MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 10288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014666	ACCAC	2	10	1569	1578	40 %	0 %	0 %	60 %	312193898
2	NC_014666	CCCGG	2	10	1825	1834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_014666	CGGGG	2	10	1980	1989	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014666	CCGGG	2	10	3000	3009	0 %	0 %	60 %	40 %	312193899
5	NC_014666	GCCGG	2	10	3094	3103	0 %	0 %	60 %	40 %	312193899
6	NC_014666	ACCGG	2	10	8821	8830	20 %	0 %	40 %	40 %	312193903
7	NC_014666	CCTCG	2	10	9491	9500	0 %	20 %	20 %	60 %	312193903
8	NC_014666	GGGCC	2	10	10166	10175	0 %	0 %	60 %	40 %	312193903
9	NC_014666	CCGGG	2	10	10947	10956	0 %	0 %	60 %	40 %	312193904
10	NC_014666	CGGCG	2	10	11259	11268	0 %	0 %	60 %	40 %	312193904
11	NC_014666	CGGAC	2	10	11285	11294	20 %	0 %	40 %	40 %	312193904
12	NC_014666	GGCCG	2	10	11444	11453	0 %	0 %	60 %	40 %	312193904
13	NC_014666	GCCGG	2	10	13314	13323	0 %	0 %	60 %	40 %	312193905
14	NC_014666	CTGCG	2	10	15284	15293	0 %	20 %	40 %	40 %	312193907
15	NC_014666	GCGGA	2	10	15450	15459	20 %	0 %	60 %	20 %	312193907
16	NC_014666	CGGCT	2	10	15857	15866	0 %	20 %	40 %	40 %	312193907
17	NC_014666	CCACA	2	10	17849	17858	40 %	0 %	0 %	60 %	312193909
18	NC_014666	TCGAC	2	10	19840	19849	20 %	20 %	20 %	40 %	312193911
19	NC_014666	CTGTT	2	10	21041	21050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014666	AGACG	2	10	22423	22432	40 %	0 %	40 %	20 %	312193913
21	NC_014666	GGTGC	2	10	23569	23578	0 %	20 %	60 %	20 %	312193914
22	NC_014666	CCGGG	2	10	24084	24093	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014666	CCCGG	2	10	24751	24760	0 %	0 %	40 %	60 %	312193916
24	NC_014666	GGACG	2	10	25225	25234	20 %	0 %	60 %	20 %	312193917
25	NC_014666	CCGGC	2	10	25323	25332	0 %	0 %	40 %	60 %	312193917
26	NC_014666	CCGGC	2	10	27081	27090	0 %	0 %	40 %	60 %	312193918
27	NC_014666	TGGCC	2	10	27100	27109	0 %	20 %	40 %	40 %	312193918
28	NC_014666	GGACC	2	10	28208	28217	20 %	0 %	40 %	40 %	312193919
29	NC_014666	GCCCG	2	10	28565	28574	0 %	0 %	40 %	60 %	312193919
30	NC_014666	AACGG	2	10	29167	29176	40 %	0 %	40 %	20 %	312193920
31	NC_014666	CGGCG	2	10	30593	30602	0 %	0 %	60 %	40 %	312193924
32	NC_014666	CAGAT	2	10	32310	32319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014666	CGCGG	2	10	32553	32562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014666	TCGTC	2	10	33531	33540	0 %	40 %	20 %	40 %	312193925
35	NC_014666	CGGGG	2	10	34482	34491	0 %	0 %	80 %	20 %	312193926
36	NC_014666	GGGTC	2	10	34881	34890	0 %	20 %	60 %	20 %	312193927
37	NC_014666	GGTCG	2	10	36944	36953	0 %	20 %	60 %	20 %	312193928
38	NC_014666	CGATG	2	10	37143	37152	20 %	20 %	40 %	20 %	312193928
39	NC_014666	TCGGG	2	10	37513	37522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014666	CGCGG	2	10	38462	38471	0 %	0 %	60 %	40 %	312193929
41	NC_014666	CCGGT	2	10	39185	39194	0 %	20 %	40 %	40 %	312193929
