MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 1949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014718	GCAA	2	8	629	636	50 %	0 %	25 %	25 %	312602096
2	NC_014718	CGGC	2	8	737	744	0 %	0 %	50 %	50 %	312602096
3	NC_014718	CGCA	2	8	1538	1545	25 %	0 %	25 %	50 %	312602098
4	NC_014718	ATTC	2	8	1554	1561	25 %	50 %	0 %	25 %	312602098
5	NC_014718	AGCC	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	312602099
6	NC_014718	TAAT	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	312602101
7	NC_014718	CAGT	2	8	2605	2612	25 %	25 %	25 %	25 %	312602102
8	NC_014718	CATT	2	8	3542	3549	25 %	50 %	0 %	25 %	312602102
9	NC_014718	AGAT	2	8	5685	5692	50 %	25 %	25 %	0 %	312602105
10	NC_014718	CCTT	2	8	6226	6233	0 %	50 %	0 %	50 %	312602107
11	NC_014718	GAAG	2	8	6822	6829	50 %	0 %	50 %	0 %	312602108
12	NC_014718	GCCG	2	8	6943	6950	0 %	0 %	50 %	50 %	312602109
13	NC_014718	GGGC	2	8	6979	6986	0 %	0 %	75 %	25 %	312602109
14	NC_014718	TCAT	2	8	7032	7039	25 %	50 %	0 %	25 %	312602109
15	NC_014718	GCCG	2	8	7234	7241	0 %	0 %	50 %	50 %	312602109
16	NC_014718	TTCT	2	8	7268	7275	0 %	75 %	0 %	25 %	312602109
17	NC_014718	GCCA	2	8	8244	8251	25 %	0 %	25 %	50 %	312602110
18	NC_014718	GCTG	2	8	8654	8661	0 %	25 %	50 %	25 %	312602110
19	NC_014718	CGTT	2	8	8720	8727	0 %	50 %	25 %	25 %	312602111
20	NC_014718	TATG	2	8	9205	9212	25 %	50 %	25 %	0 %	312602112
21	NC_014718	TTGT	2	8	9521	9528	0 %	75 %	25 %	0 %	312602113
22	NC_014718	CGAT	2	8	9819	9826	25 %	25 %	25 %	25 %	312602113
23	NC_014718	TGCC	2	8	10845	10852	0 %	25 %	25 %	50 %	312602114
24	NC_014718	TGAG	2	8	10959	10966	25 %	25 %	50 %	0 %	312602114
25	NC_014718	CCGA	2	8	11052	11059	25 %	0 %	25 %	50 %	312602115
26	NC_014718	AATT	2	8	11063	11070	50 %	50 %	0 %	0 %	312602115
27	NC_014718	GCCG	2	8	11372	11379	0 %	0 %	50 %	50 %	312602116
28	NC_014718	GCCG	2	8	11761	11768	0 %	0 %	50 %	50 %	312602118
29	NC_014718	CAGC	2	8	11796	11803	25 %	0 %	25 %	50 %	312602118
30	NC_014718	TGGA	2	8	12831	12838	25 %	25 %	50 %	0 %	312602119
31	NC_014718	ATCA	2	8	15933	15940	50 %	25 %	0 %	25 %	312602124
32	NC_014718	GCGG	2	8	16261	16268	0 %	0 %	75 %	25 %	312602124
33	NC_014718	GTCA	2	8	16293	16300	25 %	25 %	25 %	25 %	312602124
34	NC_014718	CGCC	2	8	16751	16758	0 %	0 %	25 %	75 %	312602126
35	NC_014718	CCCA	2	8	17338	17345	25 %	0 %	0 %	75 %	312602126
36	NC_014718	CACG	2	8	17377	17384	25 %	0 %	25 %	50 %	312602126
37	NC_014718	GGCC	2	8	17520	17527	0 %	0 %	50 %	50 %	312602126
38	NC_014718	GGTC	2	8	17601	17608	0 %	25 %	50 %	25 %	312602126
39	NC_014718	TCGA	2	8	18733	18740	25 %	25 %	25 %	25 %	312602128
40	NC_014718	TCGG	2	8	18877	18884	0 %	25 %	50 %	25 %	312602128
41	NC_014718	ATTG	2	8	19041	19048	25 %	50 %	25 %	0 %	312602128
42	NC_014718	GCTC	2	8	19054	19061	0 %	25 %	25 %	50 %	312602128
43	NC_014718	TCGA	2	8	19483	19490	25 %	25 %	25 %	25 %	312602128
44	NC_014718	CGGC	2	8	20483	20490	0 %	0 %	50 %	50 %	312602129
45	NC_014718	GCTG	2	8	20710	20717	0 %	25 %	50 %	25 %	312602129
46	NC_014718	GCTG	2	8	20960	20967	0 %	25 %	50 %	25 %	312602129
47	NC_014718	AACG	2	8	21072	21079	50 %	0 %	25 %	25 %	312602129
48	NC_014718	CGTG	2	8	21139	21146	0 %	25 %	50 %	25 %	312602129
49	NC_014718	GGCC	2	8	21210	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	312602129
50	NC_014718	CAGG	2	8	21602	21609	25 %	0 %	50 %	25 %	312602131
51	NC_014718	TGCG	2	8	21743	21750	0 %	25 %	50 %	25 %	312602131
52	NC_014718	GCTG	2	8	22267	22274	0 %	25 %	50 %	25 %	312602132
