MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 2498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	GGAAA	2	10	736	745	60 %	0 %	40 %	0 %	312792284
2	NC_014721	AGGCG	2	10	1296	1305	20 %	0 %	60 %	20 %	312792284
3	NC_014721	AAGCT	2	10	1856	1865	40 %	20 %	20 %	20 %	312792285
4	NC_014721	ATAAA	2	10	2850	2859	80 %	20 %	0 %	0 %	312792286
5	NC_014721	CTTCT	2	10	2892	2901	0 %	60 %	0 %	40 %	312792286
6	NC_014721	AGAGA	2	10	3052	3061	60 %	0 %	40 %	0 %	312792286
7	NC_014721	TTTAG	2	10	3398	3407	20 %	60 %	20 %	0 %	312792286
8	NC_014721	CTTCT	2	10	3642	3651	0 %	60 %	0 %	40 %	312792286
9	NC_014721	GGATA	2	10	4196	4205	40 %	20 %	40 %	0 %	312792288
10	NC_014721	AAAAG	2	10	7769	7778	80 %	0 %	20 %	0 %	312792290
11	NC_014721	TGTGT	2	10	8349	8358	0 %	60 %	40 %	0 %	312792290
12	NC_014721	AGACA	2	10	8573	8582	60 %	0 %	20 %	20 %	312792290
13	NC_014721	TTTCT	2	10	9085	9094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014721	CTTAA	2	10	9151	9160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014721	AAGGA	2	10	9930	9939	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014721	AGAAT	2	10	10808	10817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014721	TAGTT	2	10	11661	11670	20 %	60 %	20 %	0 %	312792292
18	NC_014721	AAGAA	2	10	12825	12834	80 %	0 %	20 %	0 %	312792292
19	NC_014721	CTAAT	2	10	14142	14151	40 %	40 %	0 %	20 %	312792293
20	NC_014721	TTTAA	2	10	14595	14604	40 %	60 %	0 %	0 %	312792294
21	NC_014721	CAAAG	2	10	15960	15969	60 %	0 %	20 %	20 %	312792295
22	NC_014721	AAACC	2	10	15995	16004	60 %	0 %	0 %	40 %	312792295
23	NC_014721	TTCAA	2	10	17564	17573	40 %	40 %	0 %	20 %	312792295
24	NC_014721	AGACA	2	10	18085	18094	60 %	0 %	20 %	20 %	312792295
25	NC_014721	TTTTA	2	10	19367	19376	20 %	80 %	0 %	0 %	312792296
26	NC_014721	ATTAT	2	10	20477	20486	40 %	60 %	0 %	0 %	312792296
27	NC_014721	AACCT	2	10	20836	20845	40 %	20 %	0 %	40 %	312792296
28	NC_014721	GTACA	2	10	21837	21846	40 %	20 %	20 %	20 %	312792296
29	NC_014721	AAGGT	2	10	22569	22578	40 %	20 %	40 %	0 %	312792296
30	NC_014721	GCGGA	2	10	22681	22690	20 %	0 %	60 %	20 %	312792296
31	NC_014721	GTTAG	2	10	25060	25069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	GTAAA	2	10	25091	25100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	AGATA	2	10	25809	25818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014721	CAAAA	2	10	27084	27093	80 %	0 %	0 %	20 %	312792297
35	NC_014721	TCTGT	2	10	27288	27297	0 %	60 %	20 %	20 %	312792297
36	NC_014721	AGAAA	2	10	27478	27487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014721	AAGAA	2	10	28081	28090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014721	AGCCA	2	10	28146	28155	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014721	GAAAA	2	10	28159	28168	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014721	GGCAG	2	10	29165	29174	20 %	0 %	60 %	20 %	312792298
41	NC_014721	GTTTG	2	10	31799	31808	0 %	60 %	40 %	0 %	312792299
42	NC_014721	TGGTT	2	10	33479	33488	0 %	60 %	40 %	0 %	312792300
43	NC_014721	AGACA	2	10	33500	33509	60 %	0 %	20 %	20 %	312792300
44	NC_014721	TAAAA	2	10	33818	33827	80 %	20 %	0 %	0 %	312792300
45	NC_014721	TTGTC	2	10	34629	34638	0 %	60 %	20 %	20 %	312792301
46	NC_014721	CATTG	2	10	37079	37088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014721	ATTAC	2	10	37921	37930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014721	AAGAT	2	10	41048	41057	60 %	20 %	20 %	0 %	312792302
