MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 5424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014666	GCCG	2	8	1930	1937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014666	GCCG	2	8	2003	2010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014666	CCGC	2	8	2404	2411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_014666	GCCC	2	8	2436	2443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_014666	ATTT	2	8	2670	2677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014666	GAGG	2	8	2863	2870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014666	TGGC	2	8	10617	10624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014666	GTGG	2	8	12324	12331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014666	GCCG	2	8	16659	16666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014666	GCCA	2	8	18582	18589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014666	CTGT	2	8	19655	19662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014666	GCAA	2	8	24512	24519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014666	CTGC	2	8	30058	30065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014666	CGGC	2	8	30181	30188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014666	TCCC	2	8	30265	30272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_014666	CGGA	2	8	31877	31884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014666	CTGG	2	8	32492	32499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014666	GCGG	2	8	32565	32572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014666	GCGG	2	8	34217	34224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014666	CACC	2	8	36083	36090	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014666	CGGA	2	8	36200	36207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014666	CTAC	2	8	36293	36300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014666	CGGC	2	8	36320	36327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014666	GCCC	2	8	37309	37316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014666	ATGG	2	8	37348	37355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014666	TCCG	2	8	38074	38081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014666	GGCC	2	8	39590	39597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014666	CGGC	2	8	39609	39616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014666	AGCC	2	8	42993	43000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014666	GCCG	2	8	43009	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014666	CGGC	2	8	46295	46302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014666	CGGC	2	8	46391	46398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014666	GTCG	2	8	47592	47599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014666	CGAC	2	8	47826	47833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014666	CCCG	2	8	49360	49367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014666	TGGC	2	8	53826	53833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014666	GAAG	2	8	53961	53968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014666	GCCG	2	8	55724	55731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014666	GGCA	2	8	62194	62201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014666	CGGC	2	8	63527	63534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014666	GCCG	2	8	64610	64617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014666	CTGC	2	8	64679	64686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014666	CGTC	2	8	64723	64730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014666	TGGC	2	8	68365	68372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014666	TCCA	2	8	69813	69820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014666	ACCG	2	8	69928	69935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014666	CGGC	2	8	75535	75542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014666	CTCG	2	8	75627	75634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014666	CGGT	2	8	77171	77178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014666	GCAG	2	8	77355	77362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014666	GCTA	2	8	77432	77439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014666	GGGC	2	8	79419	79426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014666	CCGG	2	8	81784	81791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014666	TCGG	2	8	81793	81800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014666	CCGG	2	8	82683	82690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014666	GGCC	2	8	82970	82977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014666	GCGA	2	8	83159	83166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014666	AGGA	2	8	83192	83199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014666	GTCG	2	8	86981	86988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014666	CCGG	2	8	88763	88770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014666	GGCC	2	8	89563	89570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014666	CGCC	2	8	90878	90885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_014666	CCGA	2	8	94698	94705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014666	CCGC	2	8	95655	95662	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014666	CCTC	2	8	107753	107760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_014666	TGGC	2	8	108115	108122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014666	CTGG	2	8	108272	108279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014666	CGTT	2	8	109203	109210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014666	CCGG	2	8	109317	109324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014666	GCCG	2	8	109332	109339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014666	CGGC	2	8	110542	110549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014666	GCCG	2	8	115315	115322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014666	GTCG	2	8	115345	115352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014666	GCCA	2	8	115397	115404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014666	TGTC	2	8	116866	116873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014666	ACAG	2	8	117899	117906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014666	GGCC	2	8	118046	118053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014666	GGGC	2	8	119188	119195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014666	CGGC	2	8	119318	119325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014666	TCGG	2	8	119422	119429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014666	CGGC	2	8	119468	119475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014666	GGGT	2	8	119605	119612	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014666	CGGC	2	8	119624	119631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014666	AGGC	2	8	121839	121846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014666	GCGG	2	8	123018	123025	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014666	CGGA	2	8	128088	128095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014666	TCCG	2	8	134017	134024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014666	CACC	2	8	134186	134193	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_014666	GGCC	2	8	139816	139823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014666	CGGT	2	8	140249	140256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014666	CCGG	2	8	142063	142070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014666	CCGG	2	8	142098	142105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014666	CGGC	2	8	143624	143631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014666	GGTC	2	8	146683	146690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014666	ACCG	2	8	146865	146872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014666	CTGC	2	8	147079	147086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014666	AGCG	2	8	147439	147446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014666	CCGC	2	8	147471	147478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014666	GTCC	2	8	148457	148464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014666	CCGG	2	8	150168	150175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014666	AGCC	2	8	151706	151713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014666	CCGG	2	8	154224	154231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014666	TCGG	2	8	154242	154249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014666	CCGC	2	8	155338	155345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_014666	GACG	2	8	155762	155769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014666	TCTT	2	8	155851	155858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014666	TCGC	2	8	155860	155867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014666	TCGC	2	8	162606	162613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014666	TTGC	2	8	162753	162760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014666	CGGG	2	8	163133	163140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014666	GAGT	2	8	163243	163250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014666	CCGG	2	8	164652	164659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014666	TCCC	2	8	164758	164765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014666	TCCG	3	12	164803	164814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014666	ACGG	2	8	165000	165007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014666	GGAG	2	8	165454	165461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014666	ATGG	2	8	166998	167005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014666	GCTC	2	8	167159	167166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014666	CGAC	2	8	167201	167208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014666	CGGA	2	8	167226	167233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014666	CGGC	2	8	167318	167325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014666	CCGC	2	8	171610	171617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_014666	GTGG	2	8	171823	171830	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014666	GCCC	2	8	172970	172977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_014666	GCTC	2	8	172986	172993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014666	CCCA	2	8	174081	174088	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_014666	GACG	2	8	175951	175958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014666	AGCG	2	8	175993	176000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014666	GCTC	2	8	176230	176237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014666	GGCA	2	8	177969	177976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014666	TCGG	2	8	179217	179224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014666	CCCG	2	8	181022	181029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_014666	GTCC	2	8	181041	181048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014666	CGCC	2	8	181054	181061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_014666	CAGG	2	8	182046	182053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014666	CGGG	2	8	183434	183441	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014666	CCGA	2	8	183449	183456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014666	CCAG	2	8	183557	183564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014666	GCCG	2	8	183647	183654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014666	CGGC	2	8	183664	183671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014666	CCGG	2	8	185596	185603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014666	CACG	2	8	187033	187040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014666	CCGG	2	8	190677	190684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014666	GTCT	2	8	192958	192965	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014666	GGAC	2	8	193081	193088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014666	ATGG	2	8	193097	193104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014666	CGAC	2	8	201145	201152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014666	CCCG	2	8	201390	201397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_014666	CTAC	2	8	201403	201410	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014666	CCGT	2	8	201708	201715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014666	GCCG	2	8	201727	201734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014666	CGCC	2	8	206450	206457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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270	NC_014666	GCCG	2	8	351678	351685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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486	NC_014666	CTGG	2	8	675922	675929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_014666	TAGC	2	8	676495	676502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_014666	GACC	2	8	676632	676639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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