MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B plasmid pCALKR01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014719	AGT	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014719	AGT	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014719	TAA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014719	AAG	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014719	AGC	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014719	GTT	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014719	GAT	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014719	TAA	2	6	3972	3977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014719	CAA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014719	GTA	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014719	ATT	2	6	7279	7284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014719	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014719	GAT	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014719	GAA	2	6	10315	10320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014719	AAG	2	6	10327	10332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014719	TTA	2	6	10968	10973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014719	CCT	2	6	11802	11807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014719	CAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014719	TCA	2	6	11950	11955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014719	AGC	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014719	CAG	2	6	12189	12194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014719	GAT	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014719	AGT	2	6	12296	12301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014719	ACC	2	6	12328	12333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014719	TAA	2	6	12457	12462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014719	CAG	2	6	12476	12481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014719	TTG	2	6	12493	12498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014719	CTG	2	6	12531	12536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014719	GTA	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014719	TAG	2	6	12568	12573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014719	AGT	2	6	12641	12646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014719	ACT	2	6	12677	12682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014719	CAT	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014719	AAT	2	6	12923	12928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014719	AAC	2	6	13191	13196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014719	ACC	2	6	13377	13382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014719	CAA	2	6	13455	13460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014719	GGT	2	6	14238	14243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014719	TAT	2	6	15340	15345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014719	GAA	2	6	15373	15378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014719	AAT	2	6	15591	15596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014719	AGA	2	6	15602	15607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014719	CAG	2	6	15611	15616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014719	AGT	2	6	15658	15663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014719	AGA	2	6	15675	15680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014719	ACA	2	6	15773	15778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014719	GCA	2	6	15795	15800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014719	GAA	2	6	15809	15814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014719	AAG	2	6	15877	15882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014719	CAG	2	6	15927	15932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014719	AGT	2	6	15955	15960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.