MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014718	GATCA	2	10	511	520	40 %	20 %	20 %	20 %	312602096
2	NC_014718	TGGCG	2	10	1082	1091	0 %	20 %	60 %	20 %	312602097
3	NC_014718	ATTCA	2	10	1315	1324	40 %	40 %	0 %	20 %	312602098
4	NC_014718	GAAGC	2	10	2656	2665	40 %	0 %	40 %	20 %	312602102
5	NC_014718	GAAGC	2	10	2734	2743	40 %	0 %	40 %	20 %	312602102
6	NC_014718	GAAGC	2	10	2764	2773	40 %	0 %	40 %	20 %	312602102
7	NC_014718	CGCGT	2	10	3937	3946	0 %	20 %	40 %	40 %	312602102
8	NC_014718	GCGTG	2	10	4530	4539	0 %	20 %	60 %	20 %	312602103
9	NC_014718	CGGCC	2	10	4622	4631	0 %	0 %	40 %	60 %	312602103
10	NC_014718	GTTGT	2	10	5828	5837	0 %	60 %	40 %	0 %	312602106
11	NC_014718	CATGC	2	10	6597	6606	20 %	20 %	20 %	40 %	312602108
12	NC_014718	GCGCG	2	10	7306	7315	0 %	0 %	60 %	40 %	312602109
13	NC_014718	CTGGG	2	10	8619	8628	0 %	20 %	60 %	20 %	312602110
14	NC_014718	CCGGG	2	10	8765	8774	0 %	0 %	60 %	40 %	312602111
15	NC_014718	ACGCG	2	10	9259	9268	20 %	0 %	40 %	40 %	312602113
16	NC_014718	CCGAC	2	10	9480	9489	20 %	0 %	20 %	60 %	312602113
17	NC_014718	TTGGC	2	10	10827	10836	0 %	40 %	40 %	20 %	312602114
18	NC_014718	GCGCC	2	10	11862	11871	0 %	0 %	40 %	60 %	312602118
19	NC_014718	CGGCG	2	10	11923	11932	0 %	0 %	60 %	40 %	312602118
20	NC_014718	GGCTC	2	10	14414	14423	0 %	20 %	40 %	40 %	312602123
21	NC_014718	ACGCG	2	10	17559	17568	20 %	0 %	40 %	40 %	312602126
22	NC_014718	GCGGT	2	10	19774	19783	0 %	20 %	60 %	20 %	312602128
23	NC_014718	GGTGT	2	10	20584	20593	0 %	40 %	60 %	0 %	312602129
24	NC_014718	ACGGT	2	10	20861	20870	20 %	20 %	40 %	20 %	312602129
25	NC_014718	GTCCT	2	10	20944	20953	0 %	40 %	20 %	40 %	312602129
26	NC_014718	GCGCC	2	10	23581	23590	0 %	0 %	40 %	60 %	312602135
27	NC_014718	GCGCT	2	10	27230	27239	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
28	NC_014718	CGCTG	2	10	27303	27312	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
29	NC_014718	AGCCG	2	10	27550	27559	20 %	0 %	40 %	40 %	312602137
30	NC_014718	GTCAG	2	10	27856	27865	20 %	20 %	40 %	20 %	312602137
31	NC_014718	GTGGC	2	10	33480	33489	0 %	20 %	60 %	20 %	312602137
32	NC_014718	GGCGC	2	10	33787	33796	0 %	0 %	60 %	40 %	312602137
33	NC_014718	GTGGC	2	10	36678	36687	0 %	20 %	60 %	20 %	312602137
34	NC_014718	GGCGC	2	10	36985	36994	0 %	0 %	60 %	40 %	312602137
35	NC_014718	GTGAG	2	10	37329	37338	20 %	20 %	60 %	0 %	312602137
36	NC_014718	CAATG	2	10	37726	37735	40 %	20 %	20 %	20 %	312602137
37	NC_014718	TCAAG	2	10	39214	39223	40 %	20 %	20 %	20 %	312602137
38	NC_014718	GCATT	2	10	39681	39690	20 %	40 %	20 %	20 %	312602137
39	NC_014718	GCGCT	2	10	39965	39974	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
40	NC_014718	GCGTG	2	10	40057	40066	0 %	20 %	60 %	20 %	312602137
41	NC_014718	AAGCC	2	10	40522	40531	40 %	0 %	20 %	40 %	312602137