42	NC_014666	CCCGG	2	10	42787	42796	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014666	TGACC	2	10	45209	45218	20 %	20 %	20 %	40 %	312193936
44	NC_014666	CCAGC	2	10	47530	47539	20 %	0 %	20 %	60 %	312193938
45	NC_014666	GAGCC	2	10	47922	47931	20 %	0 %	40 %	40 %	312193939
46	NC_014666	GGCCG	2	10	48435	48444	0 %	0 %	60 %	40 %	312193939
47	NC_014666	CTGAC	2	10	48573	48582	20 %	20 %	20 %	40 %	312193939
48	NC_014666	GCACG	2	10	48804	48813	20 %	0 %	40 %	40 %	312193940
49	NC_014666	CGGCC	2	10	48987	48996	0 %	0 %	40 %	60 %	312193940
50	NC_014666	CGCTG	2	10	49576	49585	0 %	20 %	40 %	40 %	312193941
51	NC_014666	ACGCC	2	10	49996	50005	20 %	0 %	20 %	60 %	312193941
52	NC_014666	GGCCC	2	10	50970	50979	0 %	0 %	40 %	60 %	312193942
53	NC_014666	GCCTG	2	10	51895	51904	0 %	20 %	40 %	40 %	312193943
54	NC_014666	GCTGG	2	10	53198	53207	0 %	20 %	60 %	20 %	312193944
55	NC_014666	GGGTC	2	10	53294	53303	0 %	20 %	60 %	20 %	312193944
56	NC_014666	CGCGG	2	10	53357	53366	0 %	0 %	60 %	40 %	312193944
57	NC_014666	GACCA	2	10	54465	54474	40 %	0 %	20 %	40 %	312193945
58	NC_014666	GTCGA	2	10	54930	54939	20 %	20 %	40 %	20 %	312193945
59	NC_014666	TCACG	2	10	55866	55875	20 %	20 %	20 %	40 %	312193946
60	NC_014666	GCCTC	2	10	55976	55985	0 %	20 %	20 %	60 %	312193946
61	NC_014666	GCGCG	2	10	56565	56574	0 %	0 %	60 %	40 %	312193946
62	NC_014666	CGGCG	2	10	57096	57105	0 %	0 %	60 %	40 %	312193946
63	NC_014666	GCGCC	2	10	57917	57926	0 %	0 %	40 %	60 %	312193947
64	NC_014666	CGCGG	2	10	59902	59911	0 %	0 %	60 %	40 %	312193950
65	NC_014666	ACCGG	2	10	59931	59940	20 %	0 %	40 %	40 %	312193950
66	NC_014666	CGAGC	2	10	60160	60169	20 %	0 %	40 %	40 %	312193950
67	NC_014666	CGCGG	2	10	60436	60445	0 %	0 %	60 %	40 %	312193950
68	NC_014666	GCCGG	2	10	62562	62571	0 %	0 %	60 %	40 %	312193953
69	NC_014666	GCGCG	2	10	63170	63179	0 %	0 %	60 %	40 %	312193953
70	NC_014666	GGCCG	2	10	63978	63987	0 %	0 %	60 %	40 %	312193954
71	NC_014666	TCGAG	2	10	65590	65599	20 %	20 %	40 %	20 %	312193955
72	NC_014666	CGCGG	2	10	66036	66045	0 %	0 %	60 %	40 %	312193956
73	NC_014666	GGCGC	2	10	66795	66804	0 %	0 %	60 %	40 %	312193957
74	NC_014666	CCGCG	2	10	67667	67676	0 %	0 %	40 %	60 %	312193958
75	NC_014666	GCCGA	2	10	67891	67900	20 %	0 %	40 %	40 %	312193958
76	NC_014666	GCCGG	2	10	71309	71318	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014666	CGGTC	2	10	71861	71870	0 %	20 %	40 %	40 %	312193962
78	NC_014666	GACCG	2	10	72075	72084	20 %	0 %	40 %	40 %	312193962
79	NC_014666	GGGCT	2	10	72984	72993	0 %	20 %	60 %	20 %	312193963
80	NC_014666	ACGCC	2	10	74035	74044	20 %	0 %	20 %	60 %	312193963
81	NC_014666	TGGCG	2	10	74128	74137	0 %	20 %	60 %	20 %	312193963
82	NC_014666	CTGGC	2	10	76093	76102	0 %	20 %	40 %	40 %	312193964
83	NC_014666	GCCGG	2	10	76272	76281	0 %	0 %	60 %	40 %	312193964
84	NC_014666	CAGGG	2	10	77885	77894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014666	CCGGC	2	10	78322	78331	0 %	0 %	40 %	60 %	312193966
86	NC_014666	AGCGC	2	10	78680	78689	20 %	0 %	40 %	40 %	312193966
