MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 7228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	ATGC	2	8	556	563	25 %	25 %	25 %	25 %	312792284
2	NC_014721	ATGT	2	8	607	614	25 %	50 %	25 %	0 %	312792284
3	NC_014721	AAAC	2	8	1001	1008	75 %	0 %	0 %	25 %	312792284
4	NC_014721	TGGA	2	8	2645	2652	25 %	25 %	50 %	0 %	312792285
5	NC_014721	ATCT	2	8	2722	2729	25 %	50 %	0 %	25 %	312792285
6	NC_014721	TAGA	2	8	3039	3046	50 %	25 %	25 %	0 %	312792286
7	NC_014721	GTTT	2	8	3118	3125	0 %	75 %	25 %	0 %	312792286
8	NC_014721	CTTG	2	8	3424	3431	0 %	50 %	25 %	25 %	312792286
9	NC_014721	GATT	2	8	4153	4160	25 %	50 %	25 %	0 %	312792287
10	NC_014721	TGTC	2	8	5176	5183	0 %	50 %	25 %	25 %	312792288
11	NC_014721	CTTT	2	8	5743	5750	0 %	75 %	0 %	25 %	312792288
12	NC_014721	AAGA	2	8	6136	6143	75 %	0 %	25 %	0 %	312792289
13	NC_014721	AGAT	2	8	6292	6299	50 %	25 %	25 %	0 %	312792289
14	NC_014721	TGAT	2	8	6305	6312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014721	TGAT	2	8	6916	6923	25 %	50 %	25 %	0 %	312792290
16	NC_014721	TACT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	0 %	25 %	312792290
17	NC_014721	TAAG	2	8	8897	8904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014721	TCTT	2	8	9141	9148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014721	GATA	2	8	9386	9393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014721	TGAA	2	8	9761	9768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014721	AAAT	2	8	9818	9825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014721	AAGT	2	8	10049	10056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014721	AACT	2	8	10380	10387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014721	GAAA	2	8	10409	10416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014721	AAAT	2	8	10601	10608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	TTGC	2	8	10693	10700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014721	AAAG	2	8	11244	11251	75 %	0 %	25 %	0 %	312792291
28	NC_014721	AAAG	2	8	11270	11277	75 %	0 %	25 %	0 %	312792291
29	NC_014721	TAAA	2	8	11408	11415	75 %	25 %	0 %	0 %	312792291
30	NC_014721	AGAA	2	8	11774	11781	75 %	0 %	25 %	0 %	312792292
31	NC_014721	TGTA	2	8	11879	11886	25 %	50 %	25 %	0 %	312792292
32	NC_014721	GAAG	2	8	12259	12266	50 %	0 %	50 %	0 %	312792292
33	NC_014721	AGAT	2	8	12353	12360	50 %	25 %	25 %	0 %	312792292
34	NC_014721	AAAG	2	8	12363	12370	75 %	0 %	25 %	0 %	312792292
35	NC_014721	ATTA	2	8	12486	12493	50 %	50 %	0 %	0 %	312792292
36	NC_014721	AAAG	2	8	13253	13260	75 %	0 %	25 %	0 %	312792293
37	NC_014721	CCAG	2	8	13294	13301	25 %	0 %	25 %	50 %	312792293
38	NC_014721	GAGT	2	8	14389	14396	25 %	25 %	50 %	0 %	312792294
39	NC_014721	GACA	2	8	15733	15740	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
40	NC_014721	ATCA	2	8	15916	15923	50 %	25 %	0 %	25 %	312792295
41	NC_014721	CAGA	2	8	16157	16164	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
42	NC_014721	CAAG	2	8	16365	16372	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
43	NC_014721	TGAC	2	8	16590	16597	25 %	25 %	25 %	25 %	312792295
44	NC_014721	AAAC	2	8	16827	16834	75 %	0 %	0 %	25 %	312792295
45	NC_014721	GACA	2	8	17020	17027	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
46	NC_014721	ACAT	2	8	17381	17388	50 %	25 %	0 %	25 %	312792295
47	NC_014721	TAAG	2	8	17409	17416	50 %	25 %	25 %	0 %	312792295
48	NC_014721	GACA	2	8	17449	17456	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
49	NC_014721	ACAA	2	8	17531	17538	75 %	0 %	0 %	25 %	312792295
50	NC_014721	GACA	2	8	17944	17951	50 %	0 %	25 %	25 %	312792295
51	NC_014721	AAGA	2	8	18516	18523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	TATG	2	8	18858	18865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014721	GTTA	2	8	19611	19618	25 %	50 %	25 %	0 %	312792296
54	NC_014721	GCCA	2	8	20143	20150	25 %	0 %	25 %	50 %	312792296
55	NC_014721	GGAT	2	8	20565	20572	25 %	25 %	50 %	0 %	312792296
56	NC_014721	TGGA	2	8	21961	21968	25 %	25 %	50 %	0 %	312792296
57	NC_014721	CAAA	2	8	23608	23615	75 %	0 %	0 %	25 %	312792296
58	NC_014721	CAAT	2	8	23989	23996	50 %	25 %	0 %	25 %	312792296
59	NC_014721	CATT	2	8	24719	24726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014721	GATA	2	8	25752	25759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	AGCA	2	8	25896	25903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014721	AAGA	2	8	26601	26608	75 %	0 %	25 %	0 %	312792297
63	NC_014721	GAAA	2	8	26932	26939	75 %	0 %	25 %	0 %	312792297
64	NC_014721	GAAT	2	8	27164	27171	50 %	25 %	25 %	0 %	312792297
65	NC_014721	CAAG	2	8	27384	27391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014721	AAGA	2	8	27398	27405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014721	GAGG	2	8	27902	27909	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014721	GGAA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	50 %	0 %	312792298
69	NC_014721	AAAC	2	8	28350	28357	75 %	0 %	0 %	25 %	312792298
70	NC_014721	AGAC	2	8	28395	28402	50 %	0 %	25 %	25 %	312792298
71	NC_014721	GTTT	2	8	28673	28680	0 %	75 %	25 %	0 %	312792298
72	NC_014721	AAGA	2	8	28756	28763	75 %	0 %	25 %	0 %	312792298
73	NC_014721	GAAG	2	8	28766	28773	50 %	0 %	50 %	0 %	312792298
74	NC_014721	GATG	2	8	29224	29231	25 %	25 %	50 %	0 %	312792298
75	NC_014721	TTTG	2	8	29716	29723	0 %	75 %	25 %	0 %	312792298
