MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 1849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399457
2	NC_014723	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399457
3	NC_014723	AAG	2	6	628	633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399457
4	NC_014723	CAG	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399457
5	NC_014723	CGG	2	6	748	753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399457
6	NC_014723	CAT	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399457
7	NC_014723	GTC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399457
8	NC_014723	CAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399457
9	NC_014723	CAC	2	6	953	958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399457
10	NC_014723	TAC	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399457
11	NC_014723	ACG	2	6	1064	1069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399457
12	NC_014723	GAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399457
13	NC_014723	ACA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399457
14	NC_014723	CAG	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
15	NC_014723	GCC	2	6	1408	1413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
16	NC_014723	GCC	2	6	1421	1426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
17	NC_014723	CAG	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
18	NC_014723	GAT	3	9	1486	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399458
19	NC_014723	CAG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
20	NC_014723	TCG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399458
21	NC_014723	ACC	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
22	NC_014723	CGA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
23	NC_014723	ACC	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
24	NC_014723	TGC	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399458
25	NC_014723	CTC	2	6	2182	2187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399458
26	NC_014723	TGA	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399458
27	NC_014723	GTC	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399458
28	NC_014723	GCC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
29	NC_014723	ACC	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
30	NC_014723	AGC	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
31	NC_014723	GCA	2	6	2596	2601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
32	NC_014723	CCG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
33	NC_014723	CGG	2	6	2705	2710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399458
34	NC_014723	CGG	3	9	2751	2759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399458
35	NC_014723	GCC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
36	NC_014723	GAC	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
37	NC_014723	CAC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
38	NC_014723	GCA	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
39	NC_014723	GCA	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399458
40	NC_014723	CAT	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399458
41	NC_014723	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399458
42	NC_014723	CAC	3	9	3217	3225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
43	NC_014723	ACT	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399458
44	NC_014723	TCT	2	6	3442	3447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399458
45	NC_014723	AGG	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399458
46	NC_014723	TGA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399458
47	NC_014723	CCA	2	6	3496	3501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399458
48	NC_014723	CCG	2	6	3537	3542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
49	NC_014723	CAA	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399458
50	NC_014723	GCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399458
51	NC_014723	GTT	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399458
52	NC_014723	AAG	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399458
53	NC_014723	GTA	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399458
54	NC_014723	ATG	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399458
55	NC_014723	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399458
56	NC_014723	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399458
57	NC_014723	CCG	2	6	4686	4691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399458
58	NC_014723	CTA	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
59	NC_014723	TAG	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399459
60	NC_014723	GCG	2	6	4900	4905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399459
61	NC_014723	CAT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
62	NC_014723	CAG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
63	NC_014723	AGC	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
64	NC_014723	GCT	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399459
65	NC_014723	GGA	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399459
66	NC_014723	GCC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399459
67	NC_014723	CGA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
68	NC_014723	TCG	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399459
69	NC_014723	CGG	2	6	5695	5700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399459
70	NC_014723	AGG	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399459
71	NC_014723	CGA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
72	NC_014723	CAA	2	6	5909	5914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399459
73	NC_014723	CTT	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399459
74	NC_014723	CAT	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
75	NC_014723	ATG	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399459
76	NC_014723	TCA	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
77	NC_014723	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399459
78	NC_014723	AAC	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399459
79	NC_014723	CCG	2	6	6412	6417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399459
80	NC_014723	CCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399459
81	NC_014723	GGC	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399459
82	NC_014723	CAA	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399459
83	NC_014723	CGG	2	6	7090	7095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399459
84	NC_014723	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
85	NC_014723	GGT	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399459
86	NC_014723	GTG	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399459
87	NC_014723	CCG	2	6	7287	7292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399459
88	NC_014723	ATC	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
89	NC_014723	AAC	2	6	7406	7411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399459
90	NC_014723	CTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399459
91	NC_014723	GCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399459
92	NC_014723	TCA	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399459
93	NC_014723	GCG	2	6	7759	7764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399459
94	NC_014723	GTG	2	6	7947	7952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399459
95	NC_014723	TCT	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399459
96	NC_014723	CCT	2	6	8296	8301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399460
97	NC_014723	TCG	2	6	8369	8374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399460
