MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B plasmid pCALKR01

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014719	AACT	2	8	185	192	50 %	25 %	0 %	25 %	312281361
2	NC_014719	AAAT	2	8	363	370	75 %	25 %	0 %	0 %	312281361
3	NC_014719	GGTA	2	8	936	943	25 %	25 %	50 %	0 %	312281361
4	NC_014719	TGCT	2	8	1808	1815	0 %	50 %	25 %	25 %	312281363
5	NC_014719	TTGG	2	8	2318	2325	0 %	50 %	50 %	0 %	312281363
6	NC_014719	AAGA	2	8	3053	3060	75 %	0 %	25 %	0 %	312281365
7	NC_014719	TTTG	2	8	3157	3164	0 %	75 %	25 %	0 %	312281365
8	NC_014719	GATG	2	8	3193	3200	25 %	25 %	50 %	0 %	312281365
9	NC_014719	ATTT	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	312281366
10	NC_014719	TGAA	2	8	4812	4819	50 %	25 %	25 %	0 %	312281367
11	NC_014719	TTGT	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	312281367
12	NC_014719	GTTT	2	8	4924	4931	0 %	75 %	25 %	0 %	312281367
13	NC_014719	GTTT	2	8	5125	5132	0 %	75 %	25 %	0 %	312281368
14	NC_014719	CAAA	2	8	5738	5745	75 %	0 %	0 %	25 %	312281368
15	NC_014719	TCAA	2	8	6595	6602	50 %	25 %	0 %	25 %	312281369
16	NC_014719	AAAG	2	8	7913	7920	75 %	0 %	25 %	0 %	312281371
17	NC_014719	TTAC	2	8	8045	8052	25 %	50 %	0 %	25 %	312281371
18	NC_014719	AAAT	2	8	8329	8336	75 %	25 %	0 %	0 %	312281371
19	NC_014719	TGTT	2	8	9273	9280	0 %	75 %	25 %	0 %	312281372
20	NC_014719	CTTT	2	8	9311	9318	0 %	75 %	0 %	25 %	312281372
21	NC_014719	CAAC	2	8	9591	9598	50 %	0 %	0 %	50 %	312281372
22	NC_014719	ACAA	2	8	10081	10088	75 %	0 %	0 %	25 %	312281372
23	NC_014719	TTTA	2	8	11054	11061	25 %	75 %	0 %	0 %	312281374
24	NC_014719	TCAA	2	8	11346	11353	50 %	25 %	0 %	25 %	312281374
25	NC_014719	TGAT	2	8	11385	11392	25 %	50 %	25 %	0 %	312281374
26	NC_014719	CAGC	2	8	11470	11477	25 %	0 %	25 %	50 %	312281374
27	NC_014719	TTTC	2	8	11794	11801	0 %	75 %	0 %	25 %	312281374
28	NC_014719	CAGT	2	8	14484	14491	25 %	25 %	25 %	25 %	312281376
29	NC_014719	AAAC	2	8	14584	14591	75 %	0 %	0 %	25 %	312281376
30	NC_014719	ACTG	2	8	14924	14931	25 %	25 %	25 %	25 %	312281377
31	NC_014719	AGTA	3	12	15319	15330	50 %	25 %	25 %	0 %	312281377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.