MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	T	7	7	2939	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
2	NC_014731	G	6	6	2984	2989	0 %	0 %	100 %	0 %	313116829
3	NC_014731	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
4	NC_014731	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
5	NC_014731	G	6	6	5335	5340	0 %	0 %	100 %	0 %	313116830
6	NC_014731	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
7	NC_014731	A	6	6	11565	11570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014731	A	8	8	12219	12226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014731	T	6	6	13350	13355	0 %	100 %	0 %	0 %	313116837
10	NC_014731	T	6	6	15999	16004	0 %	100 %	0 %	0 %	313116838
11	NC_014731	C	6	6	25647	25652	0 %	0 %	0 %	100 %	313116845
12	NC_014731	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014731	T	6	6	29241	29246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014731	G	6	6	32099	32104	0 %	0 %	100 %	0 %	313116850
15	NC_014731	C	6	6	33485	33490	0 %	0 %	0 %	100 %	313116852
16	NC_014731	A	6	6	48343	48348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014731	T	8	8	48972	48979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014731	T	6	6	62313	62318	0 %	100 %	0 %	0 %	313116877
19	NC_014731	C	6	6	62927	62932	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
20	NC_014731	C	6	6	63647	63652	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
21	NC_014731	C	6	6	63757	63762	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
22	NC_014731	A	6	6	65367	65372	100 %	0 %	0 %	0 %	313116880
23	NC_014731	G	6	6	65610	65615	0 %	0 %	100 %	0 %	313116880
24	NC_014731	G	6	6	69127	69132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014731	C	6	6	72913	72918	0 %	0 %	0 %	100 %	313116888
26	NC_014731	T	6	6	77277	77282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014731	A	6	6	83354	83359	100 %	0 %	0 %	0 %	313116896
28	NC_014731	G	6	6	89049	89054	0 %	0 %	100 %	0 %	313116901
29	NC_014731	G	6	6	94453	94458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014731	G	6	6	95780	95785	0 %	0 %	100 %	0 %	313116909
31	NC_014731	C	6	6	96953	96958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_014731	A	6	6	102485	102490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014731	G	6	6	103706	103711	0 %	0 %	100 %	0 %	313116919
34	NC_014731	G	6	6	105760	105765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014731	A	6	6	107465	107470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014731	G	6	6	108450	108455	0 %	0 %	100 %	0 %	313116926
37	NC_014731	A	6	6	118397	118402	100 %	0 %	0 %	0 %	313116933
38	NC_014731	G	6	6	119863	119868	0 %	0 %	100 %	0 %	313116934
39	NC_014731	T	6	6	120146	120151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014731	G	6	6	121067	121072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014731	A	6	6	123163	123168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014731	A	6	6	126259	126264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014731	G	6	6	129547	129552	0 %	0 %	100 %	0 %	313116944
44	NC_014731	G	6	6	134030	134035	0 %	0 %	100 %	0 %	313116946
45	NC_014731	A	7	7	140047	140053	100 %	0 %	0 %	0 %	313116951
46	NC_014731	A	7	7	146864	146870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014731	A	6	6	148622	148627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014731	T	6	6	150112	150117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014731	C	6	6	151543	151548	0 %	0 %	0 %	100 %	313116961
50	NC_014731	A	6	6	153284	153289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014731	T	6	6	153396	153401	0 %	100 %	0 %	0 %	313116963
52	NC_014731	G	6	6	164012	164017	0 %	0 %	100 %	0 %	313116976
53	NC_014731	G	6	6	168557	168562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014731	A	6	6	170256	170261	100 %	0 %	0 %	0 %	313116980
55	NC_014731	C	6	6	172397	172402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_014731	T	6	6	173853	173858	0 %	100 %	0 %	0 %	313116983
57	NC_014731	A	6	6	175913	175918	100 %	0 %	0 %	0 %	313116986
58	NC_014731	C	6	6	183756	183761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_014731	G	6	6	187668	187673	0 %	0 %	100 %	0 %	313116996
60	NC_014731	C	6	6	189421	189426	0 %	0 %	0 %	100 %	313116998
61	NC_014731	T	6	6	190074	190079	0 %	100 %	0 %	0 %	313116999
62	NC_014731	T	6	6	198248	198253	0 %	100 %	0 %	0 %	313117007
63	NC_014731	A	6	6	209814	209819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014731	C	6	6	210998	211003	0 %	0 %	0 %	100 %	313117020
65	NC_014731	C	8	8	213179	213186	0 %	0 %	0 %	100 %	313117022
66	NC_014731	A	6	6	218423	218428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014731	G	6	6	219318	219323	0 %	0 %	100 %	0 %	313117033
68	NC_014731	G	6	6	227599	227604	0 %	0 %	100 %	0 %	313117040
69	NC_014731	G	6	6	228772	228777	0 %	0 %	100 %	0 %	313117041
70	NC_014731	G	6	6	236430	236435	0 %	0 %	100 %	0 %	313117047
71	NC_014731	T	6	6	237262	237267	0 %	100 %	0 %	0 %	313117048
72	NC_014731	C	6	6	258620	258625	0 %	0 %	0 %	100 %	313117064
73	NC_014731	A	6	6	259744	259749	100 %	0 %	0 %	0 %	313117066
74	NC_014731	A	6	6	259752	259757	100 %	0 %	0 %	0 %	313117066
75	NC_014731	G	6	6	264908	264913	0 %	0 %	100 %	0 %	313117070
76	NC_014731	C	6	6	266976	266981	0 %	0 %	0 %	100 %	313117072
77	NC_014731	A	7	7	278787	278793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014731	G	6	6	280845	280850	0 %	0 %	100 %	0 %	313117083
79	NC_014731	G	7	7	283743	283749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014731	T	6	6	286902	286907	0 %	100 %	0 %	0 %	313117087
81	NC_014731	A	6	6	304722	304727	100 %	0 %	0 %	0 %	313117101
82	NC_014731	G	6	6	324598	324603	0 %	0 %	100 %	0 %	313117120
83	NC_014731	A	6	6	325791	325796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014731	A	6	6	327351	327356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014731	A	6	6	328369	328374	100 %	0 %	0 %	0 %	313117123
86	NC_014731	T	6	6	331035	331040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014731	T	6	6	332541	332546	0 %	100 %	0 %	0 %	313117125
88	NC_014731	C	6	6	335096	335101	0 %	0 %	0 %	100 %	313117128
89	NC_014731	C	6	6	335324	335329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_014731	T	6	6	337822	337827	0 %	100 %	0 %	0 %	313117131

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.