MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014732	CG	3	6	1222	1227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014732	TC	3	6	8951	8956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014732	GT	3	6	9037	9042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014732	CA	3	6	9077	9082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014732	CA	3	6	15779	15784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014732	AC	3	6	26515	26520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014732	CG	3	6	29092	29097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014732	TG	3	6	33582	33587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014732	TC	3	6	34028	34033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014732	AC	3	6	35462	35467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014732	GT	3	6	40220	40225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014732	AC	3	6	40235	40240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014732	CT	3	6	41024	41029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014732	GA	3	6	44723	44728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014732	TA	3	6	44800	44805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014732	AT	3	6	45178	45183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014732	AC	3	6	45903	45908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014732	GA	3	6	45953	45958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014732	AG	3	6	46791	46796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014732	TA	3	6	47232	47237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014732	AC	3	6	47583	47588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014732	TA	3	6	47619	47624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014732	AG	3	6	48253	48258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014732	TG	3	6	50447	50452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014732	TC	3	6	50602	50607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014732	GC	4	8	50731	50738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014732	GA	3	6	54100	54105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014732	GA	3	6	55065	55070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014732	AC	3	6	55091	55096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014732	CG	4	8	55292	55299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014732	CG	3	6	55889	55894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014732	GA	3	6	60073	60078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014732	AC	3	6	65295	65300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014732	AG	3	6	70613	70618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014732	AG	3	6	70653	70658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014732	TA	3	6	79132	79137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014732	AC	4	8	79149	79156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014732	GT	3	6	79324	79329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014732	GT	3	6	79440	79445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014732	GA	3	6	79657	79662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014732	CT	3	6	80006	80011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014732	GT	3	6	80043	80048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014732	GA	3	6	80261	80266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014732	GC	3	6	80738	80743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014732	TC	3	6	81538	81543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014732	CT	3	6	86906	86911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014732	TC	3	6	86915	86920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014732	TC	3	6	87551	87556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014732	AT	3	6	87572	87577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014732	AT	3	6	87591	87596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014732	CT	3	6	87681	87686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014732	AT	3	6	88365	88370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014732	TG	3	6	91772	91777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014732	TC	3	6	91944	91949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014732	TC	3	6	92058	92063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014732	AT	3	6	92305	92310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014732	CT	3	6	99612	99617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014732	CT	3	6	99719	99724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014732	TC	3	6	99744	99749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014732	TA	4	8	99823	99830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014732	GT	3	6	103928	103933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014732	CT	3	6	104000	104005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014732	CG	3	6	104435	104440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014732	GA	3	6	107302	107307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014732	TC	3	6	107361	107366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014732	TC	3	6	109467	109472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014732	AT	3	6	110425	110430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014732	AC	3	6	110628	110633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014732	CT	3	6	114372	114377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014732	CT	3	6	116234	116239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014732	TG	3	6	117717	117722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014732	AC	3	6	117771	117776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014732	GC	3	6	117888	117893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014732	TC	3	6	121364	121369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014732	TG	3	6	121483	121488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014732	TC	3	6	124501	124506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014732	AC	3	6	124567	124572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014732	TC	3	6	127673	127678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014732	CG	3	6	130519	130524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014732	CA	3	6	130542	130547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014732	GA	3	6	135542	135547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014732	TC	3	6	136718	136723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014732	TG	3	6	137389	137394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014732	AC	3	6	138131	138136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014732	TG	3	6	143494	143499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014732	TG	3	6	143580	143585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014732	CG	3	6	144765	144770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014732	TC	3	6	146435	146440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014732	TA	3	6	146974	146979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014732	AT	3	6	147306	147311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014732	GA	3	6	149153	149158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014732	AG	3	6	149177	149182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014732	TG	3	6	149184	149189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014732	AT	3	6	149511	149516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014732	TG	3	6	151799	151804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014732	TC	3	6	151836	151841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014732	CT	3	6	160033	160038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014732	CT	4	8	168088	168095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014732	GA	3	6	168096	168101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014732	GA	4	8	169340	169347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014732	TC	3	6	171591	171596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014732	CA	4	8	171720	171727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014732	GA	3	6	171781	171786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014732	GT	3	6	172159	172164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014732	CA	3	6	172669	172674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014732	TG	3	6	172709	172714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014732	TG	3	6	174627	174632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014732	TC	5	10	174650	174659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014732	GT	3	6	174676	174681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014732	AG	3	6	174791	174796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014732	GA	3	6	177718	177723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014732	CG	3	6	177790	177795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014732	CT	3	6	179318	179323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014732	AG	3	6	179346	179351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014732	GC	3	6	179537	179542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014732	AG	3	6	180274	180279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014732	CA	4	8	182859	182866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014732	AT	3	6	185028	185033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014732	AT	3	6	188058	188063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014732	TG	5	10	193528	193537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014732	GT	3	6	194815	194820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.