42	NC_014718	GTGGC	2	10	43017	43026	0 %	20 %	60 %	20 %	312602137
43	NC_014718	GGCGC	2	10	43324	43333	0 %	0 %	60 %	40 %	312602137
44	NC_014718	CAATG	2	10	44062	44071	40 %	20 %	20 %	20 %	312602137
45	NC_014718	GGCTC	2	10	47212	47221	0 %	20 %	40 %	40 %	312602138
46	NC_014718	GCAAA	2	10	47456	47465	60 %	0 %	20 %	20 %	312602139
47	NC_014718	GCAGC	2	10	47637	47646	20 %	0 %	40 %	40 %	312602139
48	NC_014718	CGCGG	2	10	48326	48335	0 %	0 %	60 %	40 %	312602141
49	NC_014718	CGGCG	2	10	48615	48624	0 %	0 %	60 %	40 %	312602142
50	NC_014718	GCACC	2	10	49763	49772	20 %	0 %	20 %	60 %	312602143
51	NC_014718	CGCAC	2	10	50113	50122	20 %	0 %	20 %	60 %	312602143
52	NC_014718	TCGCG	2	10	52555	52564	0 %	20 %	40 %	40 %	312602146
53	NC_014718	GCATC	2	10	53451	53460	20 %	20 %	20 %	40 %	312602147
54	NC_014718	TGGGG	2	10	54931	54940	0 %	20 %	80 %	0 %	312602148
55	NC_014718	TCGGC	2	10	55037	55046	0 %	20 %	40 %	40 %	312602149
56	NC_014718	CGTTT	2	10	55080	55089	0 %	60 %	20 %	20 %	312602150
57	NC_014718	GCGCC	2	10	55755	55764	0 %	0 %	40 %	60 %	312602150
58	NC_014718	GCGCG	2	10	56272	56281	0 %	0 %	60 %	40 %	312602150
59	NC_014718	GTGAT	2	10	56666	56675	20 %	40 %	40 %	0 %	312602150
60	NC_014718	GCCGC	2	10	56779	56788	0 %	0 %	40 %	60 %	312602150
61	NC_014718	CTTGG	2	10	59012	59021	0 %	40 %	40 %	20 %	312602153
62	NC_014718	TTGCC	2	10	64106	64115	0 %	40 %	20 %	40 %	312602159
63	NC_014718	GTTTG	2	10	64397	64406	0 %	60 %	40 %	0 %	312602159
64	NC_014718	GGCGG	2	10	64918	64927	0 %	0 %	80 %	20 %	312602159
65	NC_014718	ATCGG	2	10	67285	67294	20 %	20 %	40 %	20 %	312602162
66	NC_014718	ATGAA	2	10	67867	67876	60 %	20 %	20 %	0 %	312602163
67	NC_014718	CGAGC	2	10	68171	68180	20 %	0 %	40 %	40 %	312602164
68	NC_014718	ATGGG	2	10	70455	70464	20 %	20 %	60 %	0 %	312602165
69	NC_014718	GCAAA	2	10	75588	75597	60 %	0 %	20 %	20 %	312602176
70	NC_014718	GCTGG	2	10	82235	82244	0 %	20 %	60 %	20 %	312602183
71	NC_014718	TGAAT	2	10	82813	82822	40 %	40 %	20 %	0 %	312602183
72	NC_014718	GGCCG	2	10	84068	84077	0 %	0 %	60 %	40 %	312602183
73	NC_014718	TCAAG	2	10	84949	84958	40 %	20 %	20 %	20 %	312602183
74	NC_014718	GCTGG	2	10	85406	85415	0 %	20 %	60 %	20 %	312602183
75	NC_014718	GCGCT	2	10	85703	85712	0 %	20 %	40 %	40 %	312602183
76	NC_014718	GCACG	2	10	86269	86278	20 %	0 %	40 %	40 %	312602183
77	NC_014718	TCGCG	2	10	87267	87276	0 %	20 %	40 %	40 %	312602183
78	NC_014718	CGGTG	2	10	87913	87922	0 %	20 %	60 %	20 %	312602183
79	NC_014718	TCAAG	2	10	88105	88114	40 %	20 %	20 %	20 %	312602183
80	NC_014718	TCGCC	2	10	88599	88608	0 %	20 %	20 %	60 %	312602183
81	NC_014718	GCGCT	2	10	88859	88868	0 %	20 %	40 %	40 %	312602183
82	NC_014718	CGACA	2	10	89389	89398	40 %	0 %	20 %	40 %	312602183
83	NC_014718	GCACG	2	10	89425	89434	20 %	0 %	40 %	40 %	312602183
84	NC_014718	TCAAG	2	10	91285	91294	40 %	20 %	20 %	20 %	312602183
