MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 2851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	CCCTT	2	10	641	650	0 %	40 %	0 %	60 %	312112795
2	NC_014664	GCGCC	2	10	3210	3219	0 %	0 %	40 %	60 %	312112797
3	NC_014664	TTCGC	2	10	3249	3258	0 %	40 %	20 %	40 %	312112797
4	NC_014664	AGGGC	2	10	3411	3420	20 %	0 %	60 %	20 %	312112797
5	NC_014664	TGGCG	2	10	4405	4414	0 %	20 %	60 %	20 %	312112798
6	NC_014664	GTCCG	2	10	4996	5005	0 %	20 %	40 %	40 %	312112798
7	NC_014664	CCGCG	2	10	7794	7803	0 %	0 %	40 %	60 %	312112799
8	NC_014664	GGCAG	2	10	8007	8016	20 %	0 %	60 %	20 %	312112800
9	NC_014664	CGCCC	2	10	9697	9706	0 %	0 %	20 %	80 %	312112802
10	NC_014664	GCCGC	2	10	10216	10225	0 %	0 %	40 %	60 %	312112802
11	NC_014664	GCGTC	2	10	10850	10859	0 %	20 %	40 %	40 %	312112803
12	NC_014664	ACGTC	2	10	11266	11275	20 %	20 %	20 %	40 %	312112804
13	NC_014664	GCGCG	2	10	12902	12911	0 %	0 %	60 %	40 %	312112805
14	NC_014664	ACCGA	2	10	15654	15663	40 %	0 %	20 %	40 %	312112807
15	NC_014664	GAGCG	2	10	16375	16384	20 %	0 %	60 %	20 %	312112807
16	NC_014664	GCGCG	2	10	18059	18068	0 %	0 %	60 %	40 %	312112809
17	NC_014664	CCGCC	2	10	19036	19045	0 %	0 %	20 %	80 %	312112810
18	NC_014664	CCTCG	2	10	20436	20445	0 %	20 %	20 %	60 %	312112811
19	NC_014664	CGGCT	2	10	21001	21010	0 %	20 %	40 %	40 %	312112811
20	NC_014664	CCGCC	2	10	23079	23088	0 %	0 %	20 %	80 %	312112813
21	NC_014664	GGTCC	2	10	28653	28662	0 %	20 %	40 %	40 %	312112818
22	NC_014664	CGACG	2	10	29049	29058	20 %	0 %	40 %	40 %	312112818
23	NC_014664	GCAAA	2	10	30940	30949	60 %	0 %	20 %	20 %	312112820
24	NC_014664	GAACT	2	10	31453	31462	40 %	20 %	20 %	20 %	312112820
25	NC_014664	CCGTT	2	10	31751	31760	0 %	40 %	20 %	40 %	312112821
26	NC_014664	TTCAC	2	10	32464	32473	20 %	40 %	0 %	40 %	312112821
27	NC_014664	CGGCG	2	10	33859	33868	0 %	0 %	60 %	40 %	312112822
28	NC_014664	CCGAT	2	10	34258	34267	20 %	20 %	20 %	40 %	312112822
29	NC_014664	GCATC	2	10	35235	35244	20 %	20 %	20 %	40 %	312112823
30	NC_014664	GCCGC	2	10	36530	36539	0 %	0 %	40 %	60 %	312112824
31	NC_014664	GCCGC	2	10	36974	36983	0 %	0 %	40 %	60 %	312112824
32	NC_014664	CTTGC	2	10	37720	37729	0 %	40 %	20 %	40 %	312112825
33	NC_014664	GCTTC	2	10	39882	39891	0 %	40 %	20 %	40 %	312112827
34	NC_014664	TCGGC	2	10	41265	41274	0 %	20 %	40 %	40 %	312112828
35	NC_014664	CGGGC	2	10	43145	43154	0 %	0 %	60 %	40 %	312112830
36	NC_014664	TCGGC	2	10	44961	44970	0 %	20 %	40 %	40 %	312112831
