MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 5394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	CAG	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014731	GCC	2	6	64	69	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014731	GCG	2	6	285	290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
4	NC_014731	CGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
5	NC_014731	CAC	3	9	299	307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
6	NC_014731	CGG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
7	NC_014731	GTT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116828
8	NC_014731	CGC	2	6	389	394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
9	NC_014731	TTC	2	6	486	491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
10	NC_014731	CCA	2	6	531	536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
11	NC_014731	CGT	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
12	NC_014731	CAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
13	NC_014731	TTC	2	6	631	636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
14	NC_014731	CGG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
15	NC_014731	CGA	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
16	NC_014731	CGC	2	6	686	691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
17	NC_014731	CTG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
18	NC_014731	ACT	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116828
19	NC_014731	TCG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
20	NC_014731	TCG	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
21	NC_014731	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014731	CGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014731	CCG	2	6	1099	1104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014731	GCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014731	GGC	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014731	AGT	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014731	GTG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014731	CTC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
29	NC_014731	AGT	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
30	NC_014731	CGT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
31	NC_014731	CGA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
32	NC_014731	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
33	NC_014731	ATC	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116829
34	NC_014731	TTG	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
35	NC_014731	ACG	3	9	2281	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
36	NC_014731	GTA	3	9	2464	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
37	NC_014731	GTC	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
38	NC_014731	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
39	NC_014731	TTC	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
40	NC_014731	AGG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116829
41	NC_014731	TCC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
42	NC_014731	TTC	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
43	NC_014731	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313116829
44	NC_014731	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
45	NC_014731	AGT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
46	NC_014731	AGT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
47	NC_014731	ACC	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116829
48	NC_014731	GTC	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
49	NC_014731	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
50	NC_014731	TCC	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
51	NC_014731	ATG	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
52	NC_014731	CAA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116830
53	NC_014731	CAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
54	NC_014731	GAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
55	NC_014731	AGT	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
56	NC_014731	CTG	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
57	NC_014731	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
58	NC_014731	TCC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
59	NC_014731	ACG	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
60	NC_014731	ATG	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
61	NC_014731	TAG	3	9	4505	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
62	NC_014731	GTC	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
63	NC_014731	TGG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116830
64	NC_014731	GGA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
65	NC_014731	TGA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
66	NC_014731	TCG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
67	NC_014731	GAG	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
68	NC_014731	GGA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
69	NC_014731	GAC	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
70	NC_014731	AGA	2	6	5030	5035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
71	NC_014731	GGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
72	NC_014731	AAG	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
73	NC_014731	ACG	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
74	NC_014731	TTC	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
75	NC_014731	CTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
76	NC_014731	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
77	NC_014731	GAC	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
78	NC_014731	GAC	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
79	NC_014731	ACC	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116830
80	NC_014731	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
81	NC_014731	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
82	NC_014731	CAG	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
83	NC_014731	TGA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
84	NC_014731	AGA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
85	NC_014731	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
86	NC_014731	TCA	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
87	NC_014731	GCT	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
88	NC_014731	TTC	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
89	NC_014731	AGA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
90	NC_014731	TTG	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116830
91	NC_014731	ATC	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
92	NC_014731	AAC	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014731	TCG	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014731	GAC	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014731	CGA	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116831
96	NC_014731	ACT	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116831
97	NC_014731	CGC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
98	NC_014731	TGA	2	6	6698	6703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116831
99	NC_014731	ATC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116831
100	NC_014731	GTT	2	6	6849	6854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116831
101	NC_014731	GCC	2	6	6881	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
102	NC_014731	GAG	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116831
103	NC_014731	CAC	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116831
104	NC_014731	GAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116831
105	NC_014731	GTT	3	9	7461	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116831
106	NC_014731	GCT	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
107	NC_014731	AGG	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116831
108	NC_014731	CAC	2	6	7577	7582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116831
109	NC_014731	CTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
110	NC_014731	CGC	2	6	7635	7640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
111	NC_014731	CTT	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116831
112	NC_014731	CGT	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
113	NC_014731	GTC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
114	NC_014731	GCC	2	6	7819	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
115	NC_014731	GTC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
116	NC_014731	ATA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014731	ACC	2	6	8062	8067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014731	GTC	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116832
119	NC_014731	CGC	2	6	8169	8174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116832
120	NC_014731	AAG	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014731	GAA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116833
122	NC_014731	CTC	2	6	8555	8560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116833
123	NC_014731	GTC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116833
124	NC_014731	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014731	CGA	2	6	8692	8697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014731	CAA	2	6	8700	8705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014731	TGG	2	6	8751	8756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014731	GAC	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
129	NC_014731	CAC	2	6	8942	8947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116834
130	NC_014731	CTC	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116834
131	NC_014731	GCC	2	6	8992	8997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
132	NC_014731	ACG	2	6	9056	9061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
133	NC_014731	TCC	2	6	9271	9276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116834
134	NC_014731	CGA	3	9	9311	9319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
135	NC_014731	TGT	2	6	9346	9351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116834
136	NC_014731	CGA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
137	NC_014731	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
138	NC_014731	ATC	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116834
139	NC_014731	GTC	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
140	NC_014731	TGC	2	6	9508	9513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
141	NC_014731	GCG	2	6	9528	9533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
142	NC_014731	TGG	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116834
143	NC_014731	CTG	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
144	NC_014731	CGG	2	6	9698	9703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
145	NC_014731	CTG	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
146	NC_014731	CGA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
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149	NC_014731	GTC	2	6	9960	9965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
150	NC_014731	GAC	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
151	NC_014731	AGA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116834
152	NC_014731	GCG	2	6	10077	10082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
153	NC_014731	ACG	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
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159	NC_014731	GCC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
160	NC_014731	TCG	3	9	10387	10395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
161	NC_014731	GCA	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
162	NC_014731	GGC	2	6	10442	10447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
163	NC_014731	CCA	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116834
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166	NC_014731	CGA	3	9	10526	10534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
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169	NC_014731	GAG	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116834
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181	NC_014731	TGA	2	6	11663	11668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014731	TGG	2	6	11716	11721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014731	CGC	2	6	11772	11777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_014731	GCC	2	6	11922	11927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_014731	GTC	3	9	11982	11990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_014731	TCG	2	6	12112	12117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_014731	ACG	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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229	NC_014731	ACT	2	6	15333	15338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_014731	GCC	2	6	17710	17715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_014731	CAA	2	6	17726	17731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_014731	TCG	2	6	18082	18087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116842
260	NC_014731	CGT	2	6	18224	18229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116842
261	NC_014731	TCC	2	6	18259	18264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116842
262	NC_014731	ACT	2	6	18346	18351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_014731	GAC	2	6	18389	18394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_014731	GAA	2	6	18537	18542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014731	ACG	2	6	18560	18565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
266	NC_014731	CGG	2	6	18573	18578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116843
267	NC_014731	GAC	2	6	18580	18585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116843
268	NC_014731	TGA	2	6	18594	18599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116843
269	NC_014731	ACT	2	6	18624	18629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116843
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272	NC_014731	TCG	2	6	18758	18763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116843
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298	NC_014731	GGC	2	6	20147	20152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_014731	CGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_014731	GAC	2	6	20223	20228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_014731	CAG	2	6	20339	20344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_014731	TCC	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
303	NC_014731	CGA	2	6	20366	20371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_014731	CGA	2	6	20438	20443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
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500	NC_014731	CCG	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849

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