85	NC_014718	CGACA	2	10	91676	91685	40 %	0 %	20 %	40 %	312602183
86	NC_014718	GCGCT	2	10	92036	92045	0 %	20 %	40 %	40 %	312602183
87	NC_014718	ACGTC	2	10	92973	92982	20 %	20 %	20 %	40 %	312602183
88	NC_014718	GCCGT	2	10	97211	97220	0 %	20 %	40 %	40 %	312602183
89	NC_014718	GCGAT	2	10	100622	100631	20 %	20 %	40 %	20 %	312602185
90	NC_014718	TTGGG	2	10	101867	101876	0 %	40 %	60 %	0 %	312602188
91	NC_014718	TACCG	2	10	102282	102291	20 %	20 %	20 %	40 %	312602189
92	NC_014718	GAAAA	2	10	102714	102723	80 %	0 %	20 %	0 %	312602190
93	NC_014718	CTGGC	2	10	103359	103368	0 %	20 %	40 %	40 %	312602191
94	NC_014718	GCGGA	2	10	103472	103481	20 %	0 %	60 %	20 %	312602191
95	NC_014718	TTTTG	2	10	105054	105063	0 %	80 %	20 %	0 %	312602195
96	NC_014718	CGGCT	2	10	105920	105929	0 %	20 %	40 %	40 %	312602196
97	NC_014718	ATCGA	2	10	106025	106034	40 %	20 %	20 %	20 %	312602196
98	NC_014718	TTTGT	2	10	108471	108480	0 %	80 %	20 %	0 %	312602200
99	NC_014718	TAGCT	2	10	108828	108837	20 %	40 %	20 %	20 %	312602200
100	NC_014718	CAGCA	2	10	110491	110500	40 %	0 %	20 %	40 %	312602203
101	NC_014718	GCCTG	2	10	116577	116586	0 %	20 %	40 %	40 %	312602207
102	NC_014718	AGTAC	2	10	116681	116690	40 %	20 %	20 %	20 %	312602207
103	NC_014718	GCAAG	2	10	118392	118401	40 %	0 %	40 %	20 %	312602207
104	NC_014718	GTGAT	2	10	118610	118619	20 %	40 %	40 %	0 %	312602207
105	NC_014718	GGCGC	2	10	119037	119046	0 %	0 %	60 %	40 %	312602207
106	NC_014718	CGCTG	2	10	119673	119682	0 %	20 %	40 %	40 %	312602207
107	NC_014718	GCAGA	2	10	120943	120952	40 %	0 %	40 %	20 %	312602207
108	NC_014718	TCAAG	2	10	121308	121317	40 %	20 %	20 %	20 %	312602207
109	NC_014718	CGACA	2	10	121699	121708	40 %	0 %	20 %	40 %	312602207
110	NC_014718	CTAAT	2	10	122623	122632	40 %	40 %	0 %	20 %	312602207
111	NC_014718	AACGT	2	10	123460	123469	40 %	20 %	20 %	20 %	312602209
112	NC_014718	GATGG	2	10	124339	124348	20 %	20 %	60 %	0 %	312602209
113	NC_014718	CAGAT	2	10	125685	125694	40 %	20 %	20 %	20 %	312602211
114	NC_014718	AGCGA	2	10	127740	127749	40 %	0 %	40 %	20 %	312602212
115	NC_014718	CTTTG	2	10	127888	127897	0 %	60 %	20 %	20 %	312602212
116	NC_014718	GCTGG	2	10	128603	128612	0 %	20 %	60 %	20 %	312602214
117	NC_014718	GCGCC	2	10	131991	132000	0 %	0 %	40 %	60 %	312602221
118	NC_014718	GCGTC	2	10	133762	133771	0 %	20 %	40 %	40 %	312602224
119	NC_014718	CGGCG	2	10	133837	133846	0 %	0 %	60 %	40 %	312602224
120	NC_014718	GCGCT	2	10	134758	134767	0 %	20 %	40 %	40 %	312602225
121	NC_014718	TGTGC	2	10	136297	136306	0 %	40 %	40 %	20 %	312602228
122	NC_014718	GCCGG	2	10	137042	137051	0 %	0 %	60 %	40 %	312602229
123	NC_014718	GATGC	2	10	138049	138058	20 %	20 %	40 %	20 %	312602229
124	NC_014718	AGGGC	2	10	138240	138249	20 %	0 %	60 %	20 %	312602229
125	NC_014718	GGGCT	2	10	138253	138262	0 %	20 %	60 %	20 %	312602229
