MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 7464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	TGAA	2	8	99	106	50 %	25 %	25 %	0 %	312621128
2	NC_014720	AAAT	2	8	141	148	75 %	25 %	0 %	0 %	312621128
3	NC_014720	TTTA	2	8	533	540	25 %	75 %	0 %	0 %	312621128
4	NC_014720	ATGC	2	8	572	579	25 %	25 %	25 %	25 %	312621128
5	NC_014720	TATG	2	8	622	629	25 %	50 %	25 %	0 %	312621128
6	NC_014720	AGAC	2	8	681	688	50 %	0 %	25 %	25 %	312621128
7	NC_014720	AAAC	2	8	1017	1024	75 %	0 %	0 %	25 %	312621128
8	NC_014720	TAGA	2	8	1848	1855	50 %	25 %	25 %	0 %	312621130
9	NC_014720	GAAG	2	8	2222	2229	50 %	0 %	50 %	0 %	312621130
10	NC_014720	ACAA	2	8	2839	2846	75 %	0 %	0 %	25 %	312621131
11	NC_014720	TTCT	2	8	2987	2994	0 %	75 %	0 %	25 %	312621131
12	NC_014720	TAAA	2	8	3382	3389	75 %	25 %	0 %	0 %	312621131
13	NC_014720	GATA	2	8	3581	3588	50 %	25 %	25 %	0 %	312621131
14	NC_014720	AACC	2	8	4669	4676	50 %	0 %	0 %	50 %	312621133
15	NC_014720	GACA	2	8	5224	5231	50 %	0 %	25 %	25 %	312621133
16	NC_014720	AAAG	2	8	5404	5411	75 %	0 %	25 %	0 %	312621133
17	NC_014720	AATG	2	8	5939	5946	50 %	25 %	25 %	0 %	312621133
18	NC_014720	AAAG	2	8	7937	7944	75 %	0 %	25 %	0 %	312621136
19	NC_014720	AAGC	2	8	8826	8833	50 %	0 %	25 %	25 %	312621136
20	NC_014720	TACT	2	8	8928	8935	25 %	50 %	0 %	25 %	312621136
21	NC_014720	TTTA	2	8	9476	9483	25 %	75 %	0 %	0 %	312621137
22	NC_014720	AGAC	2	8	9757	9764	50 %	0 %	25 %	25 %	312621137
23	NC_014720	AGAT	2	8	10720	10727	50 %	25 %	25 %	0 %	312621137
24	NC_014720	TTTG	2	8	11087	11094	0 %	75 %	25 %	0 %	312621137
25	NC_014720	GAAA	2	8	12509	12516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014720	GATG	2	8	13069	13076	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
27	NC_014720	GTTT	2	8	13355	13362	0 %	75 %	25 %	0 %	312621140
28	NC_014720	GAGT	2	8	13375	13382	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
29	NC_014720	AGCA	2	8	13393	13400	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
30	NC_014720	AGCA	2	8	13410	13417	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
31	NC_014720	TATT	2	8	13597	13604	25 %	75 %	0 %	0 %	312621140
32	NC_014720	GCGA	2	8	13644	13651	25 %	0 %	50 %	25 %	312621140
33	NC_014720	TGAA	2	8	13966	13973	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
34	NC_014720	ATGG	2	8	14217	14224	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
35	NC_014720	CAGT	2	8	14413	14420	25 %	25 %	25 %	25 %	312621140
36	NC_014720	TTAC	2	8	14451	14458	25 %	50 %	0 %	25 %	312621140
37	NC_014720	AAAG	2	8	14711	14718	75 %	0 %	25 %	0 %	312621140
38	NC_014720	TTAC	2	8	15867	15874	25 %	50 %	0 %	25 %	312621140
39	NC_014720	GTAT	2	8	16527	16534	25 %	50 %	25 %	0 %	312621140
40	NC_014720	TAGG	2	8	16558	16565	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
41	NC_014720	GAAT	2	8	16703	16710	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
42	NC_014720	TAGG	2	8	16720	16727	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
43	NC_014720	TGGG	2	8	16876	16883	0 %	25 %	75 %	0 %	312621140
44	NC_014720	CAGA	2	8	17178	17185	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
45	NC_014720	AAAT	2	8	17458	17465	75 %	25 %	0 %	0 %	312621140
46	NC_014720	ATCG	2	8	17586	17593	25 %	25 %	25 %	25 %	312621140
