MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 38191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	GTT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014720	AGG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621128
3	NC_014720	GAC	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
4	NC_014720	TAA	2	6	264	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
5	NC_014720	TTC	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621128
6	NC_014720	TGA	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621128
7	NC_014720	TGT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621128
8	NC_014720	AAC	3	9	455	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621128
9	NC_014720	GCA	2	6	479	484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
10	NC_014720	ACC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621128
11	NC_014720	TCA	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
12	NC_014720	GAC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621128
13	NC_014720	AAG	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
14	NC_014720	AAG	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
15	NC_014720	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
16	NC_014720	TCA	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
17	NC_014720	CCA	2	6	839	844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621128
18	NC_014720	AGA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
19	NC_014720	GCC	2	6	913	918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312621128
20	NC_014720	ATC	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621128
21	NC_014720	AAG	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621128
22	NC_014720	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621128
23	NC_014720	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621129
24	NC_014720	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621129
25	NC_014720	TGG	2	6	1620	1625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621129
26	NC_014720	AAG	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
27	NC_014720	ATA	2	6	1701	1706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621130
28	NC_014720	CTG	2	6	1722	1727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621130
29	NC_014720	CAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621130
30	NC_014720	AAT	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621130
31	NC_014720	CTT	2	6	1880	1885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621130
32	NC_014720	GAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
33	NC_014720	AGA	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
34	NC_014720	TTG	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
35	NC_014720	TTG	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
36	NC_014720	AGA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621130
37	NC_014720	TGA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
38	NC_014720	TTG	2	6	2166	2171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621130
39	NC_014720	GAT	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
40	NC_014720	CAA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621130
41	NC_014720	ATG	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621130
42	NC_014720	CTG	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621130
43	NC_014720	GAC	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621130
44	NC_014720	TTC	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621130
45	NC_014720	TAA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
46	NC_014720	AAT	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
47	NC_014720	CTT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621131
48	NC_014720	ATA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621131
49	NC_014720	AGG	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621131
50	NC_014720	ATT	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621131
51	NC_014720	ACA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621131
52	NC_014720	GCA	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621131
53	NC_014720	AGA	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621131
54	NC_014720	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621132
55	NC_014720	TTG	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621132
56	NC_014720	ATG	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621132
57	NC_014720	GAA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621132
58	NC_014720	AAT	2	6	4086	4091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621132
59	NC_014720	ATT	2	6	4182	4187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621133
60	NC_014720	TTG	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621133
61	NC_014720	GTG	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
62	NC_014720	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
63	NC_014720	TTC	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
64	NC_014720	GGT	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
65	NC_014720	TGT	2	6	4586	4591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621133
66	NC_014720	TAC	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621133
67	NC_014720	CGA	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621133
68	NC_014720	TGA	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621133
69	NC_014720	TGG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621133
70	NC_014720	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
71	NC_014720	AAC	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621133
72	NC_014720	CTG	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621133
73	NC_014720	CTT	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
74	NC_014720	AGA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
75	NC_014720	GGC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312621133
76	NC_014720	CTT	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
77	NC_014720	ATA	2	6	5703	5708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621133
78	NC_014720	CTT	3	9	5748	5756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
79	NC_014720	GAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
80	NC_014720	TTC	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621133
81	NC_014720	AAG	2	6	6068	6073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621133
82	NC_014720	GAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621134
83	NC_014720	AGA	2	6	6250	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621134
84	NC_014720	AAT	2	6	6256	6261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621134
85	NC_014720	GAA	2	6	6275	6280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621134
86	NC_014720	TTG	2	6	6340	6345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621135
87	NC_014720	GAG	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621135
88	NC_014720	AAT	2	6	6498	6503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621135
89	NC_014720	TAA	2	6	6528	6533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621135
90	NC_014720	CAA	2	6	6573	6578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621135
91	NC_014720	TAT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621135
92	NC_014720	GTA	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621135
93	NC_014720	TGT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621135
94	NC_014720	GGA	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014720	AGA	2	6	6857	6862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
96	NC_014720	ATC	2	6	6951	6956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621136
97	NC_014720	TGC	2	6	6967	6972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621136
