MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 9539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	GCCA	2	8	732	739	25 %	0 %	25 %	50 %	312112795
2	NC_014664	AACA	2	8	919	926	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014664	TCGA	2	8	1004	1011	25 %	25 %	25 %	25 %	312112796
4	NC_014664	TCGA	2	8	1019	1026	25 %	25 %	25 %	25 %	312112796
5	NC_014664	CTCG	2	8	2310	2317	0 %	25 %	25 %	50 %	312112796
6	NC_014664	CGAC	2	8	2700	2707	25 %	0 %	25 %	50 %	312112797
7	NC_014664	ATCT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	0 %	25 %	312112797
8	NC_014664	GCGG	2	8	3140	3147	0 %	0 %	75 %	25 %	312112797
9	NC_014664	GACG	2	8	3637	3644	25 %	0 %	50 %	25 %	312112797
10	NC_014664	ACCG	2	8	4172	4179	25 %	0 %	25 %	50 %	312112798
11	NC_014664	GCGG	2	8	5739	5746	0 %	0 %	75 %	25 %	312112799
12	NC_014664	CCAG	2	8	6445	6452	25 %	0 %	25 %	50 %	312112799
13	NC_014664	GCCC	3	12	8100	8111	0 %	0 %	25 %	75 %	312112800
14	NC_014664	TCGC	2	8	8193	8200	0 %	25 %	25 %	50 %	312112800
15	NC_014664	TCCG	2	8	8307	8314	0 %	25 %	25 %	50 %	312112800
16	NC_014664	TTTC	2	8	8618	8625	0 %	75 %	0 %	25 %	312112800
17	NC_014664	CGAT	2	8	8707	8714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014664	GGCA	2	8	8804	8811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014664	ATTG	2	8	8821	8828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014664	AGCC	2	8	8995	9002	25 %	0 %	25 %	50 %	312112801
21	NC_014664	GCCT	2	8	9017	9024	0 %	25 %	25 %	50 %	312112801
22	NC_014664	CGCC	2	8	9244	9251	0 %	0 %	25 %	75 %	312112801
23	NC_014664	AGCG	2	8	9279	9286	25 %	0 %	50 %	25 %	312112801
24	NC_014664	CTTC	2	8	10143	10150	0 %	50 %	0 %	50 %	312112802
25	NC_014664	CGTC	2	8	11069	11076	0 %	25 %	25 %	50 %	312112803
26	NC_014664	AGGA	2	8	11086	11093	50 %	0 %	50 %	0 %	312112803
27	NC_014664	GCCT	2	8	11292	11299	0 %	25 %	25 %	50 %	312112804
28	NC_014664	GGAA	2	8	11731	11738	50 %	0 %	50 %	0 %	312112804
29	NC_014664	CCGG	2	8	12201	12208	0 %	0 %	50 %	50 %	312112804
30	NC_014664	CGGT	2	8	12444	12451	0 %	25 %	50 %	25 %	312112804
31	NC_014664	GCCA	2	8	12485	12492	25 %	0 %	25 %	50 %	312112804
32	NC_014664	CGCC	2	8	12616	12623	0 %	0 %	25 %	75 %	312112804
33	NC_014664	CCTT	2	8	12676	12683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014664	GTCC	2	8	13312	13319	0 %	25 %	25 %	50 %	312112805
35	NC_014664	CTTC	2	8	13708	13715	0 %	50 %	0 %	50 %	312112805
36	NC_014664	GGCC	2	8	14512	14519	0 %	0 %	50 %	50 %	312112805
37	NC_014664	TCTT	2	8	14731	14738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014664	AACG	2	8	14980	14987	50 %	0 %	25 %	25 %	312112806
39	NC_014664	GCCT	2	8	15841	15848	0 %	25 %	25 %	50 %	312112807
40	NC_014664	AGAT	2	8	15935	15942	50 %	25 %	25 %	0 %	312112807
41	NC_014664	CGAG	2	8	15978	15985	25 %	0 %	50 %	25 %	312112807
42	NC_014664	CGCC	2	8	16539	16546	0 %	0 %	25 %	75 %	312112807
43	NC_014664	GTGA	2	8	16741	16748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014664	ATTT	2	8	16812	16819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014664	GCCT	2	8	18012	18019	0 %	25 %	25 %	50 %	312112809
46	NC_014664	TGCC	2	8	18079	18086	0 %	25 %	25 %	50 %	312112809
