MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Paludibacter propionicigenes WB4 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014734	AAAATT	2	12	29763	29774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014734	AATTCA	2	12	45582	45593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014734	ATGCGA	2	12	57147	57158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014734	AATTTA	2	12	89554	89565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014734	ATTTTT	2	12	134668	134679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014734	TAACAT	2	12	154240	154251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014734	TAAAAT	2	12	175704	175715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014734	AAAGCG	2	12	192768	192779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014734	AAGCGA	2	12	194880	194891	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014734	AGAATG	2	12	197825	197836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014734	GTAGTT	2	12	225421	225432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014734	TCGGTT	2	12	231250	231261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014734	TAAGAC	2	12	232483	232494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014734	TGTTGG	2	12	254319	254330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014734	ATATTT	2	12	298843	298854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014734	AGTTAT	2	12	318352	318363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014734	TTTTGA	2	12	326954	326965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014734	AAATAC	2	12	343819	343830	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014734	TTCAAT	2	12	344976	344987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014734	TTTAAA	2	12	351107	351118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014734	TGTTTA	2	12	358483	358494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014734	TGCTTT	2	12	414158	414169	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014734	TTATAA	2	12	431633	431644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014734	TGATTA	2	12	436866	436877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014734	TAAATA	2	12	436907	436918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014734	GATAAA	2	12	450654	450665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014734	CTATAA	2	12	468218	468229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014734	TTTTTG	2	12	527566	527577	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014734	ATGTTT	2	12	527732	527743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014734	AAAGGA	2	12	561119	561130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014734	TTAGTA	2	12	614264	614275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014734	ATAAAA	2	12	614319	614330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014734	TGAAAA	2	12	686180	686191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014734	AGAAAA	2	12	690170	690181	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014734	GGGTAG	2	12	747888	747899	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014734	TTTATT	2	12	749310	749321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014734	GCCCAT	2	12	768233	768244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014734	TATTTC	2	12	770044	770055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014734	CAGAAA	2	12	776093	776104	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014734	TAAAAT	2	12	778838	778849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014734	TCTATT	2	12	794569	794580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014734	GTACAT	2	12	795199	795210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014734	ACTGAC	2	12	803481	803492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014734	AAAAAT	2	12	819822	819833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014734	ATAGGT	2	12	879793	879804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014734	TATACC	2	12	892616	892627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014734	TTCATT	2	12	1003190	1003201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014734	GAAAAA	2	12	1004410	1004421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014734	AAACAA	2	12	1013671	1013682	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014734	ATTCTA	2	12	1025905	1025916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014734	CATGAA	2	12	1061110	1061121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014734	TAATTA	2	12	1065462	1065473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014734	AATTTT	2	12	1073759	1073770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014734	CCTTTT	2	12	1082591	1082602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014734	AACTCA	2	12	1086695	1086706	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014734	TGCCCC	2	12	1095883	1095894	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014734	TAGAAA	2	12	1140909	1140920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014734	AATTTA	2	12	1177662	1177673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014734	TTATAC	2	12	1209974	1209985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014734	ACTTTT	2	12	1222737	1222748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014734	TATCAT	2	12	1239581	1239592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014734	AAACGG	2	12	1267676	1267687	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014734	GAATTT	2	12	1277028	1277039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014734	ATCACT	2	12	1327083	1327094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014734	TTCATA	2	12	1327128	1327139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014734	TTTAAA	2	12	1328629	1328640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014734	AGAATA	2	12	1330822	1330833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014734	AACAAT	2	12	1355362	1355373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014734	TATTCA	2	12	1379747	1379758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014734	ATATTT	2	12	1382173	1382184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014734	ATTTTC	2	12	1382545	1382556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014734	TCGCTT	2	12	1437372	1437383	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014734	CGCTTT	2	12	1439484	1439495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014734	ATTGAA	2	12	1441391	1441402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014734	TTTAAA	2	12	1485223	1485234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014734	TTGATT	2	12	1536234	1536245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014734	ATTTTC	2	12	1546351	1546362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014734	GTTTAT	2	12	1579810	1579821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014734	TTGAAT	2	12	1600246	1600257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014734	AGATAA	2	12	1631078	1631089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014734	AAAAAT	2	12	1653353	1653364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014734	CTTCAT	2	12	1664920	1664931	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014734	TATAAA	2	12	1694710	1694721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014734	AAAATA	2	12	1714545	1714556	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014734	TTTCTA	2	12	1772320	1772331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014734	CAGAAG	2	12	1776092	1776103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014734	TTTATC	2	12	1778462	1778473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014734	TTCATT	2	12	1800478	1800489	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014734	AAAGTA	2	12	1806647	1806658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014734	AAAATA	2	12	1806659	1806670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014734	CAAAAG	2	12	1817632	