MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	TA	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	330399457
2	NC_014723	GA	3	6	1009	1014	50 %	0 %	50 %	0 %	330399457
3	NC_014723	CT	3	6	1027	1032	0 %	50 %	0 %	50 %	330399457
4	NC_014723	CG	3	6	1126	1131	0 %	0 %	50 %	50 %	330399457
5	NC_014723	CG	4	8	1692	1699	0 %	0 %	50 %	50 %	330399458
6	NC_014723	GA	3	6	4754	4759	50 %	0 %	50 %	0 %	330399458
7	NC_014723	AC	3	6	5179	5184	50 %	0 %	0 %	50 %	330399459
8	NC_014723	GT	4	8	8783	8790	0 %	50 %	50 %	0 %	330399460
9	NC_014723	GC	3	6	9094	9099	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
10	NC_014723	GC	3	6	10528	10533	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
11	NC_014723	GC	3	6	10685	10690	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
12	NC_014723	TC	3	6	10994	10999	0 %	50 %	0 %	50 %	330399460
13	NC_014723	GC	3	6	12311	12316	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
14	NC_014723	CT	3	6	13311	13316	0 %	50 %	0 %	50 %	330399460
15	NC_014723	CG	3	6	13509	13514	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
16	NC_014723	GC	3	6	14653	14658	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
17	NC_014723	GC	3	6	16199	16204	0 %	0 %	50 %	50 %	330399461
18	NC_014723	GC	3	6	16818	16823	0 %	0 %	50 %	50 %	330399462
19	NC_014723	CG	3	6	18530	18535	0 %	0 %	50 %	50 %	330399463
20	NC_014723	TG	3	6	21916	21921	0 %	50 %	50 %	0 %	330399468
21	NC_014723	CG	4	8	22117	22124	0 %	0 %	50 %	50 %	330399468
22	NC_014723	GC	3	6	22277	22282	0 %	0 %	50 %	50 %	330399469
23	NC_014723	AT	3	6	22287	22292	50 %	50 %	0 %	0 %	330399469
24	NC_014723	GC	3	6	22319	22324	0 %	0 %	50 %	50 %	330399469
25	NC_014723	TG	3	6	23468	23473	0 %	50 %	50 %	0 %	330399472
26	NC_014723	GC	4	8	24014	24021	0 %	0 %	50 %	50 %	330399473
27	NC_014723	GC	3	6	24186	24191	0 %	0 %	50 %	50 %	330399473
28	NC_014723	CG	3	6	25314	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	330399475
29	NC_014723	CG	3	6	25338	25343	0 %	0 %	50 %	50 %	330399475
30	NC_014723	GC	3	6	25892	25897	0 %	0 %	50 %	50 %	330399476
31	NC_014723	CG	3	6	26036	26041	0 %	0 %	50 %	50 %	330399476
32	NC_014723	TC	3	6	26947	26952	0 %	50 %	0 %	50 %	330399477
33	NC_014723	CT	3	6	27835	27840	0 %	50 %	0 %	50 %	330399478
34	NC_014723	CG	3	6	29867	29872	0 %	0 %	50 %	50 %	330399479
35	NC_014723	CG	8	16	30539	30554	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
36	NC_014723	CG	3	6	30611	30616	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
37	NC_014723	CG	3	6	30636	30641	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
38	NC_014723	TA	4	8	30917	30924	50 %	50 %	0 %	0 %	330399480
39	NC_014723	CG	3	6	33423	33428	0 %	0 %	50 %	50 %	330399485
40	NC_014723	GC	3	6	34023	34028	0 %	0 %	50 %	50 %	330399486
41	NC_014723	GC	4	8	36284	36291	0 %	0 %	50 %	50 %	330399490
42	NC_014723	CG	3	6	37623	37628	0 %	0 %	50 %	50 %	330399492
43	NC_014723	AC	3	6	37642	37647	50 %	0 %	0 %	50 %	330399492
44	NC_014723	GC	3	6	37649	37654	0 %	0 %	50 %	50 %	330399492
45	NC_014723	CG	3	6	38547	38552	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
46	NC_014723	GC	3	6	38868	38873	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
47	NC_014723	CG	3	6	39012	39017	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
48	NC_014723	CG	5	10	39259	39268	0 %	0 %	50 %	50 %	330399494
49	NC_014723	CG	3	6	40492	40497	0 %	0 %	50 %	50 %	330399495