98	NC_014720	TTG	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
99	NC_014720	GCT	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621136
100	NC_014720	TGA	2	6	7168	7173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
101	NC_014720	CAA	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621136
102	NC_014720	GAT	2	6	7337	7342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
103	NC_014720	AAT	2	6	7351	7356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621136
104	NC_014720	ATC	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621136
105	NC_014720	CAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621136
106	NC_014720	GTT	2	6	7496	7501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
107	NC_014720	AAG	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
108	NC_014720	TTG	2	6	7728	7733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
109	NC_014720	AGA	2	6	7808	7813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
110	NC_014720	AGA	2	6	7837	7842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
111	NC_014720	GAA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
112	NC_014720	GAT	2	6	8065	8070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
113	NC_014720	GAA	2	6	8207	8212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
114	NC_014720	CAA	2	6	8331	8336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621136
115	NC_014720	TTG	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
116	NC_014720	CAA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621136
117	NC_014720	CAC	2	6	8378	8383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621136
118	NC_014720	CTA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621136
119	NC_014720	AAG	2	6	8541	8546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
120	NC_014720	ATG	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
121	NC_014720	AAG	2	6	8582	8587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
122	NC_014720	GAT	3	9	8648	8656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
123	NC_014720	TTG	2	6	8661	8666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
124	NC_014720	TGT	2	6	8725	8730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
125	NC_014720	AAG	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
126	NC_014720	TTG	2	6	8811	8816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
127	NC_014720	TCT	2	6	8845	8850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621136
128	NC_014720	AAG	2	6	8878	8883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
129	NC_014720	TTG	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621136
130	NC_014720	ATG	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621136
131	NC_014720	GAA	2	6	9063	9068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621136
132	NC_014720	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621136
133	NC_014720	TCA	2	6	9119	9124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621136
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135	NC_014720	AAT	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014720	TTA	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_014720	TAA	3	9	9377	9385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_014720	ATA	2	6	17161	17166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
261	NC_014720	CTA	2	6	17197	17202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621140
262	NC_014720	ATG	2	6	17215	17220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
263	NC_014720	ATT	2	6	17281	17286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
264	NC_014720	TAT	2	6	17361	17366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
265	NC_014720	AGA	2	6	17579	17584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
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267	NC_014720	GAT	2	6	17622	17627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
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270	NC_014720	AGA	2	6	17774	17779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
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273	NC_014720	TTA	2	6	17877	17882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
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276	NC_014720	TAT	2	6	18027	18032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
277	NC_014720	ATG	2	6	18061	18066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
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280	NC_014720	ATG	2	6	18250	18255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
281	NC_014720	GAA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
282	NC_014720	ATG	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
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285	NC_014720	CAA	2	6	18487	18492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621140
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289	NC_014720	AGA	2	6	18600	18605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
290	NC_014720	ACA	2	6	18612	18617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621140
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292	NC_014720	AAT	2	6	18653	18658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
293	NC_014720	ATG	2	6	18691	18696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
294	NC_014720	TAT	2	6	18744	18749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
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296	NC_014720	ATG	2	6	18817	18822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
297	NC_014720	ATA	2	6	18843	18848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
298	NC_014720	GAA	2	6	19053	19058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
299	NC_014720	TGG	2	6	19166	19171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621140
300	NC_014720	ATG	2	6	19192	19197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
301	NC_014720	AAG	2	6	19198	19203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
302	NC_014720	AAG	2	6	19321	19326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
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313	NC_014720	AGA	2	6	20303	20308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
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316	NC_014720	ACG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
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343	NC_014720	AGA	3	9	21983	21991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_014720	TAG	2	6	22919	22924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621141
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369	NC_014720	TTC	2	6	23249	23254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621141
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372	NC_014720	TAG	2	6	23326	23331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
373	NC_014720	AGA	2	6	23342	23347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621142
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375	NC_014720	TTA	2	6	23430	23435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621142
376	NC_014720	GAT	2	6	23481	23486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
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378	NC_014720	GGC	2	6	23605	23610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312621142
379	NC_014720	TAG	2	6	23650	23655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
380	NC_014720	AGA	2	6	23666	23671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621142
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382	NC_014720	AGA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621142
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