47	NC_014664	GCTC	2	8	18465	18472	0 %	25 %	25 %	50 %	312112809
48	NC_014664	GCTG	2	8	18541	18548	0 %	25 %	50 %	25 %	312112809
49	NC_014664	GCCT	2	8	18575	18582	0 %	25 %	25 %	50 %	312112809
50	NC_014664	GGCT	2	8	18763	18770	0 %	25 %	50 %	25 %	312112809
51	NC_014664	CGCC	2	8	19359	19366	0 %	0 %	25 %	75 %	312112810
52	NC_014664	CTCG	2	8	19423	19430	0 %	25 %	25 %	50 %	312112810
53	NC_014664	GCGG	2	8	19661	19668	0 %	0 %	75 %	25 %	312112810
54	NC_014664	GGCG	2	8	20229	20236	0 %	0 %	75 %	25 %	312112811
55	NC_014664	AGCC	2	8	20317	20324	25 %	0 %	25 %	50 %	312112811
56	NC_014664	CGCT	2	8	20578	20585	0 %	25 %	25 %	50 %	312112811
57	NC_014664	GGCT	2	8	21031	21038	0 %	25 %	50 %	25 %	312112811
58	NC_014664	CGCA	2	8	21348	21355	25 %	0 %	25 %	50 %	312112812
59	NC_014664	GGGC	2	8	21514	21521	0 %	0 %	75 %	25 %	312112812
60	NC_014664	ACCG	2	8	22098	22105	25 %	0 %	25 %	50 %	312112813
61	NC_014664	CCGA	2	8	22188	22195	25 %	0 %	25 %	50 %	312112813
62	NC_014664	GGCG	2	8	22313	22320	0 %	0 %	75 %	25 %	312112813
63	NC_014664	CGCC	2	8	22857	22864	0 %	0 %	25 %	75 %	312112813
64	NC_014664	TCCA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	0 %	50 %	312112814
65	NC_014664	GAGC	2	8	24026	24033	25 %	0 %	50 %	25 %	312112814
66	NC_014664	TATC	2	8	24197	24204	25 %	50 %	0 %	25 %	312112814
67	NC_014664	GATC	2	8	24545	24552	25 %	25 %	25 %	25 %	312112814
68	NC_014664	CAGC	2	8	24593	24600	25 %	0 %	25 %	50 %	312112814
69	NC_014664	GATC	2	8	25056	25063	25 %	25 %	25 %	25 %	312112815
70	NC_014664	CGAC	2	8	25377	25384	25 %	0 %	25 %	50 %	312112815
71	NC_014664	TGCA	2	8	25680	25687	25 %	25 %	25 %	25 %	312112815
72	NC_014664	GCCC	2	8	25786	25793	0 %	0 %	25 %	75 %	312112815
73	NC_014664	CTTC	2	8	26566	26573	0 %	50 %	0 %	50 %	312112816
74	NC_014664	CGTC	2	8	26880	26887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014664	GCCT	2	8	27317	27324	0 %	25 %	25 %	50 %	312112817
76	NC_014664	CGCC	2	8	27382	27389	0 %	0 %	25 %	75 %	312112817
77	NC_014664	CCTT	2	8	27513	27520	0 %	50 %	0 %	50 %	312112817
78	NC_014664	CCGC	2	8	27888	27895	0 %	0 %	25 %	75 %	312112817
79	NC_014664	TGAC	2	8	27976	27983	25 %	25 %	25 %	25 %	312112817
80	NC_014664	TTGC	2	8	29185	29192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014664	GCTC	2	8	29888	29895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014664	GCGG	2	8	30592	30599	0 %	0 %	75 %	25 %	312112820
83	NC_014664	TCGC	2	8	30630	30637	0 %	25 %	25 %	50 %	312112820
84	NC_014664	CAAC	2	8	31335	31342	50 %	0 %	0 %	50 %	312112820
85	NC_014664	GCCC	2	8	32116	32123	0 %	0 %	25 %	75 %	312112821
86	NC_014664	TGGA	2	8	32281	32288	25 %	25 %	50 %	0 %	312112821
87	NC_014664	CTGG	2	8	32435	32442	0 %	25 %	50 %	25 %	312112821
88	NC_014664	GCGA	2	8	32811	32818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014664	TCGG	2	8	32873	32880	0 %	25 %	50 %	25 %	312112822
90	NC_014664	CATG	2	8	33022	33029	25 %	25 %	25 %	25 %	312112822
91	NC_014664	TTGC	2	8	33695	33702	0 %	50 %	25 %	25 %	312112822
92	NC_014664	CATT	2	8	33744	33751	25 %	50 %	0 %	25 %	312112822
93	NC_014664	CTGT	2	8	33811	33818	0 %	50 %	25 %	25 %	312112822
94	NC_014664	CGGC	2	8	33946	33953	0 %	0 %	50 %	50 %	312112822