47	NC_014720	GAAG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
48	NC_014720	TGAT	2	8	17899	17906	25 %	50 %	25 %	0 %	312621140
49	NC_014720	AGAC	2	8	18592	18599	50 %	0 %	25 %	25 %	312621140
50	NC_014720	ACTT	2	8	19513	19520	25 %	50 %	0 %	25 %	312621140
51	NC_014720	GATA	2	8	19562	19569	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
52	NC_014720	TAGG	2	8	19684	19691	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
53	NC_014720	AGGT	2	8	19711	19718	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
54	NC_014720	AGAT	2	8	19736	19743	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
55	NC_014720	AGGA	2	8	20531	20538	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
56	NC_014720	GGGT	2	8	20938	20945	0 %	25 %	75 %	0 %	312621140
57	NC_014720	AATT	2	8	21187	21194	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
58	NC_014720	AGTG	2	8	21332	21339	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
59	NC_014720	AGGA	2	8	21455	21462	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
60	NC_014720	AAAG	2	8	21639	21646	75 %	0 %	25 %	0 %	312621140
61	NC_014720	CAAT	2	8	21750	21757	50 %	25 %	0 %	25 %	312621140
62	NC_014720	TTGT	2	8	22074	22081	0 %	75 %	25 %	0 %	312621141
63	NC_014720	TAAA	2	8	22342	22349	75 %	25 %	0 %	0 %	312621141
64	NC_014720	CCTC	2	8	25640	25647	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014720	ATTG	2	8	25936	25943	25 %	50 %	25 %	0 %	312621143
66	NC_014720	GAAG	2	8	26384	26391	50 %	0 %	50 %	0 %	312621143
67	NC_014720	ATCA	2	8	26662	26669	50 %	25 %	0 %	25 %	312621143
68	NC_014720	CTCA	2	8	26845	26852	25 %	25 %	0 %	50 %	312621143
69	NC_014720	TTTG	2	8	27214	27221	0 %	75 %	25 %	0 %	312621143
70	NC_014720	CAAA	2	8	27233	27240	75 %	0 %	0 %	25 %	312621143
71	NC_014720	TTGT	2	8	27292	27299	0 %	75 %	25 %	0 %	312621143
72	NC_014720	ATTC	2	8	28203	28210	25 %	50 %	0 %	25 %	312621143
73	NC_014720	CAAA	2	8	28405	28412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014720	TTTA	2	8	28506	28513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014720	AACA	2	8	28951	28958	75 %	0 %	0 %	25 %	312621144
76	NC_014720	AAAG	2	8	29177	29184	75 %	0 %	25 %	0 %	312621144
77	NC_014720	ATTA	2	8	29360	29367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014720	GTAA	2	8	29695	29702	50 %	25 %	25 %	0 %	312621145
79	NC_014720	TTCA	2	8	32040	32047	25 %	50 %	0 %	25 %	312621146
80	NC_014720	TCTT	2	8	32523	32530	0 %	75 %	0 %	25 %	312621146
81	NC_014720	AGTG	2	8	32587	32594	25 %	25 %	50 %	0 %	312621146
82	NC_014720	TATT	2	8	33115	33122	25 %	75 %	0 %	0 %	312621146
83	NC_014720	GAAA	2	8	33476	33483	75 %	0 %	25 %	0 %	312621146
84	NC_014720	CAAA	2	8	33563	33570	75 %	0 %	0 %	25 %	312621146
85	NC_014720	TAAC	2	8	33845	33852	50 %	25 %	0 %	25 %	312621146
86	NC_014720	ATGT	2	8	33875	33882	25 %	50 %	25 %	0 %	312621146
87	NC_014720	ATAA	2	8	33902	33909	75 %	25 %	0 %	0 %	312621146
88	NC_014720	ATTG	2	8	34315	34322	25 %	50 %	25 %	0 %	312621146
89	NC_014720	GAAG	2	8	34667	34674	50 %	0 %	50 %	0 %	312621146
90	NC_014720	TCTA	2	8	35010	35017	25 %	50 %	0 %	25 %	312621147
91	NC_014720	CATT	2	8	35041	35048	25 %	50 %	0 %	25 %	312621147
92	NC_014720	TGTT	2	8	35250	35257	0 %	75 %	25 %	0 %	312621147
93	NC_014720	CTTT	2	8	35383	35390	0 %	75 %	0 %	25 %	312621147
