MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ND02 chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014727	TCTTTT	2	12	10255	10266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014727	TGAAAA	2	12	24552	24563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014727	TGGCAA	2	12	38342	38353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014727	TTAATA	2	12	38825	38836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014727	ATCTAT	2	12	46110	46121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014727	AAAATG	2	12	48151	48162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014727	GACCTG	2	12	49215	49226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014727	CCGCTG	2	12	81271	81282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014727	CAGGAG	2	12	81888	81899	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014727	AAAAGC	2	12	91989	92000	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014727	ATGTCT	2	12	96398	96409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014727	TTTTGA	2	12	181538	181549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014727	TTGCAC	2	12	191575	191586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014727	TATTTT	2	12	195939	195950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014727	TTACTT	2	12	219086	219097	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014727	ATCAAA	2	12	236882	236893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014727	CCAACA	2	12	239160	239171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014727	GTTATG	2	12	267561	267572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014727	TCGATT	2	12	273335	273346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014727	ATAACA	2	12	284444	284455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014727	TAAAAA	2	12	289220	289231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014727	AAATAT	2	12	354943	354954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014727	AGCATC	2	12	382465	382476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014727	TTTATA	2	12	382718	382729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014727	TCTTTT	2	12	441632	441643	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014727	ATAACA	2	12	463400	463411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014727	GCCGGG	2	12	469368	469379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014727	ATGAAG	2	12	533682	533693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014727	TAGACA	2	12	533806	533817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014727	AAAAGC	2	12	574121	574132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014727	AAGTAA	2	12	592289	592300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014727	AAATGA	2	12	624317	624328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014727	AATTAA	2	12	649174	649185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014727	AAAAAT	2	12	670466	670477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014727	TCTTTT	2	12	706501	706512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014727	AAAAGA	2	12	710587	710598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014727	TCATGC	2	12	711451	711462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014727	TTAAAA	2	12	711471	711482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014727	TGGCAA	2	12	741477	741488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014727	AGAGGA	2	12	802496	802507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014727	TTATGA	2	12	807330	807341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014727	ACGAAA	2	12	858145	858156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014727	AAAAAT	2	12	858228	858239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014727	TGGCAA	2	12	863431	863442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014727	CCTCTT	2	12	889329	889340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014727	AAGTTT	2	12	895635	895646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014727	CTTTTT	2	12	941050	941061	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014727	AATTTT	2	12	964565	964576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014727	TTATGA	2	12	975756	975767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014727	ATGTAT	2	12	982200	982211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014727	TGTCAA	2	12	1017452	1017463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014727	ATGCCC	2	12	1020792	1020803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014727	GGGAAG	2	12	1031085	1031096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014727	GCAGCT	2	12	1031390	1031401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014727	GTTAAT	2	12	1043347	1043358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014727	TAGATG	2	12	1044786	1044797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014727	AACTTT	2	12	1047064	1047075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014727	TCTTTC	2	12	1063803	1063814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014727	TCTGTT	2	12	1063824	1063835	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014727	TCATAA	2	12	1077063	1077074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014727	TCATAA	2	12	1125291	1125302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014727	TCATAA	2	12	1143061	1143072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014727	CTGCTT	2	12	1159445	1159456	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014727	TATCCG	2	12	1163732	1163743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014727	TTTTCT	2	12	1167908	1167919	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014727	AAAAAG	2	12	1200614	1200625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014727	CTCCAA	2	12	1243960	1243971	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014727	GTCTTT	2	12	1244755	1244766	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014727	TGTTCA	2	12	1245634	1245645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014727	CCCTCC	2	12	1250067	1250078	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_014727	TAAATT	2	12	1261556	1261567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014727	ACGATA	2	12	1275138	1275149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014727	GAGGAC	2	12	1278775	1278786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014727	GTCATA	2	12	1278868	1278879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014727	ATTTTC	2	12	1287248	1287259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014727	TCTTTT	2	12	1338774	1338785	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014727	CATTTT	2	12	1366401	1366412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014727	TTTTCT	2	12	1370880	1370891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014727	TCATAA	2	12	1418622	1418633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014727	CCTTTT	2	12	1442696	1442707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014727	TCTTTT	2	12	1445014	1445025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014727	ATACAG	2	12	1478775	1478786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014727	CATCCC	2	12	1488668	1488679	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014727	TTATGA	2	12	1492556	1492567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014727	AGAAAA	2	12	1519666	1519677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014727	TGTGAA	2	12	1584235	1584246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014727	TTGAAT	2	12	1602535	1602546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014727	GTCTTC	2	12	1610869	1610880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014727	TTAAAA	2	12	1622605	1622616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014727	TTTAGC	2	12	1676892	1676903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014727	GCACTT	2	12	1705289	1705300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014727	TTCCTT	2	12	1728960	1728971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014727	GCTTCT	2	12	1746499	1746510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014727	AAACTA	2	12	1805075	1805086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014727	ATAGTT	2	12	1810722	1810733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014727	AGAAAA	2	12	1818386	1818397	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014727	CCTTAT	2	12	1826833	1826844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014727	CCGCAA	2	12	1837999	1838010	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014727	GAACTT	2	12	1885600	1885611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014727	GTTTAT	2	12	1892891	1892902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014727	GAACTT	2	12	1895162	1895173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014727	TGTCAT	2	12	1932880	1932891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014727	TTTCAT	2	12	1983392	1983403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014727	CTTCAT	2	12	1983671	1983682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014727	AATGTA	2	12	1983811	1983822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014727	CCTTTT	2	12	1989000	1989011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014727	CACAAA	2	12	1996191	1996202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014727	TCTTTT	2	12	2037894	2037905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014727	AGTGTG	2	12	2045536	2045547	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014727	CTTTTT	2	12	2071057	2071068	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014727	AGGAAT	2	12	2081587	2081598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014727	TAACAA	2	12	2113332	2113343	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.