MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	CCATC	2	10	1266	1275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014731	CGATC	2	10	15554	15563	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014731	ACAGC	2	10	27740	27749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014731	CAACA	2	10	29484	29493	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014731	AACGT	2	10	46740	46749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014731	GATGA	2	10	47723	47732	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014731	TATCA	2	10	48496	48505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014731	AATTA	2	10	54621	54630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014731	GAGTA	2	10	57599	57608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014731	CGTTC	2	10	57875	57884	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014731	CGCGT	2	10	65915	65924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014731	CAAAT	2	10	77098	77107	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014731	TCGAA	2	10	88374	88383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014731	GGCTT	2	10	88584	88593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014731	GCGGG	2	10	105629	105638	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014731	CATCG	2	10	108123	108132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014731	TCGAA	2	10	122730	122739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014731	TAGAT	2	10	123203	123212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014731	GGTGA	2	10	128089	128098	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014731	CTGTC	2	10	133113	133122	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014731	GTCTC	3	15	141673	141687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014731	GTCTT	2	10	141688	141697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014731	GTCTC	2	10	141698	141707	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014731	CGTCG	2	10	142851	142860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014731	GACGA	2	10	142970	142979	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014731	GAGAG	2	10	153140	153149	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014731	GAGAG	2	10	153182	153191	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014731	TGCTG	2	10	166125	166134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014731	GTGGG	2	10	168809	168818	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014731	GTGGG	2	10	169175	169184	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014731	CACCC	2	10	170655	170664	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_014731	CCACC	2	10	170669	170678	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_014731	TGTCT	2	10	174918	174927	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014731	CTCGG	2	10	193616	193625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014731	AGATC	2	10	195347	195356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014731	CGAAG	2	10	199680	199689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014731	CAGTT	2	10	204084	204093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014731	ATCCA	2	10	205163	205172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014731	TCCCG	2	10	210215	210224	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014731	CTCAC	2	10	230318	230327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014731	CGTCT	2	10	234782	234791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014731	TTAGA	2	10	239279	239288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014731	TCCTT	2	10	242016	242025	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014731	CGAGT	2	10	259150	259159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014731	GACAT	2	10	259938	259947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014731	ACCGT	2	10	261576	261585	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014731	CCGTA	22	110	264269	264378	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014731	CTCGA	2	10	274634	274643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014731	GGCCG	2	10	283552	283561	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014731	CCGTT	2	10	283661	283670	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014731	GTTAA	2	10	302669	302678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014731	TCGAG	2	10	303590	303599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014731	AACTC	2	10	303668	303677	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014731	GGCTG	2	10	303738	303747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014731	CTTGT	2	10	311164	311173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014731	GAATA	2	10	313814	313823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014731	TCTTT	2	10	327163	327172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014731	CATTC	2	10	330248	330257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014731	TCGAT	2	10	330728	330737	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014731	GATTG	2	10	330936	330945	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014731	CCAAT	2	10	333840	333849	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014731	GAAAC	2	10	333947	333956	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014731	GAGAA	2	10	333990	333999	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014731	AATTG	2	10	335402	335411	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.