94	NC_014720	TAAG	2	8	35828	35835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014720	ATTT	2	8	35960	35967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014720	GTAA	2	8	36111	36118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014720	AAAG	2	8	36336	36343	75 %	0 %	25 %	0 %	312621148
98	NC_014720	ATAA	2	8	36450	36457	75 %	25 %	0 %	0 %	312621148
99	NC_014720	ATCA	2	8	36557	36564	50 %	25 %	0 %	25 %	312621148
100	NC_014720	GCAA	2	8	36840	36847	50 %	0 %	25 %	25 %	312621148
101	NC_014720	AAGT	2	8	37025	37032	50 %	25 %	25 %	0 %	312621148
102	NC_014720	GGCT	2	8	37895	37902	0 %	25 %	50 %	25 %	312621149
103	NC_014720	TTAA	2	8	38396	38403	50 %	50 %	0 %	0 %	312621149
104	NC_014720	TGAT	2	8	39070	39077	25 %	50 %	25 %	0 %	312621150
105	NC_014720	TGAA	2	8	39163	39170	50 %	25 %	25 %	0 %	312621150
106	NC_014720	TTAT	2	8	39363	39370	25 %	75 %	0 %	0 %	312621150
107	NC_014720	ATTT	2	8	39717	39724	25 %	75 %	0 %	0 %	312621150
108	NC_014720	GTTT	2	8	39850	39857	0 %	75 %	25 %	0 %	312621150
109	NC_014720	GAAA	2	8	40185	40192	75 %	0 %	25 %	0 %	312621150
110	NC_014720	ACAA	2	8	40448	40455	75 %	0 %	0 %	25 %	312621150
111	NC_014720	AAAT	2	8	40675	40682	75 %	25 %	0 %	0 %	312621150
112	NC_014720	AATG	2	8	40878	40885	50 %	25 %	25 %	0 %	312621150
113	NC_014720	AAAG	2	8	41451	41458	75 %	0 %	25 %	0 %	312621150
114	NC_014720	GTTA	2	8	41679	41686	25 %	50 %	25 %	0 %	312621150
115	NC_014720	ATCT	2	8	42092	42099	25 %	50 %	0 %	25 %	312621150
116	NC_014720	CAAT	2	8	42857	42864	50 %	25 %	0 %	25 %	312621151
117	NC_014720	GCCT	2	8	43056	43063	0 %	25 %	25 %	50 %	312621151
118	NC_014720	GAAA	2	8	43154	43161	75 %	0 %	25 %	0 %	312621151
119	NC_014720	TGAA	2	8	43983	43990	50 %	25 %	25 %	0 %	312621152
120	NC_014720	AGAA	2	8	44076	44083	75 %	0 %	25 %	0 %	312621152
121	NC_014720	TTGT	2	8	44430	44437	0 %	75 %	25 %	0 %	312621152
122	NC_014720	ATTA	2	8	44825	44832	50 %	50 %	0 %	0 %	312621152
123	NC_014720	AAGA	2	8	45273	45280	75 %	0 %	25 %	0 %	312621152
124	NC_014720	TAAA	2	8	46251	46258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014720	AGGA	2	8	46464	46471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014720	AATT	2	8	46715	46722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014720	GGAA	2	8	46999	47006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014720	GAAA	2	8	47097	47104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014720	AAGA	2	8	47180	47187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014720	GAAA	2	8	47220	47227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014720	GATG	2	8	47661	47668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014720	AAGT	2	8	47825	47832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014720	GTAT	2	8	48232	48239	25 %	50 %	25 %	0 %	312621154
134	NC_014720	TGAA	2	8	48665	48672	50 %	25 %	25 %	0 %	312621155
135	NC_014720	ATTT	2	8	49298	49305	25 %	75 %	0 %	0 %	312621155
136	NC_014720	AAAT	2	8	49313	49320	75 %	25 %	0 %	0 %	312621155
137	NC_014720	TAAA	2	8	49901	49908	75 %	25 %	0 %	0 %	312621155
138	NC_014720	ATCA	2	8	51366	51373	50 %	25 %	0 %	25 %	312621156
139	NC_014720	TATT	2	8	51979	51986	25 %	75 %	0 %	0 %	312621156
140	NC_014720	AAAT	2	8	52796	52803	75 %	25 %	0 %	0 %	312621156
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