37	NC_014664	GCTGT	2	10	47797	47806	0 %	40 %	40 %	20 %	312112834
38	NC_014664	CGGCC	2	10	48426	48435	0 %	0 %	40 %	60 %	312112836
39	NC_014664	ATCGA	2	10	50370	50379	40 %	20 %	20 %	20 %	312112837
40	NC_014664	CGCGC	2	10	50742	50751	0 %	0 %	40 %	60 %	312112838
41	NC_014664	GTCGA	2	10	50985	50994	20 %	20 %	40 %	20 %	312112838
42	NC_014664	ACGAC	2	10	51058	51067	40 %	0 %	20 %	40 %	312112838
43	NC_014664	CTCGC	2	10	51192	51201	0 %	20 %	20 %	60 %	312112838
44	NC_014664	CGGCG	2	10	51407	51416	0 %	0 %	60 %	40 %	312112838
45	NC_014664	GGGCA	2	10	51804	51813	20 %	0 %	60 %	20 %	312112838
46	NC_014664	AAGGC	2	10	53622	53631	40 %	0 %	40 %	20 %	312112841
47	NC_014664	ATGGG	2	10	55479	55488	20 %	20 %	60 %	0 %	312112843
48	NC_014664	CGGCA	2	10	56172	56181	20 %	0 %	40 %	40 %	312112844
49	NC_014664	CGGCG	2	10	56765	56774	0 %	0 %	60 %	40 %	312112845
50	NC_014664	CGCGA	2	10	59869	59878	20 %	0 %	40 %	40 %	312112847
51	NC_014664	TCGCG	2	10	61060	61069	0 %	20 %	40 %	40 %	312112847
52	NC_014664	GGCGA	2	10	63839	63848	20 %	0 %	60 %	20 %	312112848
53	NC_014664	GCGCC	2	10	64015	64024	0 %	0 %	40 %	60 %	312112848
54	NC_014664	TACGG	2	10	66636	66645	20 %	20 %	40 %	20 %	312112850
55	NC_014664	CGCGC	2	10	68292	68301	0 %	0 %	40 %	60 %	312112852
56	NC_014664	ACAGC	2	10	69041	69050	40 %	0 %	20 %	40 %	312112853
57	NC_014664	GGCGG	2	10	69152	69161	0 %	0 %	80 %	20 %	312112853
58	NC_014664	GACCG	2	10	70132	70141	20 %	0 %	40 %	40 %	312112854
59	NC_014664	GGCGC	2	10	73315	73324	0 %	0 %	60 %	40 %	312112857
60	NC_014664	AACGC	2	10	74015	74024	40 %	0 %	20 %	40 %	312112857
61	NC_014664	GCGCC	2	10	75179	75188	0 %	0 %	40 %	60 %	312112859
62	NC_014664	CGACG	2	10	76262	76271	20 %	0 %	40 %	40 %	312112859
63	NC_014664	TGAAA	2	10	76803	76812	60 %	20 %	20 %	0 %	312112860
64	NC_014664	CCGCG	2	10	78533	78542	0 %	0 %	40 %	60 %	312112861
65	NC_014664	CGCAC	2	10	80190	80199	20 %	0 %	20 %	60 %	312112862
66	NC_014664	CGGAT	2	10	82102	82111	20 %	20 %	40 %	20 %	312112864
67	NC_014664	GCAGC	2	10	82673	82682	20 %	0 %	40 %	40 %	312112864
68	NC_014664	GCCCG	2	10	84142	84151	0 %	0 %	40 %	60 %	312112866
69	NC_014664	GCCCG	2	10	84530	84539	0 %	0 %	40 %	60 %	312112866
70	NC_014664	GCACC	2	10	84894	84903	20 %	0 %	20 %	60 %	312112867
71	NC_014664	CATCT	2	10	84920	84929	20 %	40 %	0 %	40 %	312112867
72	NC_014664	CGGCG	2	10	85728	85737	0 %	0 %	60 %	40 %	312112867
73	NC_014664	CCGCC	2	10	86821	86830	0 %	0 %	20 %	80 %	312112868
