MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus equi 103S

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014659	GACGGG	2	12	65713	65724	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014659	CGGCGT	2	12	73773	73784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014659	GCGTCG	2	12	133763	133774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014659	TTCTCG	2	12	152912	152923	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014659	CTTGAC	2	12	202031	202042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014659	GACGAA	2	12	209556	209567	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014659	AAAGGG	2	12	215608	215619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014659	AGTGCA	2	12	244444	244455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014659	CCGGCA	2	12	244516	244527	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014659	CACCGC	2	12	298872	298883	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014659	CGCCGG	2	12	319744	319755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014659	CCGCCA	2	12	325476	325487	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014659	GGTGGA	2	12	362197	362208	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014659	TCGGCG	2	12	389962	389973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014659	CGCTGA	2	12	466130	466141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014659	CGCTCA	2	12	467118	467129	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014659	CGGAGG	2	12	539684	539695	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014659	GCCGGC	2	12	553990	554001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014659	CGCCGT	2	12	572906	572917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014659	AGTGCA	2	12	579687	579698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014659	CCGGCA	2	12	579759	579770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014659	ACGCAC	2	12	592857	592868	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014659	TGGCCC	2	12	616201	616212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014659	GCCTGC	2	12	620382	620393	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014659	TGTCGG	2	12	642816	642827	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014659	CGTTTC	2	12	669019	669030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014659	CGGATG	2	12	682048	682059	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014659	AGTGCG	2	12	687719	687730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014659	TCCCGC	2	12	840359	840370	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014659	TCGACG	2	12	933771	933782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014659	GACGTG	2	12	936102	936113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014659	GCCCCG	2	12	1003846	1003857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014659	CGGGGC	2	12	1003863	1003874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014659	GCGCAG	3	18	1079944	1079961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014659	CAGTCG	2	12	1120519	1120530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014659	GGGCGG	2	12	1136148	1136159	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014659	GTAGCT	2	12	1139649	1139660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014659	CGACGC	2	12	1157306	1157317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014659	GCACGA	2	12	1185009	1185020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014659	ACGGCG	2	12	1211464	1211475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014659	CGTCGA	2	12	1245664	1245675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014659	TGTGTT	2	12	1266468	1266479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014659	GTGCCC	2	12	1277528	1277539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014659	TCGGTG	2	12	1278017	1278028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014659	TCCGCC	2	12	1286951	1286962	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014659	GGCGCA	2	12	1322837	1322848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014659	CAGTGC	2	12	1325764	1325775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014659	GGGCGC	2	12	1350477	1350488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014659	CAAACG	2	12	1350522	1350533	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014659	GAAACC	2	12	1363858	1363869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014659	GCACGG	2	12	1391253	1391264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014659	GAGGTT	2	12	1400416	1400427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014659	GCGGTC	2	12	1402113	1402124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014659	TCCCGC	2	12	1458405	1458416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014659	GATGTC	2	12	1459787	1459798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014659	TTCTCG	2	12	1499727	1499738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014659	GAGGGT	2	12	1534238	1534249	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014659	TCGCGG	2	12	1590483	1590494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014659	GACATG	2	12	1611839	1611850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014659	GTTCCG	2	12	1638784	1638795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014659	AGGTCG	2	12	1728081	1728092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014659	TCCCGC	2	12	1761426	1761437	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014659	GAAGAC	2	12	1789300	1789311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014659	TCCGGT	2	12	1850041	1850052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014659	CCGACA	2	12	1855689	1855700	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014659	AGTGCA	2	12	1870341	1870352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014659	CCGGCA	2	12	1870413	1870424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014659	CGTGTC	2	12	1879765	1879776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014659	CCGCGA	2	12	1927159	1927170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014659	TGCGGG	2	12	2047927	2047938	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014659	ACGAGG	2	12	2139785	2139796	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014659	TCGACT	2	12	2219187	2219198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014659	GCCGAG	2	12	2220220	2220231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014659	CCGGGC	3	18	2234810	2234827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014659	TGGTCT	2	12	2234881	2234892	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014659	CGGGCG	2	12	2273782	2273793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014659	AGACCG	2	12	2280654	2280665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014659	AAATCA	2	12	2295205	2295216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014659	CGACGT	2	12	2334829	2334840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014659	GTGGCG	2	12	2365095	2365106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014659	CTGCTC	2	12	2450424	2450435	