MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	ATA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014723	CAT	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014723	TTA	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014723	TGT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014723	GCA	2	6	243	248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014723	TGC	2	6	250	255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014723	TCA	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014723	ACC	2	6	16027	16032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014723	CAT	2	6	16055	16060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014723	CAA	2	6	16064	16069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014723	TGG	2	6	16124	16129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014723	TCG	2	6	16491	16496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014723	GCG	2	6	17085	17090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014723	GCA	2	6	17243	17248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014723	CGA	2	6	17321	17326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014723	GTA	2	6	17460	17465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014723	GAG	2	6	18840	18845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014723	CAT	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014723	CTT	2	6	19799	19804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014723	TGC	2	6	19994	19999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014723	GCT	2	6	20081	20086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014723	GCG	2	6	22607	22612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014723	GCA	2	6	23783	23788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014723	GAA	2	6	23799	23804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014723	ACC	2	6	24454	24459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014723	TGC	2	6	24512	24517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014723	GCG	2	6	24721	24726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014723	AGC	2	6	27352	27357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014723	GTG	2	6	27502	27507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014723	TGT	2	6	27508	27513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014723	TGA	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014723	CGG	2	6	30202	30207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014723	CGC	2	6	31609	31614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014723	GCC	2	6	32718	32723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014723	CCG	2	6	32760	32765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014723	AAC	2	6	32819	32824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014723	CCA	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014723	GCA	2	6	32951	32956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014723	ATT	2	6	33073	33078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014723	TTA	2	6	33706	33711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014723	TTG	2	6	34863	34868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014723	CGC	2	6	34871	34876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014723	AGC	2	6	35712	35717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014723	CGT	2	6	35800	35805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014723	CGG	2	6	36513	36518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014723	GCT	2	6	36781	36786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014723	GCC	2	6	36842	36847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014723	CAG	2	6	36887	36892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014723	CTT	2	6	37129	37134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014723	TTC	2	6	37170	37175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014723	CGC	2	6	37324	37329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014723	GGC	2	6	37749	37754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014723	ACT	2	6	37789	37794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014723	ATA	2	6	37801	37806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014723	TAT	2	6	37829	37834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014723	GCT	2	6	37883	37888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014723	ATT	2	6	37962	37967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014723	CGT	2	6	38126	38131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014723	TGG	2	6	38395	38400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014723	CAA	2	6	38410	38415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014723	AGC	2	6	38434	38439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014723	ATC	2	6	38453	38458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014723	GCG	2	6	38475	38480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014723	TCG	2	6	39436	39441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014723	CGG	2	6	39464	39469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014723	CCA	2	6	39487	39492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014723	GCC	2	6	39688	39693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014723	AGC	2	6	39718	39723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014723	AGG	2	6	39808	39813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014723	GCA	2	6	39875	39880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014723	GTT	2	6	39926	39931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014723	TGC	2	6	39983	39988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014723	GCC	2	6	40095	40100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014723	GAA	2	6	40190	40195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014723	TCG	2	6	40344	40349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014723	CCG	2	6	40360	40365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014723	TAG	2	6	41392	41397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014723	CGA	2	6	42020	42025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014723	CTG	2	6	42039	42044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014723	GCC	2	6	42083	42088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014723	ACC	2	6	42260	42265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014723	GAC	2	6	42329	42334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014723	GAA	2	6	42438	42443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014723	GAA	2	6	42453	42458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014723	CAG	2	6	43886	43891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014723	TGC	2	6	44320	44325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014723	CGG	2	6	45087	45092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014723	GCG	2	6	45184	45189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014723	TTG	2	6	45197	45202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014723	CGC	2	6	45209	45214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014723	CGC	2	6	45226	45231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014723	GCG	2	6	45232	45237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014723	TGC	2	6	45244	45249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014723	GAC	2	6	45442	45447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014723	GGC	2	6	45462	45467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014723	GTG	2	6	46485	46490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014723	CTG	2	6	46527	46532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014723	CGA	2	6	46578	46583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014723	AGC	2	6	46855	46860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014723	ATG	2	6	47505	47510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014723	GCC	2	6	47553	47558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014723	CTG	2	6	48023	48028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014723	TTG	2	6	48180	48185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014723	GCT	2	6	50763	50768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014723	CAA	3	9	53876	53884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014723	CGG	2	6	53941	53946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014723	CGG	2	6	53960	53965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014723	CAT	2	6	54028	54033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014723	CGC	2	6	54106	54111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014723	GAA	2	6	54269	54274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014723	CTG	2	6	54337	54342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014723	GTC	2	6	54343	54348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014723	TGC	2	6	55917	55922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014723	GGC	2	6	56012	56017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014723	GAA	2	6	56069	56074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014723	GTA	2	6	56075	56080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014723	TTC	2	6	56149	56154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014723	CAA	2	6	56165	56170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014723	CGT	2	6	56240	56245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014723	GCA	2	6	56256	56261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014723	GCC	2	6	75859	75864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014723	AGG	2	6	76502	76507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014723	GGT	2	6	76789	76794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014723	GAT	2	6	76891	76896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014723	CAA	2	6	77697	77702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014723	CTG	2	6	77748	77753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014723	GTG	2	6	78020	78025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014723	GCT	2	6	78086	78091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014723	ATC	2	6	78155	78160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014723	CCA	2	6	78163	78168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014723	CGA	2	6	78606	78611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014723	GGC	2	6	78710	78715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014723	CAA	2	6	80162	80167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014723	GCT	2	6	80192	80197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014723	CCG	2	6	80213	80218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014723	GAT	2	6	80228	80233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014723	TAA	2	6	80397	80402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014723	AGT	2	6	80468	80473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014723	ACA	2	6	80511	80516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.