MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 2183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CGTAT	2	10	675	684	20 %	40 %	20 %	20 %	312794750
2	NC_014722	AGCGC	2	10	3491	3500	20 %	0 %	40 %	40 %	312794752
3	NC_014722	GACGC	2	10	5125	5134	20 %	0 %	40 %	40 %	312794752
4	NC_014722	GTGGG	2	10	9770	9779	0 %	20 %	80 %	0 %	312794756
5	NC_014722	AGCAC	2	10	10202	10211	40 %	0 %	20 %	40 %	312794756
6	NC_014722	CAAAC	2	10	13680	13689	60 %	0 %	0 %	40 %	312794759
7	NC_014722	GGCTA	2	10	16149	16158	20 %	20 %	40 %	20 %	312794762
8	NC_014722	GCCCT	2	10	17527	17536	0 %	20 %	20 %	60 %	312794762
9	NC_014722	TCGCT	2	10	17676	17685	0 %	40 %	20 %	40 %	312794762
10	NC_014722	CGAGA	2	10	18661	18670	40 %	0 %	40 %	20 %	312794763
11	NC_014722	GCTTT	2	10	20673	20682	0 %	60 %	20 %	20 %	312794764
12	NC_014722	CTTAT	2	10	20764	20773	20 %	60 %	0 %	20 %	312794764
13	NC_014722	GGAAC	2	10	24456	24465	40 %	0 %	40 %	20 %	312794767
14	NC_014722	AATCG	2	10	26631	26640	40 %	20 %	20 %	20 %	312794768
15	NC_014722	ATAAA	2	10	26720	26729	80 %	20 %	0 %	0 %	312794768
16	NC_014722	TGCCA	2	10	31985	31994	20 %	20 %	20 %	40 %	312794769
17	NC_014722	GCTCG	2	10	32898	32907	0 %	20 %	40 %	40 %	312794771
18	NC_014722	TCCTG	2	10	33073	33082	0 %	40 %	20 %	40 %	312794771
19	NC_014722	GCATC	2	10	33503	33512	20 %	20 %	20 %	40 %	312794771
20	NC_014722	CCATC	2	10	34055	34064	20 %	20 %	0 %	60 %	312794771
21	NC_014722	CGCAC	2	10	34767	34776	20 %	0 %	20 %	60 %	312794772
22	NC_014722	ATTTT	2	10	36285	36294	20 %	80 %	0 %	0 %	312794775
23	NC_014722	ACCGC	2	10	36528	36537	20 %	0 %	20 %	60 %	312794775
24	NC_014722	ACGTC	2	10	39606	39615	20 %	20 %	20 %	40 %	312794777
25	NC_014722	CAGCG	2	10	44476	44485	20 %	0 %	40 %	40 %	312794787
26	NC_014722	GCCGC	2	10	44505	44514	0 %	0 %	40 %	60 %	312794787
27	NC_014722	GTAGC	2	10	45928	45937	20 %	20 %	40 %	20 %	312794788
28	NC_014722	TGCGA	2	10	46205	46214	20 %	20 %	40 %	20 %	312794788
29	NC_014722	GCCAT	2	10	46221	46230	20 %	20 %	20 %	40 %	312794788
30	NC_014722	GCGCA	2	10	47922	47931	20 %	0 %	40 %	40 %	312794789
31	NC_014722	ATACG	2	10	48272	48281	40 %	20 %	20 %	20 %	312794789
32	NC_014722	TGGCA	2	10	51143	51152	20 %	20 %	40 %	20 %	312794793
33	NC_014722	CTGAT	2	10	53886	53895	20 %	40 %	20 %	20 %	312794797
34	NC_014722	GAAAT	2	10	56849	56858	60 %	20 %	20 %	0 %	312794803
35	NC_014722	TCGAC	2	10	58320	58329	20 %	20 %	20 %	40 %	312794806
36	NC_014722	GCCCA	2	10	60896	60905	20 %	0 %	20 %	60 %	312794807
37	NC_014722	TTTCG	2	10	62239	62248	0 %	60 %	20 %	20 %	312794807
38	NC_014722	GGCCA	2	10	64116	64125	20 %	0 %	40 %	40 %	312794808
39	NC_014722	CACTT	2	10	67564	67573	20 %	40 %	0 %	40 %	312794812
40	NC_014722	TCGCC	2	10	68029	68038	0 %	20 %	20 %	60 %	312794813
41	NC_014722	CGGCG	2	10	69599	69608	0 %	0 %	60 %	40 %	312794816
42	NC_014722	CAATC	2	10	70331	70340	40 %	20 %	0 %	40 %	312794818
43	NC_014722	TCGCC	2	10	71053	71062	0 %	20 %	20 %	60 %	312794818
44	NC_014722	ACGGG	2	10	71831	71840	20 %	0 %	60 %	20 %	312794819
