MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 1096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ACACAA	2	12	1121	1132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792284
2	NC_014721	AGATGC	2	12	1796	1807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312792285
3	NC_014721	TGAGGT	2	12	1899	1910	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312792285
4	NC_014721	AATTTC	2	12	2412	2423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792285
5	NC_014721	GGAAAA	2	12	7053	7064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312792290
6	NC_014721	GATGCA	2	12	7272	7283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312792290
7	NC_014721	CAGGAA	2	12	7848	7859	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312792290
8	NC_014721	TGGAAT	2	12	11081	11092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792291
9	NC_014721	TTCTTT	2	12	13278	13289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312792293
10	NC_014721	TTGCAA	2	12	14770	14781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312792294
11	NC_014721	ATACAA	2	12	15633	15644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312792295
12	NC_014721	ATGGGA	2	12	20447	20458	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312792296
13	NC_014721	CCAACA	2	12	21708	21719	50 %	0 %	0 %	50 %	312792296
14	NC_014721	CCGACA	2	12	21720	21731	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312792296
15	NC_014721	ACCGAC	2	12	21785	21796	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312792296
16	NC_014721	TGGTCA	2	12	22188	22199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312792296
17	NC_014721	CAACAC	2	12	22321	22332	50 %	0 %	0 %	50 %	312792296
18	NC_014721	CCAACA	2	12	22362	22373	50 %	0 %	0 %	50 %	312792296
19	NC_014721	TTAAGG	2	12	22516	22527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792296
20	NC_014721	TAGCAA	2	12	23932	23943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792296
21	NC_014721	AAAGTG	2	12	30165	30176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312792299
22	NC_014721	AATATA	2	12	30732	30743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312792299
23	NC_014721	CTGTTC	2	12	32310	32321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312792299
24	NC_014721	ATTCTT	2	12	33132	33143	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312792300
25	NC_014721	GAAAAA	2	12	47256	47267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792303
26	NC_014721	TGAAGA	2	12	48229	48240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312792304
27	NC_014721	TAAAAA	2	12	49953	49964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312792306
28	NC_014721	GAAAAA	2	12	53451	53462	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792308
29	NC_014721	TCTTCC	2	12	66936	66947	0 %	50 %	0 %	50 %	312792319
30	NC_014721	ATGCAA	2	12	66985	66996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792319
31	NC_014721	TCGTTT	2	12	74348	74359	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792327
32	NC_014721	CATGAA	2	12	74687	74698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792327
33	NC_014721	TGTCAT	2	12	76343	76354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312792328
34	NC_014721	AATTTT	2	12	77375	77386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792328
35	NC_014721	GAACTT	2	12	80709	80720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312792330
36	NC_014721	TTTAGC	2	12	89140	89151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312792340
37	NC_014721	TAATCC	2	12	91496	91507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792342
38	NC_014721	ACTTTG	2	12	96643	96654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312792345
39	NC_014721	CAACTT	2	12	97332	97343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792346
40	NC_014721	CTAAAT	2	12	97955	97966	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792346
41	NC_014721	TGGAAG	2	12	104281	104292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312792353
42	NC_014721	ATGACA	2	12	112255	112266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792363
43	NC_014721	AAATCA	2	12	116611	116622	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312792366
44	NC_014721	CAATAT	2	12	122074	122085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792372
45	NC_014721	GCTTTT	2	12	123743	123754	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792374
46	NC_014721	GTAAGA	2	12	123958	123969	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312792375
47	NC_014721	AAAAGT	2	12	125374	125385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792376
48	NC_014721	GCTTGG	2	12	126887	126898	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312792377
49	NC_014721	TTGACG	2	12	133249	133260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312792382
50	NC_014721	AAGTGA	2	12	133853	133864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312792382
51	NC_014721	ACATTT	2	12	134368	134379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792383
52	NC_014721	TAAGAA	2	12	136244	136255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792385
53	NC_014721	GACAAT	2	12	138094	138105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792386
54	NC_014721	TCTTGT	2	12	140956	140967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792388
55	NC_014721	ATGACA	2	12	142747	142758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792389
56	NC_014721	GGCAGA	2	12	156735	156746	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312792390
57	NC_014721	CTTGAA	2	12	157722	157733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312792391
58	NC_014721	GACAAC	2	12	160092	160103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312792392
59	NC_014721	GTTTTT	2	12	160883	160894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312792393
60	NC_014721	GACAAA	2	12	161760	161771	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312792394
61	NC_014721	TGAGGT	2	12	162828	162839	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312792395
62	NC_014721	CTTGCT	2	12	165631	165642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312792397
63	NC_014721	TCCTTC	2	12	170128	170139	0 %	50 %	0 %	50 %	312792401
64	NC_014721	ATTTTT	2	12	172100	172111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312792404
65	NC_014721	GTCCAT	2	12	173473	173484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312792405
66	NC_014721	TTGAAG	2	12	177901	177912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792409
67	NC_014721	AAAAGA	2	12	179708	179719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792412
68	NC_014721	ACCAAA	2	12	183946	183957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312792416
69	NC_014721	ACAAAG	2	12	184443	184454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312792416
70	NC_014721	TTGCAC	2	12	189801	189812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312792419
71	NC_014721	CAATAA	2	12	191308	191319	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312792420
72	NC_014721	CATATC	2	12	192268	192279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312792420
73	NC_014721	AGAAAA	2	12	192948	192959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792421
74	NC_014721	TTTCAA	2	12	195036	195047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792423
