MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	TA	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	330399457
2	NC_014723	GA	3	6	1009	1014	50 %	0 %	50 %	0 %	330399457
3	NC_014723	CT	3	6	1027	1032	0 %	50 %	0 %	50 %	330399457
4	NC_014723	CG	3	6	1126	1131	0 %	0 %	50 %	50 %	330399457
5	NC_014723	CG	4	8	1692	1699	0 %	0 %	50 %	50 %	330399458
6	NC_014723	GA	3	6	4754	4759	50 %	0 %	50 %	0 %	330399458
7	NC_014723	AC	3	6	5179	5184	50 %	0 %	0 %	50 %	330399459
8	NC_014723	GT	4	8	8783	8790	0 %	50 %	50 %	0 %	330399460
9	NC_014723	GC	3	6	9094	9099	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
10	NC_014723	GC	3	6	10528	10533	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
11	NC_014723	GC	3	6	10685	10690	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
12	NC_014723	TC	3	6	10994	10999	0 %	50 %	0 %	50 %	330399460
13	NC_014723	GC	3	6	12311	12316	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
14	NC_014723	CT	3	6	13311	13316	0 %	50 %	0 %	50 %	330399460
15	NC_014723	CG	3	6	13509	13514	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
16	NC_014723	GC	3	6	14653	14658	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
17	NC_014723	GA	3	6	16144	16149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014723	GC	3	6	16199	16204	0 %	0 %	50 %	50 %	330399461
19	NC_014723	GC	3	6	16818	16823	0 %	0 %	50 %	50 %	330399462
20	NC_014723	GC	3	6	17296	17301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014723	CG	3	6	18530	18535	0 %	0 %	50 %	50 %	330399463
22	NC_014723	TC	3	6	19834	19839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014723	TG	3	6	21916	21921	0 %	50 %	50 %	0 %	330399468
24	NC_014723	CG	4	8	22117	22124	0 %	0 %	50 %	50 %	330399468
25	NC_014723	GC	3	6	22277	22282	0 %	0 %	50 %	50 %	330399469
26	NC_014723	AT	3	6	22287	22292	50 %	50 %	0 %	0 %	330399469
27	NC_014723	GC	3	6	22319	22324	0 %	0 %	50 %	50 %	330399469
28	NC_014723	TG	3	6	23468	23473	0 %	50 %	50 %	0 %	330399472
29	NC_014723	GC	4	8	24014	24021	0 %	0 %	50 %	50 %	330399473
30	NC_014723	GC	3	6	24186	24191	0 %	0 %	50 %	50 %	330399473
31	NC_014723	CG	3	6	25314	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	330399475
32	NC_014723	CG	3	6	25338	25343	0 %	0 %	50 %	50 %	330399475
33	NC_014723	GC	3	6	25892	25897	0 %	0 %	50 %	50 %	330399476
34	NC_014723	CG	3	6	26036	26041	0 %	0 %	50 %	50 %	330399476
35	NC_014723	TC	3	6	26947	26952	0 %	50 %	0 %	50 %	330399477
36	NC_014723	GC	3	6	27514	27519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014723	CT	3	6	27835	27840	0 %	50 %	0 %	50 %	330399478
38	NC_014723	CG	3	6	29867	29872	0 %	0 %	50 %	50 %	330399479
39	NC_014723	CG	8	16	30539	30554	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
40	NC_014723	CG	3	6	30611	30616	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
41	NC_014723	CG	3	6	30636	30641	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
42	NC_014723	TA	4	8	30917	30924	50 %	50 %	0 %	0 %	330399480
43	NC_014723	CG	3	6	33423	33428	0 %	0 %	50 %	50 %	330399485
44	NC_014723	GC	3	6	34023	34028	0 %	0 %	50 %	50 %	330399486
45	NC_014723	TC	3	6	35763	35768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014723	GC	4	8	36284	36291	0 %	0 %	50 %	50 %	330399490
47	NC_014723	GA	3	6	36852	36857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014723	GC	3	6	37259	37264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014723	CG	3	6	37623	37628	0 %	0 %	50 %	50 %	330399492
50	NC_014723	AC	3	6	37642	37647	50 %	0 %	0 %	50 %	330399492
51	NC_014723	GC	3	6	37649	37654	0 %	0 %	50 %	50 %	330399492
52	NC_014723	TG	3	6	38211	38216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014723	TG	4	8	38350	38357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014723	CG	3	6	38547	38552	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
55	NC_014723	GC	3	6	38868	38873	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
56	NC_014723	CG	3	6	39012	39017	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
57	NC_014723	CG	5	10	39259	39268	0 %	0 %	50 %	50 %	330399494
58	NC_014723	AC	3	6	39773	39778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014723	GT	3	6	39919	39924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014723	AT	3	6	40170	40175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014723	CG	3	6	40287	40292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014723	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014723	CG	3	6	40492	40497	0 %	0 %	50 %	50 %	330399495
64	NC_014723	GC	3	6	40594	40599	0 %	0 %	50 %	50 %	330399495
65	NC_014723	CA	3	6	41424	41429	50 %	0 %	0 %	50 %	330399496
66	NC_014723	CA	3	6	42184	42189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014723	GT	3	6	42217	42222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014723	GC	3	6	42570	42575	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
69	NC_014723	GC	3	6	42604	42609	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
70	NC_014723	CG	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
71	NC_014723	CG	3	6	43431	43436	0 %	0 %	50 %	50 %	330399498
72	NC_014723	GC	3	6	44027	44032	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
73	NC_014723	GC	3	6	44111	44116	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
74	NC_014723	GC	3	6	44220	44225	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