74	NC_014664	CGAGG	2	10	87417	87426	20 %	0 %	60 %	20 %	312112868
75	NC_014664	GCGCC	2	10	91119	91128	0 %	0 %	40 %	60 %	312112870
76	NC_014664	CATGA	2	10	92011	92020	40 %	20 %	20 %	20 %	312112872
77	NC_014664	CAGCG	2	10	92554	92563	20 %	0 %	40 %	40 %	312112872
78	NC_014664	GCCCA	2	10	94500	94509	20 %	0 %	20 %	60 %	312112873
79	NC_014664	GCGCA	2	10	94797	94806	20 %	0 %	40 %	40 %	312112874
80	NC_014664	CCGCG	2	10	95738	95747	0 %	0 %	40 %	60 %	312112874
81	NC_014664	CGCTG	2	10	96278	96287	0 %	20 %	40 %	40 %	312112875
82	NC_014664	AGCGC	2	10	99328	99337	20 %	0 %	40 %	40 %	312112879
83	NC_014664	GCGCC	2	10	99346	99355	0 %	0 %	40 %	60 %	312112879
84	NC_014664	AAGGC	2	10	99502	99511	40 %	0 %	40 %	20 %	312112879
85	NC_014664	GCGCG	2	10	101761	101770	0 %	0 %	60 %	40 %	312112882
86	NC_014664	CGGCG	2	10	102319	102328	0 %	0 %	60 %	40 %	312112882
87	NC_014664	GCGTC	2	10	103394	103403	0 %	20 %	40 %	40 %	312112883
88	NC_014664	CGTCT	2	10	105710	105719	0 %	40 %	20 %	40 %	312112884
89	NC_014664	CGTCC	2	10	106502	106511	0 %	20 %	20 %	60 %	312112884
90	NC_014664	AAGGG	2	10	107006	107015	40 %	0 %	60 %	0 %	312112885
91	NC_014664	GCTGT	2	10	107452	107461	0 %	40 %	40 %	20 %	312112885
92	NC_014664	TGGCG	2	10	108271	108280	0 %	20 %	60 %	20 %	312112886
93	NC_014664	GCGCA	2	10	108360	108369	20 %	0 %	40 %	40 %	312112886
94	NC_014664	TGCGC	2	10	109213	109222	0 %	20 %	40 %	40 %	312112886
95	NC_014664	GTTCT	2	10	110039	110048	0 %	60 %	20 %	20 %	312112887
96	NC_014664	CAGGA	2	10	110163	110172	40 %	0 %	40 %	20 %	312112888
97	NC_014664	GCCAC	2	10	112151	112160	20 %	0 %	20 %	60 %	312112890
98	NC_014664	GCGCC	2	10	114296	114305	0 %	0 %	40 %	60 %	312112893
99	NC_014664	GCGTC	2	10	115603	115612	0 %	20 %	40 %	40 %	312112894
100	NC_014664	GCGCA	2	10	116189	116198	20 %	0 %	40 %	40 %	312112894
101	NC_014664	CGGGG	2	10	117058	117067	0 %	0 %	80 %	20 %	312112895
102	NC_014664	CCTCG	2	10	117259	117268	0 %	20 %	20 %	60 %	312112895
103	NC_014664	CGAGC	2	10	118040	118049	20 %	0 %	40 %	40 %	312112897
104	NC_014664	CGGCG	2	10	122251	122260	0 %	0 %	60 %	40 %	312112898
105	NC_014664	AGGGC	2	10	122266	122275	20 %	0 %	60 %	20 %	312112898
106	NC_014664	CGGAT	2	10	127214	127223	20 %	20 %	40 %	20 %	312112901
107	NC_014664	GAAAG	2	10	127684	127693	60 %	0 %	40 %	0 %	312112901
108	NC_014664	GGTCG	2	10	128601	128610	0 %	20 %	60 %	20 %	312112902
109	NC_014664	CGTAG	2	10	129158	129167	20 %	20 %	40 %	20 %	312112903
110	NC_014664	GCCGG	2	10	133301	133310	0 %	0 %	60 %	40 %	312112905