87	NC_014666	GCGCG	2	10	80647	80656	0 %	0 %	60 %	40 %	312193967
88	NC_014666	CCTGG	2	10	81539	81548	0 %	20 %	40 %	40 %	312193967
89	NC_014666	GCCGG	2	10	82060	82069	0 %	0 %	60 %	40 %	312193968
90	NC_014666	CGCGA	2	10	83120	83129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014666	TGTCC	2	10	83384	83393	0 %	40 %	20 %	40 %	312193969
92	NC_014666	GCCCG	2	10	83678	83687	0 %	0 %	40 %	60 %	312193969
93	NC_014666	CCTGG	2	10	84680	84689	0 %	20 %	40 %	40 %	312193969
94	NC_014666	TTCCG	2	10	85571	85580	0 %	40 %	20 %	40 %	312193970
95	NC_014666	CGGCT	2	10	86051	86060	0 %	20 %	40 %	40 %	312193970
96	NC_014666	CCGGC	2	10	88170	88179	0 %	0 %	40 %	60 %	312193971
97	NC_014666	GCCGC	2	10	88299	88308	0 %	0 %	40 %	60 %	312193971
98	NC_014666	CGCCC	2	10	88453	88462	0 %	0 %	20 %	80 %	312193971
99	NC_014666	GAAGA	2	10	88917	88926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014666	GCCGG	2	10	89258	89267	0 %	0 %	60 %	40 %	312193972
101	NC_014666	GGGCC	2	10	89578	89587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014666	GCCCG	2	10	89983	89992	0 %	0 %	40 %	60 %	312193973
103	NC_014666	GGCCA	2	10	91633	91642	20 %	0 %	40 %	40 %	312193974
104	NC_014666	GAGGT	2	10	91867	91876	20 %	20 %	60 %	0 %	312193974
105	NC_014666	TGACC	2	10	91957	91966	20 %	20 %	20 %	40 %	312193974
106	NC_014666	GGTCC	2	10	92170	92179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014666	GTGGC	2	10	92519	92528	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014666	CTGAG	2	10	92579	92588	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014666	TCGGT	2	10	92969	92978	0 %	40 %	40 %	20 %	312193975
110	NC_014666	GCACC	2	10	93101	93110	20 %	0 %	20 %	60 %	312193975
111	NC_014666	CAGCG	2	10	93552	93561	20 %	0 %	40 %	40 %	312193975
112	NC_014666	CCGAG	2	10	94637	94646	20 %	0 %	40 %	40 %	312193975
113	NC_014666	GGCGG	2	10	95460	95469	0 %	0 %	80 %	20 %	312193977
114	NC_014666	GTCGG	2	10	95719	95728	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014666	GGCCG	2	10	96002	96011	0 %	0 %	60 %	40 %	312193978
116	NC_014666	CCCGG	2	10	96344	96353	0 %	0 %	40 %	60 %	312193978
117	NC_014666	ACGCC	2	10	96490	96499	20 %	0 %	20 %	60 %	312193978
118	NC_014666	CAGGC	2	10	97289	97298	20 %	0 %	40 %	40 %	312193980
119	NC_014666	CCCGG	2	10	97612	97621	0 %	0 %	40 %	60 %	312193980
120	NC_014666	GCCGC	2	10	98097	98106	0 %	0 %	40 %	60 %	312193980
121	NC_014666	CGTCA	2	10	99230	99239	20 %	20 %	20 %	40 %	312193980
122	NC_014666	CGTGC	2	10	100808	100817	0 %	20 %	40 %	40 %	312193981
123	NC_014666	GGCTG	2	10	101008	101017	0 %	20 %	60 %	20 %	312193981
124	NC_014666	GGTCC	2	10	101389	101398	0 %	20 %	40 %	40 %	312193982
125	NC_014666	GGCCG	2	10	102332	102341	0 %	0 %	60 %	40 %	312193982
126	NC_014666	GTCCC	2	10	102951	102960	0 %	20 %	20 %	60 %	312193983
127	NC_014666	GGCGA	2	10	103304	103313	20 %	0 %	60 %	20 %	312193983
128	NC_014666	GCGCG	2	10	103623	103632	0 %	0 %	60 %	40 %	312193983
