MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	TAGT	2	8	132	139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014731	TAAA	2	8	193	200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014731	AGCA	3	12	1284	1295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014731	CTTT	2	8	1374	1381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014731	TTCG	2	8	1559	1566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014731	AAAG	2	8	3010	3017	75 %	0 %	25 %	0 %	313116829
7	NC_014731	ATCT	2	8	3712	3719	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
8	NC_014731	GCGA	2	8	4216	4223	25 %	0 %	50 %	25 %	313116830
9	NC_014731	ATCT	2	8	4638	4645	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
10	NC_014731	TGCT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	25 %	25 %	313116831
11	NC_014731	TAGT	2	8	6659	6666	25 %	50 %	25 %	0 %	313116831
12	NC_014731	AGCG	2	8	6765	6772	25 %	0 %	50 %	25 %	313116831
13	NC_014731	GAAC	2	8	7254	7261	50 %	0 %	25 %	25 %	313116831
14	NC_014731	CCGA	2	8	8190	8197	25 %	0 %	25 %	50 %	313116832
15	NC_014731	CAGT	2	8	8306	8313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014731	CCGA	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	313116833
17	NC_014731	TGAC	2	8	8623	8630	25 %	25 %	25 %	25 %	313116833
18	NC_014731	TGAC	2	8	8646	8653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014731	GACG	2	8	8951	8958	25 %	0 %	50 %	25 %	313116834
20	NC_014731	ACGG	2	8	9146	9153	25 %	0 %	50 %	25 %	313116834
21	NC_014731	CCGG	2	8	9842	9849	0 %	0 %	50 %	50 %	313116834
22	NC_014731	GCCT	2	8	10191	10198	0 %	25 %	25 %	50 %	313116834
23	NC_014731	TTGC	2	8	10299	10306	0 %	50 %	25 %	25 %	313116834
24	NC_014731	CCAG	2	8	10700	10707	25 %	0 %	25 %	50 %	313116834
25	NC_014731	AACC	2	8	10934	10941	50 %	0 %	0 %	50 %	313116835
26	NC_014731	CAGC	2	8	10963	10970	25 %	0 %	25 %	50 %	313116835
27	NC_014731	TTCT	2	8	11083	11090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014731	AGAA	2	8	11257	11264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014731	AGTG	2	8	11408	11415	25 %	25 %	50 %	0 %	313116836
30	NC_014731	ACGG	2	8	11460	11467	25 %	0 %	50 %	25 %	313116836
31	NC_014731	ACGA	2	8	12057	12064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014731	GCGG	2	8	14063	14070	0 %	0 %	75 %	25 %	313116837
33	NC_014731	GGCT	2	8	14718	14725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014731	GTGG	2	8	15078	15085	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014731	ACTA	2	8	15190	15197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014731	ATAG	2	8	15253	15260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014731	TCCC	2	8	15882	15889	0 %	25 %	0 %	75 %	313116838
38	NC_014731	CAAC	2	8	16098	16105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014731	AGCG	2	8	16311	16318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014731	CCAA	2	8	16368	16375	50 %	0 %	0 %	50 %	313116839
41	NC_014731	GACA	2	8	16579	16586	50 %	0 %	25 %	25 %	313116839
42	NC_014731	TCGA	2	8	16669	16676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014731	TAGT	2	8	16977	16984	25 %	50 %	25 %	0 %	313116841
44	NC_014731	CCCA	2	8	17088	17095	25 %	0 %	0 %	75 %	313116841
45	NC_014731	AACT	2	8	17661	17668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014731	CGAC	2	8	18041	18048	25 %	0 %	25 %	50 %	313116842
47	NC_014731	GACC	2	8	18203	18210	25 %	0 %	25 %	50 %	313116842
48	NC_014731	AGGC	2	8	18694	18701	25 %	0 %	50 %	25 %	313116843
49	NC_014731	CTGG	2	8	19104	19111	0 %	25 %	50 %	25 %	313116843
