MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014732	CGAGA	2	10	12459	12468	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014732	ACTGA	2	10	18643	18652	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014732	TCGGT	2	10	47278	47287	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014732	GTGTT	2	10	50694	50703	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014732	CTAAT	2	10	53943	53952	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014732	AACGA	2	10	75451	75460	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014732	CCCGA	2	10	104459	104468	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014732	CTCGT	2	10	114305	114314	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014732	CCCCG	2	10	116561	116570	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_014732	CACGC	2	10	116663	116672	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014732	GACAC	2	10	117820	117829	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014732	TCTCG	2	10	127587	127596	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014732	GCTTT	2	10	131849	131858	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014732	CCGCG	2	10	135566	135575	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014732	GATAA	2	10	136743	136752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014732	CGTCG	2	10	149167	149176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014732	TTGAA	2	10	149573	149582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014732	TTGAA	2	10	160535	160544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014732	ACTCT	2	10	172435	172444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014732	CGTCG	2	10	174567	174576	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014732	AGTAT	2	10	188044	188053	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.