1817643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014734	TACAAA	2	12	1817672	1817683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014734	CTACTT	2	12	1823691	1823702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014734	TTTTCA	2	12	1839978	1839989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014734	CTTTTT	2	12	1857186	1857197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014734	AACAAT	2	12	1877882	1877893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014734	TCTCTT	2	12	1904602	1904613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014734	GTTATT	2	12	1906233	1906244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014734	AACATA	2	12	1906352	1906363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014734	TTTCAA	2	12	1908431	1908442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014734	TTGGTA	2	12	1922630	1922641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014734	TTAATT	2	12	1968470	1968481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014734	CAATAA	2	12	2051938	2051949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014734	AAAATT	2	12	2059343	2059354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014734	AAATTT	2	12	2076135	2076146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014734	TTAAAA	2	12	2077003	2077014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014734	TAATTC	2	12	2086842	2086853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014734	TATTTG	2	12	2129535	2129546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014734	TTTTAA	2	12	2129786	2129797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014734	AAATAT	2	12	2140242	2140253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014734	TTTTCA	2	12	2189890	2189901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014734	AAATAA	2	12	2241647	2241658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014734	AAATAT	2	12	2247330	2247341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014734	TTAATC	2	12	2267047	2267058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014734	ATTTTA	2	12	2275413	2275424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014734	TCGCTT	2	12	2293826	2293837	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014734	CGCTTT	2	12	2295937	2295948	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014734	TGCAAC	2	12	2304882	2304893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014734	TGCATT	2	12	2328076	2328087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014734	TCTTTT	2	12	2343105	2343116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014734	ATTCCG	2	12	2375548	2375559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014734	GTTTTG	2	12	2375660	2375671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014734	AGGATT	2	12	2376156	2376167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014734	TCCCCA	2	12	2381888	2381899	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014734	TATTCC	2	12	2394029	2394040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014734	TGTTAC	2	12	2422723	2422734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014734	ATTTAA	2	12	2424818	2424829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014734	AAGAAA	2	12	2459383	2459394	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014734	TATTTT	2	12	2472528	2472539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014734	TTGAGA	2	12	2500139	2500150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014734	AAAAAG	2	12	2504918	2504929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014734	TTTACA	2	12	2506235	2506246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014734	TTAAAT	2	12	2526523	2526534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014734	TTTAAA	2	12	2538748	2538759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014734	ATAAAA	2	12	2540916	2540927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014734	CTGTTC	2	12	2542864	2542875	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014734	ATGAAA	2	12	2578292	2578303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014734	ATTTAA	2	12	2593385	2593396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014734	AAGTAA	2	12	2616239	2616250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014734	AAATTG	2	12	2623316	2623327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014734	TTCTTT	2	12	2676213	2676224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014734	ATAAAA	2	12	2728753	2728764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014734	TTTGCT	2	12	2737426	2737437	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014734	CGTAAA	2	12	2759489	2759500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014734	TTTTGT	2	12	2777754	2777765	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014734	AGCTAA	2	12	2787399	2787410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_014734	AAACAG	2	12	2840203	2840214	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_014734	CTGTTT	2	12	2840235	2840246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014734	TAAAGA	2	12	2847393	2847404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014734	TCTTTT	2	12	2887125	2887136	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014734	AAAAGA	2	12	2904493	2904504	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014734	GTCGAA	2	12	2917796	2917807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_014734	GTATTT	2	12	2919074	2919085	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014734	TAAAAA	2	12	2942123	2942134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014734	TTTTTC	2	12	3054636	3054647	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014734	GCTGTT	2	12	3066899	3066910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014734	ATAGTA	2	12	3100318	3100329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014734	GTCTTA	2	12	3100388	3100399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_014734	TAACTG	2	12	3107923	3107934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_014734	TTTTAT	2	12	3116278	3116289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014734	TTTTTA	2	12	3131621	3131632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014734	GTGCTT	2	12	3168699	3168710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_014734	TTAATT	2	12	3179461	3179472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014734	ATTGTT	2	12	3195430	3195441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014734	AAAATG	2	12	3200021	3200032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014734	CATTGA	2	12	3221077	3221088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_014734	TATAAA	2	12	3253805	3253816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014734	ATTTCA	2	12	3264977	3264988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_014734	ATTCAA	2	12	3362639	3362650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_014734	AAAAGT	2	12	3368127	3368138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014734	CATTTT	2	12	3403445	3403456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_014734	TCATTT	2	12	3422458	3422469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_014734	GCAAAA	2	12	3443231	3443242	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_014734	TTTTCT	2	12	3474344	3474355	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_014734	AAAACA	2	12	3492303	3492314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
176	NC_014734	TGAAAA	2	12	3572489	3572500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014734	TTTAAA	2	12	3574611	3574622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014734	ATCAAA	2	12	3594413	3594424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_014734	AGAAAT	2	12	3607608	3607619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014734	ATAGAT	2	12	3633839	3633850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014734	TATTCA	2	12	3639553	3639564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.