129	NC_014666	GACCG	3	15	104207	104221	20 %	0 %	40 %	40 %	312193984
130	NC_014666	CTGGC	2	10	104818	104827	0 %	20 %	40 %	40 %	312193984
131	NC_014666	GCCGG	2	10	106204	106213	0 %	0 %	60 %	40 %	312193986
132	NC_014666	CGGGC	3	15	106683	106697	0 %	0 %	60 %	40 %	312193986
133	NC_014666	GCCGC	2	10	107844	107853	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014666	TGCCG	2	10	111283	111292	0 %	20 %	40 %	40 %	312193990
135	NC_014666	CCGGT	2	10	113127	113136	0 %	20 %	40 %	40 %	312193992
136	NC_014666	CTGCG	2	10	113368	113377	0 %	20 %	40 %	40 %	312193992
137	NC_014666	TCCGC	2	10	113806	113815	0 %	20 %	20 %	60 %	312193993
138	NC_014666	GCGCG	2	10	114270	114279	0 %	0 %	60 %	40 %	312193993
139	NC_014666	CTGCC	2	10	115036	115045	0 %	20 %	20 %	60 %	312193993
140	NC_014666	GCCCG	2	10	115120	115129	0 %	0 %	40 %	60 %	312193993
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142	NC_014666	GCCCG	2	10	121544	121553	0 %	0 %	40 %	60 %	312193998
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199	NC_014666	GCGTC	2	10	162711	162720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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243	NC_014666	TGACG	2	10	193613	193622	20 %	20 %	40 %	20 %	312194046
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254	NC_014666	GCCTG	2	10	204417	204426	0 %	20 %	40 %	40 %	312194052
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264	NC_014666	GTCCC	2	10	212058	212067	0 %	20 %	20 %	60 %	312194058
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267	NC_014666	CGCGG	2	10	213595	213604	0 %	0 %	60 %	40 %	312194059
268	NC_014666	CAGCT	2	10	214468	214477	20 %	20 %	20 %	40 %	312194059
269	NC_014666	CGGGG	2	10	217181	217190	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
270	NC_014666	CCGCG	2	10	218801	218810	0 %	0 %	40 %	60 %	312194062
271	NC_014666	CGACG	2	10	219480	219489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_014666	GCGGA	2	10	221513	221522	20 %	0 %	60 %	20 %	312194064
273	NC_014666	CGGTC	2	10	222358	222367	0 %	20 %	40 %	40 %	312194064
274	NC_014666	CTGTG	2	10	225011	225020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_014666	GTCCG	2	10	277236	277245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
332	NC_014666	GGATC	2	10	278470	278479	20 %	20 %	40 %	20 %	312194103
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352	NC_014666	CGGTC	2	10	297787	297796	0 %	20 %	40 %	40 %	312194119
353	NC_014666	CGCTG	2	10	298014	298023	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
354	NC_014666	GCGGG	2	10	299483	299492	0 %	0 %	80 %	20 %	312194121
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365	NC_014666	TTGCT	2	10	309216	309225	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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368	NC_014666	GCAAT	2	10	311682	311691	40 %	20 %	20 %	20 %	312194129
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382	NC_014666	GTCGA	2	10	322885	322894	20 %	20 %	40 %	20 %	312194139
