905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117200
127	NC_014735	AGC	2	6	11910	11915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117200
128	NC_014735	GAT	2	6	12012	12017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117201
129	NC_014735	CGA	2	6	12119	12124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117201
130	NC_014735	CGA	2	6	12135	12140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117201
131	NC_014735	CTT	2	6	12170	12175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117201
132	NC_014735	CGG	2	6	12180	12185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117201
133	NC_014735	AGA	2	6	12186	12191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117201
134	NC_014735	GAG	2	6	12271	12276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117201
135	NC_014735	GGC	2	6	12313	12318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117201
136	NC_014735	AGC	2	6	12331	12336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117201
137	NC_014735	CGC	2	6	12378	12383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117201
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141	NC_014735	TCG	2	6	12635	12640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117201
142	NC_014735	GCG	2	6	12654	12659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117201
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149	NC_014735	CGT	2	6	13159	13164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117202
150	NC_014735	CGC	2	6	13174	13179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117202
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153	NC_014735	GGA	2	6	14664	14669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117203
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159	NC_014735	ATC	2	6	14911	14916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117203
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161	NC_014735	CTG	2	6	14998	15003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117203
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189	NC_014735	GCG	2	6	16627	16632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117204
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238	NC_014735	GGA	2	6	22364	22369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117210
239	NC_014735	AGT	2	6	22452	22457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117210
240	NC_014735	GCC	2	6	22512	22517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117210
241	NC_014735	ACG	2	6	22519	22524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117210
242	NC_014735	GAA	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117210
243	NC_014735	CGA	2	6	22667	22672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117210
244	NC_014735	CTC	2	6	22686	22691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117210
245	NC_014735	CGA	2	6	22701	22706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117210
246	NC_014735	GGA	2	6	22804	22809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117211
247	NC_014735	CGA	2	6	22948	22953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117211
248	NC_014735	CGT	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117211
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250	NC_014735	GGA	2	6	23213	23218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117211
251	NC_014735	TGG	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117211
252	NC_014735	CGA	2	6	23329	23334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117211
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374	NC_014735	ATA	2	6	34271	34276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117221
375	NC_014735	AGG	2	6	34282	34287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117221
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377	NC_014735	GAC	3	9	34547	34555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117221
378	NC_014735	GAC	2	6	34574	34579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117221
379	NC_014735	GAG	2	6	34637	34642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117221
380	NC_014735	GAA	2	6	34645	34650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117221
381	NC_014735	CCG	2	6	34755	34760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117221
382	NC_014735	GTC	2	6	34778	34783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117221
383	NC_014735	GAG	2	6	34820	34825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117221
384	NC_014735	GTC	2	6	34862	34867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117221
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386	NC_014735	GGC	2	6	35049	35054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117221
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398	NC_014735	CGA	2	6	35805	35810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117222
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402	NC_014735	GAC	2	6	36055	36060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117222
403	NC_014735	TTC	2	6	36095	36100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117222
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479	NC_014735	TGA	2	6	41064	41069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117226
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482	NC_014735	CGA	2	6	41115	41120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117226
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484	NC_014735	GAC	2	6	41206	41211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117226
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489	NC_014735	GTC	2	6	41425	41430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117226
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491	NC_014735	CGG	2	6	41515	41520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117226
492	NC_014735	GAA	2	6	41526	41531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117226
493	NC_014735	CGA	2	6	41589	41594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117226
494	NC_014735	GTC	2	6	41674	41679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117226
495	NC_014735	AGT	2	6	41687	41692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117226
496	NC_014735	CCA	2	6	41807	41812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117227
497	NC_014735	CAC	2	6	41827	41832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117227
498	NC_014735	ATA	2	6	41949	41954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117227
499	NC_014735	TGA	2	6	41986	41991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117227
500	NC_014735	TTC	2	6	42035	42040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117227

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