126	NC_014718	GTTGC	2	10	138619	138628	0 %	40 %	40 %	20 %	312602229
127	NC_014718	CGCGA	2	10	140593	140602	20 %	0 %	40 %	40 %	312602232
128	NC_014718	CTCGG	2	10	141124	141133	0 %	20 %	40 %	40 %	312602232
129	NC_014718	CGAGT	2	10	141525	141534	20 %	20 %	40 %	20 %	312602232
130	NC_014718	TGCGT	2	10	142324	142333	0 %	40 %	40 %	20 %	312602232
131	NC_014718	CGCGC	2	10	142742	142751	0 %	0 %	40 %	60 %	312602232
132	NC_014718	CGGGC	2	10	142965	142974	0 %	0 %	60 %	40 %	312602232
133	NC_014718	AGTGG	2	10	143802	143811	20 %	20 %	60 %	0 %	312602233
134	NC_014718	CAGCG	2	10	143838	143847	20 %	0 %	40 %	40 %	312602233
135	NC_014718	GCGCA	2	10	144342	144351	20 %	0 %	40 %	40 %	312602234
136	NC_014718	ATTCA	2	10	144641	144650	40 %	40 %	0 %	20 %	312602235
137	NC_014718	TATCG	2	10	144778	144787	20 %	40 %	20 %	20 %	312602235
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143	NC_014718	GACGC	2	10	150652	150661	20 %	0 %	40 %	40 %	312602240
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149	NC_014718	CGTGG	2	10	155427	155436	0 %	20 %	60 %	20 %	312602240
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245	NC_014718	TCACG	2	10	268106	268115	20 %	20 %	20 %	40 %	312602342
246	NC_014718	GGACC	2	10	268683	268692	20 %	0 %	40 %	40 %	312602342
247	NC_014718	GTCAG	2	10	269716	269725	20 %	20 %	40 %	20 %	312602342
248	NC_014718	TTGCG	2	10	273670	273679	0 %	40 %	40 %	20 %	312602342
249	NC_014718	CGTTT	2	10	276120	276129	0 %	60 %	20 %	20 %	312602347
250	NC_014718	AAAAG	2	10	276968	276977	80 %	0 %	20 %	0 %	312602347
251	NC_014718	AGTTG	2	10	281581	281590	20 %	40 %	40 %	0 %	312602348
252	NC_014718	AAGCG	2	10	283176	283185	40 %	0 %	40 %	20 %	312602349
253	NC_014718	GCTTA	2	10	283566	283575	20 %	40 %	20 %	20 %	312602349
254	NC_014718	AGGCG	2	10	284513	284522	20 %	0 %	60 %	20 %	312602350
255	NC_014718	GCGAC	2	10	285116	285125	20 %	0 %	40 %	40 %	312602350
256	NC_014718	GGGCA	2	10	286464	286473	20 %	0 %	60 %	20 %	312602350
257	NC_014718	CGATG	2	10	288059	288068	20 %	20 %	40 %	20 %	312602350
258	NC_014718	TGCGT	2	10	289165	289174	0 %	40 %	40 %	20 %	312602351
259	NC_014718	GTCGG	2	10	289682	289691	0 %	20 %	60 %	20 %	312602351
260	NC_014718	CGATC	2	10	290087	290096	20 %	20 %	20 %	40 %	312602351
261	NC_014718	GGGGC	2	10	291259	291268	0 %	0 %	80 %	20 %	312602351
262	NC_014718	CGGCG	2	10	291305	291314	0 %	0 %	60 %	40 %	312602351
263	NC_014718	GCGAT	2	10	295537	295546	20 %	20 %	40 %	20 %	312602354
264	NC_014718	GCCGC	2	10	299120	299129	0 %	0 %	40 %	60 %	312602358
265	NC_014718	CGCGT	2	10	299257	299266	0 %	20 %	40 %	40 %	312602359
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499	NC_014718	CAGCG	2	10	563754	563763	20 %	0 %	40 %	40 %	312602631
500	NC_014718	CTTGC	2	10	564939	564948	0 %	40 %	20 %	40 %	312602633

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