MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	TTTCT	2	10	9085	9094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014721	CTTAA	2	10	9151	9160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014721	AAGGA	2	10	9930	9939	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014721	AGAAT	2	10	10808	10817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014721	GTTAG	2	10	25060	25069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014721	GTAAA	2	10	25091	25100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014721	AGATA	2	10	25809	25818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014721	AGAAA	2	10	27478	27487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014721	AAGAA	2	10	28081	28090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014721	AGCCA	2	10	28146	28155	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014721	GAAAA	2	10	28159	28168	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014721	CATTG	2	10	37079	37088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014721	ATTAC	2	10	37921	37930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014721	ATTTT	2	10	42818	42827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014721	AGATT	2	10	42857	42866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014721	TAATT	2	10	43137	43146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014721	GTAAT	2	10	43508	43517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014721	TAAAT	2	10	44088	44097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014721	GTAAT	2	10	44828	44837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014721	GATAT	2	10	45460	45469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014721	AGTTT	2	10	46245	46254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014721	ATAGA	2	10	48371	48380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014721	ATATT	2	10	48702	48711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014721	AGTTT	2	10	48725	48734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014721	GTTAT	2	10	51057	51066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	GCGTT	2	10	51456	51465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014721	TTAAA	2	10	56020	56029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014721	TCTCT	2	10	60354	60363	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014721	AGAAA	2	10	60936	60945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014721	ATAAA	2	10	61354	61363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014721	TAAGA	2	10	61399	61408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	TTTGT	2	10	61771	61780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	TTAAA	2	10	64038	64047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014721	CACTA	2	10	64096	64105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014721	TAAAT	2	10	64127	64136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014721	AAGAA	2	10	69337	69346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014721	AAATA	2	10	70446	70455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014721	TATTT	2	10	79516	79525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014721	AGGCA	2	10	83945	83954	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014721	ATTTA	2	10	95092	95101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014721	AGTTT	2	10	104657	104666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014721	CTACA	2	10	106851	106860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014721	ATATA	2	10	109332	109341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014721	AATAT	2	10	109422	109431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014721	TAAAA	2	10	112025	112034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014721	GAAAG	2	10	118682	118691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014721	TGCTT	2	10	122539	122548	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014721	CTATA	2	10	131404	131413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014721	CTTTT	2	10	131414	131423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014721	ATAAA	2	10	132251	132260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014721	AAAAT	2	10	140084	140093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	ACTTG	2	10	140173	140182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014721	TAAAA	2	10	142517	142526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014721	ATCTT	2	10	143860	143869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014721	TCGTG	2	10	145620	145629	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014721	GGGAG	2	10	146759	146768	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014721	AGGGG	2	10	148129	148138	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014721	CCGAA	2	10	148158	148167	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014721	ACCAT	2	10	151262	151271	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014721	TTAAA	2	10	153111	153120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	ATTTG	2	10	154781	154790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014721	AAAAT	2	10	154964	154973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014721	TAAAA	2	10	159474	159483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	TTTTG	2	10	164915	164924	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014721	ATGAA	2	10	182300	182309	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	GAAAT	2	10	182376	182385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014721	AGTAT	2	10	199772	199781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014721	ATTCC	2	10	206745	206754	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014721	ATTTT	2	10	207222	207231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014721	TAATA	2	10	210765	210774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014721	AAATG	2	10	215142	215151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014721	AGAAA	2	10	220029	220038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014721	TTTAA	2	10	237586	237595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014721	TTTTA	2	10	242068	242077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014721	TGTTT	2	10	257823	257832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014721	TAAAA	2	10	270396	270405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	TATAA	2	10	271598	271607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	TAAAA	2	10	275723	275732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014721	CAAAA	2	10	289622	289631	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014721	CAGGG	2	10	301551	301560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014721	ATTTT	2	10	304179	304188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014721	TAAAA	2	10	310303	310312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014721	GTTGA	2	10	314910	314919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014721	ATATA	2	10	317739	317748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014721	GGCAA	2	10	325682	325691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014721	AAATT	2	10	330987	330996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014721	TTTAT	2	10	341271	341280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014721	TAAAA	2	10	348462	348471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014721	TAAAA	2	10	350600	350609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014721	AAGGG	2	10	368232	368241	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014721	ATACT	3	15	372067	372081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014721	AGGTA	2	10	372166	372175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	TATAA	2	10	377547	377556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014721	TCGTG	2	10	383702	383711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014721	TAGGT	2	10	384188	384197	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014721	TTTGA	2	10	384202	384211	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014721	GGGAG	2	10	384998	385007	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014721	AGGGG	2	10	386368	386377	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014721	CCGAA	2	10	386397	386406	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014721	ATAGA	2	10	387923	387932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014721	TTATT	2	10	387933	387942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014721	AAAAG	2	10	398397	398406	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014721	CTTTG	2	10	400055	400064	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014721	TCTTT	2	10	405092	405101	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014721	ATTCC	2	10	405485	405494	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014721	CTTTA	2	10	406719	406728	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014721	TTTTC	2	10	409695	409704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014721	TGAAA	2	10	410794	410803	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014721	TTGAA	2	10	413478	413487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014721	ATACC	2	10	425494	425503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014721	TAAAT	2	10	427607	427616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014721	TAAAA	2	10	427765	427774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	CTAAA	2	10	432115	432124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014721	TAAAA	3	15	450084	450098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014721	TTCTT	2	10	484657	484666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014721	ATATT	2	10	503088	503097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014721	AGTTT	2	10	506669	506678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014721	AAATT	2	10	508001	508010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	TTAAA	2	10	511400	511409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014721	TTTTA	2	10	512089	512098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014721	CAAAA	2	10	517862	517871	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014721	CAAGA	2	10	518495	518504	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014721	TAACA	2	10	529423	529432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014721	AAAGG	2	10	532438	532447	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014721	GATTA	2	10	541518	541527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014721	TTTGA	2	10	543841	543850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014721	AAGAA	2	10	549674	549683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014721	TTAGA	2	10	563138	563147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014721	TTATT	2	10	577726	577735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014721	TAAAT	2	10	577819	577828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014721	ATATC	2	10	579542	579551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014721	TAAAA	2	10	580806	580815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014721	ATATA	2	10	590259	590268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014721	TAAAA	2	10	594267	594276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014721	AATAT	2	10	603275	603284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014721	CTTTA	2	10	605508	605517	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014721	TAGAA	2	10	605709	605718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014721	TTTCA	2	10	606586	606595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014721	ATTTT	2	10	607859	607868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014721	TAAGA	2	10	607925	607934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014721	CTTTA	2	10	614980	614989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014721	CTAAC	2	10	615012	615021	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014721	ATATA	2	10	615434	615443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014721	AAAAT	2	10	619036	619045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014721	ATATA	2	10	638915	638924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014721	AATTT	2	10	652372	652381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014721	ATAGA	2	10	659369	659378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014721	ACAGA	2	10	667023	667032	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014721	TAAAT	2	10	667693	667702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014721	TTTAA	2	10	671605	671614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014721	TCTTA	2	10	678826	678835	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_014721	ATTTT	2	10	758488	758497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_014721	TTAAA	2	10	2468626	2468635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_014721	AAACT	2	10	2468946	2468955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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