50	NC_014723	GC	3	6	40594	40599	0 %	0 %	50 %	50 %	330399495
51	NC_014723	CA	3	6	41424	41429	50 %	0 %	0 %	50 %	330399496
52	NC_014723	GC	3	6	42570	42575	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
53	NC_014723	GC	3	6	42604	42609	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
54	NC_014723	CG	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	330399497
55	NC_014723	CG	3	6	43431	43436	0 %	0 %	50 %	50 %	330399498
56	NC_014723	GC	3	6	44027	44032	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
57	NC_014723	GC	3	6	44111	44116	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
58	NC_014723	GC	3	6	44220	44225	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
59	NC_014723	GC	3	6	44951	44956	0 %	0 %	50 %	50 %	330399501
60	NC_014723	CG	3	6	44992	44997	0 %	0 %	50 %	50 %	330399501
61	NC_014723	GC	3	6	45677	45682	0 %	0 %	50 %	50 %	330399502
62	NC_014723	CG	4	8	45740	45747	0 %	0 %	50 %	50 %	330399502
63	NC_014723	GA	3	6	47127	47132	50 %	0 %	50 %	0 %	330399505
64	NC_014723	CG	3	6	47266	47271	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
65	NC_014723	GC	3	6	47273	47278	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
66	NC_014723	GC	4	8	47294	47301	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
67	NC_014723	CG	3	6	48718	48723	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
68	NC_014723	CG	5	10	49302	49311	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
69	NC_014723	AG	3	6	49557	49562	50 %	0 %	50 %	0 %	330399509
70	NC_014723	TC	3	6	50023	50028	0 %	50 %	0 %	50 %	330399509
71	NC_014723	CG	3	6	50222	50227	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
72	NC_014723	GC	3	6	50613	50618	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
73	NC_014723	CA	4	8	51419	51426	50 %	0 %	0 %	50 %	330399510
74	NC_014723	AG	3	6	51617	51622	50 %	0 %	50 %	0 %	330399510
75	NC_014723	CT	3	6	51664	51669	0 %	50 %	0 %	50 %	330399510
76	NC_014723	GA	3	6	53036	53041	50 %	0 %	50 %	0 %	330399511
77	NC_014723	TC	3	6	54834	54839	0 %	50 %	0 %	50 %	330399512
78	NC_014723	GC	3	6	55312	55317	0 %	0 %	50 %	50 %	330399513
79	NC_014723	AC	3	6	55558	55563	50 %	0 %	0 %	50 %	330399513
80	NC_014723	CG	3	6	56469	56474	0 %	0 %	50 %	50 %	330399514
81	NC_014723	TC	3	6	56861	56866	0 %	50 %	0 %	50 %	330399515
82	NC_014723	CG	3	6	56970	56975	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
83	NC_014723	CG	3	6	57099	57104	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
84	NC_014723	GC	4	8	57308	57315	0 %	0 %	50 %	50 %	330399516
85	NC_014723	CG	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
86	NC_014723	GC	3	6	59114	59119	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
87	NC_014723	GC	3	6	59736	59741	0 %	0 %	50 %	50 %	330399520
88	NC_014723	GC	3	6	60535	60540	0 %	0 %	50 %	50 %	330399520
89	NC_014723	GT	3	6	60873	60878	0 %	50 %	50 %	0 %	330399521
90	NC_014723	GC	3	6	61026	61031	0 %	0 %	50 %	50 %	330399521
91	NC_014723	CG	3	6	61702	61707	0 %	0 %	50 %	50 %	330399522
92	NC_014723	AC	3	6	62260	62265	50 %	0 %	0 %	50 %	330399523
93	NC_014723	GC	3	6	62545	62550	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
94	NC_014723	CG	3	6	62722	62727	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
95	NC_014723	AG	3	6	62770	62775	50 %	0 %	50 %	0 %	330399523
96	NC_014723	GC	3	6	64151	64156	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
