MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 4620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	GCG	2	6	285	290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
2	NC_014731	CGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
3	NC_014731	CAC	3	9	299	307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
4	NC_014731	CGG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
5	NC_014731	GTT	2	6	383	388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116828
6	NC_014731	CGC	2	6	389	394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
7	NC_014731	TTC	2	6	486	491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
8	NC_014731	CCA	2	6	531	536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116828
9	NC_014731	CGT	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
10	NC_014731	CAG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
11	NC_014731	TTC	2	6	631	636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116828
12	NC_014731	CGG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116828
13	NC_014731	CGA	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116828
14	NC_014731	CGC	2	6	686	691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116828
15	NC_014731	CTG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
16	NC_014731	ACT	2	6	866	871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116828
17	NC_014731	TCG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
18	NC_014731	TCG	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116828
19	NC_014731	CTC	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
20	NC_014731	AGT	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
21	NC_014731	CGT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
22	NC_014731	CGA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
23	NC_014731	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
24	NC_014731	ATC	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116829
25	NC_014731	TTG	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
26	NC_014731	ACG	3	9	2281	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116829
27	NC_014731	GTA	3	9	2464	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
28	NC_014731	GTC	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
29	NC_014731	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
30	NC_014731	TTC	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
31	NC_014731	AGG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116829
32	NC_014731	TCC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116829
33	NC_014731	TTC	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
34	NC_014731	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313116829
35	NC_014731	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116829
36	NC_014731	AGT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
37	NC_014731	AGT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116829
38	NC_014731	ACC	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116829
39	NC_014731	GTC	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116829
40	NC_014731	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116829
41	NC_014731	TCC	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
42	NC_014731	ATG	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
43	NC_014731	CAA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116830
44	NC_014731	CAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
45	NC_014731	GAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
46	NC_014731	AGT	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
47	NC_014731	CTG	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
48	NC_014731	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
49	NC_014731	TCC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116830
50	NC_014731	ACG	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
51	NC_014731	ATG	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
52	NC_014731	TAG	3	9	4505	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
53	NC_014731	GTC	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
54	NC_014731	TGG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116830
55	NC_014731	GGA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
56	NC_014731	TGA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
57	NC_014731	TCG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
58	NC_014731	GAG	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
59	NC_014731	GGA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
60	NC_014731	GAC	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
61	NC_014731	AGA	2	6	5030	5035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
62	NC_014731	GGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116830
63	NC_014731	AAG	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
64	NC_014731	ACG	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
65	NC_014731	TTC	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
66	NC_014731	CTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
67	NC_014731	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
68	NC_014731	GAC	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
69	NC_014731	GAC	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
70	NC_014731	ACC	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116830
71	NC_014731	CGT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
72	NC_014731	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
73	NC_014731	CAG	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
74	NC_014731	TGA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116830
75	NC_014731	AGA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
76	NC_014731	CGA	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116830
77	NC_014731	TCA	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
78	NC_014731	GCT	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116830
79	NC_014731	TTC	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116830
80	NC_014731	AGA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116830
81	NC_014731	TTG	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116830
82	NC_014731	ATC	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116830
83	NC_014731	CGA	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116831
84	NC_014731	ACT	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116831
85	NC_014731	CGC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
86	NC_014731	TGA	2	6	6698	6703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116831
87	NC_014731	ATC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116831
88	NC_014731	GTT	2	6	6849	6854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116831
89	NC_014731	GCC	2	6	6881	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
90	NC_014731	GAG	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116831
91	NC_014731	CAC	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116831
92	NC_014731	GAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116831
93	NC_014731	GTT	3	9	7461	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116831
94	NC_014731	GCT	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
95	NC_014731	AGG	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116831
96	NC_014731	CAC	2	6	7577	7582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116831
97	NC_014731	CTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
98	NC_014731	CGC	2	6	7635	7640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
99	NC_014731	CTT	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116831
100	NC_014731	CGT	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
101	NC_014731	GTC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
102	NC_014731	GCC	2	6	7819	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116831
103	NC_014731	GTC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116831
104	NC_014731	GTC	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116832
105	NC_014731	CGC	2	6	8169	8174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116832
106	NC_014731	GAA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116833
107	NC_014731	CTC	2	6	8555	8560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116833
108	NC_014731	GTC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116833
109	NC_014731	GAC	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
110	NC_014731	CAC	2	6	8942	8947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116834
111	NC_014731	CTC	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116834
112	NC_014731	GCC	2	6	8992	8997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
113	NC_014731	ACG	2	6	9056	9061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
114	NC_014731	TCC	2	6	9271	9276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116834
115	NC_014731	CGA	3	9	9311	9319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