49	NC_014721	ATTTT	2	10	42818	42827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014721	AGATT	2	10	42857	42866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014721	TAATT	2	10	43137	43146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	GTAAT	2	10	43508	43517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014721	TAAAT	2	10	44088	44097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014721	GTAAT	2	10	44828	44837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014721	GATAT	2	10	45460	45469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014721	AGTTT	2	10	46245	46254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014721	GGAGC	2	10	46755	46764	20 %	0 %	60 %	20 %	312792303
58	NC_014721	ATTGG	2	10	47693	47702	20 %	40 %	40 %	0 %	312792304
59	NC_014721	AAGAG	2	10	48191	48200	60 %	0 %	40 %	0 %	312792304
60	NC_014721	ATAGA	2	10	48371	48380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	ATCTT	2	10	48579	48588	20 %	60 %	0 %	20 %	312792305
62	NC_014721	ATATT	2	10	48702	48711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014721	AGTTT	2	10	48725	48734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	CATTT	2	10	50580	50589	20 %	60 %	0 %	20 %	312792307
65	NC_014721	GTTAT	2	10	51057	51066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	GCGTT	2	10	51456	51465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014721	AAGAA	2	10	53483	53492	80 %	0 %	20 %	0 %	312792308
68	NC_014721	AGAAA	2	10	53576	53585	80 %	0 %	20 %	0 %	312792308
69	NC_014721	AAATT	2	10	53955	53964	60 %	40 %	0 %	0 %	312792308
70	NC_014721	ATAAA	2	10	54256	54265	80 %	20 %	0 %	0 %	312792308
71	NC_014721	TTAAA	2	10	56020	56029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014721	GTATT	2	10	58249	58258	20 %	60 %	20 %	0 %	312792312
73	NC_014721	GACAT	2	10	58866	58875	40 %	20 %	20 %	20 %	312792314
74	NC_014721	TCTCT	2	10	60354	60363	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014721	AGAAA	2	10	60936	60945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014721	ATAAA	2	10	61354	61363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	TAAGA	2	10	61399	61408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	TTTGT	2	10	61771	61780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014721	CAAAA	2	10	62006	62015	80 %	0 %	0 %	20 %	312792315
80	NC_014721	GTTTT	2	10	62052	62061	0 %	80 %	20 %	0 %	312792315
81	NC_014721	TTAAA	2	10	64038	64047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014721	CACTA	2	10	64096	64105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014721	TAAAT	2	10	64127	64136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014721	TGAAA	2	10	64389	64398	60 %	20 %	20 %	0 %	312792317
85	NC_014721	ATGTT	2	10	65113	65122	20 %	60 %	20 %	0 %	312792318
86	NC_014721	TTTTC	2	10	65899	65908	0 %	80 %	0 %	20 %	312792318
87	NC_014721	ACATT	2	10	65995	66004	40 %	40 %	0 %	20 %	312792319
88	NC_014721	AGGTT	2	10	66352	66361	20 %	40 %	40 %	0 %	312792319
89	NC_014721	TTGTC	2	10	68356	68365	0 %	60 %	20 %	20 %	312792321
90	NC_014721	AAGAA	2	10	69337	69346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014721	TATAA	2	10	69890	69899	60 %	40 %	0 %	0 %	312792322
92	NC_014721	AAATA	2	10	70446	70455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	TTAAC	2	10	70910	70919	40 %	40 %	0 %	20 %	312792323
94	NC_014721	ATAGC	2	10	71330	71339	40 %	20 %	20 %	20 %	312792323
95	NC_014721	TGTGT	2	10	74273	74282	0 %	60 %	40 %	0 %	312792327
96	NC_014721	AGGAG	2	10	75793	75802	40 %	0 %	60 %	0 %	312792327
