MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylovorus sp. MP688 chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014733	GATAGG	2	12	72958	72969	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014733	TGCATT	2	12	86607	86618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014733	GATAGC	2	12	89173	89184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014733	AATTAA	2	12	127413	127424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014733	TCATGC	2	12	130657	130668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014733	CAAAAG	2	12	182811	182822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014733	ATCTTT	2	12	209333	209344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014733	GGCCAG	2	12	243898	243909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014733	GGCCCA	2	12	258587	258598	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014733	GAGGGG	2	12	266867	266878	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014733	TTACGG	2	12	375247	375258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014733	TCGCAG	2	12	385091	385102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014733	AGCTTG	2	12	506440	506451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014733	TTGGGG	2	12	540249	540260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014733	AATCCG	2	12	630338	630349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014733	AAGAAA	2	12	751306	751317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014733	GCCCCA	2	12	764720	764731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014733	TTTTAT	2	12	767274	767285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014733	GTACTG	2	12	844004	844015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014733	TGCCAG	2	12	961902	961913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014733	CTTTTT	2	12	980960	980971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014733	GATAAA	2	12	1059523	1059534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014733	CATCAA	2	12	1085729	1085740	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014733	GTGGTT	2	12	1099099	1099110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014733	TAAGGG	2	12	1215937	1215948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014733	TAAGGA	2	12	1233851	1233862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014733	TTATTT	2	12	1288453	1288464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014733	ATGGGT	2	12	1296883	1296894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014733	CAAGCG	2	12	1449350	1449361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014733	ACGATG	2	12	1468036	1468047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014733	CTGCCT	2	12	1579196	1579207	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014733	CAGCAA	2	12	1579479	1579490	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014733	CCCTCT	2	12	1580090	1580101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014733	TAAGCC	2	12	1581825	1581836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014733	TCTCAT	2	12	1587845	1587856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014733	AGTGGC	2	12	1620492	1620503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014733	GCTTTT	2	12	1631001	1631012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014733	GGGCTG	2	12	1686856	1686867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014733	TCCTTT	2	12	1733818	1733829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014733	AAGAAC	2	12	1743987	1743998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014733	ATCATT	2	12	1749134	1749145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014733	GTTTTT	2	12	1769664	1769675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014733	AGTGTG	2	12	1887887	1887898	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014733	CTGGTT	2	12	1946159	1946170	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014733	TCATGA	2	12	1982399	1982410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014733	CGCACA	2	12	2045412	2045423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014733	ACTTGA	2	12	2059456	2059467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014733	TATGCA	2	12	2137288	2137299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014733	AATATA	2	12	2174164	2174175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014733	GCTCAA	2	12	2384678	2384689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014733	AACCCC	2	12	2507846	2507857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014733	CTGCGC	2	12	2577568	2577579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014733	AAAGGC	2	12	2577720	2577731	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014733	GCTGGC	2	12	2659804	2659815	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014733	CGGCCA	2	12	2735523	2735534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014733	ATTGGC	2	12	2735858	2735869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014733	GCCTGC	2	12	2736033	2736044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014733	GCTGCG	2	12	2736416	2736427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014733	TCAGGA	2	12	2736570	2736581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014733	TGAGGC	2	12	2739604	2739615	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014733	TGCTTA	2	12	2766652	2766663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014733	TGAACG	2	12	2813445	2813456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.