MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	TAGATC	2	12	30340	30351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014664	GCGGGT	2	12	83451	83462	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014664	TGCGGC	2	12	107651	107662	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014664	TTTTGA	2	12	116664	116675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014664	GCCCAA	2	12	166827	166838	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014664	CCTGTT	2	12	190189	190200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014664	CGTGTA	2	12	193440	193451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014664	CCATTG	2	12	193773	193784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014664	GAGGGC	2	12	211899	211910	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014664	GCGCGG	2	12	219808	219819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014664	AACCCG	2	12	270995	271006	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014664	ACGCCA	2	12	324186	324197	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014664	GAGCGC	2	12	343214	343225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014664	CGCGGG	2	12	378998	379009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014664	CCGCGA	2	12	408580	408591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014664	GGCGAG	2	12	442545	442556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014664	GGATCC	2	12	469928	469939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014664	GACCGA	2	12	470088	470099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014664	TCCCTC	2	12	597916	597927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014664	CTTTTT	2	12	636671	636682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014664	TCGGCG	2	12	652603	652614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014664	CAATTT	2	12	653567	653578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014664	CCAGCG	2	12	682630	682641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014664	GCGATG	2	12	688035	688046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014664	AGCGCA	2	12	706099	706110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014664	CGCATA	2	12	714292	714303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014664	TACAAG	2	12	714339	714350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014664	CGTTCC	2	12	716074	716085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014664	GCCGGT	2	12	744103	744114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014664	GCGCCA	2	12	748415	748426	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014664	CGTGAC	2	12	748754	748765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014664	ATTGGA	2	12	752963	752974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014664	CCGAAT	2	12	757856	757867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014664	TCCGCC	2	12	768113	768124	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014664	GTCTGC	2	12	811034	811045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014664	CGAAGC	2	12	815984	815995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014664	GTGGCG	2	12	849599	849610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014664	CCGAAG	2	12	852943	852954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014664	TGCGGA	2	12	912102	912113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014664	TGGAGG	2	12	959967	959978	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014664	GGAGCC	2	12	969950	969961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014664	CCCTCC	2	12	992738	992749	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
43	NC_014664	AGTGCG	2	12	1031790	1031801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014664	GCTCGC	2	12	1057893	1057904	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014664	TTAGTC	2	12	1062065	1062076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014664	TTTCGG	2	12	1069636	1069647	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014664	ATCGCG	2	12	1110241	1110252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014664	TGCAAC	2	12	1147508	1147519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014664	AGGCGG	2	12	1156870	1156881	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014664	CGGCTG	2	12	1156901	1156912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014664	GATGCG	2	12	1199392	1199403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014664	CTCGCG	2	12	1199662	1199673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014664	GCTGGC	2	12	1199862	1199873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014664	TTGTAC	2	12	1200940	1200951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014664	TGAGCA	2	12	1217004	1217015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014664	CGCTGC	2	12	1293253	1293264	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014664	GCTTTT	2	12	1321126	1321137	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014664	CCTCCC	2	12	1331903	1331914	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_014664	TTTGCG	2	12	1332690	1332701	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014664	GGTCCA	2	12	1360499	1360510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014664	GTCGAA	2	12	1376759	1376770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014664	TCGCCG	2	12	1389595	1389606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014664	ATCTGC	2	12	1391426	1391437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014664	CGTTTT	2	12	1403618	1403629	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014664	AGCGGC	2	12	1406179	1406190	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014664	ATCCGC	2	12	1460958	1460969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014664	GCGACG	2	12	1470145	1470156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014664	GCGTCG	2	12	1499321	1499332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014664	GGGCAG	2	12	1523546	1523557	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014664	TTCGAT	2	12	1541964	1541975	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014664	AGCCGC	2	12	1556338	1556349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014664	TCCGGC	2	12	1575000	1575011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014664	CAATCA	2	12	1581666	1581677	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014664	TGCTGT	2	12	1610853	1610864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014664	CGGCGT	2	12	1639315	1639326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014664	AGCTTG	2	12	1758353	1758364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014664	CAACCT	2	12	1776793	1776804	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014664	GCTTGC	2	12	1776810	1776821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014664	GACGCC	2	12	1822873	1822884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014664	GCTCGC	2	12	1827995	1828006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014664	TGGGAT	2	12	1878813	1878824	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014664	AGCTCA	2	12	1892313	1892324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014664	CAATCA	2	12	1937646	1937657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014664	TCGGCG	2	12	1941563	1941574	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014664	AAGCCC	2	12	1945646	1945657	