97	NC_014721	TATTT	2	10	79516	79525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014721	ACTTT	2	10	80752	80761	20 %	60 %	0 %	20 %	312792330
99	NC_014721	AGGCA	2	10	83945	83954	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014721	GAAAG	2	10	86336	86345	60 %	0 %	40 %	0 %	312792335
101	NC_014721	TTTTG	2	10	86431	86440	0 %	80 %	20 %	0 %	312792335
102	NC_014721	TTTCA	2	10	87054	87063	20 %	60 %	0 %	20 %	312792336
103	NC_014721	AAAAG	2	10	87380	87389	80 %	0 %	20 %	0 %	312792336
104	NC_014721	GGAGC	2	10	89264	89273	20 %	0 %	60 %	20 %	312792340
105	NC_014721	GTATC	2	10	91327	91336	20 %	40 %	20 %	20 %	312792342
106	NC_014721	CAAGG	2	10	92142	92151	40 %	0 %	40 %	20 %	312792342
107	NC_014721	TGGAA	2	10	93054	93063	40 %	20 %	40 %	0 %	312792342
108	NC_014721	ATTTA	2	10	95092	95101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014721	TGTCT	2	10	96444	96453	0 %	60 %	20 %	20 %	312792344
110	NC_014721	TCATA	2	10	97070	97079	40 %	40 %	0 %	20 %	312792345
111	NC_014721	GAAAA	2	10	104174	104183	80 %	0 %	20 %	0 %	312792353
112	NC_014721	AGTTT	2	10	104657	104666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	AAATC	2	10	106010	106019	60 %	20 %	0 %	20 %	312792355
114	NC_014721	CTACA	2	10	106851	106860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014721	AATCC	2	10	107482	107491	40 %	20 %	0 %	40 %	312792356
116	NC_014721	TTCAC	2	10	108031	108040	20 %	40 %	0 %	40 %	312792356
117	NC_014721	ATATA	2	10	109332	109341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014721	AATAT	2	10	109422	109431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	CATAA	2	10	111661	111670	60 %	20 %	0 %	20 %	312792362
120	NC_014721	TAACT	2	10	111727	111736	40 %	40 %	0 %	20 %	312792362
121	NC_014721	TAAAA	2	10	112025	112034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014721	AGTGA	2	10	113809	113818	40 %	20 %	40 %	0 %	312792364
123	NC_014721	CTTTT	2	10	114993	115002	0 %	80 %	0 %	20 %	312792366
124	NC_014721	TGTTT	2	10	116447	116456	0 %	80 %	20 %	0 %	312792366
125	NC_014721	CAATG	2	10	117412	117421	40 %	20 %	20 %	20 %	312792367
126	NC_014721	GAAAG	2	10	118682	118691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014721	TCATT	2	10	119852	119861	20 %	60 %	0 %	20 %	312792370
128	NC_014721	TAAAA	2	10	121462	121471	80 %	20 %	0 %	0 %	312792372
129	NC_014721	TAAGA	2	10	122086	122095	60 %	20 %	20 %	0 %	312792372
130	NC_014721	TGCTT	2	10	122539	122548	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014721	GATTT	2	10	123814	123823	20 %	60 %	20 %	0 %	312792374
132	NC_014721	AATAT	2	10	124362	124371	60 %	40 %	0 %	0 %	312792375
133	NC_014721	TTTTA	2	10	124400	124409	20 %	80 %	0 %	0 %	312792375
134	NC_014721	AAAGA	2	10	124698	124707	80 %	0 %	20 %	0 %	312792375
135	NC_014721	AGAAA	2	10	125698	125707	80 %	0 %	20 %	0 %	312792376
136	NC_014721	ATTTT	2	10	125859	125868	20 %	80 %	0 %	0 %	312792376
137	NC_014721	CTATA	2	10	131404	131413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014721	CTTTT	2	10	131414	131423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014721	ATAAA	2	10	132251	132260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014721	CAAAA	2	10	132507	132516	80 %	0 %	0 %	20 %	312792382
141	NC_014721	TGGAA	2	10	133670	133679	40 %	20 %	40 %	0 %	312792382
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275	NC_014721	TAAAA	2	10	310303	310312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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