45	NC_014722	GGCCC	2	10	72374	72383	0 %	0 %	40 %	60 %	312794819
46	NC_014722	CGGCG	2	10	73732	73741	0 %	0 %	60 %	40 %	312794820
47	NC_014722	CGAAG	2	10	78969	78978	40 %	0 %	40 %	20 %	312794825
48	NC_014722	CATTC	2	10	79145	79154	20 %	40 %	0 %	40 %	312794825
49	NC_014722	CCGGC	2	10	83481	83490	0 %	0 %	40 %	60 %	312794828
50	NC_014722	CGCGG	2	10	84849	84858	0 %	0 %	60 %	40 %	312794830
51	NC_014722	CGCAT	2	10	84876	84885	20 %	20 %	20 %	40 %	312794830
52	NC_014722	ACGCG	2	10	85457	85466	20 %	0 %	40 %	40 %	312794831
53	NC_014722	CGATG	2	10	87040	87049	20 %	20 %	40 %	20 %	312794832
54	NC_014722	GCGCT	2	10	87218	87227	0 %	20 %	40 %	40 %	312794832
55	NC_014722	GCGCA	2	10	88911	88920	20 %	0 %	40 %	40 %	312794833
56	NC_014722	CGGCG	2	10	91072	91081	0 %	0 %	60 %	40 %	312794835
57	NC_014722	CGCGT	2	10	91624	91633	0 %	20 %	40 %	40 %	312794835
58	NC_014722	GACCT	2	10	92853	92862	20 %	20 %	20 %	40 %	312794837
59	NC_014722	AGGTT	2	10	94050	94059	20 %	40 %	40 %	0 %	312794840
60	NC_014722	AGTCT	2	10	95606	95615	20 %	40 %	20 %	20 %	312794841
61	NC_014722	CGCGG	2	10	95628	95637	0 %	0 %	60 %	40 %	312794841
62	NC_014722	GCGCC	2	10	95648	95657	0 %	0 %	40 %	60 %	312794841
63	NC_014722	CAATG	2	10	96552	96561	40 %	20 %	20 %	20 %	312794843
64	NC_014722	GCCAC	2	10	96611	96620	20 %	0 %	20 %	60 %	312794843
65	NC_014722	GGGCC	2	10	97894	97903	0 %	0 %	60 %	40 %	312794844
66	NC_014722	GCGCC	2	10	98738	98747	0 %	0 %	40 %	60 %	312794845
67	NC_014722	CGCAC	2	10	99079	99088	20 %	0 %	20 %	60 %	312794845
68	NC_014722	GCGCA	2	10	99884	99893	20 %	0 %	40 %	40 %	312794846
69	NC_014722	GCAAC	2	10	100395	100404	40 %	0 %	20 %	40 %	312794847
70	NC_014722	GCGAC	2	10	100819	100828	20 %	0 %	40 %	40 %	312794848
71	NC_014722	TGCGG	2	10	101932	101941	0 %	20 %	60 %	20 %	312794850
72	NC_014722	ACGTC	2	10	102556	102565	20 %	20 %	20 %	40 %	312794851
73	NC_014722	TCGCC	2	10	102571	102580	0 %	20 %	20 %	60 %	312794851
74	NC_014722	AGCGC	2	10	103111	103120	20 %	0 %	40 %	40 %	312794851
75	NC_014722	GTTGC	2	10	103121	103130	0 %	40 %	40 %	20 %	312794851
76	NC_014722	GCTGA	2	10	108625	108634	20 %	20 %	40 %	20 %	312794855
77	NC_014722	ATCGA	2	10	108960	108969	40 %	20 %	20 %	20 %	312794856
78	NC_014722	TTGCG	2	10	110727	110736	0 %	40 %	40 %	20 %	312794858
79	NC_014722	TGGCG	2	10	111972	111981	0 %	20 %	60 %	20 %	312794858
80	NC_014722	GCCGC	2	10	112175	112184	0 %	0 %	40 %	60 %	312794858
81	NC_014722	CTTCG	2	10	112185	112194	0 %	40 %	20 %	40 %	312794858
82	NC_014722	TACAG	2	10	113221	113230	40 %	20 %	20 %	20 %	312794860
83	NC_014722	TGACC	2	10	115314	115323	20 %	20 %	20 %	40 %	312794862
84	NC_014722	GGCGA	2	10	118002	118011	20 %	0 %	60 %	20 %	312794866
85	NC_014722	CGTGC	2	10	120010	120019	0 %	20 %	40 %	40 %	312794868
86	NC_014722	GTCCG	2	10	120136	120145	0 %	20 %	40 %	40 %	312794868
87	NC_014722	TCGCG	2	10	121554	121563	0 %	20 %	40 %	40 %	312794871
88	NC_014722	CGAGC	2	10	121594	121603	20 %	0 %	40 %	40 %	312794871
