MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 37318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CTG	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794750
2	NC_014722	CAG	2	6	94	99	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
3	NC_014722	GCA	2	6	246	251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
4	NC_014722	GCC	2	6	379	384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794750
5	NC_014722	CGA	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
6	NC_014722	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794750
7	NC_014722	TGC	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794750
8	NC_014722	CGT	2	6	816	821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794750
9	NC_014722	CGA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
10	NC_014722	CTA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794750
11	NC_014722	CTG	2	6	880	885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794750
12	NC_014722	CGA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
13	NC_014722	TTC	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794750
14	NC_014722	GGA	2	6	930	935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794750
15	NC_014722	TTC	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794750
16	NC_014722	ATC	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794750
17	NC_014722	GCC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794750
18	NC_014722	TTC	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794750
19	NC_014722	GAA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794750
20	NC_014722	TGC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794750
21	NC_014722	CGA	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794750
22	NC_014722	GCC	2	6	1593	1598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794750
23	NC_014722	GCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794751
24	NC_014722	GCC	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794751
25	NC_014722	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
26	NC_014722	CGC	2	6	2047	2052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794751
27	NC_014722	CTG	2	6	2077	2082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
28	NC_014722	CAC	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794751
29	NC_014722	ACG	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794751
30	NC_014722	TCG	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
31	NC_014722	GGC	2	6	2310	2315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794751
32	NC_014722	CGA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794751
33	NC_014722	GCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794751
34	NC_014722	TGG	2	6	2459	2464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794751
35	NC_014722	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794751
36	NC_014722	GCT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
37	NC_014722	CGA	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794751
38	NC_014722	TCG	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
39	NC_014722	GCA	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794751
40	NC_014722	GCG	2	6	2788	2793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794751
41	NC_014722	TCG	2	6	2831	2836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794751
42	NC_014722	GTG	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794751
43	NC_014722	GAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794752
44	NC_014722	GTC	2	6	3240	3245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
45	NC_014722	CGA	2	6	3471	3476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
46	NC_014722	TGA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794752
47	NC_014722	CGG	2	6	3531	3536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
48	NC_014722	CGG	2	6	3567	3572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
49	NC_014722	GGC	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
50	NC_014722	AAG	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794752
51	NC_014722	CGT	2	6	3675	3680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
52	NC_014722	AGC	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
53	NC_014722	CGA	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
54	NC_014722	GCG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
55	NC_014722	TCG	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
56	NC_014722	CAA	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794752
57	NC_014722	GTC	2	6	3991	3996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
58	NC_014722	AAC	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794752
59	NC_014722	CGG	2	6	4095	4100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
60	NC_014722	CAA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794752
61	NC_014722	GAC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
62	NC_014722	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
63	NC_014722	GTC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
64	NC_014722	GAG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794752
65	NC_014722	TCG	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
66	NC_014722	CGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794752
67	NC_014722	TCG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
68	NC_014722	GTC	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
69	NC_014722	GAC	2	6	4705	4710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
70	NC_014722	ACC	2	6	4733	4738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794752
71	NC_014722	CAT	4	12	4740	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794752
72	NC_014722	GCT	3	9	4788	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
73	NC_014722	TTC	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794752
74	NC_014722	GAT	2	6	4824	4829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794752
75	NC_014722	CCG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794752
76	NC_014722	TGG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794752
77	NC_014722	ATG	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794752
78	NC_014722	GCG	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
79	NC_014722	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
80	NC_014722	CAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
81	NC_014722	GCG	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794752
82	NC_014722	AGC	2	6	5459	5464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
83	NC_014722	TGC	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794752
84	NC_014722	GCC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794752
85	NC_014722	ACG	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
86	NC_014722	CGA	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794752
87	NC_014722	TAC	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794753
88	NC_014722	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794753
89	NC_014722	TCA	3	9	6026	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794753
90	NC_014722	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794753
91	NC_014722	AAT	2	6	6094	6099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794753
92	NC_014722	AAT	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794753
93	NC_014722	ATA	2	6	6410	6415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794753
94	NC_014722	AGC	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794753
95	NC_014722	TAT	2	6	6468	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794753
96	NC_014722	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794753
97	NC_014722	AAT	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794753
98	NC_014722	AGC	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794753
99	NC_014722	TCA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794753
100	NC_014722	CCA	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794753
101	NC_014722	CAC	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794754
102	NC_014722	TCA	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794755
103	NC_014722	GTT	2	6	7520	7525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794755
104	NC_014722	ATT	2	6	7553	7558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794755
105	NC_014722	GAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794755
106	NC_014722	TTC	2	6	8028	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794755