116	NC_014731	TGT	2	6	9346	9351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116834
117	NC_014731	CGA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
118	NC_014731	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
119	NC_014731	ATC	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116834
120	NC_014731	GTC	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
121	NC_014731	TGC	2	6	9508	9513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
122	NC_014731	GCG	2	6	9528	9533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
123	NC_014731	TGG	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116834
124	NC_014731	CTG	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
125	NC_014731	CGG	2	6	9698	9703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
126	NC_014731	CTG	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
127	NC_014731	CGA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
128	NC_014731	CGT	2	6	9905	9910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
129	NC_014731	GCA	2	6	9930	9935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
130	NC_014731	GTC	2	6	9960	9965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
131	NC_014731	GAC	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
132	NC_014731	AGA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116834
133	NC_014731	GCG	2	6	10077	10082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
134	NC_014731	ACG	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
135	NC_014731	AGG	2	6	10111	10116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116834
136	NC_014731	CAT	2	6	10118	10123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116834
137	NC_014731	TGC	2	6	10145	10150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
138	NC_014731	CAG	2	6	10216	10221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
139	NC_014731	CGG	2	6	10247	10252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
140	NC_014731	GCC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116834
141	NC_014731	TCG	3	9	10387	10395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
142	NC_014731	GCA	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
143	NC_014731	GGC	2	6	10442	10447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116834
144	NC_014731	CCA	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116834
145	NC_014731	GAG	2	6	10506	10511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116834
146	NC_014731	GCT	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
147	NC_014731	CGA	3	9	10526	10534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116834
148	NC_014731	TGC	2	6	10583	10588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
149	NC_014731	GTC	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
150	NC_014731	GAG	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116834
151	NC_014731	TCG	2	6	10779	10784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116834
152	NC_014731	TGG	3	9	10882	10890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116834
153	NC_014731	AAG	2	6	10991	10996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116835
154	NC_014731	TCG	3	9	11019	11027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116835
155	NC_014731	TGT	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116836
156	NC_014731	GAG	2	6	11325	11330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116836
157	NC_014731	TCT	2	6	11343	11348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116836
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159	NC_014731	CGT	2	6	11424	11429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116836
160	NC_014731	GTC	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116836
161	NC_014731	TCG	2	6	12558	12563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116837
162	NC_014731	CGA	2	6	12646	12651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116837
163	NC_014731	GAT	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116837
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165	NC_014731	TCG	2	6	12861	12866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116837
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242	NC_014731	CGA	2	6	20735	20740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
243	NC_014731	ACC	2	6	20854	20859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116844
244	NC_014731	CGA	2	6	20939	20944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
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246	NC_014731	GAC	2	6	21082	21087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
247	NC_014731	GAG	2	6	21156	21161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116844
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249	NC_014731	ACG	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
250	NC_014731	CGA	2	6	21242	21247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
251	NC_014731	GAC	2	6	21300	21305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
252	NC_014731	ACC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116844
253	NC_014731	GTT	2	6	21443	21448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116844
254	NC_014731	GGA	2	6	21467	21472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116844
255	NC_014731	GTC	2	6	21504	21509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116844
256	NC_014731	GCC	2	6	21546	21551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116844
257	NC_014731	CAG	2	6	21565	21570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
258	NC_014731	CGG	2	6	21613	21618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
259	NC_014731	GAG	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116844
260	NC_014731	GAC	2	6	22074	22079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
261	NC_014731	ATG	2	6	22143	22148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116844
262	NC_014731	CGG	2	6	22210	22215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
263	NC_014731	CAG	2	6	22216	22221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116844
264	NC_014731	GAG	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116844
265	NC_014731	GCG	2	6	22293	22298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116844
266	NC_014731	CCT	2	6	22310	22315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116844
267	NC_014731	ACC	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116844
268	NC_014731	GAT	2	6	22437	22442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116844
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270	NC_014731	CGC	2	6	22475	22480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116844
271	NC_014731	GGC	2	6	22765	22770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116845
272	NC_014731	GTC	2	6	22780	22785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
273	NC_014731	TCG	2	6	22862	22867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
274	NC_014731	GTC	2	6	22897	22902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
275	NC_014731	GCG	2	6	22952	22957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116845
276	NC_014731	ACG	2	6	23006	23011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116845
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278	NC_014731	ATC	2	6	23047	23052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116845
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281	NC_014731	GTC	2	6	23116	23121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
282	NC_014731	CGA	2	6	23169	23174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116845
283	NC_014731	CGG	2	6	23178	23183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116845
284	NC_014731	GAC	2	6	23230	23235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116845
285	NC_014731	CGA	2	6	23280	23285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116845
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332	NC_014731	CGT	2	6	25797	25802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
333	NC_014731	CTG	2	6	25824	25829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116845
334	NC_014731	TCC	2	6	25853	25858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116845
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372	NC_014731	CGA	2	6	28161	28166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116847
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497	NC_014731	GTT	2	6	37337	37342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116854
498	NC_014731	ACT	2	6	37455	37460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116854
499	NC_014731	TGG	2	6	37473	37478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116854
500	NC_014731	ACC	2	6	37540	37545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116854

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