MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	AAAG	2	8	3010	3017	75 %	0 %	25 %	0 %	313116829
2	NC_014731	ATCT	2	8	3712	3719	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
3	NC_014731	GCGA	2	8	4216	4223	25 %	0 %	50 %	25 %	313116830
4	NC_014731	ATCT	2	8	4638	4645	25 %	50 %	0 %	25 %	313116830
5	NC_014731	TGCT	2	8	6410	6417	0 %	50 %	25 %	25 %	313116831
6	NC_014731	TAGT	2	8	6659	6666	25 %	50 %	25 %	0 %	313116831
7	NC_014731	AGCG	2	8	6765	6772	25 %	0 %	50 %	25 %	313116831
8	NC_014731	GAAC	2	8	7254	7261	50 %	0 %	25 %	25 %	313116831
9	NC_014731	CCGA	2	8	8190	8197	25 %	0 %	25 %	50 %	313116832
10	NC_014731	CCGA	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	313116833
11	NC_014731	TGAC	2	8	8623	8630	25 %	25 %	25 %	25 %	313116833
12	NC_014731	GACG	2	8	8951	8958	25 %	0 %	50 %	25 %	313116834
13	NC_014731	ACGG	2	8	9146	9153	25 %	0 %	50 %	25 %	313116834
14	NC_014731	CCGG	2	8	9842	9849	0 %	0 %	50 %	50 %	313116834
15	NC_014731	GCCT	2	8	10191	10198	0 %	25 %	25 %	50 %	313116834
16	NC_014731	TTGC	2	8	10299	10306	0 %	50 %	25 %	25 %	313116834
17	NC_014731	CCAG	2	8	10700	10707	25 %	0 %	25 %	50 %	313116834
18	NC_014731	AACC	2	8	10934	10941	50 %	0 %	0 %	50 %	313116835
19	NC_014731	CAGC	2	8	10963	10970	25 %	0 %	25 %	50 %	313116835
20	NC_014731	AGTG	2	8	11408	11415	25 %	25 %	50 %	0 %	313116836
21	NC_014731	ACGG	2	8	11460	11467	25 %	0 %	50 %	25 %	313116836
22	NC_014731	GCGG	2	8	14063	14070	0 %	0 %	75 %	25 %	313116837
23	NC_014731	TCCC	2	8	15882	15889	0 %	25 %	0 %	75 %	313116838
24	NC_014731	CCAA	2	8	16368	16375	50 %	0 %	0 %	50 %	313116839
25	NC_014731	GACA	2	8	16579	16586	50 %	0 %	25 %	25 %	313116839
26	NC_014731	TAGT	2	8	16977	16984	25 %	50 %	25 %	0 %	313116841
27	NC_014731	CCCA	2	8	17088	17095	25 %	0 %	0 %	75 %	313116841
28	NC_014731	CGAC	2	8	18041	18048	25 %	0 %	25 %	50 %	313116842
29	NC_014731	GACC	2	8	18203	18210	25 %	0 %	25 %	50 %	313116842
30	NC_014731	AGGC	2	8	18694	18701	25 %	0 %	50 %	25 %	313116843
31	NC_014731	CTGG	2	8	19104	19111	0 %	25 %	50 %	25 %	313116843
32	NC_014731	GCCG	2	8	19561	19568	0 %	0 %	50 %	50 %	313116843
33	NC_014731	TCGA	2	8	19864	19871	25 %	25 %	25 %	25 %	313116843
34	NC_014731	GGGC	2	8	20091	20098	0 %	0 %	75 %	25 %	313116843
35	NC_014731	CGTC	2	8	20545	20552	0 %	25 %	25 %	50 %	313116844
36	NC_014731	CGGC	2	8	20860	20867	0 %	0 %	50 %	50 %	313116844
37	NC_014731	CGTC	2	8	21478	21485	0 %	25 %	25 %	50 %	313116844
38	NC_014731	CGTG	2	8	21654	21661	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
39	NC_014731	CGGT	2	8	21767	21774	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
40	NC_014731	GCTG	2	8	21812	21819	0 %	25 %	50 %	25 %	313116844
41	NC_014731	TTCG	2	8	23220	23227	0 %	50 %	25 %	25 %	313116845
42	NC_014731	GCGA	2	8	23672	23679	25 %	0 %	50 %	25 %	313116845
43	NC_014731	CGGT	2	8	23810	23817	0 %	25 %	50 %	25 %	313116845
44	NC_014731	GCAC	2	8	24152	24159	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
45	NC_014731	CGCA	2	8	24213	24220	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
46	NC_014731	GCCA	2	8	24550	24557	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
