MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014718	CAAA	2	8	1238	1245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014718	TCAG	2	8	2103	2110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014718	CTGG	2	8	4964	4971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014718	GCCT	2	8	5200	5207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014718	GTCC	2	8	12672	12679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014718	CCGG	2	8	14945	14952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014718	TACG	2	8	15011	15018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014718	GGGA	2	8	17635	17642	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014718	TGTT	2	8	23308	23315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014718	TTTC	2	8	23335	23342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014718	TAAA	2	8	23522	23529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014718	CTCG	2	8	47841	47848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014718	GGCG	2	8	48003	48010	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014718	CGGG	2	8	52342	52349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014718	TTTA	2	8	57319	57326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014718	TGCG	2	8	59446	59453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014718	GATT	2	8	62020	62027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014718	ATGC	2	8	62034	62041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014718	GCGG	2	8	67104	67111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014718	TTCT	2	8	70882	70889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014718	GTCA	2	8	71947	71954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014718	CTTC	2	8	72942	72949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014718	TGAC	2	8	73715	73722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014718	ATAA	2	8	76797	76804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014718	TAAA	2	8	76830	76837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014718	TGTT	2	8	76845	76852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014718	GGTT	2	8	77156	77163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014718	ACCC	2	8	78113	78120	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_014718	CCTG	2	8	78537	78544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014718	CTTC	2	8	79579	79586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014718	GTGG	2	8	99247	99254	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014718	CTGC	2	8	99600	99607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014718	AAAG	2	8	99613	99620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014718	AGCC	2	8	99689	99696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014718	CAGT	2	8	100281	100288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014718	CGGC	2	8	102477	102484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014718	GCGG	2	8	104589	104596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014718	ACTA	2	8	109390	109397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014718	TTGC	2	8	109617	109624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014718	TGTT	2	8	109668	109675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014718	GGTG	2	8	127021	127028	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014718	GCAA	2	8	127113	127120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014718	ACCG	2	8	127187	127194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014718	CTGG	2	8	128288	128295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014718	TCAT	2	8	128864	128871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014718	GATT	2	8	129332	129339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014718	AGCG	2	8	132503	132510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014718	CTAG	2	8	132521	132528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014718	GCTG	2	8	135239	135246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014718	CTCG	2	8	135839	135846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014718	ATCA	2	8	145081	145088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014718	CGGC	2	8	168278	168285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014718	CGCT	2	8	179256	179263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014718	ACGC	2	8	182091	182098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014718	GGCT	2	8	182104	182111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014718	GAAA	2	8	182212	182219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014718	GATG	2	8	182240	182247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014718	TGAC	2	8	182492	182499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014718	GCCA	2	8	182542	182549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014718	AGGC	2	8	184718	184725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014718	GCTC	2	8	194257	194264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014718	ACGA	2	8	211942	211949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014718	GGCA	2	8	218876	218883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014718	GCCG	2	8	218922	218929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014718	TTGG	2	8	222474	222481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014718	TAAA	2	8	222527	222534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014718	ATAA	2	8	222542	222549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014718	CCGG	2	8	223397	223404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014718	AGCC	2	8	232543	232550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014718	TGGC	2	8	235667	235674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014718	GCAA	2	8	242313	242320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014718	GTCG	2	8	242413	242420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014718	CATG	2	8	257756	257763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014718	GCAG	2	8	257832	257839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014718	CGAG	2	8	259446	259453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014718	CTAT	2	8	259660	259667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014718	GTGG	2	8	259847	259854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014718	GTAA	2	8	260420	260427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014718	GCTG	2	8	260447	260454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014718	ACGG	2	8	274935	274942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014718	GCGA	2	8	274984	274991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014718	GTGC	2	8	275770	275777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014718	CGAG	2	8	279346	279353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014718	GCCG	2	8	297081	297088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014718	GGCC	2	8	299821	299828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014718	GCGG	2	8	300510	300517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014718	GACG	2	8	304203	304210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014718	GATT	2	8	304965	304972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014718	CAAA	2	8	305907	305914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014718	GCCG	2	8	306020	306027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014718	TGAA	2	8	306067	306074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014718	CATC	2	8	308525	308532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014718	GTGA	2	8	308535	308542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014718	TAAA	2	8	308795	308802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014718	CGGT	2	8	319045	319052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014718	GGAC	2	8	319980	319987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014718	TCGT	2	8	324848	324855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014718	GCCT	2	8	325179	325186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014718	GGCC	2	8	326573	326580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014718	CAGC	2	8	327185	327192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014718	GGAT	2	8	328657	328664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014718	CGCC	2	8	330535	330542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_014718	AGCA	2	8	330626	330633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014718	AGCC	2	8	333107	333114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014718	CCTA	2	8	333653	333660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014718	TCAA	2	8	336027	336034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014718	GCGT	2	8	336468	336475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014718	TTAA	2	8	340850	340857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014718	GCAT	2	8	343629	343636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014718	AGGC	2	8	345730	345737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014718	CCGG	2	8	349784	349791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014718	GTAG	2	8	352842	352849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014718	CCTT	2	8	355971	355978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014718	GCCT	2	8	355986	355993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014718	CCTG	2	8	356053	356060	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014718	GGCC	2	8	359450	359457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014718	CGTC	2	8	360662	360669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014718	CAGT	2	8	362742	362749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014718	CTAG	2	8	364699	364706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014718	ACCC	2	8	364835	364842	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_014718	TGCA	2	8	364990	364997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014718	TCCG	2	8	369221	369228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014718	CTTT	2	8	369325	369332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014718	ACGC	2	8	372137	372144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014718	GACA	2	8	373800	373807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014718	CATT	2	8	399815	399822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014718	GTGC	2	8	412957	412964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014718	TAAA	2	8	413362	413369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014718	GACC	2	8	413373	413380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014718	TTAC	2	8	415215	415222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014718	CATT	2	8	415291	415298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014718	GCTT	2	8	417514	417521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014718	CAAA	2	8	417544	417551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014718	CCAG	2	8	417553	417560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014718	CCTG	2	8	417631	417638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014718	TGGG	2	8	417773	417780	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014718	GCAA	2	8	421596	421603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014718	GCCC	2	8	421675	421682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014718	TGCG	2	8	422169	422176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014718	CATT	2	8	422284	422291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014718	CGAC	2	8	422317	422324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014718	ATGG	2	8	424096	424103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014718	AATT	2	8	424189	424196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014718	TTGC	2	8	429467	429474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014718	GCAG	2	8	429502	429509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014718	GATG	2	8	434987	434994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014718	TGCC	2	8	442447	442454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014718	TCGC	2	8	442715	442722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014718	TTTA	2	8	443210	443217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014718	GGTC	2	8	443375	443382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014718	CTGC	2	8	443386	443393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_014718	TCGC	2	8	797615	797622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
298	NC_014718	TGTA	2	8	804219	804226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
299	NC_014718	GGTT	2	8	804245	804252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014718	AAAT	2	8	807580	807587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014718	CTGT	2	8	813575	813582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
302	NC_014718	GCGA	2	8	813853	813860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
303	NC_014718	TTGC	2	8	813934	813941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
304	NC_014718	GGCG	2	8	815182	815189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
305	NC_014718	CTGC	2	8	815312	815319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
306	NC_014718	TAAT	2	8	817191	817198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_014718	TAAT	2	8	817231	817238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.