MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 6791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CGAA	2	8	494	501	50 %	0 %	25 %	25 %	312794750
2	NC_014722	CAAC	2	8	747	754	50 %	0 %	0 %	50 %	312794750
3	NC_014722	CGCA	2	8	922	929	25 %	0 %	25 %	50 %	312794750
4	NC_014722	TGCG	2	8	2216	2223	0 %	25 %	50 %	25 %	312794751
5	NC_014722	CGAC	2	8	2492	2499	25 %	0 %	25 %	50 %	312794751
6	NC_014722	GACG	2	8	2529	2536	25 %	0 %	50 %	25 %	312794751
7	NC_014722	GACC	2	8	3879	3886	25 %	0 %	25 %	50 %	312794752
8	NC_014722	GCTC	3	12	5010	5021	0 %	25 %	25 %	50 %	312794752
9	NC_014722	GCAG	2	8	5034	5041	25 %	0 %	50 %	25 %	312794752
10	NC_014722	GCGG	2	8	5643	5650	0 %	0 %	75 %	25 %	312794752
11	NC_014722	TGTT	2	8	6249	6256	0 %	75 %	25 %	0 %	312794753
12	NC_014722	ATTT	2	8	6270	6277	25 %	75 %	0 %	0 %	312794753
13	NC_014722	TTTC	2	8	6608	6615	0 %	75 %	0 %	25 %	312794753
14	NC_014722	CATC	2	8	7501	7508	25 %	25 %	0 %	50 %	312794755
15	NC_014722	TCGA	2	8	8226	8233	25 %	25 %	25 %	25 %	312794755
16	NC_014722	ACCG	2	8	8491	8498	25 %	0 %	25 %	50 %	312794756
17	NC_014722	CGCC	2	8	8628	8635	0 %	0 %	25 %	75 %	312794756
18	NC_014722	AAGC	2	8	9351	9358	50 %	0 %	25 %	25 %	312794756
19	NC_014722	CCCA	2	8	9368	9375	25 %	0 %	0 %	75 %	312794756
20	NC_014722	GCCT	2	8	9705	9712	0 %	25 %	25 %	50 %	312794756
21	NC_014722	GCCG	2	8	10265	10272	0 %	0 %	50 %	50 %	312794756
22	NC_014722	TGCG	2	8	10351	10358	0 %	25 %	50 %	25 %	312794756
23	NC_014722	GCAT	2	8	10506	10513	25 %	25 %	25 %	25 %	312794756
24	NC_014722	AGTC	2	8	10583	10590	25 %	25 %	25 %	25 %	312794756
25	NC_014722	AACC	2	8	11619	11626	50 %	0 %	0 %	50 %	312794758
26	NC_014722	ACAA	2	8	11631	11638	75 %	0 %	0 %	25 %	312794758
27	NC_014722	GCTA	2	8	12348	12355	25 %	25 %	25 %	25 %	312794759
28	NC_014722	ATAC	2	8	12464	12471	50 %	25 %	0 %	25 %	312794759
29	NC_014722	GAAG	2	8	12634	12641	50 %	0 %	50 %	0 %	312794759
30	NC_014722	CGCT	2	8	13019	13026	0 %	25 %	25 %	50 %	312794759
31	NC_014722	CAGA	2	8	13177	13184	50 %	0 %	25 %	25 %	312794759
32	NC_014722	CAGC	2	8	13614	13621	25 %	0 %	25 %	50 %	312794759
33	NC_014722	AGGT	2	8	13797	13804	25 %	25 %	50 %	0 %	312794760
34	NC_014722	CAAA	2	8	13930	13937	75 %	0 %	0 %	25 %	312794760
35	NC_014722	TCCC	2	8	14140	14147	0 %	25 %	0 %	75 %	312794760
36	NC_014722	AAGA	2	8	14422	14429	75 %	0 %	25 %	0 %	312794760
37	NC_014722	ACAA	2	8	14823	14830	75 %	0 %	0 %	25 %	312794761
38	NC_014722	GAAT	2	8	15139	15146	50 %	25 %	25 %	0 %	312794761
39	NC_014722	AGCC	2	8	15694	15701	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
40	NC_014722	CCGA	2	8	16082	16089	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
41	NC_014722	GCTC	2	8	16499	16506	0 %	25 %	25 %	50 %	312794762
42	NC_014722	AGGC	2	8	16671	16678	25 %	0 %	50 %	25 %	312794762
43	NC_014722	GTTC	2	8	17021	17028	0 %	50 %	25 %	25 %	312794762
44	NC_014722	GCCG	2	8	17125	17132	0 %	0 %	50 %	50 %	312794762
45	NC_014722	CAGC	2	8	17472	17479	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
46	NC_014722	ATCA	2	8	17637	17644	50 %	25 %	0 %	25 %	312794762
