MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 1307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	TGAT	2	8	6305	6312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014721	TAAG	2	8	8897	8904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014721	TCTT	2	8	9141	9148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014721	GATA	2	8	9386	9393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014721	TGAA	2	8	9761	9768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014721	AAAT	2	8	9818	9825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014721	AAGT	2	8	10049	10056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014721	AACT	2	8	10380	10387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014721	GAAA	2	8	10409	10416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014721	AAAT	2	8	10601	10608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014721	TTGC	2	8	10693	10700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014721	AAGA	2	8	18516	18523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014721	TATG	2	8	18858	18865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014721	CATT	2	8	24719	24726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014721	GATA	2	8	25752	25759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014721	AGCA	2	8	25896	25903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014721	CAAG	2	8	27384	27391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014721	AAGA	2	8	27398	27405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014721	GAGG	2	8	27902	27909	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014721	TCTT	2	8	32514	32521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014721	GCGA	2	8	35133	35140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014721	ATGG	2	8	35706	35713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014721	CAGT	2	8	35902	35909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014721	ACTT	2	8	35938	35945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014721	AAAG	2	8	36200	36207	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	ACTA	2	8	37220	37227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014721	TTAC	2	8	37356	37363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014721	GTAT	2	8	38016	38023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014721	TAGG	2	8	38047	38054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014721	GAAT	2	8	38192	38199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014721	TAGG	2	8	38209	38216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	TGGG	2	8	38365	38372	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	ACAG	2	8	38670	38677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014721	TAGG	2	8	38929	38936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014721	AAAT	2	8	38947	38954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014721	ATCG	2	8	39075	39082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014721	GCAG	2	8	39306	39313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014721	TGAT	2	8	39388	39395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014721	AGAC	2	8	40081	40088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014721	TTGT	2	8	40553	40560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014721	TTTG	2	8	42305	42312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014721	ATTC	2	8	42759	42766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014721	AGAC	2	8	43197	43204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014721	ACTT	2	8	43694	43701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014721	GATA	2	8	43743	43750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014721	TAGG	2	8	43865	43872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014721	AGGT	2	8	43892	43899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014721	AGAT	2	8	43917	43924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014721	AAGT	2	8	44498	44505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014721	TTAT	2	8	44651	44658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014721	AGGA	2	8	44712	44719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	ACAA	2	8	45022	45029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014721	ATAG	2	8	45130	45137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014721	TGGT	2	8	45188	45195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014721	TAAA	2	8	45344	45351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014721	CCTC	2	8	45598	45605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014721	AGGA	2	8	45735	45742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014721	TAAA	2	8	45782	45789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014721	AGTA	2	8	45924	45931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014721	ATAA	2	8	48333	48340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	CAAG	2	8	48389	48396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014721	GTAA	2	8	51130	51137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014721	TTTG	2	8	51776	51783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	TTAC	2	8	55510	55517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014721	TTTA	2	8	56426	56433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	TTGA	2	8	58393	58400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014721	AAAG	2	8	59173	59180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014721	ATTA	2	8	59925	59932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014721	TTAT	2	8	59998	60005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014721	TTTG	2	8	60265	60272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014721	AGAA	2	8	60616	60623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014721	TGCT	2	8	61043	61050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014721	TTGA	2	8	61115	61122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014721	ACAA	2	8	61293	61300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014721	TTGA	2	8	61523	61530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014721	AGAT	2	8	61683	61690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	AAAG	2	8	62743	62750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	CAGG	2	8	62824	62831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014721	ACAG	2	8	62846	62853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014721	GCAA	2	8	62912	62919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014721	GAGT	2	8	63415	63422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014721	TCCT	2	8	63943	63950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014721	TCAT	2	8	69170	69177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014721	ACTT	2	8	70082	70089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014721	TGAG	2	8	70294	70301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014721	AATG	2	8	70332	70339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014721	AAAG	2	8	70376	70383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014721	AGAT	2	8	72498	72505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014721	CAAA	2	8	73548	73555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014721	AATA	2	8	77733	77740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014721	GTTT	2	8	77854	77861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014721	TTAT	2	8	77890	77897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	TTGG	2	8	78510	78517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014721	AGCA	2	8	78616	78623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014721	TATT	2	8	78796	78803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014721	GATG	2	8	78805	78812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014721	CAAA	2	8	79012	79019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014721	ACTA	2	8	79026	79033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014721	AAAT	2	8	79063	79070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014721	TTAT	2	8	86014	86021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014721	TTTG	2	8	88645	88652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014721	CAAT	2	8	88725	88732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014721	GATA	2	8	88762	88769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014721	AAAG	2	8	88867	88874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014721	TCTT	2	8	94601	94608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014721	AAAC	2	8	98015	98022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014721	TACT	2	8	98405	98412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014721	CCTA	2	8	101201	101208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014721	AACC	2	8	103245	103252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014721	AGCA	2	8	104557	104564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014721	ACAA	2	8	104699	104706	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014721	ATTT	2	8	107025	107032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	GAGT	2	8	108228	108235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014721	GAAA	2	8	108674	108681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014721	GTGG	2	8	109695	109702	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014721	AAAT	2	8	110996	111003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014721	CACT	2	8	111108	111115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014721	TATT	2	8	118483	118490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	ATTT	2	8	118575	118582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014721	AGAA	2	8	119997	120004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014721	TGAT	2	8	120027	120034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014721	TCCT	2	8	120076	120083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014721	TAAA	2	8	120282	120289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014721	TATT	2	8	120367	120374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014721	GTGA	2	8	123271	123278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014721	CTTT	2	8	132080	132087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014721	TGAT	2	8	132152	132159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014721	TAGA	2	8	132237	132244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014721	GAAA	2	8	134077	134084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014721	TAAA	2	8	138743	138750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014721	ATAA	2	8	140137	140144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014721	TATG	2	8	140155	140162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014721	CAGA	2	8	140204	140211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014721	TATT	2	8	141983	141990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014721	TTTC	2	8	142013	142020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014721	TATC	2	8	142343	142350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014721	TAAT	2	8	144414	144421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014721	GATG	2	8	145357	145364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014721	GTCT	2	8	146209	146216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014721	GAAG	2	8	146230	146237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014721	TTAC	2	8	146858	146865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014721	GACG	2	8	147941	147948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014721	GGAC	2	8	148955	148962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014721	ATAA	2	8	149547	149554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014721	TAAT	2	8	149599	149606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014721	AATT	2	8	150290	150297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014721	TATC	2	8	150655	150662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014721	GATA	2	8	150691	150698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014721	CGGA	2	8	151973	151980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014721	AAAT	2	8	151997	152004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014721	TCAT	2	8	152582	152589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014721	CCAG	2	8	152997	153004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_014721	TTTA	2	8	153992	153999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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