53	NC_014718	CGCC	2	8	22313	22320	0 %	0 %	25 %	75 %	312602132
54	NC_014718	CTTG	2	8	23629	23636	0 %	50 %	25 %	25 %	312602135
55	NC_014718	ACGA	2	8	23746	23753	50 %	0 %	25 %	25 %	312602136
56	NC_014718	AGCC	2	8	24072	24079	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
57	NC_014718	GGCA	2	8	25867	25874	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
58	NC_014718	TTCC	2	8	25938	25945	0 %	50 %	0 %	50 %	312602137
59	NC_014718	AACG	2	8	26052	26059	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
60	NC_014718	TCAA	2	8	26142	26149	50 %	25 %	0 %	25 %	312602137
61	NC_014718	CGGC	2	8	26221	26228	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
62	NC_014718	ACAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
63	NC_014718	CGGT	2	8	26289	26296	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
64	NC_014718	TTAG	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
65	NC_014718	CTGC	2	8	26750	26757	0 %	25 %	25 %	50 %	312602137
66	NC_014718	ACCG	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
67	NC_014718	AGGC	2	8	28230	28237	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
68	NC_014718	TCTG	2	8	29042	29049	0 %	50 %	25 %	25 %	312602137
69	NC_014718	GCTC	2	8	29108	29115	0 %	25 %	25 %	50 %	312602137
70	NC_014718	GCCA	2	8	29198	29205	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
71	NC_014718	CACG	2	8	29293	29300	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
72	NC_014718	ATCT	2	8	29435	29442	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
73	NC_014718	ACCG	2	8	30880	30887	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
74	NC_014718	CAGC	3	12	32180	32191	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
75	NC_014718	ACGC	2	8	32342	32349	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
76	NC_014718	GGCC	2	8	32564	32571	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
77	NC_014718	ATCT	2	8	32588	32595	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
78	NC_014718	CGGT	2	8	32631	32638	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
79	NC_014718	ATGT	2	8	33128	33135	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
80	NC_014718	GATC	2	8	33646	33653	25 %	25 %	25 %	25 %	312602137
81	NC_014718	GCTG	2	8	33876	33883	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
82	NC_014718	GCAA	2	8	34015	34022	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
83	NC_014718	CGTG	2	8	34995	35002	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
84	NC_014718	TTCA	2	8	35636	35643	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
85	NC_014718	ATTG	2	8	35746	35753	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
86	NC_014718	CCGA	2	8	35764	35771	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
87	NC_014718	GCCA	2	8	35808	35815	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
88	NC_014718	ATGT	2	8	36326	36333	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
89	NC_014718	GATC	2	8	36844	36851	25 %	25 %	25 %	25 %	312602137
90	NC_014718	GCTG	2	8	37074	37081	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
91	NC_014718	CGTG	2	8	38193	38200	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
92	NC_014718	ATCT	2	8	38781	38788	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
93	NC_014718	GCGA	2	8	39863	39870	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
94	NC_014718	TGCG	3	12	40146	40157	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