47	NC_014722	GATG	2	8	17690	17697	25 %	25 %	50 %	0 %	312794762
48	NC_014722	AGCA	2	8	17712	17719	50 %	0 %	25 %	25 %	312794762
49	NC_014722	TCGC	2	8	17913	17920	0 %	25 %	25 %	50 %	312794763
50	NC_014722	GCCC	2	8	18333	18340	0 %	0 %	25 %	75 %	312794763
51	NC_014722	CTGC	2	8	18801	18808	0 %	25 %	25 %	50 %	312794763
52	NC_014722	GGCT	2	8	18988	18995	0 %	25 %	50 %	25 %	312794763
53	NC_014722	GACC	2	8	19668	19675	25 %	0 %	25 %	50 %	312794764
54	NC_014722	TTCT	2	8	20106	20113	0 %	75 %	0 %	25 %	312794764
55	NC_014722	ACCA	2	8	20364	20371	50 %	0 %	0 %	50 %	312794764
56	NC_014722	CTTT	2	8	20421	20428	0 %	75 %	0 %	25 %	312794764
57	NC_014722	AACC	2	8	20491	20498	50 %	0 %	0 %	50 %	312794764
58	NC_014722	ATTT	2	8	20789	20796	25 %	75 %	0 %	0 %	312794764
59	NC_014722	AGCA	2	8	21018	21025	50 %	0 %	25 %	25 %	312794764
60	NC_014722	TCCA	2	8	21288	21295	25 %	25 %	0 %	50 %	312794764
61	NC_014722	TCTT	2	8	21733	21740	0 %	75 %	0 %	25 %	312794765
62	NC_014722	TCTG	2	8	23202	23209	0 %	50 %	25 %	25 %	312794766
63	NC_014722	AACG	2	8	24637	24644	50 %	0 %	25 %	25 %	312794767
64	NC_014722	TTGA	2	8	24763	24770	25 %	50 %	25 %	0 %	312794767
65	NC_014722	GCTT	2	8	25690	25697	0 %	50 %	25 %	25 %	312794767
66	NC_014722	ATCC	2	8	25840	25847	25 %	25 %	0 %	50 %	312794767
67	NC_014722	AACA	2	8	26580	26587	75 %	0 %	0 %	25 %	312794768
68	NC_014722	ATTG	2	8	26590	26597	25 %	50 %	25 %	0 %	312794768
69	NC_014722	TTTG	2	8	26679	26686	0 %	75 %	25 %	0 %	312794768
70	NC_014722	TCCT	2	8	27718	27725	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
71	NC_014722	ACGT	2	8	28152	28159	25 %	25 %	25 %	25 %	312794769
72	NC_014722	AGCA	2	8	28270	28277	50 %	0 %	25 %	25 %	312794769
73	NC_014722	GCTG	2	8	29309	29316	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
74	NC_014722	GCCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	25 %	75 %	312794769
75	NC_014722	GGCT	2	8	30386	30393	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
76	NC_014722	CAGC	2	8	31317	31324	25 %	0 %	25 %	50 %	312794769
77	NC_014722	CCGG	2	8	31607	31614	0 %	0 %	50 %	50 %	312794769
78	NC_014722	TGGC	2	8	31627	31634	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
79	NC_014722	TAAG	2	8	31830	31837	50 %	25 %	25 %	0 %	312794769
80	NC_014722	CCCT	2	8	32119	32126	0 %	25 %	0 %	75 %	312794770
81	NC_014722	CTTT	2	8	32417	32424	0 %	75 %	0 %	25 %	312794770
82	NC_014722	GGCC	2	8	33241	33248	0 %	0 %	50 %	50 %	312794771
83	NC_014722	TGCG	2	8	33843	33850	0 %	25 %	50 %	25 %	312794771
84	NC_014722	GATA	2	8	34410	34417	50 %	25 %	25 %	0 %	312794772
85	NC_014722	TCGC	2	8	34419	34426	0 %	25 %	25 %	50 %	312794772
86	NC_014722	GCCC	2	8	34495	34502	0 %	0 %	25 %	75 %	312794772
87	NC_014722	GCAA	2	8	35325	35332	50 %	0 %	25 %	25 %	312794774
88	NC_014722	CCGC	2	8	36039	36046	0 %	0 %	25 %	75 %	312794775
89	NC_014722	CAAC	2	8	36217	36224	50 %	0 %	0 %	50 %	312794775
90	NC_014722	CGCC	2	8	37882	37889	0 %	0 %	25 %	75 %	312794776
91	NC_014722	ATCA	2	8	37988	37995	50 %	25 %	0 %	25 %	312794776
92	NC_014722	GATC	2	8	38212	38219	25 %	25 %	25 %	25 %	312794776
93	NC_014722	CTGT	2	8	38338	38345	0 %	50 %	25 %	25 %	312794776