76	NC_014721	AAGC	2	8	29937	29944	50 %	0 %	25 %	25 %	312792298
77	NC_014721	TCAT	2	8	30385	30392	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
78	NC_014721	TCAT	2	8	30844	30851	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
79	NC_014721	AAGA	2	8	31160	31167	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
80	NC_014721	AAGA	2	8	31310	31317	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
81	NC_014721	AAGA	2	8	31460	31467	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
82	NC_014721	TCAT	2	8	31750	31757	25 %	50 %	0 %	25 %	312792299
83	NC_014721	AAAG	2	8	31918	31925	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
84	NC_014721	AAGA	2	8	32072	32079	75 %	0 %	25 %	0 %	312792299
85	NC_014721	TCTT	2	8	32514	32521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014721	GAAT	2	8	33245	33252	50 %	25 %	25 %	0 %	312792300
87	NC_014721	GTTT	2	8	33542	33549	0 %	75 %	25 %	0 %	312792300
88	NC_014721	AGCA	2	8	33580	33587	50 %	0 %	25 %	25 %	312792300
89	NC_014721	GCAA	2	8	33598	33605	50 %	0 %	25 %	25 %	312792300
90	NC_014721	GGTT	2	8	33860	33867	0 %	50 %	50 %	0 %	312792300
91	NC_014721	GAAA	2	8	34066	34073	75 %	0 %	25 %	0 %	312792301
92	NC_014721	ATGG	2	8	34441	34448	25 %	25 %	50 %	0 %	312792301
93	NC_014721	CTTT	2	8	34475	34482	0 %	75 %	0 %	25 %	312792301
94	NC_014721	GCTT	2	8	34716	34723	0 %	50 %	25 %	25 %	312792301
95	NC_014721	GCGA	2	8	35133	35140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014721	ATGG	2	8	35706	35713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014721	CAGT	2	8	35902	35909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014721	ACTT	2	8	35938	35945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014721	AAAG	2	8	36200	36207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014721	ACTA	2	8	37220	37227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014721	TTAC	2	8	37356	37363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014721	GTAT	2	8	38016	38023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014721	TAGG	2	8	38047	38054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014721	GAAT	2	8	38192	38199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014721	TAGG	2	8	38209	38216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014721	TGGG	2	8	38365	38372	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014721	ACAG	2	8	38670	38677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014721	TAGG	2	8	38929	38936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014721	AAAT	2	8	38947	38954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014721	ATCG	2	8	39075	39082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014721	GCAG	2	8	39306	39313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014721	TGAT	2	8	39388	39395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	AGAC	2	8	40081	40088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014721	TTGT	2	8	40553	40560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014721	GATA	2	8	41250	41257	50 %	25 %	25 %	0 %	312792302
116	NC_014721	GAAA	2	8	41580	41587	75 %	0 %	25 %	0 %	312792302
117	NC_014721	AATA	2	8	41610	41617	75 %	25 %	0 %	0 %	312792302
118	NC_014721	TGAG	2	8	41687	41694	25 %	25 %	50 %	0 %	312792302
119	NC_014721	TTTG	2	8	42305	42312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014721	ATTC	2	8	42759	42766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014721	AGAC	2	8	43197	43204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014721	ACTT	2	8	43694	43701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014721	GATA	2	8	43743	43750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014721	TAGG	2	8	43865	43872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014721	AGGT	2	8	43892	43899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014721	AGAT	2	8	43917	43924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014721	AAGT	2	8	44498	44505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014721	TTAT	2	8	44651	44658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014721	AGGA	2	8	44712	44719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014721	ACAA	2	8	45022	45029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014721	ATAG	2	8	45130	45137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014721	TGGT	2	8	45188	45195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014721	TAAA	2	8	45344	45351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014721	CCTC	2	8	45598	45605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_014721	AGGA	2	8	45735	45742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014721	TAAA	2	8	45782	45789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014721	AGTA	2	8	45924	45931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014721	GATA	2	8	46418	46425	50 %	25 %	25 %	0 %	312792303
139	NC_014721	AACA	2	8	46453	46460	75 %	0 %	0 %	25 %	312792303
140	NC_014721	ATTG	2	8	46493	46500	25 %	50 %	25 %	0 %	312792303
141	NC_014721	TTTA	2	8	46505	46512	25 %	75 %	0 %	0 %	312792303
142	NC_014721	AGAA	2	8	46913	46920	75 %	0 %	25 %	0 %	312792303
143	NC_014721	TTAA	2	8	47034	47041	50 %	50 %	0 %	0 %	312792303
144	NC_014721	AGAT	2	8	47287	47294	50 %	25 %	25 %	0 %	312792303
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