47	NC_014731	TCGT	2	8	24935	24942	0 %	50 %	25 %	25 %	313116845
48	NC_014731	TCGC	2	8	24998	25005	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
49	NC_014731	GCCA	2	8	25109	25116	25 %	0 %	25 %	50 %	313116845
50	NC_014731	CGCT	2	8	25698	25705	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
51	NC_014731	GATC	2	8	26067	26074	25 %	25 %	25 %	25 %	313116845
52	NC_014731	TGGA	2	8	26257	26264	25 %	25 %	50 %	0 %	313116845
53	NC_014731	TCCG	2	8	26731	26738	0 %	25 %	25 %	50 %	313116845
54	NC_014731	GACG	2	8	26839	26846	25 %	0 %	50 %	25 %	313116845
55	NC_014731	TGGC	2	8	27488	27495	0 %	25 %	50 %	25 %	313116846
56	NC_014731	TGAC	2	8	28808	28815	25 %	25 %	25 %	25 %	313116847
57	NC_014731	TCCA	2	8	31357	31364	25 %	25 %	0 %	50 %	313116849
58	NC_014731	GTCC	2	8	32245	32252	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
59	NC_014731	GTGG	2	8	32361	32368	0 %	25 %	75 %	0 %	313116850
60	NC_014731	TCCG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
61	NC_014731	CGTC	2	8	33554	33561	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
62	NC_014731	CTGC	2	8	33800	33807	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
63	NC_014731	ACGA	2	8	33903	33910	50 %	0 %	25 %	25 %	313116852
64	NC_014731	CAAA	2	8	34537	34544	75 %	0 %	0 %	25 %	313116853
65	NC_014731	GCCA	2	8	34592	34599	25 %	0 %	25 %	50 %	313116853
66	NC_014731	TGAC	2	8	34674	34681	25 %	25 %	25 %	25 %	313116853
67	NC_014731	GACA	2	8	34724	34731	50 %	0 %	25 %	25 %	313116853
68	NC_014731	CGCT	2	8	34828	34835	0 %	25 %	25 %	50 %	313116853
69	NC_014731	TTGG	2	8	34915	34922	0 %	50 %	50 %	0 %	313116853
70	NC_014731	GTGA	2	8	35145	35152	25 %	25 %	50 %	0 %	313116853
71	NC_014731	TTGC	2	8	35209	35216	0 %	50 %	25 %	25 %	313116853
72	NC_014731	AGTG	2	8	35576	35583	25 %	25 %	50 %	0 %	313116853
73	NC_014731	CGGA	2	8	37279	37286	25 %	0 %	50 %	25 %	313116854
74	NC_014731	ACGG	2	8	37417	37424	25 %	0 %	50 %	25 %	313116854
75	NC_014731	CGTT	2	8	38564	38571	0 %	50 %	25 %	25 %	313116856
76	NC_014731	TCAC	2	8	40261	40268	25 %	25 %	0 %	50 %	313116858
77	NC_014731	TGAG	2	8	40512	40519	25 %	25 %	50 %	0 %	313116858
78	NC_014731	CCGA	2	8	40793	40800	25 %	0 %	25 %	50 %	313116859
79	NC_014731	CGGA	2	8	41021	41028	25 %	0 %	50 %	25 %	313116859
80	NC_014731	CACT	2	8	41740	41747	25 %	25 %	0 %	50 %	313116860
81	NC_014731	TCCA	2	8	43207	43214	25 %	25 %	0 %	50 %	313116861
82	NC_014731	TCAC	2	8	44580	44587	25 %	25 %	0 %	50 %	313116864
83	NC_014731	CAGC	2	8	45727	45734	25 %	0 %	25 %	50 %	313116864
84	NC_014731	AACT	2	8	48645	48652	50 %	25 %	0 %	25 %	313116865
85	NC_014731	TCCG	2	8	49523	49530	0 %	25 %	25 %	50 %	313116866
86	NC_014731	CTGG	2	8	49675	49682	0 %	25 %	50 %	25 %	313116866
87	NC_014731	GGAT	2	8	49873	49880	25 %	25 %	50 %	0 %	313116866
88	NC_014731	CAGT	2	8	50386	50393	25 %	25 %	25 %	25 %	313116867
89	NC_014731	CTCG	2	8	50539	50546	0 %	25 %	25 %	50 %	313116867
90	NC_014731	TCGC	2	8	50609	50616	0 %	25 %	25 %	50 %	313116867
91	NC_014731	GTCG	2	8	50733	50740	0 %	25 %	50 %	25 %	313116867
92	NC_014731	CAGC	2	8	51072	51079	25 %	0 %	25 %	50 %	313116867