94	NC_014722	CCGC	2	8	38960	38967	0 %	0 %	25 %	75 %	312794777
95	NC_014722	ATTG	2	8	39213	39220	25 %	50 %	25 %	0 %	312794777
96	NC_014722	TGGC	2	8	39285	39292	0 %	25 %	50 %	25 %	312794777
97	NC_014722	ACGT	2	8	39401	39408	25 %	25 %	25 %	25 %	312794777
98	NC_014722	TAAA	2	8	39636	39643	75 %	25 %	0 %	0 %	312794777
99	NC_014722	TCGA	2	8	40099	40106	25 %	25 %	25 %	25 %	312794778
100	NC_014722	CCCG	2	8	40733	40740	0 %	0 %	25 %	75 %	312794780
101	NC_014722	TAGC	2	8	42277	42284	25 %	25 %	25 %	25 %	312794783
102	NC_014722	AATA	2	8	42567	42574	75 %	25 %	0 %	0 %	312794784
103	NC_014722	CCGA	2	8	44048	44055	25 %	0 %	25 %	50 %	312794787
104	NC_014722	CGCC	2	8	44370	44377	0 %	0 %	25 %	75 %	312794787
105	NC_014722	CGTA	2	8	44386	44393	25 %	25 %	25 %	25 %	312794787
106	NC_014722	GTCG	2	8	44830	44837	0 %	25 %	50 %	25 %	312794787
107	NC_014722	CAGC	2	8	44978	44985	25 %	0 %	25 %	50 %	312794787
108	NC_014722	CGAG	2	8	45006	45013	25 %	0 %	50 %	25 %	312794787
109	NC_014722	ATCG	2	8	45079	45086	25 %	25 %	25 %	25 %	312794788
110	NC_014722	TGCG	2	8	45105	45112	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
111	NC_014722	ACAA	2	8	45203	45210	75 %	0 %	0 %	25 %	312794788
112	NC_014722	CGAC	2	8	46149	46156	25 %	0 %	25 %	50 %	312794788
113	NC_014722	GCGT	2	8	46402	46409	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
114	NC_014722	CGTG	2	8	46428	46435	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
115	NC_014722	GCAA	2	8	46646	46653	50 %	0 %	25 %	25 %	312794788
116	NC_014722	CATC	2	8	46826	46833	25 %	25 %	0 %	50 %	312794788
117	NC_014722	GCCG	2	8	46984	46991	0 %	0 %	50 %	50 %	312794788
118	NC_014722	ATGC	2	8	48850	48857	25 %	25 %	25 %	25 %	312794791
119	NC_014722	GCAT	2	8	49964	49971	25 %	25 %	25 %	25 %	312794792
120	NC_014722	GTAC	2	8	50225	50232	25 %	25 %	25 %	25 %	312794793
121	NC_014722	ATTT	2	8	50354	50361	25 %	75 %	0 %	0 %	312794793
122	NC_014722	GCGA	2	8	50507	50514	25 %	0 %	50 %	25 %	312794793
123	NC_014722	TTGC	2	8	51009	51016	0 %	50 %	25 %	25 %	312794793
124	NC_014722	TTGT	2	8	52094	52101	0 %	75 %	25 %	0 %	312794795
125	NC_014722	GCTC	2	8	52156	52163	0 %	25 %	25 %	50 %	312794795
126	NC_014722	CTAT	2	8	52329	52336	25 %	50 %	0 %	25 %	312794795
127	NC_014722	TACT	2	8	52704	52711	25 %	50 %	0 %	25 %	312794796
128	NC_014722	GCAC	2	8	52793	52800	25 %	0 %	25 %	50 %	312794796
129	NC_014722	GCCA	2	8	53044	53051	25 %	0 %	25 %	50 %	312794796
130	NC_014722	GCGA	2	8	53254	53261	25 %	0 %	50 %	25 %	312794796
131	NC_014722	TGGC	2	8	53950	53957	0 %	25 %	50 %	25 %	312794797
132	NC_014722	GCTG	2	8	54034	54041	0 %	25 %	50 %	25 %	312794797
133	NC_014722	TGGC	2	8	54246	54253	0 %	25 %	50 %	25 %	312794798
134	NC_014722	GCTC	2	8	54516	54523	0 %	25 %	25 %	50 %	312794798
135	NC_014722	AAAT	2	8	55058	55065	75 %	25 %	0 %	0 %	312794800
136	NC_014722	GCTT	2	8	55200	55207	0 %	50 %	25 %	25 %	312794800
137	NC_014722	ATTT	2	8	55411	55418	25 %	75 %	0 %	0 %	312794800
138	NC_014722	GGAA	2	8	55992	55999	50 %	0 %	50 %	0 %	312794800
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