50	NC_014731	GCCG	2	8	19561	19568	0 %	0 %	50 %	50 %	313116843
51	NC_014731	TCGA	2	8	19864	19871	25 %	25 %	25 %	25 %	313116843
52	NC_014731	GGGC	2	8	20091	20098	0 %	0 %	75 %	25 %	313116843
53	NC_014731	CGTC	2	8	20545	20552	0 %	25 %	25 %	50 %	313116844
54	NC_014731	CGGC	2	8	20860	20867	0 %	0 %	50 %	50 %	313116844
55	NC_014731	CGTC	2	8	21478	21485	0 %	25 %	25 %	50 %	313116844
56	NC_014731	CGTG	2	8	21654	21661	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
57	NC_014731	CGGT	2	8	21767	21774	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
58	NC_014731	GCTG	2	8	21812	21819	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
59	NC_014731	TTCG	2	8	23220	23227	0 %	50 %	25 %	25 %	313116845
60	NC_014731	GCGA	2	8	23672	23679	25 %	0 %	50 %	25 %	313116845
61	NC_014731	CGGT	2	8	23810	23817	0 %	25 %	50 %	25 %	313116845
62	NC_014731	GCAC	2	8	24152	24159	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
63	NC_014731	CGCA	2	8	24213	24220	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
64	NC_014731	GCCA	2	8	24550	24557	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
65	NC_014731	TCGT	2	8	24935	24942	0 %	50 %	25 %	25 %	313116845
66	NC_014731	TCGC	2	8	24998	25005	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
67	NC_014731	GCCA	2	8	25109	25116	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
68	NC_014731	CGCT	2	8	25698	25705	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
69	NC_014731	GATC	2	8	26067	26074	25 %	25 %	25 %	25 %	313116845
70	NC_014731	TGGA	2	8	26257	26264	25 %	25 %	50 %	0 %	313116845
71	NC_014731	TCCG	2	8	26731	26738	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
72	NC_014731	GACG	2	8	26839	26846	25 %	0 %	50 %	25 %	313116845
73	NC_014731	TGGC	2	8	27488	27495	0 %	25 %	50 %	25 %	313116846
74	NC_014731	GTTT	2	8	27876	27883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014731	AATC	2	8	28048	28055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014731	TGAC	2	8	28808	28815	25 %	25 %	25 %	25 %	313116847
77	NC_014731	GTAG	2	8	29368	29375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014731	GCAG	2	8	29852	29859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014731	GACG	2	8	30404	30411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014731	TCCA	2	8	31357	31364	25 %	25 %	0 %	50 %	313116849
81	NC_014731	GTCC	2	8	32245	32252	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
82	NC_014731	GTGG	2	8	32361	32368	0 %	25 %	75 %	0 %	313116850
83	NC_014731	TCCG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
84	NC_014731	AGGA	2	8	33138	33145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014731	CGTC	2	8	33554	33561	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
86	NC_014731	CTGC	2	8	33800	33807	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
87	NC_014731	ACGA	2	8	33903	33910	50 %	0 %	25 %	25 %	313116852
88	NC_014731	CAAA	2	8	34537	34544	75 %	0 %	0 %	25 %	313116853
89	NC_014731	GCCA	2	8	34592	34599	25 %	0 %	25 %	50 %	313116853
90	NC_014731	TGAC	2	8	34674	34681	25 %	25 %	25 %	25 %	313116853
91	NC_014731	GACA	2	8	34724	34731	50 %	0 %	25 %	25 %	313116853
92	NC_014731	CGCT	2	8	34828	34835	0 %	25 %	25 %	50 %	313116853
93	NC_014731	TTGG	2	8	34915	34922	0 %	50 %	50 %	0 %	313116853
94	NC_014731	GTGA	2	8	35145	35152	25 %	25 %	50 %	0 %	313116853
95	NC_014731	TTGC	2	8	35209	35216	0 %	50 %	25 %	25 %	313116853
96	NC_014731	AGTG	2	8	35576	35583	25 %	25 %	50 %	0 %	313116853
97	NC_014731	CGGA	2	8	37279	37286	25 %	0 %	50 %	25 %	313116854
