MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014724	ATTAAG	2	12	2733	2744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014724	ATAAAT	2	12	14287	14298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014724	GAAAAA	2	12	34066	34077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014724	CGGAGC	2	12	68715	68726	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014724	TTCATT	2	12	81602	81613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014724	ATTGAT	2	12	81681	81692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014724	TTCATT	2	12	90468	90479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014724	CTAAAA	2	12	111241	111252	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014724	AGAAAG	2	12	143957	143968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014724	AAAGAC	2	12	173107	173118	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014724	CAAAAA	2	12	203825	203836	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014724	TTGTCT	2	12	225656	225667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014724	TATAAA	2	12	236811	236822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014724	AAAACA	2	12	240178	240189	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014724	TTCCGG	2	12	257576	257587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014724	GATTAA	2	12	268181	268192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014724	TTTAGC	2	12	361765	361776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014724	TCAAGA	2	12	388938	388949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014724	TGGCTG	2	12	420852	420863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014724	TTGAGG	2	12	427982	427993	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014724	ATTTCA	2	12	431515	431526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014724	ATCTAG	2	12	434419	434430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014724	CTTTTT	2	12	440445	440456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014724	CGGAGC	2	12	452795	452806	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014724	TATTAA	2	12	457733	457744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014724	CGGAGC	2	12	472373	472384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014724	ACATTT	2	12	482934	482945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014724	ACTTAT	2	12	498489	498500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014724	CTTTTT	2	12	510868	510879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014724	TTACAA	2	12	546959	546970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014724	TTTTTA	2	12	547457	547468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014724	AGTAAA	2	12	555353	555364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014724	GGAATT	2	12	571006	571017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014724	TTCATA	2	12	589190	589201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014724	AAAAGA	2	12	596388	596399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014724	TTTCTG	2	12	596429	596440	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014724	TAAAGA	2	12	600215	600226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014724	TTGAAC	2	12	610039	610050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014724	TTTTTG	2	12	631094	631105	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014724	AATATT	2	12	666135	666146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014724	TATAAG	2	12	678473	678484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014724	TTAATG	2	12	731322	731333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014724	ATCTAT	2	12	737221	737232	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014724	TTGGTT	2	12	759313	759324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014724	CTTAGC	2	12	759500	759511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014724	ACGTTT	2	12	760252	760263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014724	ATCTAA	2	12	768183	768194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014724	CAAACT	2	12	890514	890525	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014724	TTTTAT	2	12	914518	914529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014724	TTCTAT	2	12	927798	927809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014724	AAAAAG	2	12	932261	932272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014724	CAAAAG	2	12	937193	937204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014724	CTTATG	2	12	946865	946876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014724	GATATA	2	12	950775	950786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014724	GCTATA	2	12	966610	966621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014724	TAAATA	2	12	966717	966728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014724	CTTATA	2	12	998750	998761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014724	AAGAAT	2	12	1010578	1010589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014724	AGTTAA	2	12	1030959	1030970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014724	ATATAA	2	12	1098455	1098466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014724	CTCGCA	2	12	1144127	1144138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014724	TCAGGC	2	12	1171119	1171130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014724	GTTTCA	2	12	1186564	1186575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014724	ACGGTA	2	12	1188535	1188546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014724	ATTTAT	2	12	1211255	1211266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014724	TACTAG	2	12	1212320	1212331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014724	ATTTTA	2	12	1220921	1220932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014724	TTTTTA	2	12	1228572	1228583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014724	CTTTAG	2	12	1259761	1259772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014724	TAGTCG	2	12	1262216	1262227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014724	TGAACT	2	12	1262408	1262419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014724	TAAAAT	2	12	1277455	1277466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014724	AGTTAA	2	12	1308423	1308434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014724	ATAATT	2	12	1308542	1308553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014724	CATTAG	2	12	1311488	1311499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014724	ATGAGA	2	12	1329503	1329514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014724	ACCTCA	2	12	1333339	1333350	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014724	AAAATT	2	12	1380554	1380565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014724	GAAAGT	2	12	1380620	1380631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014724	CCAGCG	2	12	1385661	1385672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014724	TTTCTT	2	12	1416730	1416741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014724	GAACAA	2	12	1475838	1475849	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014724	TTTAAT	2	12	1514693	1514704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014724	CTGGAA	2	12	1566493	1566504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014724	CTATTT	2	12	1588974	1588985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014724	CAAAAA	2	12	1593232	1593243	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014724	ACTAAA	2	12	1659915	1659926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014724	CCTTGA	2	12	1717672	1717683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014724	GCTCCG	2	12	1743134	1743145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014724	AAAAAG	2	12	1752829	1752840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014724	TTTTAT	2	12	1779117	1779128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014724	TAAAAA	2	12	1789680	1789691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014724	TTATAT	2	12	1811142	1811153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014724	AAAATA	2	12	1829928	1829939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014724	TATTTT	2	12	1876717	1876728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014724	TTCTAT	2	12	1911190	1911201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014724	AAAAGA	2	12	1920475	1920486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014724	ATTATA	2	12	1921569	1921580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014724	ATAAAA	2	12	1963807	1963818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014724	TTATTT	2	12	1971510	1971521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014724	TAGTGC	2	12	1974265	1974276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014724	CCTTTT	2	12	2010831	2010842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014724	TATTTT	2	12	2067426	2067437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.