95	NC_014718	TGGT	2	8	40219	40226	0 %	50 %	50 %	0 %	312602137
96	NC_014718	GCCG	2	8	40282	40289	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
97	NC_014718	CACC	2	8	40494	40501	25 %	0 %	0 %	75 %	312602137
98	NC_014718	CGAG	2	8	40732	40739	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
99	NC_014718	GGCT	2	8	40985	40992	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
100	NC_014718	TTGA	2	8	41306	41313	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
101	NC_014718	GCGG	2	8	41399	41406	0 %	0 %	75 %	25 %	312602137
102	NC_014718	TTCA	2	8	41975	41982	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
103	NC_014718	CCGA	2	8	42103	42110	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
104	NC_014718	GCCA	2	8	42147	42154	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
105	NC_014718	GATC	2	8	43183	43190	25 %	25 %	25 %	25 %	312602137
106	NC_014718	GCTG	2	8	43413	43420	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
107	NC_014718	TGCG	2	8	43716	43723	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
108	NC_014718	CGTG	2	8	44529	44536	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
109	NC_014718	GATC	2	8	45016	45023	25 %	25 %	25 %	25 %	312602137
110	NC_014718	ATTG	2	8	45157	45164	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
111	NC_014718	GGTT	2	8	45189	45196	0 %	50 %	50 %	0 %	312602137
112	NC_014718	CCGA	2	8	45248	45255	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
113	NC_014718	AAAC	2	8	45300	45307	75 %	0 %	0 %	25 %	312602137
114	NC_014718	GGCC	2	8	45323	45330	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
115	NC_014718	GCCA	2	8	45369	45376	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
116	NC_014718	TCCT	2	8	46152	46159	0 %	50 %	0 %	50 %	312602137
117	NC_014718	AGAA	2	8	46515	46522	75 %	0 %	25 %	0 %	312602137
118	NC_014718	GATG	2	8	46591	46598	25 %	25 %	50 %	0 %	312602137
119	NC_014718	ACGT	2	8	47946	47953	25 %	25 %	25 %	25 %	312602140
120	NC_014718	GCAC	2	8	48177	48184	25 %	0 %	25 %	50 %	312602141
121	NC_014718	CGGC	2	8	49055	49062	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
122	NC_014718	CGCA	2	8	49314	49321	25 %	0 %	25 %	50 %	312602143
123	NC_014718	CGGC	2	8	49376	49383	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
124	NC_014718	AACG	2	8	49938	49945	50 %	0 %	25 %	25 %	312602143
125	NC_014718	TGAG	2	8	50220	50227	25 %	25 %	50 %	0 %	312602143
126	NC_014718	TTGC	2	8	50649	50656	0 %	50 %	25 %	25 %	312602144
127	NC_014718	GCTT	2	8	51292	51299	0 %	50 %	25 %	25 %	312602144
128	NC_014718	GGAC	2	8	51747	51754	25 %	0 %	50 %	25 %	312602144
129	NC_014718	GCCC	2	8	52189	52196	0 %	0 %	25 %	75 %	312602145
130	NC_014718	CCAG	2	8	52960	52967	25 %	0 %	25 %	50 %	312602147
131	NC_014718	GGAT	2	8	53721	53728	25 %	25 %	50 %	0 %	312602147
132	NC_014718	CGAC	2	8	53961	53968	25 %	0 %	25 %	50 %	312602147
133	NC_014718	GCTC	2	8	54418	54425	0 %	25 %	25 %	50 %	312602148
134	NC_014718	TCGC	2	8	55181	55188	0 %	25 %	25 %	50 %	312602150
135	NC_014718	ATCC	2	8	55408	55415	25 %	25 %	0 %	50 %	312602150
136	NC_014718	ATGC	2	8	55432	55439	25 %	25 %	25 %	25 %	312602150
137	NC_014718	TCGG	2	8	55557	55564	0 %	25 %	50 %	25 %	312602150
138	NC_014718	GCAT	2	8	55661	55668	25 %	25 %	25 %	25 %	312602150
139	NC_014718	TGCG	2	8	55693	55700	0 %	25 %	50 %	25 %	312602150
140	NC_014718	CGTG	2	8	56730	56737	0 %	25 %	50 %	25 %	312602150
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