111	NC_014664	TGTTC	2	10	134519	134528	0 %	60 %	20 %	20 %	312112906
112	NC_014664	GCGAG	2	10	136887	136896	20 %	0 %	60 %	20 %	312112908
113	NC_014664	GGCGA	2	10	136922	136931	20 %	0 %	60 %	20 %	312112908
114	NC_014664	AGCGC	2	10	137776	137785	20 %	0 %	40 %	40 %	312112909
115	NC_014664	GTTTC	2	10	138775	138784	0 %	60 %	20 %	20 %	312112910
116	NC_014664	GCATC	2	10	139586	139595	20 %	20 %	20 %	40 %	312112911
117	NC_014664	CGGCA	2	10	141599	141608	20 %	0 %	40 %	40 %	312112911
118	NC_014664	TGGAA	2	10	141808	141817	40 %	20 %	40 %	0 %	312112911
119	NC_014664	TCGCC	2	10	141860	141869	0 %	20 %	20 %	60 %	312112911
120	NC_014664	TCGCC	2	10	142700	142709	0 %	20 %	20 %	60 %	312112913
121	NC_014664	GCTCG	2	10	144665	144674	0 %	20 %	40 %	40 %	312112914
122	NC_014664	GAAGC	2	10	145610	145619	40 %	0 %	40 %	20 %	312112915
123	NC_014664	TGCCA	2	10	145729	145738	20 %	20 %	20 %	40 %	312112915
124	NC_014664	GCGAG	2	10	145822	145831	20 %	0 %	60 %	20 %	312112915
125	NC_014664	AACGG	2	10	148084	148093	40 %	0 %	40 %	20 %	312112916
126	NC_014664	CGCGC	2	10	149384	149393	0 %	0 %	40 %	60 %	312112917
127	NC_014664	GCCGG	2	10	149647	149656	0 %	0 %	60 %	40 %	312112917
128	NC_014664	CGCAT	2	10	149795	149804	20 %	20 %	20 %	40 %	312112917
129	NC_014664	ACCTA	2	10	150083	150092	40 %	20 %	0 %	40 %	312112917
130	NC_014664	GCGTG	2	10	152008	152017	0 %	20 %	60 %	20 %	312112920
131	NC_014664	GGCGA	2	10	153506	153515	20 %	0 %	60 %	20 %	312112920
132	NC_014664	GCCCG	2	10	157184	157193	0 %	0 %	40 %	60 %	312112923
133	NC_014664	AGCCG	2	10	160022	160031	20 %	0 %	40 %	40 %	312112926
134	NC_014664	GCGCG	2	10	160377	160386	0 %	0 %	60 %	40 %	312112927
135	NC_014664	GGCGC	2	10	163254	163263	0 %	0 %	60 %	40 %	312112929
136	NC_014664	GCCGC	2	10	164829	164838	0 %	0 %	40 %	60 %	312112931
137	NC_014664	CGCGC	2	10	167475	167484	0 %	0 %	40 %	60 %	312112933
138	NC_014664	CGCGC	2	10	172714	172723	0 %	0 %	40 %	60 %	312112934
139	NC_014664	GAACC	2	10	173340	173349	40 %	0 %	20 %	40 %	312112934
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260	NC_014664	AGCGG	2	10	342883	342892	20 %	0 %	60 %	20 %	312113085
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263	NC_014664	GGGTC	2	10	350526	350535	0 %	20 %	60 %	20 %	312113091
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499	NC_014664	TGGGC	2	10	692498	692507	0 %	20 %	60 %	20 %	312113395
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