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014664	GTTTGA	2	12	1947169	1947180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014664	CGCGGC	2	12	1949987	1949998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014664	CACGGT	2	12	1950693	1950704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014664	CTCATC	2	12	1957343	1957354	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014664	CATGCC	2	12	1958048	1958059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014664	CAATCA	2	12	1959841	1959852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014664	TTCGGC	2	12	1961717	1961728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014664	TTGCCC	2	12	1961813	1961824	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014664	AAGTCT	2	12	1964032	1964043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014664	CGAAAA	2	12	1967979	1967990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014664	GATCGA	2	12	2003310	2003321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014664	ATGCCG	2	12	2003357	2003368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014664	AACGGG	2	12	2012952	2012963	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014664	GCCCCT	2	12	2034770	2034781	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014664	GCCATC	2	12	2045735	2045746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014664	TACGAA	2	12	2049096	2049107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014664	GGAACC	2	12	2077429	2077440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014664	TCAAGC	2	12	2081236	2081247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014664	CAAATT	2	12	2142196	2142207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014664	AGGTTG	2	12	2147297	2147308	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014664	GAACGT	2	12	2211211	2211222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014664	CGTCTA	2	12	2287136	2287147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014664	TGCCGC	2	12	2292109	2292120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014664	CGGAAC	2	12	2338277	2338288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014664	CCGGCA	2	12	2362241	2362252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014664	TTGCGA	2	12	2392267	2392278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014664	AGGTCG	2	12	2461795	2461806	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014664	ATTTGC	2	12	2467523	2467534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014664	TGGGGC	2	12	2529397	2529408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014664	TCGGAA	2	12	2546836	2546847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014664	CGCGGA	2	12	2613321	2613332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014664	ACCGGA	2	12	2618377	2618388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014664	GTCGAG	2	12	2642513	2642524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014664	AAGCGC	2	12	2652025	2652036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014664	AAATCG	2	12	2664388	2664399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014664	GCAGAT	2	12	2665879	2665890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014664	GTGATT	2	12	2698242	2698253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014664	ATCGAG	2	12	2700130	2700141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014664	GATGCC	2	12	2707569	2707580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014664	GGCGCG	2	12	2727912	2727923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014664	TTTTTG	2	12	2859717	2859728	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014664	CAGAAC	2	12	2860735	2860746	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014664	GCTTTC	2	12	2890222	2890233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014664	CCGCGA	2	12	2924420	2924431	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014664	TTCAGG	2	12	3009766	3009777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014664	GTTTGA	2	12	3094692	3094703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014664	GCTTTG	2	12	3097126	3097137	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014664	ATTCGT	2	12	3098881	3098892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014664	TGCGTC	2	12	3112021	3112032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014664	AGGTCG	2	12	3123118	3123129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014664	ATACGA	2	12	3217220	3217231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014664	GTGCAC	2	12	3219059	3219070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014664	TCATTT	2	12	3263915	3263926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014664	CTCAGA	2	12	3276021	3276032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014664	AAGCGA	2	12	3276379	3276390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014664	GGCGCG	2	12	3350808	3350819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014664	CCCTTC	2	12	3352488	3352499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014664	CGCTAT	2	12	3407339	3407350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014664	GGCTGT	2	12	3431255	3431266	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014664	TCTCGA	2	12	3431386	3431397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014664	GCGAGC	2	12	3431441	3431452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014664	CGAGGC	2	12	3439002	3439013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014664	CAATCA	2	12	3459957	3459968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014664	GAAAGT	2	12	3469258	3469269	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014664	GATTCT	2	12	3469375	3469386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014664	ACGGGA	2	12	3504554	3504565	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014664	GATATT	2	12	3603334	3603345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014664	CTTCCT	2	12	3664445	3664456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014664	ATCCCG	2	12	3669762	3669773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014664	CTTCTC	2	12	3702070	3702081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_014664	CGGGAT	2	12	3711126	3711137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014664	TCGATT	2	12	3725978	3725989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_014664	TGGGTC	2	12	3747778	3747789	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_014664	TGAGGG	2	12	3749384	3749395	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014664	CGCCTC	2	12	3760173	3760184	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_014664	ACCGAA	2	12	3760375	3760386	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014664	AAACGG	2	12	3762188	3762199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_014664	GTTCAA	2	12	3773554	3773565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_014664	GCTGTT	2	12	3800431	3800442	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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166	NC_014664	CCTTCT	2	12	3828522	3828533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_014664	CCCGCA	2	12	3917940	3917951	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_014664	GCAGAT	2	12	3943846	3943857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_014664	GCGATC	2	12	3962460	3962471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.