75	NC_014723	CG	3	6	44332	44337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014723	GC	3	6	44951	44956	0 %	0 %	50 %	50 %	330399501
77	NC_014723	CG	3	6	44992	44997	0 %	0 %	50 %	50 %	330399501
78	NC_014723	CG	3	6	45114	45119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014723	GC	3	6	45677	45682	0 %	0 %	50 %	50 %	330399502
80	NC_014723	CG	4	8	45740	45747	0 %	0 %	50 %	50 %	330399502
81	NC_014723	GA	3	6	47127	47132	50 %	0 %	50 %	0 %	330399505
82	NC_014723	CG	3	6	47266	47271	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
83	NC_014723	GC	3	6	47273	47278	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
84	NC_014723	GC	4	8	47294	47301	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
85	NC_014723	AC	3	6	47485	47490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014723	CA	3	6	48164	48169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014723	CG	3	6	48718	48723	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
88	NC_014723	CG	5	10	49302	49311	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
89	NC_014723	AG	3	6	49557	49562	50 %	0 %	50 %	0 %	330399509
90	NC_014723	TC	3	6	50023	50028	0 %	50 %	0 %	50 %	330399509
91	NC_014723	CG	3	6	50222	50227	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
92	NC_014723	GC	3	6	50613	50618	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
93	NC_014723	CA	4	8	51419	51426	50 %	0 %	0 %	50 %	330399510
94	NC_014723	AG	3	6	51617	51622	50 %	0 %	50 %	0 %	330399510
95	NC_014723	CT	3	6	51664	51669	0 %	50 %	0 %	50 %	330399510
96	NC_014723	GA	3	6	53036	53041	50 %	0 %	50 %	0 %	330399511
97	NC_014723	AT	3	6	54066	54071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014723	AT	3	6	54394	54399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014723	TC	3	6	54834	54839	0 %	50 %	0 %	50 %	330399512
100	NC_014723	GC	3	6	55312	55317	0 %	0 %	50 %	50 %	330399513
101	NC_014723	AC	3	6	55558	55563	50 %	0 %	0 %	50 %	330399513
102	NC_014723	AC	3	6	56030	56035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014723	CG	3	6	56469	56474	0 %	0 %	50 %	50 %	330399514
104	NC_014723	TC	3	6	56861	56866	0 %	50 %	0 %	50 %	330399515
105	NC_014723	CG	3	6	56970	56975	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
106	NC_014723	CG	3	6	57099	57104	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
107	NC_014723	GC	4	8	57308	57315	0 %	0 %	50 %	50 %	330399516
108	NC_014723	CG	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
109	NC_014723	GC	3	6	59114	59119	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
110	NC_014723	GC	3	6	59736	59741	0 %	0 %	50 %	50 %	330399520
111	NC_014723	GC	3	6	60535	60540	0 %	0 %	50 %	50 %	330399520
112	NC_014723	GT	3	6	60873	60878	0 %	50 %	50 %	0 %	330399521
113	NC_014723	GC	3	6	61026	61031	0 %	0 %	50 %	50 %	330399521
114	NC_014723	CG	3	6	61702	61707	0 %	0 %	50 %	50 %	330399522
115	NC_014723	AC	3	6	62260	62265	50 %	0 %	0 %	50 %	330399523
116	NC_014723	GC	3	6	62545	62550	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
117	NC_014723	CG	3	6	62722	62727	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
118	NC_014723	AG	3	6	62770	62775	50 %	0 %	50 %	0 %	330399523
119	NC_014723	GC	3	6	64151	64156	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
120	NC_014723	AT	3	6	65295	65300	50 %	50 %	0 %	0 %	330399526
121	NC_014723	GC	3	6	65577	65582	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
122	NC_014723	GC	3	6	65719	65724	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
123	NC_014723	CG	3	6	67501	67506	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
124	NC_014723	CG	3	6	67737	67742	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
125	NC_014723	TC	3	6	67777	67782	0 %	50 %	0 %	50 %	330399529
126	NC_014723	CG	3	6	67921	67926	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
127	NC_014723	GC	3	6	68061	68066	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
128	NC_014723	GT	3	6	68763	68768	0 %	50 %	50 %	0 %	330399530
129	NC_014723	GT	3	6	69228	69233	0 %	50 %	50 %	0 %	330399531
130	NC_014723	GC	3	6	71551	71556	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
131	NC_014723	CG	3	6	72617	72622	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
132	NC_014723	GC	3	6	72733	72738	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
133	NC_014723	GC	3	6	73246	73251	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
134	NC_014723	GC	3	6	73373	73378	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
135	NC_014723	CG	3	6	74760	74765	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
136	NC_014723	GC	3	6	75003	75008	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
137	NC_014723	GC	3	6	75224	75229	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
138	NC_014723	CG	3	6	75482	75487	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
139	NC_014723	GT	3	6	75537	75542	0 %	50 %	50 %	0 %	330399535
140	NC_014723	CA	3	6	77314	77319	50 %	0 %	0 %	50 %	330399539
141	NC_014723	AT	3	6	77845	77850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014723	GC	3	6	78459	78464	0 %	0 %	50 %	50 %	330399540
143	NC_014723	GA	3	6	79306	79311	50 %	0 %	50 %	0 %	330399541
144	NC_014723	CG	3	6	79558	79563	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
145	NC_014723	CG	3	6	80080	80085	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.