75	NC_014721	GCAAAA	2	12	197285	197296	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312792424
76	NC_014721	TCCAAA	2	12	198208	198219	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312792424
77	NC_014721	ACAAGA	2	12	202170	202181	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312792426
78	NC_014721	TGAAGC	3	18	205991	206008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312792432
79	NC_014721	TATCAA	2	12	206433	206444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792432
80	NC_014721	ATTTCA	2	12	208720	208731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792434
81	NC_014721	ATATGA	2	12	213976	213987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312792439
82	NC_014721	TTTTGT	2	12	228012	228023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312792452
83	NC_014721	ATAAAA	2	12	230047	230058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312792454
84	NC_014721	TTGAAC	2	12	232388	232399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312792456
85	NC_014721	ATGGGC	2	12	234201	234212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312792457
86	NC_014721	GAATTT	2	12	235858	235869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312792460
87	NC_014721	AACATC	2	12	236328	236339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312792460
88	NC_014721	GCTTTT	2	12	237864	237875	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792461
89	NC_014721	TATAAC	2	12	238813	238824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792462
90	NC_014721	CTTTTG	2	12	240030	240041	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792463
91	NC_014721	ATTGAA	2	12	245314	245325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312792467
92	NC_014721	TTTTTG	2	12	245672	245683	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312792467
93	NC_014721	CTTTTG	2	12	248633	248644	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312792469
94	NC_014721	CAACCA	2	12	249131	249142	50 %	0 %	0 %	50 %	312792469
95	NC_014721	AATACT	2	12	253983	253994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792472
96	NC_014721	ATTTGA	2	12	259059	259070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312792477
97	NC_014721	GAAATA	2	12	263478	263489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792481
98	NC_014721	TAGCAC	2	12	263692	263703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312792481
99	NC_014721	AATGAA	2	12	263985	263996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792481
100	NC_014721	GGCTGA	2	12	272809	272820	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312792489
101	NC_014721	GATAAA	2	12	273964	273975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792489
102	NC_014721	GCAAAA	2	12	276356	276367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312792493
103	NC_014721	CAGATG	2	12	277072	277083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312792493
104	NC_014721	TTATAA	2	12	277460	277471	50 %	50 %	0 %	0 %	312792493
105	NC_014721	TGATGT	2	12	281245	281256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792497
106	NC_014721	GAGTTT	2	12	281351	281362	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792497
107	NC_014721	AAAGCT	2	12	282874	282885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312792498
108	NC_014721	CTATTT	2	12	283472	283483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312792498
109	NC_014721	GAAAAA	2	12	284590	284601	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792498
110	NC_014721	TCTTCA	2	12	289413	289424	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312792501
111	NC_014721	AAGGTA	2	12	290136	290147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312792502
112	NC_014721	ATTTTA	2	12	291163	291174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312792504
113	NC_014721	AAGAAA	2	12	292437	292448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312792506
114	NC_014721	TAGAGG	2	12	293092	293103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312792506
115	NC_014721	GAATTA	2	12	294260	294271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312792508
116	NC_014721	ATGTAT	2	12	294288	294299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312792508
117	NC_014721	TTACAT	2	12	294931	294942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312792509
118	NC_014721	TGGTAT	2	12	296063	296074	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792509
119	NC_014721	AAGGCA	2	12	297017	297028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312792510
120	NC_014721	GTTTGA	2	12	304736	304747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792519
121	NC_014721	ATATTG	2	12	304927	304938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312792519
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124	NC_014721	TTTGAG	2	12	321500	321511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792536
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126	NC_014721	TTGCTC	2	12	324737	324748	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312792539
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218	NC_014721	TGCATA	2	12	571465	571476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312792765
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224	NC_014721	TGAATG	2	12	596299	596310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312792785
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232	NC_014721	TAAAAG	2	12	611124	611135	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312792796
233	NC_014721	TATCAA	2	12	611782	611793	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312792796
234	NC_014721	GAAGGA	2	12	612985	612996	50 %	0 %	50 %	0 %	312792798
235	NC_014721	TTGATA	2	12	612998	613009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312792798
236	NC_014721	TTAGTT	2	12	619276	619287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312792803
237	NC_014721	TTCCCA	2	12	620128	620139	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312792803
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260	NC_014721	GATGTT	2	12	687213	687224	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312792863
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328	NC_014721	TTTTCT	2	12	861534	861545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312793006
329	NC_014721	GTTGCA	2	12	862112	862123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312793007
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332	NC_014721	CGTATC	2	12	869362	869373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312793017
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340	NC_014721	TAAAAA	2	12	893785	893796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312793040
341	NC_014721	ATCAAA	2	12	897434	897445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312793042
342	NC_014721	ATTTGT	2	12	898446	898457	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312793045
343	NC_014721	TTCCTA	2	12	899122	899133	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312793045
344	NC_014721	ATTACT	2	12	902163	902174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312793047
345	NC_014721	AGCTAA	2	12	902980	902991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312793049
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