89	NC_014722	GCGTG	2	10	121901	121910	0 %	20 %	60 %	20 %	312794872
90	NC_014722	CGCAG	2	10	122274	122283	20 %	0 %	40 %	40 %	312794873
91	NC_014722	GGCGA	2	10	123169	123178	20 %	0 %	60 %	20 %	312794874
92	NC_014722	CGCTG	2	10	123322	123331	0 %	20 %	40 %	40 %	312794875
93	NC_014722	AATGC	2	10	123894	123903	40 %	20 %	20 %	20 %	312794876
94	NC_014722	TGGGC	2	10	124142	124151	0 %	20 %	60 %	20 %	312794877
95	NC_014722	ACATG	2	10	124552	124561	40 %	20 %	20 %	20 %	312794879
96	NC_014722	AAATG	2	10	125146	125155	60 %	20 %	20 %	0 %	312794881
97	NC_014722	CGGCG	2	10	125347	125356	0 %	0 %	60 %	40 %	312794882
98	NC_014722	GTTGC	2	10	126996	127005	0 %	40 %	40 %	20 %	312794883
99	NC_014722	CAAGT	2	10	127146	127155	40 %	20 %	20 %	20 %	312794883
100	NC_014722	TTCGA	2	10	127992	128001	20 %	40 %	20 %	20 %	312794884
101	NC_014722	CAGGC	2	10	128065	128074	20 %	0 %	40 %	40 %	312794884
102	NC_014722	GCAGC	2	10	129370	129379	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
103	NC_014722	CGCGA	2	10	130003	130012	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
104	NC_014722	TGCAA	2	10	130051	130060	40 %	20 %	20 %	20 %	312794887
105	NC_014722	GCAGC	2	10	130580	130589	20 %	0 %	40 %	40 %	312794887
106	NC_014722	GGGCG	2	10	131764	131773	0 %	0 %	80 %	20 %	312794888
107	NC_014722	GCGGT	2	10	131996	132005	0 %	20 %	60 %	20 %	312794888
108	NC_014722	GGCGC	2	10	135570	135579	0 %	0 %	60 %	40 %	312794893
109	NC_014722	ATGAA	2	10	137596	137605	60 %	20 %	20 %	0 %	312794895
110	NC_014722	CTCGA	2	10	138033	138042	20 %	20 %	20 %	40 %	312794895
111	NC_014722	CGAAG	2	10	138779	138788	40 %	0 %	40 %	20 %	312794896
112	NC_014722	GCGCG	2	10	141507	141516	0 %	0 %	60 %	40 %	312794898
113	NC_014722	CGATG	2	10	141804	141813	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
114	NC_014722	CTGGA	2	10	142378	142387	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
115	NC_014722	GGCAT	2	10	142550	142559	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
116	NC_014722	GGCGC	2	10	143660	143669	0 %	0 %	60 %	40 %	312794900
117	NC_014722	GCTCG	2	10	144243	144252	0 %	20 %	40 %	40 %	312794900
118	NC_014722	CGGGC	2	10	144947	144956	0 %	0 %	60 %	40 %	312794900
119	NC_014722	GGGCG	2	10	144958	144967	0 %	0 %	80 %	20 %	312794900
120	NC_014722	GCGCG	2	10	146671	146680	0 %	0 %	60 %	40 %	312794901
121	NC_014722	CCAGT	2	10	147860	147869	20 %	20 %	20 %	40 %	312794902
122	NC_014722	CGAAC	2	10	148954	148963	40 %	0 %	20 %	40 %	312794903
123	NC_014722	GCGCT	2	10	151236	151245	0 %	20 %	40 %	40 %	312794903
124	NC_014722	GCATG	2	10	151696	151705	20 %	20 %	40 %	20 %	312794903
125	NC_014722	CACGC	2	10	155451	155460	20 %	0 %	20 %	60 %	312794905
126	NC_014722	GCGCT	2	10	155807	155816	0 %	20 %	40 %	40 %	312794906
127	NC_014722	GGTCA	2	10	156175	156184	20 %	20 %	40 %	20 %	312794906
128	NC_014722	TCGTC	2	10	156210	156219	0 %	40 %	20 %	40 %	312794906
129	NC_014722	AACAA	2	10	156887	156896	80 %	0 %	0 %	20 %	312794908
130	NC_014722	GCGCG	2	10	159627	159636	0 %	0 %	60 %	40 %	312794908
