MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	GCCG	2	8	1650	1657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014722	GGCG	2	8	1678	1685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014722	AATA	2	8	5965	5972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014722	AGTC	2	8	7411	7418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014722	CGTC	2	8	8356	8363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014722	AATC	2	8	10785	10792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014722	AGTG	2	8	11284	11291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014722	GTTG	2	8	11302	11309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014722	ATGG	2	8	11411	11418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014722	TAAA	2	8	12311	12318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014722	AGTC	2	8	14656	14663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014722	CAGC	2	8	19602	19609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014722	TCGA	2	8	21448	21455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014722	TTCG	2	8	40882	40889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014722	AGGA	2	8	43479	43486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014722	ACTG	2	8	48473	48480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014722	TCCT	2	8	48485	48492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014722	CATT	2	8	49257	49264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014722	CAAA	2	8	49372	49379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014722	GCCA	2	8	49794	49801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014722	GCCG	2	8	53603	53610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014722	AGGC	2	8	53747	53754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014722	AAAT	2	8	54677	54684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014722	TAAT	2	8	54821	54828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014722	CCTA	2	8	57736	57743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014722	AGCA	2	8	64337	64344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014722	TTCA	2	8	69210	69217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014722	GCAG	2	8	69370	69377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014722	GGCA	2	8	78473	78480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014722	GGCC	2	8	78514	78521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014722	CCCG	2	8	82998	83005	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014722	ACGC	2	8	95452	95459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014722	GACA	2	8	95497	95504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014722	GCGG	2	8	110047	110054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014722	GTTG	2	8	110370	110377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014722	CGTG	2	8	110521	110528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014722	AATG	2	8	113493	113500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014722	AGCC	2	8	113861	113868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014722	TGGA	2	8	117028	117035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014722	GCCC	2	8	118749	118756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_014722	TAAA	2	8	123979	123986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014722	TTTC	2	8	124318	124325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014722	TCGG	2	8	134642	134649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014722	TCGA	2	8	134888	134895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014722	TTAT	2	8	141182	141189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014722	GAAC	2	8	145501	145508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014722	CCCT	2	8	148532	148539	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_014722	TAAA	2	8	148634	148641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014722	CGTG	2	8	153935	153942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014722	CGGG	3	12	153950	153961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014722	TCGA	2	8	165177	165184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014722	GGCA	2	8	165275	165282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014722	TCCC	2	8	165475	165482	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014722	TCGT	2	8	165522	165529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014722	GCCT	2	8	169528	169535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014722	GCTG	2	8	173084	173091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014722	GCGT	2	8	173140	173147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014722	TCGC	2	8	173404	173411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014722	TATC	2	8	175148	175155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014722	GATT	2	8	175799	175806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014722	GAAT	2	8	196170	196177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014722	TGGG	2	8	196185	196192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014722	TGCG	2	8	196509	196516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014722	CCGA	2	8	199916	199923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014722	GCCC	2	8	200480	200487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_014722	AAGC	2	8	200706	200713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014722	TGCT	2	8	200871	200878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014722	GAGC	2	8	201018	201025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014722	GTGG	2	8	201147	201154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014722	GTCC	2	8	202808	202815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014722	ACGT	2	8	203459	203466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014722	TCCC	2	8	206572	206579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_014722	AGGC	2	8	206793	206800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014722	CGCC	2	8	216134	216141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014722	AGGC	2	8	219212	219219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014722	ACGC	2	8	220471	220478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014722	CAGG	2	8	223957	223964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014722	GCCG	2	8	233153	233160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014722	CGGC	2	8	233176	233183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014722	GGCC	2	8	237222	237229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014722	ACGA	2	8	251365	251372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014722	CGGT	2	8	256987	256994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014722	CGCT	2	8	258681	258688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014722	CGGG	2	8	260002	260009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014722	CGGG	2	8	261647	261654	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014722	CAGG	2	8	264491	