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014659	TAGGGT	2	12	2453217	2453228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014659	CGGCAC	2	12	2468313	2468324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014659	CGATGA	2	12	2475896	2475907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014659	ACGTCG	2	12	2476028	2476039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014659	GGCCTG	2	12	2490566	2490577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014659	GACTCC	2	12	2501223	2501234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014659	ACCGGC	2	12	2588926	2588937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014659	TGCGGT	2	12	2590109	2590120	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014659	CCCCTC	2	12	2601915	2601926	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_014659	TTGAGG	2	12	2607014	2607025	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014659	GACGTC	2	12	2615386	2615397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014659	TGCCGG	2	12	2633875	2633886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014659	TGCACT	2	12	2633947	2633958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014659	TCCTCA	2	12	2747200	2747211	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014659	CGACGC	2	12	2755479	2755490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014659	GTCGGG	2	12	2756016	2756027	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014659	GTGCCG	2	12	2777715	2777726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014659	CGTGCC	4	24	2779949	2779972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014659	CGCCCG	2	12	2780502	2780513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014659	GTCGGG	2	12	2813085	2813096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014659	GCACTT	2	12	2814133	2814144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014659	TCACCA	2	12	2841564	2841575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014659	CTCACC	2	12	2851305	2851316	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014659	GATCGC	2	12	2851317	2851328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014659	CTCGAT	2	12	2851845	2851856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014659	TCGACG	2	12	2881953	2881964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014659	CTCAAC	2	12	2950791	2950802	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014659	CGGAAG	2	12	3018146	3018157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014659	CTTCGA	2	12	3084794	3084805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014659	GCGGGG	2	12	3175026	3175037	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014659	CCCGGT	2	12	3189943	3189954	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014659	GGACGG	2	12	3235810	3235821	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014659	CGGCAC	2	12	3246522	3246533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014659	CGCCGG	2	12	3246575	3246586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014659	CACAAC	2	12	3259419	3259430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014659	CGTTGA	2	12	3310610	3310621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014659	ATGCGG	2	12	3322763	3322774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014659	TCCCGG	2	12	3326547	3326558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014659	CGGCCG	2	12	3338635	3338646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014659	TCCCAC	2	12	3350385	3350396	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014659	TCGAAC	2	12	3390662	3390673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014659	GGGCCG	2	12	3415503	3415514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014659	CCCGAC	2	12	3572952	3572963	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014659	ACAGGT	2	12	3593355	3593366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014659	GAACAG	2	12	3663947	3663958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014659	TTCCAG	2	12	3664579	3664590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014659	TGGTTC	2	12	3669316	3669327	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014659	TCCGGA	2	12	3669690	3669701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014659	ATCACG	2	12	3669947	3669958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014659	TCCGGT	2	12	3731878	3731889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014659	CTGTGA	2	12	3761611	3761622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014659	CGGCCT	2	12	3762025	3762036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014659	GCCTCG	2	12	3781124	3781135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014659	CCGCTG	2	12	3794404	3794415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014659	CCCCGG	2	12	3794473	3794484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014659	CCGGCC	2	12	3795336	3795347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014659	TCGACC	2	12	3823085	3823096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014659	CGCCCC	2	12	3844013	3844024	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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141	NC_014659	GGCCGA	2	12	3936955	3936966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014659	GGCTGA	2	12	4097025	4097036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_014659	GCGCCC	2	12	4188961	4188972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014659	CGAGCG	2	12	4213612	4213623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014659	TCCCCC	2	12	4222262	4222273	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
146	NC_014659	CCGACC	2	12	4332004	4332015	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_014659	CAGCCG	2	12	4335150	4335161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014659	GCGGGG	2	12	4381894	4381905	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014659	CTCCCC	2	12	4413271	4413282	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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153	NC_014659	GGTGAG	2	12	4495994	4496005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014659	CGGGAC	2	12	4586009	4586020	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014659	GCGAGG	2	12	4598933	4598944	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014659	CCTCGT	2	12	4666678	4666689	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014659	GAAGTG	2	12	4680585	4680596	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014659	ACGCCG	2	12	4852274	4852285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_014659	CGTCGC	2	12	4857189	4857200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_014659	CGGCCG	2	12	4882631	4882642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014659	CGTTCG	2	12	4912455	4912466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_014659	TCGGCG	2	12	4913223	4913234	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_014659	TGACGG	2	12	4923874	4923885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_014659	GGGGAC	2	12	4969942	4969953	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.