131	NC_014722	CGGCG	2	10	161089	161098	0 %	0 %	60 %	40 %	312794910
132	NC_014722	TTGAG	2	10	161506	161515	20 %	40 %	40 %	0 %	312794910
133	NC_014722	CATGC	2	10	163357	163366	20 %	20 %	20 %	40 %	312794911
134	NC_014722	CGCGC	2	10	163522	163531	0 %	0 %	40 %	60 %	312794911
135	NC_014722	GAATG	2	10	164015	164024	40 %	20 %	40 %	0 %	312794911
136	NC_014722	TGCAA	2	10	165765	165774	40 %	20 %	20 %	20 %	312794913
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139	NC_014722	CATGT	2	10	170197	170206	20 %	40 %	20 %	20 %	312794920
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199	NC_014722	ACGAT	2	10	236126	236135	40 %	20 %	20 %	20 %	312795009
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202	NC_014722	ACGCC	2	10	239359	239368	20 %	0 %	20 %	60 %	312795012
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241	NC_014722	GCTGG	2	10	306684	306693	0 %	20 %	60 %	20 %	312795067
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247	NC_014722	GATCA	2	10	316032	316041	40 %	20 %	20 %	20 %	312795076
248	NC_014722	GGCGT	2	10	318191	318200	0 %	20 %	60 %	20 %	312795078
249	NC_014722	GCCGC	2	10	320257	320266	0 %	0 %	40 %	60 %	312795080
250	NC_014722	ACCAG	2	10	320846	320855	40 %	0 %	20 %	40 %	312795080
251	NC_014722	CACGC	2	10	321517	321526	20 %	0 %	20 %	60 %	312795081
252	NC_014722	GCCGC	2	10	322846	322855	0 %	0 %	40 %	60 %	312795082
253	NC_014722	TGGTG	2	10	324880	324889	0 %	40 %	60 %	0 %	312795087
254	NC_014722	CCGAC	2	10	329060	329069	20 %	0 %	20 %	60 %	312795091
255	NC_014722	TGAAC	2	10	329100	329109	40 %	20 %	20 %	20 %	312795091
256	NC_014722	CGGCG	2	10	329553	329562	0 %	0 %	60 %	40 %	312795091
257	NC_014722	ACGAT	2	10	331085	331094	40 %	20 %	20 %	20 %	312795093
258	NC_014722	GCATC	2	10	331923	331932	20 %	20 %	20 %	40 %	312795094
259	NC_014722	GCCGA	2	10	332008	332017	20 %	0 %	40 %	40 %	312795094
260	NC_014722	GCACG	2	10	332822	332831	20 %	0 %	40 %	40 %	312795095
261	NC_014722	CGTTG	2	10	333565	333574	0 %	40 %	40 %	20 %	312795095
262	NC_014722	CGGGA	2	10	333825	333834	20 %	0 %	60 %	20 %	312795096
263	NC_014722	TGCGC	2	10	333933	333942	0 %	20 %	40 %	40 %	312795096
264	NC_014722	CTGGC	2	10	334162	334171	0 %	20 %	40 %	40 %	312795097
265	NC_014722	ACGTC	2	10	335144	335153	20 %	20 %	20 %	40 %	312795098
266	NC_014722	CGGTC	2	10	342561	342570	0 %	20 %	40 %	40 %	312795105
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282	NC_014722	GCGCC	2	10	365009	365018	0 %	0 %	40 %	60 %	312795132
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381	NC_014722	CGCGT	2	10	497656	497665	0 %	20 %	40 %	40 %	312795271
382	NC_014722	CGGAT	2	10	498252	498261	20 %	20 %	40 %	20 %	312795272
383	NC_014722	GCGCA	2	10	500644	500653	20 %	0 %	40 %	40 %	312795274
384	NC_014722	ACGCC	2	10	501960	501969	20 %	0 %	20 %	60 %	312795276
385	NC_014722	CGAGC	2	10	503439	503448	20 %	0 %	40 %	40 %	312795278
386	NC_014722	CGCGT	2	10	503477	503486	0 %	20 %	40 %	40 %	312795278
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