95	NC_014664	TTCG	2	8	34128	34135	0 %	50 %	25 %	25 %	312112822
96	NC_014664	TCGG	2	8	34730	34737	0 %	25 %	50 %	25 %	312112823
97	NC_014664	CGCC	2	8	35316	35323	0 %	0 %	25 %	75 %	312112823
98	NC_014664	CTGA	2	8	35845	35852	25 %	25 %	25 %	25 %	312112823
99	NC_014664	GCGG	2	8	37253	37260	0 %	0 %	75 %	25 %	312112824
100	NC_014664	CGCC	2	8	37530	37537	0 %	0 %	25 %	75 %	312112825
101	NC_014664	TGAT	2	8	37547	37554	25 %	50 %	25 %	0 %	312112825
102	NC_014664	TCGC	2	8	37622	37629	0 %	25 %	25 %	50 %	312112825
103	NC_014664	GATG	2	8	37963	37970	25 %	25 %	50 %	0 %	312112826
104	NC_014664	TGCG	2	8	38045	38052	0 %	25 %	50 %	25 %	312112826
105	NC_014664	GAGC	2	8	38298	38305	25 %	0 %	50 %	25 %	312112826
106	NC_014664	GCGA	2	8	38505	38512	25 %	0 %	50 %	25 %	312112826
107	NC_014664	TGGC	2	8	38982	38989	0 %	25 %	50 %	25 %	312112826
108	NC_014664	GCAT	2	8	39218	39225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014664	ATGC	2	8	39813	39820	25 %	25 %	25 %	25 %	312112827
110	NC_014664	AAGA	2	8	40214	40221	75 %	0 %	25 %	0 %	312112827
111	NC_014664	CGAA	2	8	40602	40609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014664	CGCA	2	8	40734	40741	25 %	0 %	25 %	50 %	312112828
113	NC_014664	TGCC	2	8	42689	42696	0 %	25 %	25 %	50 %	312112830
114	NC_014664	GAAG	2	8	43213	43220	50 %	0 %	50 %	0 %	312112830
115	NC_014664	GAAG	2	8	44194	44201	50 %	0 %	50 %	0 %	312112831
116	NC_014664	AAGG	2	8	44982	44989	50 %	0 %	50 %	0 %	312112831
117	NC_014664	CCTT	2	8	45699	45706	0 %	50 %	0 %	50 %	312112832
118	NC_014664	AGCC	2	8	46290	46297	25 %	0 %	25 %	50 %	312112832
119	NC_014664	GGCG	2	8	46482	46489	0 %	0 %	75 %	25 %	312112833
120	NC_014664	GATC	2	8	47153	47160	25 %	25 %	25 %	25 %	312112833
121	NC_014664	CGGG	2	8	47210	47217	0 %	0 %	75 %	25 %	312112834
122	NC_014664	GGCG	2	8	47256	47263	0 %	0 %	75 %	25 %	312112834
123	NC_014664	GCTC	2	8	47366	47373	0 %	25 %	25 %	50 %	312112834
124	NC_014664	CGCT	2	8	47422	47429	0 %	25 %	25 %	50 %	312112834
125	NC_014664	CTCG	2	8	48097	48104	0 %	25 %	25 %	50 %	312112835
126	NC_014664	CCGG	2	8	49487	49494	0 %	0 %	50 %	50 %	312112837
127	NC_014664	GACC	2	8	50485	50492	25 %	0 %	25 %	50 %	312112837
128	NC_014664	GGCG	2	8	50813	50820	0 %	0 %	75 %	25 %	312112838
129	NC_014664	GGCG	2	8	50975	50982	0 %	0 %	75 %	25 %	312112838
130	NC_014664	GAAG	2	8	51224	51231	50 %	0 %	50 %	0 %	312112838
131	NC_014664	GCTG	2	8	51356	51363	0 %	25 %	50 %	25 %	312112838
132	NC_014664	GGTC	2	8	51521	51528	0 %	25 %	50 %	25 %	312112838
133	NC_014664	CTGC	2	8	51871	51878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014664	GAAC	2	8	53057	53064	50 %	0 %	25 %	25 %	312112840
135	NC_014664	GGCT	2	8	53198	53205	0 %	25 %	50 %	25 %	312112840
136	NC_014664	GGCG	2	8	53728	53735	0 %	0 %	75 %	25 %	312112841
137	NC_014664	TCCG	2	8	54011	54018	0 %	25 %	25 %	50 %	312112841
138	NC_014664	GACG	2	8	54032	54039	25 %	0 %	50 %	25 %	312112841
139	NC_014664	CCGC	2	8	54396	54403	0 %	0 %	25 %	75 %	312112842
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141	NC_014664	GGGC	2	8	55300	55307	0 %	0 %	75 %	25 %	312112843
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