MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B plasmid pCALKR01

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014719	GA	3	6	822	827	50 %	0 %	50 %	0 %	312281361
2	NC_014719	AT	3	6	1535	1540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014719	AG	3	6	1583	1588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014719	GA	3	6	1704	1709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014719	CT	3	6	2151	2156	0 %	50 %	0 %	50 %	312281363
6	NC_014719	TA	4	8	2458	2465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014719	AG	3	6	2871	2876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014719	GA	3	6	2877	2882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014719	TA	3	6	3398	3403	50 %	50 %	0 %	0 %	312281365
10	NC_014719	AC	3	6	3648	3653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014719	TA	3	6	3801	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014719	TC	3	6	3916	3921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014719	GA	3	6	4105	4110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014719	AG	3	6	5353	5358	50 %	0 %	50 %	0 %	312281368
15	NC_014719	TA	3	6	5586	5591	50 %	50 %	0 %	0 %	312281368
16	NC_014719	TA	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	312281368
17	NC_014719	AT	3	6	6703	6708	50 %	50 %	0 %	0 %	312281369
18	NC_014719	TA	3	6	6912	6917	50 %	50 %	0 %	0 %	312281369
19	NC_014719	AT	3	6	7104	7109	50 %	50 %	0 %	0 %	312281369
20	NC_014719	AT	4	8	7193	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	312281369
21	NC_014719	TC	4	8	7508	7515	0 %	50 %	0 %	50 %	312281370
22	NC_014719	AC	3	6	8370	8375	50 %	0 %	0 %	50 %	312281371
23	NC_014719	GT	5	10	8455	8464	0 %	50 %	50 %	0 %	312281371
24	NC_014719	AG	3	6	9226	9231	50 %	0 %	50 %	0 %	312281372
25	NC_014719	AG	3	6	9442	9447	50 %	0 %	50 %	0 %	312281372
26	NC_014719	GA	3	6	10732	10737	50 %	0 %	50 %	0 %	312281373
27	NC_014719	TC	3	6	11195	11200	0 %	50 %	0 %	50 %	312281374
28	NC_014719	AT	3	6	12904	12909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014719	GA	3	6	13309	13314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014719	AT	3	6	13436	13441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014719	AT	3	6	14808	14813	50 %	50 %	0 %	0 %	312281377
32	NC_014719	CA	3	6	14949	14954	50 %	0 %	0 %	50 %	312281377
33	NC_014719	AG	3	6	15024	15029	50 %	0 %	50 %	0 %	312281377
34	NC_014719	GA	3	6	15427	15432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.