MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 1162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	CTTT	2	8	4579	4586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014729	GACG	2	8	4588	4595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014729	GCGA	2	8	6033	6040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014729	CTGT	2	8	10728	10735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014729	CAAT	2	8	10796	10803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014729	CTGA	2	8	12610	12617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014729	ATAC	2	8	12917	12924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014729	GGCA	2	8	17290	17297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014729	GGTG	2	8	19524	19531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014729	CAGG	2	8	19605	19612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014729	TTTC	2	8	20848	20855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014729	TCAC	2	8	21598	21605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014729	TAGG	2	8	21928	21935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014729	CCGA	2	8	21979	21986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014729	GTCG	2	8	24860	24867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014729	CAGT	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014729	ATCC	2	8	25213	25220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014729	CGTC	2	8	25310	25317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014729	CTTC	2	8	25319	25326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014729	GGCG	2	8	28966	28973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014729	CGCC	2	8	29113	29120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014729	TTAG	2	8	32827	32834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014729	TCCG	2	8	33133	33140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014729	CCAA	2	8	36235	36242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014729	GAAA	2	8	39570	39577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014729	GAGG	2	8	39869	39876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014729	TAGG	2	8	39964	39971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014729	AAGT	2	8	40923	40930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014729	GGCG	2	8	49574	49581	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014729	GACG	2	8	49703	49710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014729	AAAC	2	8	54933	54940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014729	GAAC	2	8	55874	55881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014729	CCGC	2	8	68592	68599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_014729	CCGA	2	8	80077	80084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014729	GGCG	2	8	80198	80205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014729	TGCC	2	8	80212	80219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014729	GCGT	2	8	80306	80313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014729	CGAG	2	8	80348	80355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014729	CGAC	2	8	80517	80524	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014729	TCCG	2	8	80692	80699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014729	CAAC	2	8	81049	81056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014729	GAAC	2	8	82756	82763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014729	TTTC	2	8	82832	82839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014729	AGTG	2	8	82928	82935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014729	AGTC	2	8	82938	82945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014729	GCGA	2	8	82948	82955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014729	CGAG	2	8	82966	82973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014729	CGAC	2	8	83577	83584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014729	GACG	2	8	86873	86880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014729	AGAA	2	8	99186	99193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014729	TCGG	2	8	105249	105256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014729	AACA	2	8	105275	105282	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014729	GTTC	2	8	107309	107316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014729	GGTC	2	8	107575	107582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014729	CCGT	2	8	108672	108679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014729	CGAC	2	8	113263	113270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014729	TGAG	2	8	117224	117231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014729	GACC	2	8	119493	119500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014729	AGCG	2	8	129584	129591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014729	AGTT	2	8	131474	131481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014729	CATC	2	8	131536	131543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014729	GGTG	2	8	131710	131717	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014729	CCAG	2	8	132349	132356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014729	ACAG	2	8	132357	132364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014729	CGAG	2	8	135903	135910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014729	ACCG	2	8	135915	135922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014729	GACG	2	8	140535	140542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014729	CGCC	2	8	140548	140555	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_014729	ACAG	2	8	148581	148588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014729	GCAG	2	8	148628	148635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014729	ACTC	2	8	148905	148912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014729	CGTT	2	8	167884	167891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014729	ACAG	2	8	171123	171130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014729	CGGT	2	8	173376	173383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014729	TCTG	2	8	173878	173885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014729	TCGC	3	12	174045	174056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014729	GCGA	2	8	183181	183188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014729	ACCC	2	8	183789	183796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014729	AGTG	2	8	185569	185576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014729	GTCG	2	8	185620	185627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014729	GGGA	2	8	185701	185708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014729	GGAA	2	8	187339	187346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014729	CACC	2	8	190569	190576	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_014729	CGCT	2	8	190842	190849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014729	ACTG	2	8	192788	192795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014729	ACTG	2	8	192812	192819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014729	ACTG	2	8	192836	192843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014729	ACTG	2	8	192860	192867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014729	TCGT	2	8	197951	197958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014729	GAAA	2	8	209464	209471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014729	GGTA	2	8	218099	218106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014729	AGCG	2	8	218497	218504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014729	CCGA	2	8	218505	218512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014729	AGGG	2	8	218528	218535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014729	CGTC	2	8	224564	224571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014729	GCGA	2	8	224604	224611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014729	CTGA	2	8	224622	224629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014729	AGGG	2	8	231536	231543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014729	GGCG	2	8	235694	235701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014729	GGGT	2	8	252717	252724	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014729	ACCG	2	8	253790	253797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014729	TTTG	2	8	254009	254016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014729	GTCG	2	8	257951	257958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014729	GTTG	2	8	259369	259376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014729	CGAC	2	8	260380	260387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014729	GCAC	2	8	260411	260418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014729	CGCT	2	8	260448	260455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014729	ACGG	2	8	267162	267169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014729	TCAC	2	8	279421	279428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014729	GGCG	2	8	279516	279523	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014729	ATGG	2	8	279650	279657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014729	GAAG	2	8	281564	281571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014729	GTCC	2	8	284445	284452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014729	ACCG	2	8	291008	291015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014729	TTTC	2	8	291035	291042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014729	GACC	2	8	291131	291138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014729	CGGT	2	8	291182	291189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014729	CGAC	2	8	291201	291208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014729	GCAA	2	8	294591	294598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014729	CATG	2	8	294684	294691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014729	GTCT	2	8	295995	296002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014729	TCCG	2	8	298720	298727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014729	TGAC	2	8	302111	302118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014729	ACGA	2	8	302382	302389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014729	GGAC	2	8	303385	303392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014729	CGAG	2	8	303779	303786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014729	CTGG	2	8	303820	303827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014729	GCGA	2	8	305075	305082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014729	TCAG	2	8	305128	305135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014729	ACTT	2	8	305254	305261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014729	CGAA	2	8	306207	306214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014729	TAGG	2	8	306755	306762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014729	TTCA	2	8	307036	307043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014729	CCTG	2	8	307151	307158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014729	CATA	2	8	307586	307593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014729	ACTT	2	8	308096	308103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014729	CGGC	2	8	319842	319849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014729	TGTT	2	8	343498	343505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014729	ACAG	2	8	343859	343866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014729	TTCT	2	8	345342	345349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014729	CCGA	2	8	345507	345514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014729	TCGC	2	8	349692	349699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014729	GGCC	2	8	350462	350469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014729	ACCC	2	8	351285	351292	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_014729	CGAG	2	8	353668	353675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014729	GTGC	2	8	354682	354689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014729	CGGG	2	8	357230	357237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014729	TTCT	2	8	357300	357307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014729	GGGT	2	8	363829	363836	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014729	GTTC	2	8	366250	366257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014729	CGTC	2	8	366338	366345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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