98	NC_014723	CAA	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399460
99	NC_014723	CCA	2	6	8411	8416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399460
100	NC_014723	CGG	2	6	8474	8479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399460
101	NC_014723	CCG	2	6	8632	8637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
102	NC_014723	CTA	3	9	9177	9185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399460
103	NC_014723	GCC	2	6	9211	9216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
104	NC_014723	GTG	2	6	9244	9249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399460
105	NC_014723	CGC	2	6	9297	9302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
106	NC_014723	GGT	2	6	9333	9338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399460
107	NC_014723	CAC	3	9	9417	9425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399460
108	NC_014723	GCC	2	6	9488	9493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
109	NC_014723	GGC	2	6	9579	9584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399460
110	NC_014723	CAG	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399460
111	NC_014723	GTA	2	6	9793	9798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399460
112	NC_014723	CGA	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399460
113	NC_014723	CGA	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399460
114	NC_014723	GCT	2	6	9843	9848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399460
115	NC_014723	CCG	2	6	9917	9922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
116	NC_014723	CAA	2	6	9946	9951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399460
117	NC_014723	ATC	2	6	9997	10002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399460
118	NC_014723	CTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399460
119	NC_014723	GCC	2	6	10020	10025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
120	NC_014723	ACA	2	6	10091	10096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399460
121	NC_014723	AAG	2	6	10125	10130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399460
122	NC_014723	ACT	2	6	10241	10246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399460
123	NC_014723	TCG	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399460
124	NC_014723	GCC	2	6	10384	10389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
125	NC_014723	CGG	2	6	10436	10441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399460
126	NC_014723	CGC	2	6	10518	10523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399460
127	NC_014723	GCA	2	6	10538	10543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399460
128	NC_014723	TGC	2	6	10592	10597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399460
129	NC_014723	TGT	2	6	10730	10735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399460
130	NC_014723	AGC	3	9	10806	10814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399460
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249	NC_014723	CAT	2	6	18249	18254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399463
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251	NC_014723	TCT	2	6	18505	18510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399463
252	NC_014723	TGC	2	6	18613	18618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399464
253	NC_014723	GTG	2	6	18648	18653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399464
254	NC_014723	CAT	2	6	18722	18727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399464
255	NC_014723	TCG	2	6	18968	18973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399465
256	NC_014723	ACG	2	6	19035	19040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399465
257	NC_014723	ATT	2	6	19053	19058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399465
258	NC_014723	GTG	2	6	19140	19145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399465
259	NC_014723	CAT	2	6	19277	19282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399465
260	NC_014723	CCG	2	6	19314	19319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399465
261	NC_014723	ACT	2	6	19332	19337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399465
262	NC_014723	CCA	2	6	19440	19445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399466
263	NC_014723	GCT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399466
264	NC_014723	TTC	2	6	19624	19629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399466
265	NC_014723	CTT	2	6	19642	19647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399466
266	NC_014723	ACG	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399467
267	NC_014723	GCT	2	6	20256	20261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399467
268	NC_014723	TGC	2	6	20335	20340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399467
269	NC_014723	ACC	3	9	20378	20386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399467
270	NC_014723	GCC	2	6	20523	20528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399467
271	NC_014723	CAT	2	6	20758	20763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399467
272	NC_014723	CAA	2	6	20801	20806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399467
273	NC_014723	GCA	3	9	20866	20874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399467
274	NC_014723	ATC	2	6	20985	20990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399467
275	NC_014723	GAC	2	6	20998	21003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399467
276	NC_014723	TGC	2	6	21210	21215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399468
277	NC_014723	GCC	2	6	21222	21227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399468
278	NC_014723	TCG	2	6	21244	21249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399468
279	NC_014723	TCG	2	6	21324	21329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399468
280	NC_014723	GCG	2	6	21465	21470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399468
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282	NC_014723	TGG	2	6	21503	21508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399468
283	NC_014723	CCG	2	6	21541	21546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399468
284	NC_014723	TTC	2	6	21566	21571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399468
285	NC_014723	TCC	2	6	21663	21668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399468
286	NC_014723	GAA	2	6	21682	21687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399468
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291	NC_014723	CGC	2	6	22217	22222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399469
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377	NC_014723	TCA	2	6	31439	31444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399480
378	NC_014723	GCA	2	6	31523	31528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399480
379	NC_014723	GCA	2	6	31875	31880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399481
380	NC_014723	TGT	2	6	31935	31940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399481
381	NC_014723	CTT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399481
382	NC_014723	ATA	2	6	32015	32020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399481
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385	NC_014723	GCA	2	6	32115	32120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399481
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498	NC_014723	GAG	2	6	46236	46241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399503
499	NC_014723	CTG	2	6	46298	46303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399503
500	NC_014723	TTG	2	6	46711	46716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399504

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