107	NC_014722	AAC	3	9	8059	8067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794755
108	NC_014722	TGA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794755
109	NC_014722	CTC	2	6	8318	8323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794755
110	NC_014722	GCA	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
111	NC_014722	CCG	2	6	8570	8575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794756
112	NC_014722	TAA	2	6	8678	8683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794756
113	NC_014722	GCG	2	6	8691	8696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794756
114	NC_014722	CAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794756
115	NC_014722	GTT	2	6	8724	8729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794756
116	NC_014722	CGT	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
117	NC_014722	CAC	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794756
118	NC_014722	CAA	2	6	8772	8777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794756
119	NC_014722	TCG	2	6	8854	8859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
120	NC_014722	AAT	2	6	8863	8868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794756
121	NC_014722	TTC	2	6	8911	8916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794756
122	NC_014722	TTG	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794756
123	NC_014722	ACC	2	6	8941	8946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794756
124	NC_014722	GCT	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
125	NC_014722	GTC	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
126	NC_014722	GCG	2	6	9263	9268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794756
127	NC_014722	CCT	2	6	9302	9307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794756
128	NC_014722	GCA	2	6	9401	9406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
129	NC_014722	GCG	2	6	9431	9436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794756
130	NC_014722	CTG	2	6	9476	9481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
131	NC_014722	GTG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794756
132	NC_014722	GCC	2	6	9603	9608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794756
133	NC_014722	GCA	2	6	9626	9631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
134	NC_014722	AGC	2	6	9640	9645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
135	NC_014722	GCA	2	6	9758	9763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
136	NC_014722	TCG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
137	NC_014722	CAA	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794756
138	NC_014722	TGG	2	6	10063	10068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794756
139	NC_014722	TCA	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794756
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141	NC_014722	CCT	2	6	10373	10378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794756
142	NC_014722	GTC	2	6	10410	10415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
143	NC_014722	TGC	2	6	10426	10431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
144	NC_014722	CAG	2	6	10437	10442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794756
145	NC_014722	TGC	2	6	10444	10449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794756
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149	NC_014722	CGA	2	6	12053	12058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794758
150	NC_014722	GCG	2	6	12109	12114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794758
151	NC_014722	TAG	2	6	12152	12157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794758
152	NC_014722	CGC	2	6	12188	12193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794758
153	NC_014722	ATG	2	6	12337	12342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794759
154	NC_014722	ATC	2	6	12368	12373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794759
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158	NC_014722	CCG	2	6	12554	12559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794759
159	NC_014722	ATT	2	6	12608	12613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794759
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162	NC_014722	AGA	2	6	12891	12896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794759
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246	NC_014722	GCA	2	6	18753	18758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794763
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248	NC_014722	TCG	2	6	18890	18895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794763
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250	NC_014722	GAC	2	6	18932	18937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794763
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252	NC_014722	GCA	2	6	19059	19064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794763
253	NC_014722	CGC	2	6	19126	19131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794763
254	NC_014722	GGC	2	6	19142	19147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794763
255	NC_014722	AAT	2	6	19171	19176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794763
256	NC_014722	GTT	2	6	19263	19268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794763
257	NC_014722	GCG	2	6	19331	19336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794763
258	NC_014722	GGC	2	6	19397	19402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794763
259	NC_014722	TCA	2	6	19541	19546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794763
260	NC_014722	GCT	2	6	19714	19719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794764
261	NC_014722	CAA	2	6	19727	19732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794764
262	NC_014722	AAT	2	6	19793	19798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794764
263	NC_014722	CTC	2	6	19944	19949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794764
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265	NC_014722	AAC	2	6	20052	20057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794764
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267	NC_014722	CAT	2	6	20072	20077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794764
268	NC_014722	AGA	2	6	20079	20084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794764
269	NC_014722	CCA	3	9	20140	20148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794764
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271	NC_014722	GCA	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794764
272	NC_014722	ATA	2	6	20172	20177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794764
273	NC_014722	GTA	2	6	20311	20316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794764
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276	NC_014722	ACA	2	6	20386	20391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794764
277	NC_014722	CCT	2	6	20429	20434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794764
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280	NC_014722	CTT	2	6	20906	20911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794764
281	NC_014722	TAT	2	6	20963	20968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794764
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284	NC_014722	TCT	2	6	21773	21778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794765
285	NC_014722	TCT	3	9	21790	21798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794765
286	NC_014722	CTC	2	6	22045	22050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794765
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290	NC_014722	ACC	2	6	22820	22825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794766
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374	NC_014722	CGA	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
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377	NC_014722	GCC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
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492	NC_014722	TCT	2	6	41466	41471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794782
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499	NC_014722	ATG	2	6	42644	42649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794784
500	NC_014722	GCC	2	6	42710	42715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794784

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