MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 167552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014666	ACC	2	6	167	172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193898
2	NC_014666	GCA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
3	NC_014666	GCT	2	6	340	345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
4	NC_014666	CGC	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193898
5	NC_014666	CCG	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193898
6	NC_014666	TGC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
7	NC_014666	GTC	2	6	529	534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
8	NC_014666	GAC	3	9	551	559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
9	NC_014666	CTG	2	6	809	814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
10	NC_014666	GAA	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193898
11	NC_014666	GAG	2	6	878	883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193898
12	NC_014666	TCA	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193898
13	NC_014666	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
14	NC_014666	CAG	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
15	NC_014666	GCG	2	6	937	942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193898
16	NC_014666	TGC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
17	NC_014666	TCG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
18	NC_014666	AGG	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193898
19	NC_014666	TTC	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193898
20	NC_014666	AGC	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
21	NC_014666	TCG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
22	NC_014666	CAC	2	6	1080	1085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193898
23	NC_014666	GGA	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193898
24	NC_014666	CCG	2	6	1154	1159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193898
25	NC_014666	GAA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193898
26	NC_014666	GGC	2	6	1195	1200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193898
27	NC_014666	GCC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193898
28	NC_014666	CGC	2	6	1297	1302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193898
29	NC_014666	TGC	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
30	NC_014666	CGA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193898
31	NC_014666	CGT	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193898
32	NC_014666	GGA	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193898
33	NC_014666	CGG	2	6	1558	1563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193898
34	NC_014666	CTG	3	9	2984	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193899
35	NC_014666	TGG	3	9	3012	3020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193899
36	NC_014666	CGC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193899
37	NC_014666	GAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193899
38	NC_014666	AGC	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
39	NC_014666	CGA	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
40	NC_014666	CAA	2	6	3163	3168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193899
41	NC_014666	TCA	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193899
42	NC_014666	CGA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
43	NC_014666	GCC	2	6	3247	3252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193899
44	NC_014666	GCC	2	6	3287	3292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193899
45	NC_014666	GAC	2	6	3323	3328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
46	NC_014666	CGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193899
47	NC_014666	CTG	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193899
48	NC_014666	CGG	3	9	3505	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193899
49	NC_014666	ACC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193899
50	NC_014666	CCG	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193899
51	NC_014666	GCT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193899
52	NC_014666	GCT	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193899
53	NC_014666	TGG	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193899
54	NC_014666	ACC	2	6	3759	3764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193899
55	NC_014666	CGG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193899
56	NC_014666	ACG	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
57	NC_014666	CGG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193899
58	NC_014666	AAG	2	6	3950	3955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193899
59	NC_014666	CGA	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193899
60	NC_014666	GGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193900
61	NC_014666	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
62	NC_014666	CAA	2	6	4324	4329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193900
63	NC_014666	CCG	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
64	NC_014666	GCC	2	6	4356	4361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
65	NC_014666	GCT	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
66	NC_014666	CTG	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
67	NC_014666	GGA	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193900
68	NC_014666	CGG	2	6	4445	4450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193900
69	NC_014666	CGA	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193900
70	NC_014666	GCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
71	NC_014666	GCC	2	6	4490	4495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
72	NC_014666	CAC	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193900
73	NC_014666	CTG	2	6	4538	4543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
74	NC_014666	GCT	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
75	NC_014666	CGC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
76	NC_014666	CGA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193900
77	NC_014666	GAG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193900
78	NC_014666	TCG	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
79	NC_014666	GCC	2	6	4881	4886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193900
80	NC_014666	GAC	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193900
81	NC_014666	TGC	3	9	4986	4994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
82	NC_014666	GAC	2	6	4997	5002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193900
83	NC_014666	TCG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193900
84	NC_014666	CGG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193900
85	NC_014666	CGC	3	9	5231	5239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193901
86	NC_014666	GGT	2	6	5268	5273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193901
87	NC_014666	GCG	2	6	5281	5286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193901
88	NC_014666	CGG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193901
89	NC_014666	GAC	3	9	5340	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193901
90	NC_014666	GCC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193901
91	NC_014666	CGC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193901
92	NC_014666	CGC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193901
93	NC_014666	TCG	2	6	5509	5514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193901
94	NC_014666	GCT	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193901
95	NC_014666	TGC	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193901
96	NC_014666	CGT	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193901
97	NC_014666	GGC	2	6	5704	5709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193901
98	NC_014666	GGC	2	6	5730	5735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193901
99	NC_014666	ACG	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
100	NC_014666	CAC	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193902
101	NC_014666	GGT	2	6	6193	6198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193902
102	NC_014666	GTC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
103	NC_014666	GTC	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
104	NC_014666	GGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193902
105	NC_014666	CGG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193902
106	NC_014666	CGT	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
107	NC_014666	CAC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193902
108	NC_014666	ACC	2	6	6605	6610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193902
109	NC_014666	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193902
110	NC_014666	CGA	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
111	NC_014666	GAG	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193902
112	NC_014666	TCG	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
113	NC_014666	CGA	2	6	6768	6773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
114	NC_014666	TCG	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
115	NC_014666	GAG	2	6	6920	6925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193902
116	NC_014666	GCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193902
117	NC_014666	CGA	2	6	7015	7020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
118	NC_014666	GAC	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
119	NC_014666	ATC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193902
120	NC_014666	AAG	2	6	7133	7138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193902
121	NC_014666	TCG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
122	NC_014666	CGC	2	6	7246	7251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193902
123	NC_014666	CGC	2	6	7255	7260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193902
124	NC_014666	CGG	2	6	7291	7296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193902
125	NC_014666	TCG	2	6	7362	7367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
126	NC_014666	CGG	2	6	7377	7382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193902
127	NC_014666	GAA	2	6	7483	7488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193902
128	NC_014666	ACG	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
129	NC_014666	GCT	3	9	7618	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
130	NC_014666	GCT	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
131	NC_014666	CTG	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
132	NC_014666	GTG	2	6	7770	7775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193902
133	NC_014666	ACC	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193902
134	NC_014666	CCG	2	6	7876	7881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193902
135	NC_014666	CTG	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193902
136	NC_014666	CGA	2	6	7903	7908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
137	NC_014666	CGA	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193902
138	NC_014666	TAC	2	6	8110	8115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193903
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140	NC_014666	CCG	2	6	8246	8251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193903
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149	NC_014666	AAC	2	6	8706	8711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193903
150	NC_014666	CGA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193903
151	NC_014666	GCT	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193903
152	NC_014666	GCT	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193903
153	NC_014666	CAT	2	6	8753	8758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193903
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155	NC_014666	GCA	2	6	8836	8841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193903
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159	NC_014666	ACA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193903
160	NC_014666	AAC	2	6	9072	9077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193903
161	NC_014666	TCG	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193903
162	NC_014666	GAT	2	6	9167	9172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193903
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245	NC_014666	TCT	2	6	13283	13288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193905
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249	NC_014666	GCC	3	9	13453	13461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193905
250	NC_014666	CTG	2	6	13537	13542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193905
251	NC_014666	CCG	2	6	13547	13552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193905
252	NC_014666	CGT	2	6	13560	13565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193905
253	NC_014666	CGG	2	6	13595	13600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193905
254	NC_014666	GAG	2	6	13603	13608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193905
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