MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	GCCGAG	3	18	3302	3319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330399458
2	NC_014723	CCGGTG	2	12	3545	3556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330399458
3	NC_014723	TTTAGC	2	12	4064	4075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330399458
4	NC_014723	CTACTG	2	12	4592	4603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330399458
5	NC_014723	TGCCGG	2	12	7231	7242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330399459
6	NC_014723	GAAAGA	2	12	7901	7912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399459
7	NC_014723	GAAGTG	2	12	8194	8205	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330399460
8	NC_014723	CTTCGG	2	12	8991	9002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399460
9	NC_014723	CCATCA	2	12	10610	10621	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330399460
10	NC_014723	CCCATC	2	12	15638	15649	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	330399460
11	NC_014723	GACTAA	2	12	15835	15846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330399460
12	NC_014723	CAAGCG	2	12	21616	21627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399468
13	NC_014723	GTCACC	2	12	21720	21731	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330399468
14	NC_014723	ACATTC	2	12	21948	21959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399468
15	NC_014723	CTGTAG	2	12	21998	22009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399468
16	NC_014723	AAAGCA	2	12	25609	25620	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330399476
17	NC_014723	TACCGA	2	12	28169	28180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399478
18	NC_014723	AGCTCA	2	12	45869	45880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399503
19	NC_014723	GTGGAC	2	12	51749	51760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330399510
20	NC_014723	CCGCCA	2	12	57041	57052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330399515
21	NC_014723	ACTGGA	2	12	63961	63972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330399523
22	NC_014723	TCGCAA	2	12	64054	64065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399523
23	NC_014723	CTGCAC	2	12	66297	66308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330399528
24	NC_014723	CGCAAA	2	12	66950	66961	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330399528
25	NC_014723	CGAGCG	2	12	67292	67303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330399529
26	NC_014723	TTTATC	2	12	70209	70220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330399531
27	NC_014723	CGCCAG	2	12	85668	85679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399553
28	NC_014723	TGATCA	2	12	86329	86340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330399553
29	NC_014723	TCTGTA	2	12	89161	89172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330399556
30	NC_014723	GACATC	2	12	94607	94618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399560
31	NC_014723	AGCGCC	2	12	98837	98848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399563
32	NC_014723	TCAAGG	2	12	100616	100627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330399564
33	NC_014723	AGCGCC	2	12	100796	100807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399564
34	NC_014723	GGGTCA	2	12	102541	102552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330399565
35	NC_014723	AGCGCC	2	12	102856	102867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399565
36	NC_014723	GCTTGA	2	12	106836	106847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
37	NC_014723	GCTTGA	2	12	107424	107435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
38	NC_014723	GCTTGA	2	12	108012	108023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
39	NC_014723	GCTTGA	2	12	108309	108320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
40	NC_014723	GCTTGA	2	12	108408	108419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
41	NC_014723	GCTTGA	2	12	108507	108518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
42	NC_014723	GCTTGA	2	12	108606	108617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
43	NC_014723	GGCAGG	2	12	113222	113233	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330399577
44	NC_014723	GGCATC	2	12	121439	121450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330399597
45	NC_014723	GCAGAA	2	12	124944	124955	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330399603
46	NC_014723	CTTTGC	2	12	127534	127545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330399606
47	NC_014723	CGAGCG	2	12	132630	132641	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330399611
48	NC_014723	GCGATC	2	12	133295	133306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330399611
49	NC_014723	GAACCC	2	12	135973	135984	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330399611
50	NC_014723	GCCGAG	2	12	136549	136560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330399611
51	NC_014723	CCGGCT	2	12	136890	136901	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330399611
52	NC_014723	AGCGAC	2	12	136970	136981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399611
53	NC_014723	GGATCG	2	12	140374	140385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330399613
54	NC_014723	CCGCGC	2	12	143216	143227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399613
55	NC_014723	CGGCAC	2	12	143315	143326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399613
56	NC_014723	GGCATC	2	12	157946	157957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330399640
57	NC_014723	CATGTT	2	12	162688	162699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330399644
58	NC_014723	ACCTCG	2	12	164054	164065	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330399648
59	NC_014723	TCTTGC	2	12	166352	166363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330399651
60	NC_014723	ATGTTT	2	12	166990	167001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330399651
61	NC_014723	ACACGC	2	12	169809	169820	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	330399656

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.