97	NC_014723	AT	3	6	65295	65300	50 %	50 %	0 %	0 %	330399526
98	NC_014723	GC	3	6	65577	65582	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
99	NC_014723	GC	3	6	65719	65724	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
100	NC_014723	CG	3	6	67501	67506	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
101	NC_014723	CG	3	6	67737	67742	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
102	NC_014723	TC	3	6	67777	67782	0 %	50 %	0 %	50 %	330399529
103	NC_014723	CG	3	6	67921	67926	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
104	NC_014723	GC	3	6	68061	68066	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
105	NC_014723	GT	3	6	68763	68768	0 %	50 %	50 %	0 %	330399530
106	NC_014723	GT	3	6	69228	69233	0 %	50 %	50 %	0 %	330399531
107	NC_014723	GC	3	6	71551	71556	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
108	NC_014723	CG	3	6	72617	72622	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
109	NC_014723	GC	3	6	72733	72738	0 %	0 %	50 %	50 %	330399534
110	NC_014723	GC	3	6	73246	73251	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
111	NC_014723	GC	3	6	73373	73378	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
112	NC_014723	CG	3	6	74760	74765	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
113	NC_014723	GC	3	6	75003	75008	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
114	NC_014723	GC	3	6	75224	75229	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
115	NC_014723	CG	3	6	75482	75487	0 %	0 %	50 %	50 %	330399535
116	NC_014723	GT	3	6	75537	75542	0 %	50 %	50 %	0 %	330399535
117	NC_014723	CA	3	6	77314	77319	50 %	0 %	0 %	50 %	330399539
118	NC_014723	GC	3	6	78459	78464	0 %	0 %	50 %	50 %	330399540
119	NC_014723	GA	3	6	79306	79311	50 %	0 %	50 %	0 %	330399541
120	NC_014723	CG	3	6	79558	79563	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
121	NC_014723	CG	3	6	80080	80085	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
122	NC_014723	TG	3	6	80761	80766	0 %	50 %	50 %	0 %	330399542
123	NC_014723	AC	4	8	80794	80801	50 %	0 %	0 %	50 %	330399542
124	NC_014723	GC	3	6	82572	82577	0 %	0 %	50 %	50 %	330399545
125	NC_014723	CG	3	6	85348	85353	0 %	0 %	50 %	50 %	330399551
126	NC_014723	CG	3	6	85639	85644	0 %	0 %	50 %	50 %	330399553
127	NC_014723	GT	3	6	86818	86823	0 %	50 %	50 %	0 %	330399554
128	NC_014723	AG	3	6	87162	87167	50 %	0 %	50 %	0 %	330399554
129	NC_014723	AG	3	6	87366	87371	50 %	0 %	50 %	0 %	330399554
130	NC_014723	TG	3	6	87689	87694	0 %	50 %	50 %	0 %	330399555
131	NC_014723	CG	3	6	87837	87842	0 %	0 %	50 %	50 %	330399555
132	NC_014723	GC	3	6	88590	88595	0 %	0 %	50 %	50 %	330399556
133	NC_014723	CG	3	6	88609	88614	0 %	0 %	50 %	50 %	330399556
134	NC_014723	CG	3	6	88657	88662	0 %	0 %	50 %	50 %	330399556
135	NC_014723	GT	3	6	91010	91015	0 %	50 %	50 %	0 %	330399557
136	NC_014723	CG	3	6	91120	91125	0 %	0 %	50 %	50 %	330399557
137	NC_014723	GC	4	8	91392	91399	0 %	0 %	50 %	50 %	330399558
138	NC_014723	GT	3	6	91634	91639	0 %	50 %	50 %	0 %	330399558
139	NC_014723	CG	3	6	92040	92045	0 %	0 %	50 %	50 %	330399558
140	NC_014723	GC	5	10	92329	92338	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
141	NC_014723	GC	3	6	92407	92412	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
142	NC_014723	CG	3	6	92490	92495	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.