98	NC_014731	ACGG	2	8	37417	37424	25 %	0 %	50 %	25 %	313116854
99	NC_014731	AGGG	2	8	38519	38526	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014731	CGTT	2	8	38564	38571	0 %	50 %	25 %	25 %	313116856
101	NC_014731	CGAA	2	8	38994	39001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014731	ACAT	2	8	39050	39057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014731	ATTT	2	8	39841	39848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014731	TCAC	2	8	40261	40268	25 %	25 %	0 %	50 %	313116858
105	NC_014731	TGAG	2	8	40512	40519	25 %	25 %	50 %	0 %	313116858
106	NC_014731	CCGA	2	8	40793	40800	25 %	0 %	25 %	50 %	313116859
107	NC_014731	CGGA	2	8	41021	41028	25 %	0 %	50 %	25 %	313116859
108	NC_014731	CACT	2	8	41740	41747	25 %	25 %	0 %	50 %	313116860
109	NC_014731	TCCA	2	8	43207	43214	25 %	25 %	0 %	50 %	313116861
110	NC_014731	CGAA	2	8	43556	43563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014731	TCAC	2	8	44580	44587	25 %	25 %	0 %	50 %	313116864
112	NC_014731	CAGC	2	8	45727	45734	25 %	0 %	25 %	50 %	313116864
113	NC_014731	AGAT	2	8	45856	45863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014731	AGAT	2	8	45917	45924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014731	ATCG	2	8	46519	46526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014731	GATA	2	8	46626	46633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014731	GCGG	2	8	47242	47249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014731	GTTC	2	8	47480	47487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014731	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014731	AACT	2	8	48645	48652	50 %	25 %	0 %	25 %	313116865
121	NC_014731	CTGA	2	8	48955	48962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014731	TCCG	2	8	49523	49530	0 %	25 %	25 %	50 %	313116866
123	NC_014731	CTGG	2	8	49675	49682	0 %	25 %	50 %	25 %	313116866
124	NC_014731	GGAT	2	8	49873	49880	25 %	25 %	50 %	0 %	313116866
125	NC_014731	CTAT	2	8	50082	50089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014731	CGAA	2	8	50204	50211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014731	GTGA	2	8	50304	50311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014731	CAGT	2	8	50386	50393	25 %	25 %	25 %	25 %	313116867
129	NC_014731	CTCG	2	8	50539	50546	0 %	25 %	25 %	50 %	313116867
130	NC_014731	TCGC	2	8	50609	50616	0 %	25 %	25 %	50 %	313116867
131	NC_014731	GTCG	2	8	50733	50740	0 %	25 %	50 %	25 %	313116867
132	NC_014731	CAGC	2	8	51072	51079	25 %	0 %	25 %	50 %	313116867
133	NC_014731	GTCG	2	8	51362	51369	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
134	NC_014731	GTCG	2	8	51422	51429	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
135	NC_014731	GACA	2	8	51515	51522	50 %	0 %	25 %	25 %	313116868
136	NC_014731	CCGT	2	8	51840	51847	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
137	NC_014731	CGCT	2	8	52146	52153	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
138	NC_014731	CTCG	2	8	52454	52461	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
139	NC_014731	CGAG	2	8	52480	52487	25 %	0 %	50 %	25 %	313116868
140	NC_014731	GTCC	2	8	52669	52676	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
141	NC_014731	GAAC	2	8	52916	52923	50 %	0 %	25 %	25 %	313116868
142	NC_014731	GGCT	2	8	53139	53146	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
143	NC_014731	GATC	2	8	53158	53165	25 %	25 %	25 %	25 %	313116868
144	NC_014731	ACCG	2	8	53574	53581	25 %	0 %	25 %	50 %	313116868
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