93	NC_014731	GTCG	2	8	51362	51369	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
94	NC_014731	GTCG	2	8	51422	51429	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
95	NC_014731	GACA	2	8	51515	51522	50 %	0 %	25 %	25 %	313116868
96	NC_014731	CCGT	2	8	51840	51847	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
97	NC_014731	CGCT	2	8	52146	52153	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
98	NC_014731	CTCG	2	8	52454	52461	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
99	NC_014731	CGAG	2	8	52480	52487	25 %	0 %	50 %	25 %	313116868
100	NC_014731	GTCC	2	8	52669	52676	0 %	25 %	25 %	50 %	313116868
101	NC_014731	GAAC	2	8	52916	52923	50 %	0 %	25 %	25 %	313116868
102	NC_014731	GGCT	2	8	53139	53146	0 %	25 %	50 %	25 %	313116868
103	NC_014731	GATC	2	8	53158	53165	25 %	25 %	25 %	25 %	313116868
104	NC_014731	ACCG	2	8	53574	53581	25 %	0 %	25 %	50 %	313116868
105	NC_014731	TCCC	2	8	53612	53619	0 %	25 %	0 %	75 %	313116868
106	NC_014731	CGAG	2	8	54168	54175	25 %	0 %	50 %	25 %	313116868
107	NC_014731	AGCG	2	8	54564	54571	25 %	0 %	50 %	25 %	313116869
108	NC_014731	AAGG	2	8	54576	54583	50 %	0 %	50 %	0 %	313116869
109	NC_014731	TCGA	2	8	56298	56305	25 %	25 %	25 %	25 %	313116871
110	NC_014731	ACGA	2	8	56397	56404	50 %	0 %	25 %	25 %	313116871
111	NC_014731	AGCC	2	8	58122	58129	25 %	0 %	25 %	50 %	313116873
112	NC_014731	ACGA	2	8	58166	58173	50 %	0 %	25 %	25 %	313116873
113	NC_014731	TCCC	2	8	58296	58303	0 %	25 %	0 %	75 %	313116874
114	NC_014731	GAAC	2	8	58489	58496	50 %	0 %	25 %	25 %	313116874
115	NC_014731	GGAA	2	8	59709	59716	50 %	0 %	50 %	0 %	313116875
116	NC_014731	AAGC	2	8	59767	59774	50 %	0 %	25 %	25 %	313116875
117	NC_014731	CCGG	2	8	60328	60335	0 %	0 %	50 %	50 %	313116876
118	NC_014731	ACCC	2	8	60339	60346	25 %	0 %	0 %	75 %	313116876
119	NC_014731	CGAG	2	8	60623	60630	25 %	0 %	50 %	25 %	313116876
120	NC_014731	ACGA	2	8	60749	60756	50 %	0 %	25 %	25 %	313116876
121	NC_014731	ACCG	2	8	61728	61735	25 %	0 %	25 %	50 %	313116877
122	NC_014731	ACGT	2	8	61771	61778	25 %	25 %	25 %	25 %	313116877
123	NC_014731	TCCG	2	8	61956	61963	0 %	25 %	25 %	50 %	313116877
124	NC_014731	CGTG	2	8	62126	62133	0 %	25 %	50 %	25 %	313116877
125	NC_014731	ACGG	2	8	62242	62249	25 %	0 %	50 %	25 %	313116877
126	NC_014731	CGGT	2	8	62482	62489	0 %	25 %	50 %	25 %	313116877
127	NC_014731	CCGT	2	8	63199	63206	0 %	25 %	25 %	50 %	313116878
128	NC_014731	GACC	2	8	63494	63501	25 %	0 %	25 %	50 %	313116878
129	NC_014731	CCGT	2	8	63628	63635	0 %	25 %	25 %	50 %	313116878
130	NC_014731	GCGA	2	8	64371	64378	25 %	0 %	50 %	25 %	313116879
131	NC_014731	ACCG	2	8	65385	65392	25 %	0 %	25 %	50 %	313116880
132	NC_014731	GTCG	2	8	65681	65688	0 %	25 %	50 %	25 %	313116880
133	NC_014731	GGAG	2	8	66915	66922	25 %	0 %	75 %	0 %	313116882
134	NC_014731	AGTC	2	8	68021	68028	25 %	25 %	25 %	25 %	313116883
135	NC_014731	ACCG	2	8	68717	68724	25 %	0 %	25 %	50 %	313116884
136	NC_014731	TCGG	2	8	69620	69627	0 %	25 %	50 %	25 %	313116885
137	NC_014731	CGAA	2	8	70088	70095	50 %	0 %	25 %	25 %	313116885
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