383	NC_014666	CGGTC	2	10	325037	325046	0 %	20 %	40 %	40 %	312194141
384	NC_014666	CGCGC	2	10	325540	325549	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
385	NC_014666	GCCGG	2	10	325791	325800	0 %	0 %	60 %	40 %	312194142
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389	NC_014666	GGGCA	2	10	331251	331260	20 %	0 %	60 %	20 %	312194148
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392	NC_014666	CCCTG	2	10	333310	333319	0 %	20 %	20 %	60 %	312194153
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394	NC_014666	CCCGT	2	10	334251	334260	0 %	20 %	20 %	60 %	312194155
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400	NC_014666	GTCGG	2	10	338587	338596	0 %	20 %	60 %	20 %	312194159
401	NC_014666	CCGGC	2	10	338662	338671	0 %	0 %	40 %	60 %	312194159
402	NC_014666	TCTCG	2	10	339419	339428	0 %	40 %	20 %	40 %	312194160
403	NC_014666	GTCGG	2	10	341262	341271	0 %	20 %	60 %	20 %	312194162
404	NC_014666	CCGAC	2	10	342423	342432	20 %	0 %	20 %	60 %	312194163
405	NC_014666	GCCGC	2	10	342618	342627	0 %	0 %	40 %	60 %	312194163
406	NC_014666	TCGCG	2	10	343497	343506	0 %	20 %	40 %	40 %	312194164
407	NC_014666	GCCGG	2	10	344212	344221	0 %	0 %	60 %	40 %	312194164
408	NC_014666	GCGCG	2	10	345932	345941	0 %	0 %	60 %	40 %	312194165
409	NC_014666	CGGGC	2	10	346022	346031	0 %	0 %	60 %	40 %	312194166
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422	NC_014666	CGCGG	2	10	356700	356709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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426	NC_014666	CCGGA	2	10	360304	360313	20 %	0 %	40 %	40 %	312194182
427	NC_014666	CCTCC	2	10	360549	360558	0 %	20 %	0 %	80 %	312194183
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437	NC_014666	GCTGG	2	10	367869	367878	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
438	NC_014666	CCGGT	2	10	369376	369385	0 %	20 %	40 %	40 %	312194192
439	NC_014666	GCCGA	2	10	370452	370461	20 %	0 %	40 %	40 %	312194193
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442	NC_014666	CGATC	2	10	371335	371344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
443	NC_014666	ACCGG	2	10	371350	371359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
444	NC_014666	GACGT	2	10	371380	371389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
445	NC_014666	GGGCG	2	10	371496	371505	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_014666	CCGGG	2	10	414128	414137	0 %	0 %	60 %	40 %	312194227
488	NC_014666	GTCGG	2	10	414324	414333	0 %	20 %	60 %	20 %	312194227
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497	NC_014666	GGCCG	2	10	424036	424045	0 %	0 %	60 %	40 %	312194235
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499	NC_014666	GCGCG	2	10	425703	425712	0 %	0 %	60 %	40 %	312194238
500	NC_014666	GGGCC	2	10	426722	426731	0 %	0 %	60 %	40 %	312194239

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