MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ATTCCT	2	12	9129	9140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014721	GACAAA	2	12	18366	18377	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014721	AATACC	2	12	18980	18991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014721	AAAAAT	2	12	24904	24915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014721	AAGTAA	2	12	33088	33099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014721	ATATGA	2	12	38126	38137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014721	ATATGA	2	12	38912	38923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014721	GTATAT	2	12	39036	39047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014721	ATATGA	2	12	39353	39364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014721	AGTATG	2	12	39982	39993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014721	TGTCAT	2	12	42587	42598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014721	ATATGA	2	12	43425	43436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014721	ATATGA	2	12	43941	43952	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014721	TGTCAT	2	12	52061	52072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014721	ATTTCA	2	12	70238	70249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014721	TGAAAA	2	12	88840	88851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014721	TGTTTT	2	12	120270	120281	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014721	AATTGA	2	12	150396	150407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014721	AAAGAA	2	12	151393	151404	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014721	ATAAAA	2	12	151757	151768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014721	CGTATA	2	12	152513	152524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014721	TTTGTC	2	12	153479	153490	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014721	CAATAT	2	12	161093	161104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014721	GACAAA	2	12	237216	237227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014721	AAATAT	2	12	244228	244239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	TAAAAA	2	12	251652	251663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014721	AAAGAA	2	12	251665	251676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014721	ATTTTT	2	12	257531	257542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014721	CATAAA	2	12	258318	258329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014721	AAATAA	2	12	258370	258381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014721	TTAGAA	2	12	258462	258473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	AAAATT	2	12	264832	264843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	TCTTTT	2	12	266855	266866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014721	ATTAGC	2	12	333586	333597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014721	AAGATT	2	12	333740	333751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014721	TTGAGT	2	12	333951	333962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014721	ATTAGC	2	12	342371	342382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014721	AAGGCT	2	12	382544	382555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014721	TGCTTA	2	12	391250	391261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014721	AGAGAA	2	12	398274	398285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014721	GATTTT	2	12	399032	399043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014721	ACTTTG	2	12	410254	410265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014721	CAAAAA	2	12	421700	421711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014721	GGAAAG	2	12	434478	434489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014721	ATTGAC	2	12	536252	536263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014721	ATTTGA	2	12	579382	579393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014721	TTAATA	2	12	579901	579912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014721	GACTTT	2	12	605986	605997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014721	GGTGTA	2	12	606323	606334	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014721	TCGTTT	2	12	607629	607640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014721	TGATTT	2	12	613836	613847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	CAAACT	2	12	622457	622468	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014721	TAATAT	2	12	649357	649368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014721	TGATTG	2	12	679095	679106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014721	AGAAAA	2	12	693366	693377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014721	TTACAA	2	12	696279	696290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014721	AGCAAA	2	12	701615	701626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014721	TATAAA	2	12	720726	720737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014721	ATTTAA	2	12	724256	724267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014721	TTTCTT	2	12	725401	725412	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014721	AACAAT	2	12	730467	730478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014721	TTGAAA	2	12	733951	733962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014721	GAAAAA	2	12	737661	737672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	CAATGT	2	12	738474	738485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014721	GTTTTT	2	12	741604	741615	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	ATGGAC	2	12	753214	753225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014721	ATAGCA	2	12	753343	753354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014721	TAAAGA	2	12	761825	761836	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014721	AGTAAT	2	12	764630	764641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014721	TAAAAA	2	12	789459	789470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014721	AACAAA	2	12	794955	794966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014721	AATAAA	2	12	797820	797831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014721	TTGATA	2	12	820904	820915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014721	AATTTT	2	12	831819	831830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014721	ACAAAA	2	12	849696	849707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014721	AATATA	2	12	874567	874578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	GATGGT	2	12	884518	884529	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	TTTAAG	2	12	891843	891854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014721	AATTGT	2	12	908855	908866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014721	TATAAT	2	12	958331	958342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014721	CTTTGA	2	12	985885	985896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014721	GGTGTA	2	12	986221	986232	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014721	AAATCT	2	12	1000133	1000144	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014721	GTTTTT	2	12	1061851	1061862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014721	ACTCAA	2	12	1069408	1069419	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014721	TGCTAA	2	12	1069771	1069782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014721	ACTCAA	2	12	1072327	1072338	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014721	TCTATT	2	12	1075568	1075579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014721	TTCTCA	2	12	1115547	1115558	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014721	AAAATT	2	12	1177730	1177741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014721	AGAAGT	2	12	1241181	1241192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014721	TTTTAT	2	12	1391535	1391546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	ATTAAA	2	12	1393679	1393690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014721	AAATAA	2	12	1398810	1398821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014721	GACAAA	2	12	1403100	1403111	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014721	ATTTAT	2	12	1405817	1405828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014721	AATTTT	2	12	1416992	1417003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014721	AATTTT	2	12	1530464	1530475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014721	GTAATT	2	12	1530519	1530530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014721	TATTTT	2	12	1554260	1554271	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014721	TTTCAT	2	12	1576025	1576036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014721	TTAATT	2	12	1586790	1586801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014721	AAAATG	2	12	1587500	1587511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014721	CAAAAA	2	12	1596846	1596857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014721	TTTAAT	3	18	1599373	1599390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014721	TAAAAT	2	12	1602326	1602337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014721	TGAAAA	2	12	1650928	1650939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014721	ATTTTT	2	12	1660274	1660285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014721	TCACAA	2	12	1672850	1672861	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014721	TTATAA	2	12	1672893	1672904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014721	GACTTT	2	12	1711453	1711464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014721	CAAGCG	2	12	1719983	1719994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014721	AATCTC	2	12	1724827	1724838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014721	CCCAGC	2	12	1734797	1734808	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014721	TTTTTG	2	12	1743342	1743353	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014721	TGCAAT	2	12	1784468	1784479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014721	AGCCTT	2	12	1790058	1790069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014721	TGATTG	2	12	1839612	1839623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	ATGGCA	2	12	1850767	1850778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014721	GCCTTT	2	12	1852848	1852859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014721	TACACC	2	12	1877612	1877623	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014721	TCAAAG	2	12	1877948	1877959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014721	GACAAA	2	12	1881649	1881660	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014721	TTTTCA	2	12	1883820	1883831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014721	AAAACG	2	12	1907164	1907175	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014721	TCAAAG	2	12	1908806	1908817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014721	CCCAGC	2	12	1913653	1913664	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014721	TAAAAT	2	12	1991514	1991525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.