264498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014722	CGTC	2	8	264676	264683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014722	GCGG	2	8	265420	265427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014722	GGCA	2	8	266304	266311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014722	CGGC	2	8	267264	267271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014722	GTCC	2	8	269801	269808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014722	ACCG	2	8	271168	271175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014722	TGCA	2	8	271352	271359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014722	GCGG	2	8	271386	271393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014722	AGGT	2	8	271672	271679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014722	GAAA	2	8	272195	272202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014722	TACC	2	8	272730	272737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014722	GCGA	2	8	274068	274075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014722	GCAT	2	8	274339	274346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014722	AAAC	2	8	274607	274614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014722	AAAG	2	8	274902	274909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014722	TTGA	2	8	275685	275692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014722	GTTT	2	8	275985	275992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014722	TGGC	2	8	276772	276779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014722	ACTG	2	8	278665	278672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014722	GTGC	2	8	288154	288161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014722	CGGG	2	8	311676	311683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014722	TTCG	2	8	333712	333719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014722	CCGC	2	8	338146	338153	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_014722	TAGG	2	8	339748	339755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014722	GTGC	2	8	342341	342348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014722	CAGG	2	8	342423	342430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014722	TAAT	2	8	343193	343200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014722	GGAC	2	8	348269	348276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014722	CCGT	2	8	353371	353378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014722	CCGC	2	8	353400	353407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014722	GCTC	2	8	354285	354292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014722	CGTG	2	8	354843	354850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014722	CCGA	2	8	365704	365711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014722	GCAA	2	8	368434	368441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014722	TGCG	2	8	391896	391903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014722	AGTC	2	8	392246	392253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014722	ATCC	2	8	392291	392298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014722	GGGC	2	8	397215	397222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014722	CTGC	2	8	400835	400842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014722	GCCG	2	8	410761	410768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014722	CACC	2	8	412031	412038	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_014722	TGAA	2	8	428627	428634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014722	CTAG	2	8	428655	428662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014722	CGAT	2	8	440401	440408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014722	CAGC	2	8	447998	448005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014722	GGTC	2	8	450489	450496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014722	AAAG	2	8	452923	452930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014722	GCGT	2	8	453330	453337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014722	ATCA	2	8	453522	453529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014722	TGAG	2	8	456651	456658	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014722	TGCG	2	8	458760	458767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014722	CCGG	2	8	462456	462463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014722	TGCC	2	8	478508	478515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014722	GGGA	2	8	478626	478633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014722	GTAA	2	8	480447	480454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014722	TTAC	2	8	481622	481629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014722	GTGG	2	8	484181	484188	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014722	AATG	2	8	484272	484279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014722	GTAA	2	8	484908	484915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014722	ATTT	2	8	485342	485349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014722	TGGA	2	8	485521	485528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014722	TTTA	2	8	485565	485572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014722	GAGC	2	8	487125	487132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014722	TGAG	2	8	487178	487185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014722	TTGG	2	8	489472	489479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014722	ATTT	2	8	489522	489529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014722	TTCA	2	8	489611	489618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014722	TTCA	2	8	489708	489715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014722	AGGA	2	8	489755	489762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014722	ATGC	2	8	492060	492067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_014722	AGGC	2	8	493930	493937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014722	AAGC	2	8	494158	494165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_014722	GATG	2	8	499538	499545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014722	AAAG	2	8	534737	534744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_014722	TTGC	2	8	1666355	1666362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_014722	TCAG	2	8	1683634	1683641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_014722	AGCG	2	8	1687447	1687454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_014722	TGCG	2	8	1687559	1687566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_014722	TGGC	2	8	1687606	1687613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014722	CCGA	2	8	1689129	1689136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_014722	AAGC	2	8	1689326	1689333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_014722	TAGT	2	8	1692161	1692168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014722	AAAT	2	8	1704963	1704970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014722	ACAG	2	8	1709932	1709939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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